Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7239
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7239, 224 aa
1>>>pF1KB7239 224 - 224 aa - 224 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3994+/-0.000801; mu= 13.4096+/- 0.048
mean_var=66.8801+/-12.836, 0's: 0 Z-trim(108.1): 39 B-trim: 45 in 1/51
Lambda= 0.156829
statistics sampled from 9935 (9974) to 9935 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 1.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14187.1 RS1 gene_id:6247|Hs108|chrX ( 224) 1585 367.1 5e-102
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 394 97.7 9.4e-21
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 394 97.8 1e-20
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 387 96.6 1.4e-19
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 ( 775) 349 87.7 2.2e-17
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX ( 216) 338 85.0 4.1e-17
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 470) 333 84.0 1.8e-16
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 480) 333 84.0 1.8e-16
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351) 338 85.5 3.1e-16
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 311 79.1 8.1e-15
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 305 77.8 2.1e-14
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 303 77.3 2.2e-14
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 303 77.4 3.4e-14
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 303 77.4 3.4e-14
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 303 77.4 3.4e-14
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 303 77.4 3.4e-14
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 303 77.4 3.5e-14
CCDS34522.1 DCBLD1 gene_id:285761|Hs108|chr6 ( 539) 296 75.7 6.5e-14
CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 296 75.9 1.4e-13
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 279 72.0 1.8e-12
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 255 66.5 6e-11
>>CCDS14187.1 RS1 gene_id:6247|Hs108|chrX (224 aa)
initn: 1585 init1: 1585 opt: 1585 Z-score: 1945.2 bits: 367.1 E(32554): 5e-102
Smith-Waterman score: 1585; 100.0% identity (100.0% similar) in 224 aa overlap (1-224:1-224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSRKIEGFLLLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSRKIEGFLLLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDIDEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDIDEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB7 DRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLECVSKCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLECVSKCA
190 200 210 220
>>CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 (343 aa)
initn: 420 init1: 189 opt: 394 Z-score: 486.1 bits: 97.7 E(32554): 9.4e-21
Smith-Waterman score: 394; 39.1% identity (69.9% similar) in 156 aa overlap (68-219:189-343)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYS-SW
:::.... . ::: :. . : . ::
CCDS81 QYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWGLHLFSW
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDID--EWMTKYSVQ
. . :::..:: ::.. ..::::.:: : ..::.::: .. .....:.:
CCDS81 NPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFVASYKVA
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YRTDERLNWIYYKD-QTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIR
: .: :: :.: .::....: :: : : .::.. ::..:..:..:..:: :::.:
CCDS81 YSNDSA-NWTEYQDPRTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHNRIALR
280 290 300 310 320 330
220
pF1KB7 MELLECVSKCA
.::: :
CCDS81 LELLGC
340
>--
initn: 254 init1: 161 opt: 278 Z-score: 344.2 bits: 71.5 E(32554): 7.5e-13
Smith-Waterman score: 278; 29.7% identity (64.6% similar) in 175 aa overlap (54-224:17-187)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 STEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITC
: :: :: .:::.:.:... .::.
CCDS81 MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALECV--EPLGLENGNIANSQIAA
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SNPE-QYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQG--
:. . ..: . :. . :::: :. :: . .:.. :.:..: . ..:..:::
CCDS81 SSVRVTFLG-LQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWVTGVVTQGAS
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RCDIDEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIR
: :.. ..: : . . .. . .: . ... : :: ..... ::.. :. ....:
CCDS81 RLASHEYLKAFKVAYSLNGH-EFDFIHDVNKKHKEFVGNWNKNAVHVNLFETPVEAQYVR
110 120 130 140 150 160
210 220
pF1KB7 LIPLGWHVRIAIRMELLEC-VSKCA
: : . :. ..:.::: : .. ::
CCDS81 LYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWGLHLFSWNPSY
170 180 190 200 210 220
>>CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 (387 aa)
initn: 420 init1: 189 opt: 394 Z-score: 485.3 bits: 97.8 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 394; 39.1% identity (69.9% similar) in 156 aa overlap (68-219:233-387)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYS-SW
:::.... . ::: :. . : . ::
CCDS10 QYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWGLHLFSW
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 TANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDID--EWMTKYSVQ
. . :::..:: ::.. ..::::.:: : ..::.::: .. .....:.:
CCDS10 NPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFVASYKVA
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YRTDERLNWIYYKD-QTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIR
: .: :: :.: .::....: :: : : .::.. ::..:..:..:..:: :::.:
CCDS10 YSNDSA-NWTEYQDPRTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHNRIALR
330 340 350 360 370 380
220
pF1KB7 MELLECVSKCA
.::: :
CCDS10 LELLGC
>--
initn: 253 init1: 161 opt: 279 Z-score: 344.6 bits: 71.8 E(32554): 7.1e-13
Smith-Waterman score: 279; 28.9% identity (62.1% similar) in 190 aa overlap (40-224:55-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPL
: : : :: : .: .::
CCDS10 DICSKNPCHNGGLCEEISQEVRGDVFPSYTCTCLKG-----YAGN---HCETKCV--EPL
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GFESGEVTPDQITCSNPE-QYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLK
:.:.:... .::. :. . ..: . :. . :::: :. :: . .:.. :.:..:
CCDS10 GLENGNIANSQIAASSVRVTFLG-LQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLL
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EIKVISGILTQG--RCDIDEWMTKYSVQYRTD-ERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNSDRTST
. ..:..::: : :.. ..: : . .....:. : . ... : :: .....
CCDS10 RRMWVTGVVTQGASRLASHEYLKAFKVAYSLNGHEFDFIH--DVNKKHKEFVGNWNKNAV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220
pF1KB7 VQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLEC-VSKCA
::.. :. ....:: : . :. ..:.::: : .. ::
CCDS10 HVNLFETPVEAQYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSS
200 210 220 230 240 250
CCDS10 YKTWGLHLFSWNPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFG
260 270 280 290 300 310
>>CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224 aa)
initn: 338 init1: 159 opt: 387 Z-score: 465.2 bits: 96.6 E(32554): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 387; 39.1% identity (71.8% similar) in 156 aa overlap (68-219:2069-2221)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWT
:::.:.:.. ::: :. .. : . :
CCDS12 RYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSW-WGDYWE
2040 2050 2060 2070 2080 2090
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRC---DIDEWMTKYSVQ
.::::.:: :: .: ....:::.::: .:: :..:.::: : . . .. .:...
CCDS12 PFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQG-CKSLSSEMYVKSYTIH
2100 2110 2120 2130 2140 2150
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YRTDERLNWIYYKDQTGN-NRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIR
: ... ..: :. ... ...: ::.. . :.:.. :::::::::.:: :. ::.:
CCDS12 Y-SEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIALR
2160 2170 2180 2190 2200 2210
220
pF1KB7 MELLECVSKCA
.::. :
CCDS12 LELFGCDIY
2220
>--
initn: 210 init1: 119 opt: 289 Z-score: 345.3 bits: 74.4 E(32554): 6.5e-13
Smith-Waterman score: 289; 31.5% identity (60.6% similar) in 165 aa overlap (68-224:1910-2067)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWT
:.:. .: .. .:: : ...:. :
CCDS12 GWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRMPMGLSTGIISDSQIKAS---EFLGY---WE
1880 1890 1900 1910 1920 1930
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ANKARLNSQGFGCAW----LSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDIDE--WMTKY
::::. : :: :. :. :.:.:... .:.:: ::: . . :..
CCDS12 PRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGIQTQGAKHYLKSCYTTEF
1940 1950 1960 1970 1980 1990
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SVQYRTDERLNWIYYKDQTGNNRVFY-GNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRI
: : ... .:: .: .. : ... :::: .. .: . :::..:.::. : . :
CCDS12 YVAYSSNQ-INWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPIVARYIRISPTRAYNRP
2000 2010 2020 2030 2040 2050
220
pF1KB7 AIRMELLEC-VSKCA
..:.:: : :. :.
CCDS12 TLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDYWEPFRARLNAQGRVNAW
2060 2070 2080 2090 2100 2110
>>CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 (775 aa)
initn: 305 init1: 194 opt: 349 Z-score: 425.7 bits: 87.7 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 349; 36.6% identity (63.4% similar) in 172 aa overlap (54-219:281-449)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 STEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITC
.::: . . ::.::: .. :::
CCDS46 GGQISVVISKGIPYYESSLANNVTSVVGHLSTSLFTFKTSGCYGTLGMESGVIADPQITA
260 270 280 290 300 310
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SNPEQYV---GWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQG
:. ... : .:: .::::.. : : . : :::::::.. : :.::.: :
CCDS46 SSVLEWTDHTGQENSWKPKKARLKKPG--PPWAAFATDEYQWLQIDLNKEKKITGIITTG
320 330 340 350 360
150 160 170 180 190
pF1KB7 RCDIDE--WMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQ-TGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISR
... ... : . : .:. .: :.. . ....: ::.: . :.: . ::::.:
CCDS46 STMVEHNYYVSAYRILY-SDDGQKWTVYREPGVEQDKIFQGNKDYHQDVRNNFLPPIIAR
370 380 390 400 410 420
200 210 220
pF1KB7 FIRLIPLGWHVRIAIRMELLECVSKCA
:::. : :. .::..:::: :
CCDS46 FIRVNPTQWQQKIAMKMELLGCQFIPKGRPPKLTQPPPPRNSNDLKNTTAPPKIAKGRAP
430 440 450 460 470 480
>>CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (216 aa)
initn: 396 init1: 254 opt: 338 Z-score: 420.6 bits: 85.0 E(32554): 4.1e-17
Smith-Waterman score: 338; 33.3% identity (66.7% similar) in 153 aa overlap (68-219:61-210)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWT
:::.:: .. ::: :. ... ...:.
CCDS44 RYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASS--YFTNMFATWS
40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQG-RCDIDEWMTKYSVQYR
.::::. :: . :: . .. ..:::.:... ..:. ::: . . ..: .
CCDS44 PSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISS
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMEL
... .: . :.:. .:: ::.: . : : : ::...:..:. : .: .::.:::.
CCDS44 SQDGHQWTLFF-QNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEV
150 160 170 180 190 200
220
pF1KB7 LECVSKCA
: :
CCDS44 LGCEAQDLY
210
>>CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 (470 aa)
initn: 410 init1: 175 opt: 333 Z-score: 409.4 bits: 84.0 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 366; 38.2% identity (66.9% similar) in 157 aa overlap (67-219:311-466)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGW-YSS
.:::..::.. ::: :. . .. . .
CCDS64 AQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFT
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 WTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDID--EWMTKYSV
: ::::..:: :: : .:.:::::.:: ..::.::: :. ... .:..
CCDS64 WEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKL
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 QYRTDERLNWIYYKDQTG-NNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAI
: .: . .: :.:. ...:: :: : . .:.. ::: .: ::..: .:. ::..
CCDS64 AYSNDGE-HWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL
410 420 430 440 450
220
pF1KB7 RMELLECVSKCA
: ::: :
CCDS64 RSELLGCTEEE
460 470
>--
initn: 443 init1: 175 opt: 333 Z-score: 409.4 bits: 84.0 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 333; 31.7% identity (60.8% similar) in 199 aa overlap (38-224:113-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 FLLLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCD-CQGGPNALWSAGATSLDCIPE----
:. . :..: .. : .: :
CCDS64 EAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGR
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110
pF1KB7 -CPYH--KPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDS
: :. :::.:.: .. .::: :. .. . ..: ::::..:. :: . .:
CCDS64 NCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDR
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SQWLQIDLKEIKVISGILTQG--RCDIDEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQ-TGNNRVF
:.::.:.. ..:..::: : :.. .:.. : .: . .: .:: . :... ::
CCDS64 WPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGK-TWAMYKVKGTNEDMVF
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220
pF1KB7 YGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLEC-VSKCA
:: : .. : . ::: ....:: : . . ..::::: : .: :.
CCDS64 RGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQ
270 280 290 300 310 320
CCDS64 DYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGI
330 340 350 360 370 380
>>CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 (480 aa)
initn: 410 init1: 175 opt: 333 Z-score: 409.3 bits: 84.0 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 366; 38.2% identity (66.9% similar) in 157 aa overlap (67-219:321-476)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGW-YSS
.:::..::.. ::: :. . .. . .
CCDS40 AQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFT
300 310 320 330 340 350
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 WTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDID--EWMTKYSV
: ::::..:: :: : .:.:::::.:: ..::.::: :. ... .:..
CCDS40 WEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKL
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 QYRTDERLNWIYYKDQTG-NNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAI
: .: . .: :.:. ...:: :: : . .:.. ::: .: ::..: .:. ::..
CCDS40 AYSNDGE-HWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL
420 430 440 450 460
220
pF1KB7 RMELLECVSKCA
: ::: :
CCDS40 RSELLGCTEEE
470 480
>--
initn: 443 init1: 175 opt: 333 Z-score: 409.3 bits: 84.0 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 333; 31.7% identity (60.8% similar) in 199 aa overlap (38-224:123-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 FLLLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCD-CQGGPNALWSAGATSLDCIPE----
:. . :..: .. : .: :
CCDS40 EAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGR
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110
pF1KB7 -CPYH--KPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDS
: :. :::.:.: .. .::: :. .. . ..: ::::..:. :: . .:
CCDS40 NCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDR
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SQWLQIDLKEIKVISGILTQG--RCDIDEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQ-TGNNRVF
:.::.:.. ..:..::: : :.. .:.. : .: . .: .:: . :... ::
CCDS40 WPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGK-TWAMYKVKGTNEDMVF
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220
pF1KB7 YGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLEC-VSKCA
:: : .. : . ::: ....:: : . . ..::::: : .: :.
CCDS40 RGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQ
280 290 300 310 320 330
CCDS40 DYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGI
340 350 360 370 380 390
>>CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351 aa)
initn: 526 init1: 254 opt: 338 Z-score: 404.9 bits: 85.5 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 338; 33.3% identity (66.7% similar) in 153 aa overlap (68-219:2196-2345)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWT
:::.:: .. ::: :. ... ...:.
CCDS35 RYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASS--YFTNMFATWS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQG-RCDIDEWMTKYSVQYR
.::::. :: . :: . .. ..:::.:... ..:. ::: . . ..: .
CCDS35 PSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSMYVKEFLISS
2230 2240 2250 2260 2270 2280
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMEL
... .: . :.:. .:: ::.: . : : : ::...:..:. : .: .::.:::.
CCDS35 SQDGHQWTLFF-QNGKVKVFQGNQDSFTPVVNSLDPPLLTRYLRIHPQSWVHQIALRMEV
2290 2300 2310 2320 2330 2340
220
pF1KB7 LECVSKCA
: :
CCDS35 LGCEAQDLY
2350
>--
initn: 317 init1: 188 opt: 327 Z-score: 391.4 bits: 83.0 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 327; 32.6% identity (61.6% similar) in 190 aa overlap (39-224:2016-2194)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LLLLLFGYEATLGLSSTEDEGEDPWYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKP
. .: : . :: ..: . . :
CCDS35 KKEEYKMALYNLYPGVFETVEMLPSKAGIWRVECLIGEH--LHAGMSTLFLVYSNKCQTP
1990 2000 2010 2020 2030 2040
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGWYSSWTANKARLNSQGFGCAWLSKFQDSSQWLQIDLK
::. ::.. ::: : : :..:. . :::. .: :: .: . .:...::
CCDS35 LGMASGHIRDFQITAS------GQYGQWAPKLARLHYSGSINAWSTK--EPFSWIKVDLL
2050 2060 2070 2080 2090
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EIKVISGILTQG-RCDIDE-WMTKYSVQYRTDERLNWIYYK-DQTGNNRVFYGNSDRTST
.: :: ::: : .. ..... ..: : . .: :. ..::. ::.:: : ..
CCDS35 APMIIHGIKTQGARQKFSSLYISQFIIMYSLDGK-KWQTYRGNSTGTLMVFFGNVDSSGI
2100 2110 2120 2130 2140 2150
190 200 210 220
pF1KB7 VQNLLRPPIISRFIRLIPLGWHVRIAIRMELLEC-VSKCA
.:.. ::::.:.::: : . .: ..::::. : ...:.
CCDS35 KHNIFNPPIIARYIRLHPTHYSIRSTLRMELMGCDLNSCSMPLGMESKAISDAQITASSY
2160 2170 2180 2190 2200 2210
CCDS35 FTNMFATWSPSKARLHLQGRSNAWRPQVNNPKEWLQVDFQKTMKVTGVTTQGVKSLLTSM
2220 2230 2240 2250 2260 2270
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 274 init1: 149 opt: 311 Z-score: 379.5 bits: 79.1 E(32554): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 312; 33.9% identity (60.7% similar) in 168 aa overlap (63-219:115-274)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 WYQKACKCDCQGGPNALWSAGATSLDCIPECPYHKPLGFESGEVTPDQITCSNPEQYVGW
:: :::.:: .:. ... :. ...
CCDS13 TRPTPLVTAGPLVTPTPAGTLDPAEKQETGCP---PLGLESLRVSDSRLEASSSQSF---
90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB7 YSSWTANKARLNSQG-------FGCAWLSKFQDSSQWLQIDLKEIKVISGILTQGRCDI-
. ...::: :. . :: .. ::.. :.:.: . .::..:::: ..
CCDS13 --GLGPHRGRLNIQSGLEDGDLYDGAWCAEEQDADPWFQVDAGHPTRFSGVITQGRNSVW
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 -DEWMTKYSVQYRTDERLNWIYYKDQTGNNRVFYGNSDRTSTVQNLLRPPIISRFIRLIP
.:.:.:.::. .: : : . ..: . :: .::: . : ::: : ..:::::.:
CCDS13 RYDWVTSYKVQFSNDSRTWWGSRNHSSGMDAVFPANSDPETPVLNLLPEPQVARFIRLLP
200 210 220 230 240 250
210 220
pF1KB7 LGWHVRIA--IRMELLECVSKCA
: : .: :.: :
CCDS13 QTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNYKAMRKLMKQVQEQC
260 270 280 290 300 310
224 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:13:30 2016 done: Fri Nov 4 06:13:30 2016
Total Scan time: 1.900 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]