Result of FASTA (ccds) for pF1KB7197
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7197, 372 aa
  1>>>pF1KB7197 372 - 372 aa - 372 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8033+/-0.000814; mu= 15.0322+/- 0.049
 mean_var=112.9121+/-27.833, 0's: 0 Z-trim(110.3): 326  B-trim: 1295 in 2/49
 Lambda= 0.120699
 statistics sampled from 10891 (11479) to 10891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  2.940

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372) 2482 443.0  2e-124
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389) 1499 271.9 6.8e-73
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392) 1499 271.9 6.9e-73
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397) 1499 271.9 6.9e-73
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400) 1499 271.9   7e-73
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403) 1499 271.9   7e-73
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406) 1499 271.9 7.1e-73
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418) 1499 271.9 7.2e-73
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420) 1499 271.9 7.2e-73
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446) 1499 271.9 7.5e-73
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493) 1499 272.0 8.1e-73
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380) 1395 253.7 1.9e-67
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 319) 1344 244.8 7.9e-65
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 300) 1318 240.2 1.8e-63
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370) 1250 228.5 7.5e-60
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8          ( 291) 1237 226.1   3e-59
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  930 172.8 4.6e-43
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  890 165.8 5.8e-41
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  827 154.8   1e-37
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  806 151.1 1.3e-36
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  806 151.2 1.4e-36
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  800 150.2 3.1e-36
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  796 149.4 4.6e-36
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22         ( 422)  604 116.0   6e-26
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18         ( 349)  579 111.6 1.1e-24
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17         ( 387)  574 110.8 2.1e-24
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  527 102.6 5.7e-22
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6          ( 340)  524 102.0   8e-22
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  524 102.0 8.3e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  524 102.1 8.8e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  524 102.1 8.9e-22
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  522 101.7 1.1e-21
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22         ( 368)  518 101.0 1.7e-21
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  515 100.5 2.4e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  515 100.5 2.5e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  498 97.5 1.9e-20
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19       ( 398)  496 97.2 2.6e-20
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  490 96.1   5e-20
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  490 96.1 5.2e-20
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17         ( 389)  488 95.8 6.8e-20
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1         ( 374)  482 94.8 1.4e-19
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2           ( 407)  482 94.8 1.4e-19
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  480 94.4 1.7e-19
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  478 94.0 2.1e-19
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  477 93.8 2.3e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  473 93.2 3.9e-19
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19          ( 350)  471 92.8 4.9e-19
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  464 91.6 1.2e-18
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2          ( 311)  463 91.4 1.2e-18
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  460 90.9 1.9e-18


>>CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1                 (372 aa)
 initn: 2482 init1: 2482 opt: 2482  Z-score: 2347.4  bits: 443.0 E(32554): 2e-124
Smith-Waterman score: 2482; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-372)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARSASSLALAIAITALYSAVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGANASGPPGARSASSLALAIAITALYSAVC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 AVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSAKYLMETWPFGELL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 CKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 VPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 HLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREATARERVTAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREATARERVTAC
              310       320       330       340       350       360

              370  
pF1KB7 TPSDGPGGGAAA
       ::::::::::::
CCDS32 TPSDGPGGGAAA
              370  

>>CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (389 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1422.1  bits: 271.9 E(32554): 6.8e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

                                    10         20         30       
pF1KB7                      MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
                              :::: :. ..   : .: ::   :.    .: ..  :
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
       :   .. :.  ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
CCDS55 P--TGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
                 70        80        90       100       110        

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
       :::::::::..::: ::::: .::: :.::::::::::::::  ::::::::::::::::
CCDS55 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
      120       130       140       150       160       170        

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
       ::::: .::.::.: :.:.:..:.:.: ::.:. :.:.. : : :  :.:::... ::::
CCDS55 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
      180       190       200       210       220       230        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
       :.:::..:.::::::::::.:::.:::.:::::::::.::::::::::::..:.:::.::
CCDS55 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
      240       250       260       270       280       290        

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB7 HIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPC
       ::.::. .:: : .    .:.  :.::::::.:: ::::::::::::::::::..:    
CCDS55 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
      300       310        320       330       340       350       

       340       350       360       370  
pF1KB7 GRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
       .  . .. .: :. :  .  :: :           
CCDS55 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS   
       360       370       380            

>>CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (392 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1422.1  bits: 271.9 E(32554): 6.9e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

                                    10         20         30       
pF1KB7                      MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
                              :::: :. ..   : .: ::   :.    .: ..  :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
       :   .. :.  ::.: :::: ::.:::.:: :::. ::::::::::::::::::::::::
CCDS47 P--TGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
                 70        80        90       100       110        

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB7 ATSTLPFQSAKYLMETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
       :::::::::..::: ::::: .::: :.::::::::::::::  ::::::::::::::::
CCDS47 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
      120       130       140       150       160       170        

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
       ::::: .::.::.: :.:.:..:.:.: ::.:. :.:.. : : :  :.:::... ::::
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
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>>CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (400 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1421.9  bits: 271.9 E(32554): 7e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

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>>CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (403 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1421.9  bits: 271.9 E(32554): 7e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

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>>CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (406 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1421.9  bits: 271.9 E(32554): 7.1e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

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pF1KB7                      MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
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CCDS47 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
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CCDS47 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
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>>CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (420 aa)
 initn: 1479 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1421.7  bits: 271.9 E(32554): 7.2e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

                                    10         20         30       
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>>CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6               (446 aa)
 initn: 1456 init1: 1258 opt: 1499  Z-score: 1421.4  bits: 271.9 E(32554): 7.5e-73
Smith-Waterman score: 1499; 63.2% identity (81.4% similar) in 361 aa overlap (3-361:24-381)

                                    10         20         30       
pF1KB7                      MEPAPSAGAELQ-PPLFANASDAY-PSACPSAGANASGP
                              :::: :. ..   : .: ::   :.    .: ..  :
CCDS43 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDSLCP
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CCDS43 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
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pF1KB7 DFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYWDTVTKICV
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CCDS43 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
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pF1KB7 FLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGAFVVCWAPI
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CCDS43 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
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pF1KB7 HIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRCFRQLCRKPC
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CCDS43 HIYVIIKALVTIPETTFQTVS-WHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTS
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pF1KB7 GRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA                         
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372 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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