Result of FASTA (omim) for pF1KB7181
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7181, 355 aa
  1>>>pF1KB7181 355 - 355 aa - 355 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9968+/-0.000345; mu= 18.7311+/- 0.021
 mean_var=75.7905+/-15.062, 0's: 0 Z-trim(116.1): 75  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.147322
 statistics sampled from 26876 (26960) to 26876 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time:  7.680

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_110380 (OMIM: 165330,273395) proto-oncogene Wnt ( 355) 2570 555.4 6.7e-158
NP_149122 (OMIM: 606359) protein Wnt-3a precursor  ( 352) 2227 482.5 5.9e-136
XP_011542621 (OMIM: 606359) PREDICTED: protein Wnt ( 446) 2227 482.6  7e-136
NP_110388 (OMIM: 158330,603490,611812) protein Wnt ( 351) 1210 266.4 6.8e-71
XP_011539899 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 373) 1205 265.4 1.5e-70
XP_011539900 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 296) 1161 255.9 8.2e-68
NP_110402 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor  ( 359) 1160 255.8 1.1e-67
NP_116031 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor  ( 359) 1160 255.8 1.1e-67
XP_011528668 (OMIM: 601967) PREDICTED: protein Wnt ( 353) 1145 252.6 9.9e-67
NP_478679 (OMIM: 601967) protein Wnt-7b precursor  ( 349) 1143 252.1 1.3e-66
NP_003382 (OMIM: 147870) protein Wnt-2 precursor [ ( 360) 1142 251.9 1.6e-66
NP_005421 (OMIM: 164820,615220,615221) proto-oncog ( 370) 1136 250.7 3.9e-66
XP_011532388 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_011532390 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_011532389 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_006713387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_011532387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_016862617 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
NP_001243034 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a  ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
XP_011532391 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1130 249.4 9.2e-66
NP_003383 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a iso ( 380) 1130 249.4 9.5e-66
XP_016862616 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 394) 1130 249.4 9.8e-66
NP_004616 (OMIM: 228930,276820,601570) protein Wnt ( 349) 1122 247.7 2.9e-65
NP_078613 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 391) 1119 247.1 4.9e-65
NP_004176 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 372) 1114 246.0 9.9e-65
XP_011532393 (OMIM: 228930,276820,601570) PREDICTE ( 282) 1032 228.5 1.4e-59
NP_001278809 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform ( 299) 1025 227.0 4.2e-59
NP_004617 (OMIM: 603699) protein Wnt-11 precursor  ( 354)  948 210.7   4e-54
XP_005274288 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 354)  948 210.7   4e-54
NP_057171 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 2  ( 355)  847 189.2 1.2e-47
NP_476509 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 1  ( 365)  847 189.3 1.2e-47
NP_490645 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform 3  ( 351)  840 187.7 3.2e-47
NP_001287868 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 369)  840 187.8 3.3e-47
XP_016865314 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 391)  840 187.8 3.5e-47
NP_003384 (OMIM: 601396) protein Wnt-8b precursor  ( 351)  833 186.3   9e-47
NP_001287867 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 386)  831 185.9 1.3e-46
XP_016865313 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 408)  831 185.9 1.4e-46
XP_011543542 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364)  800 179.3 1.2e-44
XP_011543540 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364)  800 179.3 1.2e-44
XP_011543541 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364)  800 179.3 1.2e-44
XP_016873730 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251)  794 177.8 2.2e-44
XP_011543543 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251)  794 177.8 2.2e-44
XP_011541927 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 337)  739 166.3 9.1e-41
XP_011537024 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267)  736 165.5 1.2e-40
XP_016875408 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267)  736 165.5 1.2e-40
NP_003385 (OMIM: 225300,601906,617073) protein Wnt ( 389)  736 165.7 1.6e-40
NP_003387 (OMIM: 602864) protein Wnt-9b isoform 1  ( 357)  726 163.5 6.4e-40
XP_011523480 (OMIM: 602864) PREDICTED: protein Wnt ( 363)  726 163.5 6.5e-40
XP_011510231 (OMIM: 150400,224750,257980,606268) P ( 385)  726 163.6 6.8e-40
NP_079492 (OMIM: 150400,224750,257980,606268) prot ( 417)  726 163.6 7.2e-40


>>NP_110380 (OMIM: 165330,273395) proto-oncogene Wnt-3 p  (355 aa)
 initn: 2570 init1: 2570 opt: 2570  Z-score: 2955.8  bits: 555.4 E(85289): 6.7e-158
Smith-Waterman score: 2570; 100.0% identity (100.0% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-355)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350     
pF1KB7 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
              310       320       330       340       350     

>>NP_149122 (OMIM: 606359) protein Wnt-3a precursor [Hom  (352 aa)
 initn: 2219 init1: 2219 opt: 2227  Z-score: 2561.9  bits: 482.5 E(85289): 5.9e-136
Smith-Waterman score: 2227; 84.2% identity (94.4% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-352)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
       : :  :: .: :: .  ..:..::::::::.: ::.::::::.::.::::::::::::::
NP_149 MAP--LGYFL-LLCSLKQALGSYPIWWSLAVGPQYSSLGSQPILCASIPGLVPKQLRFCR
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
       ::.:::::::::.:.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::
NP_149 NYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
       :::::::::::::::..::::.:.:.: ::.:::::::::: .:: .:::::::::::::
NP_149 AGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQGSPGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRP
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
       :::::::.::::::: .: .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_149 DARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDS
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
       :::::::::::::::::::: .:. :: :::::::::: :::::::::::::::::::::
NP_149 ASEMVVEKHRESRGWVETLRPRYTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350     
pF1KB7 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
       ::.:::::::::::::::::.:.:.:.:::.:.:::::::::::: :.:::::::
NP_149 NVSSHGIDGCDLLCCGRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
       300       310       320       330       340       350  

>>XP_011542621 (OMIM: 606359) PREDICTED: protein Wnt-3a   (446 aa)
 initn: 2219 init1: 2219 opt: 2227  Z-score: 2560.5  bits: 482.6 E(85289): 7e-136
Smith-Waterman score: 2227; 84.2% identity (94.4% similar) in 355 aa overlap (1-355:1-352)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
       : :  :: .: :: .  ..:..::::::::.: ::.::::::.::.::::::::::::::
XP_011 MAP--LGYFL-LLCSLKQALGSYPIWWSLAVGPQYSSLGSQPILCASIPGLVPKQLRFCR
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
       ::.:::::::::.:.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::
XP_011 NYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRP
       :::::::::::::::..::::.:.:.: ::.:::::::::: .:: .:::::::::::::
XP_011 AGVAFAVTRSCAEGTAAICGCSSRHQGSPGKGWKWGGCSEDIEFGGMVSREFADARENRP
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 DARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDS
       :::::::.::::::: .: .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_011 DARSAMNRHNNEAGRQAIASHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWSQPDFRAIGDFLKDKYDS
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
       :::::::::::::::::::: .:. :: :::::::::: :::::::::::::::::::::
XP_011 ASEMVVEKHRESRGWVETLRPRYTYFKVPTERDLVYYEASPNFCEPNPETGSFGTRDRTC
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350          
pF1KB7 NVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK     
       ::.:::::::::::::::::.:.:.:.:::.:.:::::::::::: :.:::::::     
XP_011 NVSSHGIDGCDLLCCGRGHNARAERRREKCRCVFHWCCYVSCQECTRVYDVHTCKPCHSW
       300       310       320       330       340       350       

XP_011 ATGREGRRRWSTLGCGPRDGCLRTGHSGPCRSLAWIWSPGSQGHDLLEQLPRSGGLGQCS
       360       370       380       390       400       410       

>>NP_110388 (OMIM: 158330,603490,611812) protein Wnt-4 p  (351 aa)
 initn: 1209 init1: 425 opt: 1210  Z-score: 1393.7  bits: 266.4 E(85289): 6.8e-71
Smith-Waterman score: 1210; 50.7% identity (74.6% similar) in 335 aa overlap (26-355:25-351)

               10        20        30        40          50        
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGS--QPLLCGSIPGLVPKQLRF
                                :  ::   . .:.::  .   : .. ::. .:...
NP_110  MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLA---KLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQM
                10        20           30        40        50      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 CRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAI
       :.  .:.: :: .:..:.:.:::.:::.:::::.:.: :: .:: :. ..:::.:::.::
NP_110 CKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLD-SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAI
         60        70        80        90        100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 ASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADAREN
       .::::::::::.:. :    ::::   .:   .:..:.:::..  .::  :. :.:.:: 
NP_110 SSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER
         120       130       140       150       160       170     

      180          190       200       210       220       230     
pF1KB7 RPDA---RSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLK
          :   :. :: ::::::: .:: ::...:::::.:::::::::: : : :: .:  ::
NP_110 SKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALK
         180       190       200       210       220       230     

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB7 DKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGT
       .:.:.:.:  :: .:   :  ..:  . . ::: :..:::: : ::.::: . ..: .::
NP_110 EKFDGATE--VEPRRV--GSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGT
         240           250       260       270       280       290 

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB7 RDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
       : :::: ::..::::.::::::: .:   .  :.: : :::::.:.:..: :. ..:::.
NP_110 RGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
             300       310       320       330       340       350 

>>XP_011539899 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTED: p  (373 aa)
 initn: 1209 init1: 425 opt: 1205  Z-score: 1387.6  bits: 265.4 E(85289): 1.5e-70
Smith-Waterman score: 1205; 51.1% identity (75.5% similar) in 327 aa overlap (34-355:52-373)

            10        20        30        40          50        60 
pF1KB7 HLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGS--QPLLCGSIPGLVPKQLRFCRN
                                     . .:.::  .   : .. ::. .:...:. 
XP_011 GKRNKRLPRTLPNQRGYEGEDTGHIPRYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKR
              30        40        50        60        70        80 

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB7 YIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASA
        .:.: :: .:..:.:.:::.:::.:::::.:.: :: .:: :. ..:::.:::.::.::
XP_011 NLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLD-SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSA
              90       100       110        120       130       140

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 GVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPD
       ::::::::.:. :    ::::   .:   .:..:.:::..  .::  :. :.:.::    
XP_011 GVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKG
              150       160       170       180       190       200

                190       200       210       220       230        
pF1KB7 A---RSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKY
       :   :. :: ::::::: .:: ::...:::::.:::::::::: : : :: .:  ::.:.
XP_011 ASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKF
              210       220       230       240       250       260

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 DSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDR
       :.:.:  :: .:   :  ..:  . . ::: :..:::: : ::.::: . ..: .::: :
XP_011 DGATE--VEPRRV--GSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGR
                270         280       290       300       310      

      300       310       320       330       340       350     
pF1KB7 TCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
       ::: ::..::::.::::::: .:   .  :.: : :::::.:.:..: :. ..:::.
XP_011 TCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
        320       330       340       350       360       370   

>>XP_011539900 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTED: p  (296 aa)
 initn: 1170 init1: 425 opt: 1161  Z-score: 1338.4  bits: 255.9 E(85289): 8.2e-68
Smith-Waterman score: 1161; 53.3% identity (76.3% similar) in 300 aa overlap (59-355:2-296)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB7 LALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRR
                                     :.  .:.: :: .:..:.:.:::.:::.::
XP_011                              MCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRR
                                            10        20        30 

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB7 WNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKGP
       :::.:.: :: .:: :. ..:::.:::.::.::::::::::.:. :    ::::   .: 
XP_011 WNCSTLD-SLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGV
               40        50        60        70        80        90

      150       160       170       180          190       200     
pF1KB7 PGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDA---RSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLK
         .:..:.:::..  .::  :. :.:.::    :   :. :: ::::::: .:: ::...
XP_011 SPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVE
              100       110       120       130       140       150

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB7 CKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSL
       :::::.:::::::::: : : :: .:  ::.:.:.:.:  :: .:   :  ..:  . . 
XP_011 CKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATE--VEPRR--VGSSRALVPRNAQ
              160       170       180         190         200      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB7 FKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEK
       ::: :..:::: : ::.::: . ..: .::: :::: ::..::::.::::::: .:   .
XP_011 FKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVE
        210       220       230       240       250       260      

         330       340       350     
pF1KB7 RKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
         :.: : :::::.:.:..: :. ..:::.
XP_011 LAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
        270       280       290      

>>NP_110402 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor [Hom  (359 aa)
 initn: 972 init1: 407 opt: 1160  Z-score: 1336.1  bits: 255.8 E(85289): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1160; 44.6% identity (69.8% similar) in 368 aa overlap (3-355:2-359)

               10         20        30            40        50     
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGG-TRVLAGYPIWWSLALGQ----QYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQ
         : :: :. . ::.. ...:.    ::::::.     ..  .:.::. :...::: : :
NP_110  MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPV-CSQLPGLSPGQ
                10        20        30        40         50        

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB7 LRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFV
        ..:. : : :  ..::.: ::.::::::: :::::.: :.. ..:: :.. ..::.::.
NP_110 RKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNA-SVFGRVMQIGSRETAFT
       60        70        80        90       100        110       

         120       130       140         150       160       170   
pF1KB7 HAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCD--SHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFA
       ::...:::. :..:.: ::  . :::.  .. :  : . : ::::......:   ..::.
NP_110 HAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLP-RDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFV
       120       130       140       150        160       170      

           180               190       200       210       220     
pF1KB7 DARENRPD--------ARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQP
       :::: . .        .:  :: .:::::: ..     . :::::.:::: .::::    
NP_110 DAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLA
        180       190       200       210       220       230      

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB7 DFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCE
       .:: .:: ::.:::::. : : .    .: .: . ..   :  :: .:::: . ::..: 
NP_110 EFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTR----KGRLELVNSR---FTQPTPEDLVYVDPSPDYCL
        240       250           260          270       280         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB7 PNPETGSFGTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQEC
        :  :::.::. : :: ::.:.:::.:.:::::.:     . :.::: :::::.: :..:
NP_110 RNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKC
     290       300       310       320       330       340         

         350     
pF1KB7 IRIYDVHTCK
        .: : . ::
NP_110 TEIVDQYICK
     350         

>>NP_116031 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor [Hom  (359 aa)
 initn: 972 init1: 407 opt: 1160  Z-score: 1336.1  bits: 255.8 E(85289): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1160; 44.6% identity (69.8% similar) in 368 aa overlap (3-355:2-359)

               10         20        30            40        50     
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGG-TRVLAGYPIWWSLALGQ----QYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQ
         : :: :. . ::.. ...:.    ::::::.     ..  .:.::. :...::: : :
NP_116  MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPV-CSQLPGLSPGQ
                10        20        30        40         50        

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB7 LRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFV
        ..:. : : :  ..::.: ::.::::::: :::::.: :.. ..:: :.. ..::.::.
NP_116 RKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNA-SVFGRVMQIGSRETAFT
       60        70        80        90       100        110       

         120       130       140         150       160       170   
pF1KB7 HAIASAGVAFAVTRSCAEGTSTICGCD--SHHKGPPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFA
       ::...:::. :..:.: ::  . :::.  .. :  : . : ::::......:   ..::.
NP_116 HAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLP-RDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFV
       120       130       140       150        160       170      

           180               190       200       210       220     
pF1KB7 DARENRPD--------ARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQP
       :::: . .        .:  :: .:::::: ..     . :::::.:::: .::::    
NP_116 DAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLA
        180       190       200       210       220       230      

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB7 DFRAIGDFLKDKYDSASEMVVEKHRESRGWVETLRAKYSLFKPPTERDLVYYENSPNFCE
       .:: .:: ::.:::::. : : .    .: .: . ..   :  :: .:::: . ::..: 
NP_116 EFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTR----KGRLELVNSR---FTQPTPEDLVYVDPSPDYCL
        240       250           260          270       280         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB7 PNPETGSFGTRDRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQEC
        :  :::.::. : :: ::.:.:::.:.:::::.:     . :.::: :::::.: :..:
NP_116 RNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKC
     290       300       310       320       330       340         

         350     
pF1KB7 IRIYDVHTCK
        .: : . ::
NP_116 TEIVDQYICK
     350         

>>XP_011528668 (OMIM: 601967) PREDICTED: protein Wnt-7b   (353 aa)
 initn: 983 init1: 802 opt: 1145  Z-score: 1319.0  bits: 252.6 E(85289): 9.9e-67
Smith-Waterman score: 1145; 48.6% identity (74.3% similar) in 331 aa overlap (29-355:28-353)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCR
                                   :::..  ..::.. ..:..::::.:.:  .:.
XP_011  MLLLSPRSALVSVYCPQIFLLLSSGSYLALSS-VVALGAN-IICNKIPGLAPRQRAICQ
                10        20        30          40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 NYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIAS
       .  . .  ..::...::.:::.:::  ::::... .. ..::  :  ..::.::..::..
XP_011 SRPDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEK-TVFGQELRVGSREAAFTYAITA
        60        70        80        90        100       110      

              130       140         150       160       170        
pF1KB7 AGVAFAVTRSCAEGTSTICGCDSHHKG--PPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADAREN
       :::: ::: .:..:. . :::: ...:    .::::::::: :. .:.  ::.:.:::: 
XP_011 AGVAHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREI
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 RPDARSAMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKY
       . .::  :: ::::::: .. :.:.:.:::::.:::: .:::: . : :: .: .::.::
XP_011 KKNARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKY
        180       190       200       210       220       230      

      240       250        260        270       280       290      
pF1KB7 DSASEMVVEKHRESRGWVET-LRAKY-SLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTR
       ..: .  ::  : ::    : :: :    .. : : :::: :.:::.:: .  ::: ::.
XP_011 NAAVQ--VEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQ
        240         250       260       270       280       290    

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pF1KB7 DRTCNVTSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
        : :: :: : :::: .:::::.::.   .  .:.: :::::.:.:. : .  .: :::
XP_011 GRLCNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
          300       310       320       330       340       350   

>>NP_478679 (OMIM: 601967) protein Wnt-7b precursor [Hom  (349 aa)
 initn: 983 init1: 802 opt: 1143  Z-score: 1316.8  bits: 252.1 E(85289): 1.3e-66
Smith-Waterman score: 1143; 48.9% identity (74.3% similar) in 323 aa overlap (37-355:31-349)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB7 GLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIM
                                     .::.. ..:..::::.:.:  .:..  . .
NP_478 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGAN-IICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAI
               10        20        30         40        50         

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB7 PSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFA
         ..::...::.:::.:::  ::::... .. ..::  :  ..::.::..::..:::: :
NP_478 IVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEK-TVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHA
      60        70        80        90        100       110        

        130       140         150       160       170       180    
pF1KB7 VTRSCAEGTSTICGCDSHHKG--PPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARS
       :: .:..:. . :::: ...:    .::::::::: :. .:.  ::.:.:::: . .:: 
NP_478 VTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARR
      120       130       140       150       160       170        

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB7 AMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEM
        :: ::::::: .. :.:.:.:::::.:::: .:::: . : :: .: .::.::..: . 
NP_478 LMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQ-
      180       190       200       210       220       230        

          250        260        270       280       290       300  
pF1KB7 VVEKHRESRGWVET-LRAKY-SLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNV
        ::  : ::    : :: :    .. : : :::: :.:::.:: .  ::: ::. : :: 
NP_478 -VEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNR
        240       250       260       270       280       290      

            310       320       330       340       350     
pF1KB7 TSHGIDGCDLLCCGRGHNTRTEKRKEKCHCIFHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
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NP_478 TSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
        300       310       320       330       340         




355 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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