Result of FASTA (ccds) for pF1KB7166
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7166, 396 aa
  1>>>pF1KB7166 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6148+/-0.000793; mu= 16.8151+/- 0.048
 mean_var=86.0552+/-16.614, 0's: 0 Z-trim(109.4): 24  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.138257
 statistics sampled from 10865 (10886) to 10865 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.334), width:  16
 Scan time:  2.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396) 2689 546.0 2.3e-155
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  663 141.9 1.1e-33
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  464 102.2 9.6e-22
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  462 101.8 1.3e-21
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  449 99.1 6.6e-21
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  438 96.9 2.8e-20
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  438 97.1 4.2e-20
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  432 95.9 9.2e-20
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  416 92.5 5.8e-19
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  405 90.4   3e-18
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  388 86.9 2.5e-17
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  386 86.5 3.3e-17
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  384 86.1 4.5e-17
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  377 84.6 9.7e-17
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266)  374 84.1 1.7e-16
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  369 83.1 3.3e-16
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  354 80.0 2.3e-15
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273)  343 77.9 1.2e-14
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270)  342 77.7 1.4e-14
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10         ( 370)  327 74.8 1.4e-13


>>CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17              (396 aa)
 initn: 2689 init1: 2689 opt: 2689  Z-score: 2902.9  bits: 546.0 E(32554): 2.3e-155
Smith-Waterman score: 2689; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-396)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 ENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAMR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 WKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 LCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQIQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 YTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390      
pF1KB7 NPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI
              370       380       390      

>>CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1                (439 aa)
 initn: 1211 init1: 631 opt: 663  Z-score: 718.3  bits: 141.9 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1174; 46.5% identity (68.8% similar) in 432 aa overlap (1-386:4-431)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQ
          ::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::.:: :::.::.:::.:
CCDS15 MTNMSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKVWLTVLVVFRIVLTAVGGEAIYSDEQAKFTCNTRQ
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 PGCENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPY
       :::.::::::::::::::::::::....::::::::::.:..:.  . :  ..: : .: 
CCDS15 PGCDNVCYDAFAPLSHVRFWVFQIVVISTPSVMYLGYAVHRLARASEQER-RRALRRRPG
               70        80        90       100       110          

       120             130       140        150                    
pF1KB7 AMRWKQ------HRALEETEEDNEEDPMM-YPEMELESDK--------------------
         :  .      : .  :  . .::.::.   : : : .                     
CCDS15 PRRAPRAHLPPPHAGWPEPADLGEEEPMLGLGEEEEEEETGAAEGAGEEAEEAGAEEACT
     120       130       140       150       160       170         

                   160         170       180       190       200   
pF1KB7 -----ENKEQSQPKP--KHDGRRRIREDGLMKIYVLQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQV
            ..:  . : :  .:::::::...:::..:: ::.::..:::.::.:::.::::.:
CCDS15 KAVGADGKAAGTPGPTGQHDGRRRIQREGLMRVYVAQLVARAAFEVAFLVGQYLLYGFEV
     180       190       200       210       220       230         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB7 HPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLN
       .::. ::: :::: .:::.:::::::.:::.:: :. ::::::. :: :::.:. .:.. 
CCDS15 RPFFPCSRQPCPHVVDCFVSRPTEKTVFLLVMYVVSCLCLLLNLCEMAHLGLGSAQDAVR
     240       250       260       270       280       290         

           270        280             290          300       310   
pF1KB7 SKRRELED-PGAYNYPFTWNTPSA------PPGYNIAVKPDQ---IQYTELSNAKIAYKQ
       ..:    . :.    :     :.:      :: :...:.  .    .  .:.:  .   .
CCDS15 GRRGPPASAPAPAPRPPPCAFPAAAAGLACPPDYSLVVRAAERARAHDQNLANLALQALR
     300       310       320       330       340       350         

           320       330       340       350         360       370 
pF1KB7 NKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYS--HQNNPHGPREKKAK
       . : ...... .:   .:::  ..  :    :. :   :..: .  .:. : : .:. . 
CCDS15 DGAAAGDRDRDSSPCVGLPAASRGPPRAGAPAS-RTGSATSAGTVGEQGRP-GTHERPG-
     360       370       380       390        400        410       

             380       390      
pF1KB7 VGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI
       .  .:::.:..:::.          
CCDS15 AKPRAGSEKGSASSRDGKTTVWI  
        420       430           

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 817 init1: 454 opt: 464  Z-score: 503.9  bits: 102.2 E(32554): 9.6e-22
Smith-Waterman score: 799; 44.6% identity (72.3% similar) in 271 aa overlap (3-272:4-243)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          ::::  .:::...::: .:..:::::..:::.. ....: .. :::: :::::.:::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       :::::::   :.::.:.::.:::.:.:::.::.:.:.: . .::    .:. .:      
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYV-RME----EKRKSR------
               70        80        90       100                    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIYV
               :  :  ..      :..        :..:  :    : ...: .: :.. :.
CCDS30 --------EAEELGQQAGTNGGPDQ-----GSVKKSSGSK----GTKKFRLEGTLLRTYI
             110       120            130           140       150  

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 LQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGV
        ... .:.:::::..:.::::::.. :.: ::: :::. .:::.:::::::::.:.: .:
CCDS30 CHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSV
            160       170       180       190       200       210  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 TGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQ
       ... :.::. :. :::.  ::..:   .: .:.:                          
CCDS30 ASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSAL---KRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLL
            220       230          240       250       260         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB7 IQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYSH
                                                                   
CCDS30 EEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQFEEKISTGPLGDLSRGYQETLPSYAQVGAQ
     270       280       290       300       310       320         

>>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13                (435 aa)
 initn: 823 init1: 443 opt: 462  Z-score: 501.7  bits: 101.8 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 834; 38.2% identity (64.3% similar) in 398 aa overlap (3-376:4-359)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          :::: ::::. ..::: .::.:::::..:::.. ....:... :::: :.:::.:::
CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       :::::::   :.::.:::..:::.:.::...:::...: :..::    .::  :      
CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLH-IVRME----EKKKER------
               70        80        90        100                   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIYV
               :: :. ..:.:         : ::   :..:. . : : :.:  : :.. ::
CCDS92 --------EEEEQLKRESP---------SPKE-PPQDNPSSRDD-RGRVRMAGALLRTYV
             110       120                 130        140       150

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 LQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGV
       .... .:.:::::. ::::::::...:.: :.: :::. .:::::::::::::...: .:
CCDS92 FNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFELKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAV
              160       170       180       190       200       210

      240       250       260       270       280             290  
pF1KB7 TGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTP------SAPPGYNI
       .   ::::. :. :::.  ......:.      : : . :.    :      : ::.  :
CCDS92 ACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGVTSRL----GPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAI
              220       230           240       250       260      

            300                        310       320       330     
pF1KB7 AVKPDQIQYTE-LSNAK----------------IAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADL
       .  :   . .  :..:.                .:  . ...  . . :..:.. : .. 
CCDS92 GFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADFKLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTE-
        270       280       290       300       310       320      

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB7 EALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVW
          :    .: ::   :..::   ..: .:    . :::..                   
CCDS92 ---QNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAP----SPVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGS
            330       340       350           360       370        

                                                                
pF1KB7 I                                                        
                                                                
CCDS92 GSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLGDPGRASKASRASSGRARPEDLAI
      380       390       400       410       420       430     

>>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1                  (358 aa)
 initn: 759 init1: 436 opt: 449  Z-score: 488.8  bits: 99.1 E(32554): 6.6e-21
Smith-Waterman score: 779; 36.0% identity (64.5% similar) in 386 aa overlap (3-379:4-354)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          ::::  .:::.:.::: :::.:::::..::... ....:: . :::. : :.: :::
CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       :.:::::   :.::.:.::.:::.:.:::..:.:.:.: . .:.. .  ..: :.:    
CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTV-RMQEKRKLREAERAK----
               70        80        90       100        110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIYV
               :     . : :.              :... .  ..:  ::  .: :.. ::
CCDS92 --------EVRGSGSYEYPVA-------------EKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYV
                 120                    130       140       150    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 LQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGV
        ..: ::..::::..::::.::. .  ..:: : :::: ..:..::::::..:...: .:
CCDS92 CSILIRTTMEVGFIVGQYFIYGIFLTTLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAV
          160       170       180       190       200       210    

      240       250       260       270          280       290     
pF1KB7 TGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELED---PGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVK
       ..: :::.. :. :::.  ::. . . :...      :         ::  :: .:  ..
CCDS92 AALSLLLSLAELYHLGWKKIRQRFVKPRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTP--PPDFNQCLE
          220       230       240       250       260         270  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB7 --PDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAV
         :    .. .:: ..: .::  : . ::  :  .:. :..      ..:..: . ..  
CCDS92 NGPGGKFFNPFSN-NMASQQNTDNLVTEQVRG--QEQTPGEGFI---QVRYGQ-KPEVPN
            280        290       300         310           320     

           360          370       380       390      
pF1KB7 QAYSHQNNPHG---PREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI
        .   .  :::    ... .:..::: :.                 
CCDS92 GVSPGHRLPHGYHSDKRRLSKASSKARSDDLSV             
         330       340       350                     

>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 796 init1: 433 opt: 438  Z-score: 477.4  bits: 96.9 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 751; 38.0% identity (66.5% similar) in 334 aa overlap (3-334:4-310)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          :.:: .::.....::: :::::::::..:::.. ...:::.. :::: : ::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       : :::::   :.::.:.::.:...:.::...:::..:. ... :.   .:..        
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIY-LSRREERLRQKEG--------
               70        80        90        100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVL
          . :::          :   :..:      ...... .  .::: :::  .::  :: 
CCDS30 ---ELRAL----------PAKDPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIR-GALMGTYVA
                          120       130       140        150       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 QLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVT
       ..: ..:.:.::: ::. :::. ..: .::.: :::. .:::.:::::::::...:  : 
CCDS30 SVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVG
       160       170       180       190       200       210       

     240       250       260       270         280       290       
pF1KB7 GLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDP--GAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPD
        . :.::. :..::    .  .. ... .   :  :. . :.: ..    :  .   .: 
CCDS30 LISLVLNLLELVHLLCRCLSRGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPP
       220       230       240       250       260       270       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB7 QIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYS
          :. ::...    :: :: . :.. .: .  :  :                       
CCDS30 CPTYNGLSSSE----QNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV
       280           290       300       310       320       330   

       360       370       380       390      
pF1KB7 HQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI

>>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6               (543 aa)
 initn: 800 init1: 416 opt: 438  Z-score: 474.5  bits: 97.1 E(32554): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 807; 36.8% identity (66.1% similar) in 389 aa overlap (3-385:4-357)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          :..:  .:::.:.:::.:::::::.:..::...  :..:... :::: :.:::.:::
CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       :.:.:::   :.: .::::.:::.:..::..:.:.:....  .:.   :..         
CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEK---DRQ---------
               70        80        90       100                    

     120        130       140       150       160       170        
pF1KB7 RWKQH-RALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIY
       : :.: ::       . :.: .  : . . :.: ..  . :  :    ..   : :.. :
CCDS50 RKKSHLRA-------QMENPDLDLEEQQRIDRELRRLEEQKRIH----KVPLKGCLLRTY
      110              120       130       140           150       

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 VLQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYG
       ::..:.:.:.::::.::::.:::::.::.: :.. :::. .:::.:::::::::.:.:..
CCDS50 VLHILTRSVLEVGFMIGQYILYGFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHS
       160       170       180       190       200       210       

       240       250       260         270       280       290     
pF1KB7 VTGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRE--LEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVK
       .... ::::: :..:::.  :  .: .:     .::  .   ::  .  :.     :  .
CCDS50 IAAISLLLNILEIFHLGIRKIMRTLYKKSSSEGIEDETGP--PFHLKKYSVAQQCMICSS
       220       230       240       250         260       270     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB7 -PDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQ
        :..:.  . .: . . . :  ..    :       .:   .  : :.  .. . : . .
CCDS50 LPERISPLQANNQQQVIRVNVPKSKTMWQ-------IP---QPRQLEVDPSNGKKDWSEK
         280       290       300                 310       320     

           360       370       380       390                       
pF1KB7 -AYSHQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI                 
         .: : . :.:    ...:..  ...:  ::                            
CCDS50 DQHSGQLHVHSPCPWAGSAGNQHLGQQSDHSSFGLQNTMSQSWLGTTTAPRNCPSFAVGT
         330       340       350       360       370       380     

CCDS50 WEQSQDPEPSGEPLTDLHSHCRDSEGSMRESGVWIDRSRPGSRKASFLSRLLSEKRHLHS
         390       400       410       420       430       440     

>>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1                 (515 aa)
 initn: 759 init1: 415 opt: 432  Z-score: 468.3  bits: 95.9 E(32554): 9.2e-20
Smith-Waterman score: 765; 33.2% identity (64.0% similar) in 397 aa overlap (3-393:4-378)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG
          :..:   :::.: :::..::::::.:..::... .:..:... :::: :.:::::::
CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM
       :.:::::   :.: .:.::.:.:.:..::..:.:.:....  .:.        :..   :
CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEE-------ERQR---M
               70        80        90       100                 110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVL
       . . .  :::.:           ::  .  . ..:  : . .. ..  .:   :.  ::.
CCDS43 KAQLRVELEEVEF----------EMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLR-GTLLCTYVI
              120                 130       140       150          

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 QLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVT
       ....:.: ::::.::::.::::...:.. :   :::. ::::.:::::::::::.: ...
CCDS43 HIFTRSVVEVGFMIGQYLLYGFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIA
     160       170       180       190       200       210         

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         ::    .: ..   .: . ..... . .  .:  :    .   :. . ...:   :..
CCDS43 SAPDYNLLVEKQTHTAVYPSLNSSSVFQPNPDNHSVNDEKCILDEQETV-LSNEISTLST
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CCDS43 SCSHFQHISSNNNKDTHKIFGKELNGNQLMEKRETEGKDSKRNYYSRGHRSIPGVAIDGE
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CCDS43 NNMRQSPQTVFSLPANCDWKPRWLRATWGSSTEHENRGSPPKGNLKGQFRKGTVRTLPPS
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CCDS10 PESIGGPGGTGGGGSGGGKREDKKLQNAIVNGVLQNTENTSKETEPDCLEVKELTPHPSG
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CCDS10 LRTASKSKLRRQEGISRFYIIQVVFRNALEIGFLVGQYFLYGFSVPGLYECNRYPCIKEV
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       .:..:::::::.::..:..:.:.:..::. :. :::.  :. ..   ..::. . .    
CCDS10 ECYVSRPTEKTVFLVFMFAVSGICVVLNLAELNHLGWRKIKLAVRGAQAKRKSIYEIRNK
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CCDS10 DLPRVSVPNFGRTQSSDSAYV                                       
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>>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6                 (382 aa)
 initn: 766 init1: 396 opt: 405  Z-score: 441.0  bits: 90.4 E(32554): 3e-18
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CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
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CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLN-------------
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CCDS51 --KKEEELKVAQTDGVNVDMHLKQIEIKKFKYGIEE------H-GKVKMR-GGLLRTYII
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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