Result of FASTA (ccds) for pF1KB7156
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7156, 359 aa
  1>>>pF1KB7156 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1138+/-0.00111; mu= 11.4897+/- 0.066
 mean_var=128.7463+/-43.139, 0's: 0 Z-trim(104.0): 334  B-trim: 1036 in 2/46
 Lambda= 0.113033
 statistics sampled from 7040 (7701) to 7040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.237), width:  16
 Scan time:  2.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359) 2369 398.5 4.7e-111
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388) 2369 398.5  5e-111
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394) 2369 398.5  5e-111
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  759 135.9 5.1e-32
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  689 124.5 1.4e-28
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  689 124.5 1.4e-28
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  658 119.4 4.6e-27
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11           ( 380)  652 118.5 9.5e-27
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  645 117.3   2e-26
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  632 115.2   9e-26
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  624 113.9 2.2e-25
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  614 112.3 6.8e-25
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  614 112.3 7.4e-25
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  612 111.9 8.3e-25
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  611 111.8 9.6e-25
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  611 111.8 9.7e-25
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  609 111.5 1.2e-24
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14          ( 391)  605 110.8   2e-24
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  597 109.5 4.8e-24
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  596 109.3 5.1e-24
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  592 108.7 7.9e-24
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  592 108.7   8e-24
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  592 108.7   8e-24
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  592 108.7 8.3e-24
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  584 107.4 2.1e-23
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  580 106.7   3e-23
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  573 105.6 7.3e-23
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  572 105.4 7.7e-23
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  570 105.1 9.7e-23
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  568 104.8 1.2e-22
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  565 104.4 1.9e-22
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  561 103.7 2.9e-22
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  560 103.5 3.3e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  560 103.6 3.5e-22
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  559 103.4 3.6e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  559 103.4 4.2e-22
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  556 102.9   5e-22
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  556 102.9   5e-22
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  556 102.9   5e-22
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  556 102.9 5.1e-22
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  556 102.9 5.2e-22
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3           ( 360)  555 102.7 5.3e-22
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  555 102.7 5.4e-22
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  548 101.5 1.2e-21
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  538 99.9 3.5e-21
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19          ( 351)  530 98.6 8.7e-21
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19          ( 353)  526 97.9 1.4e-20
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  525 97.8 1.6e-20
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19          ( 350)  524 97.6 1.7e-20
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361)  524 97.6 1.8e-20


>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                 (359 aa)
 initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369  Z-score: 2107.3  bits: 398.5 E(32554): 4.7e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350         
pF1KB7 FYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
              310       320       330       340       350         

>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                (388 aa)
 initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369  Z-score: 2106.8  bits: 398.5 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:30-388)

                                            10        20        30 
pF1KB7                              MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMI
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLTFTSECGCTTFGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMI
               10        20        30        40        50        60

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB7 PTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAME
               70        80        90       100       110       120

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB7 YRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCII
              130       140       150       160       170       180

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB7 IWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLII
              190       200       210       220       230       240

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB7 LTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGII
              250       260       270       280       290       300

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB7 RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLS
              310       320       330       340       350       360

             340       350         
pF1KB7 TKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
              370       380        

>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                (394 aa)
 initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369  Z-score: 2106.8  bits: 398.5 E(32554): 5e-111
Smith-Waterman score: 2369; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:36-394)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HKSTDSPKAPQLRGGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVM
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 IPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAM
          70        80        90       100       110       120     

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 EYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCI
         130       140       150       160       170       180     

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 IIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLI
         190       200       210       220       230       240     

              220       230       240       250       260       270
pF1KB7 ILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI
         250       260       270       280       290       300     

              280       290       300       310       320       330
pF1KB7 IRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNL
         310       320       330       340       350       360     

              340       350         
pF1KB7 STKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
         370       380       390    

>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX                (363 aa)
 initn: 723 init1: 627 opt: 759  Z-score: 688.3  bits: 135.9 E(32554): 5.1e-32
Smith-Waterman score: 759; 36.5% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (31-337:47-355)

               10        20        30        40        50          
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKL-
                                     :: :: ::::.:.. : .::....  .:  
CCDS14 GLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAIPILYYIIFVIGFLVN-IVVVTLFCCQKGP
         20        30        40        50        60         70     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 KTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
       : :.:....:::.::: .: ::::::.: ...: : ::  .::. .. ...:..::.:..
CCDS14 KKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSFLTLNMFASIFFI
          80        90       100       110       120       130     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
       ::.:.::: ....:. :. ::.   :.    ..: .: :.:::..  :.:  ::  ....
CCDS14 TCMSVDRYQSVIYPFLSQ-RRNPWQASYIVPLVWCMACLSSLPTFYFRDVRTIEYLGVNA
         140       150        160       170       180       190    

     180        190       200       210       220       230        
pF1KB7 CAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDI
       : . .  .. .    :..: ::::::..:...: : :  : : : :.    ::.   :..
CCDS14 CIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLLKTNSYGKNRITRDQV
          200       210       220       230       240       250    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 FKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLN
       .:.  :.:: :.. :.: ...::::.:  .:.: .:..  ..: :.:..: ... :.:.:
CCDS14 LKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVIDLALPFAILLGFTNSCVN
          260       270       280       290       300       310    

      300       310       320          330       340       350     
pF1KB7 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPP---KAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPC
       :..: :.:..:.. . .... .:    ..: .:    : :.:                  
CCDS14 PFLYCFVGNRFQQKLRSVFR-VPITWLQGKRESMSCRKSSSLREMETFVS          
          320       330        340       350       360             

           
pF1KB7 FEVE

>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (357 aa)
 initn: 467 init1: 264 opt: 689  Z-score: 626.7  bits: 124.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (70.6% similar) in 320 aa overlap (5-318:11-321)

                     10          20        30        40        50  
pF1KB7       MILNSSTEDGIKRIQDD--CPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIV
                 :: :: ..    :  : : . ...   ..: :: ..:.:: .:::::..:
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGNSLVILV
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 IYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNL
        ..  ..::....::::::.::: ::.:::.::. .: .  : : ...::....  ..:.
CCDS27 YWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQ--WKFQTFMCKVVNSMYKMNF
               70        80        90         100       110        

            120       130       140         150       160       170
pF1KB7 YASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRT--MLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVF
       :. :.:. :.:.:::.::.. :...  :   .: .:..:. ::.::.   .: :.. .. 
CCDS27 YSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILYSQI-
      120       130       140       150       160       170        

              180       190        200       210       220         
pF1KB7 FIENTNITVCAFHYESQNST-LPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQ
         :...:..:.. : :..:: :  ..   : ::::..::...   ::.: ..:     ::
CCDS27 -KEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTL-----IQ
        180       190       200       210       220            230 

     230       240       250       260       270        280        
pF1KB7 KNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI-IRDCRIADIVDTAMPITI
        .:  .   .:. ....  : .: .:.. . .....   .. : .: ..  .:  . .: 
CCDS27 AKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQ
             240       250       260       270       280       290 

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 CIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSS
        ::.:..::::..: :.:..:.: ... ::                              
CCDS27 TIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETT
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3                (369 aa)
 initn: 467 init1: 264 opt: 689  Z-score: 626.5  bits: 124.5 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (70.6% similar) in 320 aa overlap (5-318:23-333)

                                 10          20        30        40
pF1KB7                   MILNSSTEDGIKRIQDD--CPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFV
                             :: :: ..    :  : : . ...   ..: :: ..:.
CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
               10        20        30        40        50        60

               50        60        70        80        90       100
pF1KB7 VGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYL
       :: .:::::..: ..  ..::....::::::.::: ::.:::.::. .: .  : : ...
CCDS27 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQ--WKFQTFM
               70        80        90       100       110          

              110       120       130       140         150        
pF1KB7 CKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRT--MLVAKVTCIIIWLLAGL
       ::....  ..:.:. :.:. :.:.:::.::.. :...  :   .: .:..:. ::.::. 
CCDS27 CKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAA
      120       130       140       150       160       170        

      160       170       180       190        200       210       
pF1KB7 ASLPAIIHRNVFFIENTNITVCAFHYESQNST-LPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTL
         .: :.. ..   :...:..:.. : :..:: :  ..   : ::::..::...   ::.
CCDS27 LCIPEILYSQI--KEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTI
      180         190       200       210       220       230      

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB7 IWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGI-IRDCRI
       : ..:     :: .:  .   .:. ....  : .: .:.. . .....   .. : .: .
CCDS27 IIHTL-----IQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAV
        240            250       260       270       280       290 

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB7 ADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMST
       .  .:  . .:  ::.:..::::..: :.:..:.: ... ::                  
CCDS27 STNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREG
             300       310       320       330       340       350 

        340       350         
pF1KB7 LSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
                              
CCDS27 SLKLSSMLLETTSGALSL     
             360              

>>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3                 (355 aa)
 initn: 513 init1: 223 opt: 658  Z-score: 599.4  bits: 119.4 E(32554): 4.6e-27
Smith-Waterman score: 658; 35.5% identity (69.8% similar) in 301 aa overlap (18-317:24-316)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB7       MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIY
                              : :.... .   ..: :::..::.:. :: :::.:. 
CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGNILVVLVLV
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB7 FYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYA
        : .::...:..:::::..:: ::.:::.:  :  ..  : ::. .::: :.    .::.
CCDS27 QYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYK-LKDDWVFGDAMCKILSGFYYTGLYS
               70        80        90        100       110         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB7 SVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIEN
        .:..  :.::::::::: . .   ::.  . .: :::: :: :::.:..   .. . : 
CCDS27 EIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFSKTQW-EF
     120       130       140       150       160       170         

          180        190       200       210       220       230   
pF1KB7 TNITVCAFHYESQN-STLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKP
       :. : :..:.  ..     .  .:  :..:...:.:...  :: : : : .  . .:.: 
CCDS27 THHT-CSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNEKKSK-
      180        190       200       210       220       230       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB7 RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYF
             ..:..:...::. : :...  ...:. .. . ..:. .  .: :. .:  ::: 
CCDS27 ----AVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAYT
            240       250       260       270       280       290  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB7 NNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPA
       . :.::..:.:.:..:..:. ::.                                    
CCDS27 HCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHELS
            300       310       320       330       340       350  

>>CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11                (380 aa)
 initn: 616 init1: 375 opt: 652  Z-score: 593.7  bits: 118.5 E(32554): 9.5e-27
Smith-Waterman score: 652; 32.4% identity (66.4% similar) in 333 aa overlap (30-354:30-356)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
                                    .::..: ..:..:  ::.::. ...   . :
CCDS79 MEEGGDFDNYYGADNQSECEYTDWKSSGALIPAIYMLVFLLGTTGNGLVLWTVFRSSREK
               10        20        30        40        50        60

                70        80        90       100       110         
pF1KB7 T-VASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLL
          :..:. .::.::: :..::::::.::  .: ::::...::..:  .  :.::::: :
CCDS79 RRSADIFIASLAVADLTFVVTLPLWATYTYRDYDWPFGTFFCKLSSYLIFVNMYASVFCL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 TCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITV
       : ::.:::::::.:. .   :  . . :.  ..:.::.: ..:... :..  .:::. . 
CCDS79 TGLSFDRYLAIVRPVANARLRLRVSGAVATAVLWVLAALLAMPVMVLRTTGDLENTTKVQ
              130       140       150       160       170       180

     180            190       200       210       220       230    
pF1KB7 CAFHYE-----SQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKP-
       : . :      :.. .  .:::.... .::. :: :.:: : .: ...   .. .. .  
CCDS79 CYMDYSMVATVSSEWAWEVGLGVSSTTVGFVVPFTIMLTCYFFIAQTIAGHFRKERIEGL
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 -RNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAY
        .   ...::...:. : . :.:...   : .: .: .   : .  .. . .:   ::.:
CCDS79 RKRRRLLSIIVVLVVTFALCWMPYHLVKTLYMLGSL-LHWPCDFDLFLMNIFPYCTCISY
              250       260       270        280       290         

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB7 FNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKP
        :.::::..:.:.  .:..   ..:     .  . :. :.  .. ::      :. .. :
CCDS79 VNSCLNPFLYAFFDPRFRQACTSMLCCGQSRCAGTSHSSSGEKSASYS-----SGHSQGP
     300       310       320       330       340            350    

                                 
pF1KB7 APCFEVE                   
       .:                        
CCDS79 GPNMGKGGEQMHEKSIPYSQETLVVD
          360       370       380

>>CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14               (353 aa)
 initn: 453 init1: 414 opt: 645  Z-score: 588.0  bits: 117.3 E(32554): 2e-26
Smith-Waterman score: 645; 32.8% identity (65.0% similar) in 314 aa overlap (16-324:27-334)

                          10        20        30        40         
pF1KB7            MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLV
                                 :. :.:   . .  ..::.   :   :..:: .:
CCDS99 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAW--DLLHRVLPTFIISICFFGLLGNLFV
               10        20        30          40        50        

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 VIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVS
       ..:. .  .  .:: ..: ::: .:: :.: ::.::     .. ::::  ::.. .. ..
CCDS99 LLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWNQFNWPFGALLCRVINGVIK
       60        70        80        90       100       110        

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 FNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNV
        ::. :.::.. .: ::: ..:::: :: ..    :.:::..::...:: :.:... :..
CCDS99 ANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCVLIWVVGGLLSIPTFLLRSI
      120       130       140       150       160       170        

     170       180         190       200       210       220       
pF1KB7 FFIENTNITVCAF--HYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYE
         . . :::.: .   .:. . .  . :    ::::::.:.  :.     :  .:.   :
CCDS99 QAVPDLNITACILLLPHEAWHFARIVEL----NILGFLLPLAAIVFFNYHILASLRTREE
      180       190       200           210       220       230    

       230          240       250       260       270       280    
pF1KB7 IQKNK--PRNDD-IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAM
       .....   :.:.    .:...:. :.  : :...:.::. :.:.  .: :   :..: ..
CCDS99 VSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQVQAVRGCFWEDFIDLGL
          240       250       260       270       280       290    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 PITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDN
        ..  .:. :. :::..: :.:. :.    .: :   ::.                    
CCDS99 QLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAPISSSHRKEIFQLFWRN 
          300       310       320       330       340       350    

          350         
pF1KB7 VSSSTKKPAPCFEVE

>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6                 (374 aa)
 initn: 541 init1: 209 opt: 632  Z-score: 576.2  bits: 115.2 E(32554): 9e-26
Smith-Waterman score: 632; 35.4% identity (69.1% similar) in 333 aa overlap (29-353:47-364)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMK
                                     ...:  ::.: : :..:: ::::.. :: :
CCDS52 DYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKK
         20        30        40        50        60        70      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 LKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFL
        .....:.:::.:.::. :.::::.:::  :    : :.:  ::. ..  ..:.  ...:
CCDS52 ARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGA-WVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLL
         80        90       100       110        120       130     

      120       130         140       150       160       170      
pF1KB7 LTCLSIDRYLAIVHPMKS-RLR-RTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTN
       :::.:.:::.:::.  :: ::: ::.  .:. :...: :. . :  ...  . .  ....
CCDS52 LTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSD
         140       150       160       170       180       190     

        180       190            200       210       220       230 
pF1KB7 ITVCAFHYESQNSTLPIG-----LGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKN
         ::  .:  :. . ::      ::: . ..::..:.....  ::.: :.: .:    .:
CCDS52 --VCEPKY--QTVSEPIRWKLLMLGL-ELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQA----QN
           200         210        220       230       240          

             240       250       260       270        280       290
pF1KB7 KPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGII-RDCRIADIVDTAMPITICI
       . :.  : ..:.:.:: :.   :::.. ..: .  .:: . :.:.   ..  .  .:  .
CCDS52 SKRHKAI-RVIIAVVLVFLACQIPHNM-VLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVL
        250        260       270        280       290       300    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 AYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTK
       :... ::::..:.:.:.::. :::..:: .    ....  :. .:  . : :.:.: .:.
CCDS52 AFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK--SSGFSC-AGRYSENISRQTS
          310       320       330       340          350       360 

                    
pF1KB7 KPAPCFEVE    
       . :          
CCDS52 ETADNDNASSFTM
             370    




359 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 05:20:54 2016 done: Fri Nov  4 05:20:54 2016
 Total Scan time:  2.460 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com