Result of FASTA (ccds) for pF1KB7111
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7111, 261 aa
  1>>>pF1KB7111 261 - 261 aa - 261 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3314+/-0.000908; mu= 13.9926+/- 0.054
 mean_var=61.0479+/-12.163, 0's: 0 Z-trim(105.3): 29  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.164149
 statistics sampled from 8325 (8351) to 8325 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time:  1.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261) 1801 435.0 2.5e-122
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226) 1264 307.8 4.2e-84
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283) 1077 263.6 1.1e-70
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266)  880 216.9 1.1e-56
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270)  868 214.1 8.3e-56
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273)  863 212.9 1.9e-55
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  515 130.5 1.3e-30
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  488 124.2 1.5e-28
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10         ( 370)  475 121.1 1.1e-27
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  469 119.6 1.9e-27
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  466 118.9 4.8e-27
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  466 119.0 5.7e-27
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  464 118.4 6.3e-27
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  442 113.2   2e-25
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  438 112.4 6.6e-25
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  427 109.8 4.2e-24
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  413 106.4 3.1e-23
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  369 96.0 4.3e-20
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  368 95.8 5.6e-20
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  348 91.0 1.1e-18


>>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13               (261 aa)
 initn: 1801 init1: 1801 opt: 1801  Z-score: 2309.8  bits: 435.0 E(32554): 2.5e-122
Smith-Waterman score: 1801; 100.0% identity (100.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:1-261)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKESK
              190       200       210       220       230       240

              250       260 
pF1KB7 QNEMNELISDSGQNAITGFPS
       :::::::::::::::::::::
CCDS92 QNEMNELISDSGQNAITGFPS
              250       260 

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 1283 init1: 1264 opt: 1264  Z-score: 1623.5  bits: 307.8 E(32554): 4.2e-84
Smith-Waterman score: 1264; 77.2% identity (92.0% similar) in 224 aa overlap (1-224:1-224)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       ::::::.:..::::::::::::.:.::.::::.:::::::.::::::: :::::::::::
CCDS92 MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
       :::::::.::.:::::::::::::::::::::::::: :::  ::: .:: ...:::::.
CCDS92 KNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYRRHEKKRKFIKGEIKSEFKDIEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
       :: ::::::::::::::::::::.::::::::::: .:.:. .  ..::.  :::: :::
CCDS92 IKTQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDGFSMQRLVKCNAWPCPNTVDC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKESK
       :.::::::::::.:::..: ::.::::.::::::.. :  .::.                
CCDS92 FVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLIRYCSGKSKKPV              
              190       200       210       220                    

              250       260 
pF1KB7 QNEMNELISDSGQNAITGFPS

>>CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX                (283 aa)
 initn: 1008 init1: 511 opt: 1077  Z-score: 1382.6  bits: 263.6 E(32554): 1.1e-70
Smith-Waterman score: 1077; 58.1% identity (84.1% similar) in 258 aa overlap (1-250:1-254)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       :.:  :.:...:::.:::.::.::..::::::.:.:::::. :::::. .:.::::::::
CCDS14 MNWTGLYTLLSGVNRHSTAIGRVWLSVIFIFRIMVLVVAAESVWGDEKSSFICNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
       ..::::.:::.::.:::.::::.:::::::::::::. .:   .:. : : ..:   .:.
CCDS14 NSVCYDQFFPISHVRLWSLQLILVSTPALLVAMHVAHQQH-IEKKMLRLEGHGDPLHLEE
               70        80        90       100        110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
       .:..::.: :.:::::. :. ::..:::.::::::.:: :: .  ..:: . :::: :::
CCDS14 VKRHKVHISGTLWWTYVISVVFRLLFEAVFMYVFYLLYPGYAMVRLVKCDVYPCPNTVDC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230          
pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPN-------
       :.::::::::::.::..:: ::..:::::. ::....:   ..::: ..: :.       
CCDS14 FVSRPTEKTVFTVFMLAASGICIILNVAEVVYLIIRAC---ARRAQRRSNPPSRKGSGFG
     180       190       200       210          220       230      

            240       250       260                   
pF1KB7 HALK-ESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS                  
       : :. : ::::.:.:.:.                             
CCDS14 HRLSPEYKQNEINKLLSEQDGSLKDILRRSPGTGAGLAEKSDRCSAC
        240       250       260       270       280   

>>CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1                (266 aa)
 initn: 853 init1: 503 opt: 880  Z-score: 1130.9  bits: 216.9 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 880; 46.5% identity (76.0% similar) in 271 aa overlap (1-260:1-266)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       :.:. :. ...::::.:: ....:..:.:::::.. ::::.::: :::.:::::: ::::
CCDS38 MNWAFLQGLLSGVNKYSTVLSRIWLSVVFIFRVLVYVVAAEEVWDDEQKDFVCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
        :::::.::::::.::::::::.:. :.:::.::::: :.:  :: .  .  :  .  ..
CCDS38 PNVCYDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAY-REERERKHHLKHGPNAPSLYDN
               70        80        90        100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
       ..:..    :.:::::  :..:.   .:.:.:.:. ::. : .: :. :...:::. :::
CCDS38 LSKKR----GGLWWTYLLSLIFKAAVDAGFLYIFHRLYKDYDMPRVVACSVEPCPHTVDC
     120           130       140       150       160       170     

              190       200       210       220           230      
pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFR----RSKRAQTQKNHPN---
       .::::::: ::: ::.....::.:::..:. ::. : :..    : .: . ..  :.   
CCDS38 YISRPTEKKVFTYFMVTTAAICILLNLSEVFYLVGKRCMEIFGPRHRRPRCRECLPDTCP
         180       190       200       210       220       230     

            240        250         260 
pF1KB7 -HALKESKQNE-MNELISDSGQNAIT--GFPS
        ..:... . :  : ..  .:.  .   :.: 
CCDS38 PYVLSQGGHPEDGNSVLMKAGSAPVDAGGYP 
         240       250       260       

>>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1                  (270 aa)
 initn: 785 init1: 513 opt: 868  Z-score: 1115.4  bits: 214.1 E(32554): 8.3e-56
Smith-Waterman score: 868; 52.3% identity (82.4% similar) in 222 aa overlap (1-220:1-213)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       ::: ::.....::::.::..:..:..:.:.:::.. ::::..::::::.:: ::: ::::
CCDS38 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRND-FKDIE
        :::::..::.:.:::::::::::. :.::: .:::: :.:  :. :  .:..:    . 
CCDS38 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAY-REERERRHR--QKHGDQCAKLY
               70        80        90        100         110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 DIKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCG-IDPCPNLV
       :   .:   .:.:::::  :..:..:.:  :.:... :..:...: ...:. . ::::.:
CCDS38 DNAGKK---HGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIV
       120          130       140       150       160       170    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 DCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKE
       ::.:.::::: .:: ::..::..:..:.. :::::   .: :                  
CCDS38 DCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYL---ICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSS
          180       190       200          210       220       230 

      240       250       260                 
pF1KB7 SKQNEMNELISDSGQNAITGFPS                
                                              
CCDS38 SASRASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI
             240       250       260       270

>>CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1                  (273 aa)
 initn: 851 init1: 470 opt: 863  Z-score: 1108.9  bits: 212.9 E(32554): 1.9e-55
Smith-Waterman score: 863; 46.8% identity (79.4% similar) in 248 aa overlap (1-244:1-243)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       :.:. .. ...::::.::..:..:....:::::.. .:.:..::.:...:: ::: ::::
CCDS38 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
       .:::.:.::::::.::::::::.:. :.:::.::::: :.   .. :... .:. .   .
CCDS38 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAY-REVQEKRHREAHGENSGRLYLN
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pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
         :..    :.:::::. :. :.   . ::.:::. .:  : :: :.::  :::::.:::
CCDS38 PGKKR----GGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDC
     120           130       140       150       160       170     

              190       200       210       220           230      
pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFR----RSKRAQTQKNHPNHAL
       :::.:.::..::.::.....::.:::..:: ::. : : .    :. .:.   .::. . 
CCDS38 FISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTT
         180       190       200       210       220       230     

        240       250       260              
pF1KB7 KESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS             
       .  ::...                              
CCDS38 SSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
         240       250       260       270   

>>CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17             (294 aa)
 initn: 453 init1: 263 opt: 515  Z-score: 663.0  bits: 130.5 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 515; 34.3% identity (69.0% similar) in 242 aa overlap (2-241:3-236)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPG
         .:. : ... .:. .:  .:..:..:..:::...:....  :. ::::.:::::::::
CCDS58 MGEWAFLGSLLDAVQLQSPLVGRLWLVVMLIFRILVLATVGGAVFEDEQEEFVCNTLQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CKNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKD-I
       :...:::. ::::: :.: ......:.: .:    :.:  :.. ..   .:   .    .
CCDS58 CRQTCYDRAFPVSHYRFWLFHILLLSAPPVLF---VVYSMHRAGKEAGGAEAAAQCAPGL
               70        80        90          100       110       

      120       130        140       150       160       170       
pF1KB7 EDIKKQKVRIEGS-LWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNL
        . .     ...      :  :. .:.. : .:.    .:: :...   . :.  :::. 
CCDS58 PEAQCAPCALRARRARRCYLLSVALRLLAELTFLGGQALLY-GFRVAPHFACAGPPCPHT
       120       130       140       150        160       170      

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pF1KB7 VDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALK
       ::::.:::::::::..:.......  ::.:::: .::    ..   ::  . :. :.: .
CCDS58 VDCFVSRPTEKTVFVLFYFAVGLLSALLSVAELGHLL----WKGRPRAGERDNRCNRAHE
        180       190       200       210           220       230  

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pF1KB7 ESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS                                    
       :...                                                        
CCDS58 EAQKLLPPPPPPPPPPALPSRRPGPEPCAPPAYAHPAPASLRECGSGRGKASPATGRRDL
            240       250       260       270       280       290  

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 753 init1: 467 opt: 488  Z-score: 625.9  bits: 124.2 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 769; 51.1% identity (74.7% similar) in 229 aa overlap (2-216:3-230)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPG
         ::. : ...  ::.::: ::.::.::.::::..:: .::. :::::: :::::: :::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90        100       110        
pF1KB7 CKNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYY-RHETTRKFRRGEK------R
       :.:::::. ::.::::::.::.::::::.:. . :...: : :  :: :..:.       
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB7 NDFKDIEDIKK-------QKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPW
       :   :  ..::       .: :.::.:  ::   :.:. .::..:.   :::: :...  
CCDS30 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLY-GFRILP
              130       140       150       160       170          

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB7 VLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRA
       . .:.  ::::.::::.:::::::.: .::.:.. . ..::: :: .: ::         
CCDS30 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KB7 QTQKNHPNHALKESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS                        
                                                                   
CCDS30 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQ
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10              (370 aa)
 initn: 462 init1: 303 opt: 475  Z-score: 610.3  bits: 121.1 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 475; 35.3% identity (63.9% similar) in 238 aa overlap (6-233:7-235)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPG
             :  .:  .: . : .::.:... ...:....:.:.. :. :::: :::::::::
CCDS71 MEGVDLLGFLIITLNCNVTMVGKLWFVLTMLLRMLVIVLAGRPVYQDEQERFVCNTLQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CKNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRN-DFKDI
       : ::::: : ::::.:.: .: . :  :. . ...:  .:  :   .  : .:  : .. 
CCDS71 CANVCYDVFSPVSHLRFWLIQGVCVLLPSAVFSVYV-LHRGATLAAL--GPRRCPDPREP
               70        80        90        100         110       

      120          130            140       150       160       170
pF1KB7 EDIKKQKVRI---EGSLWWT-----YTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCG
        . ...  :    .:.:        :   ...: ..::::  . :::. :.  :  . : 
CCDS71 ASGQRRCPRPFGERGGLQVPDFSAGYIIHLLLRTLLEAAFGALHYFLF-GFLAPKKFPCT
       120       130       140       150       160        170      

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pF1KB7 IDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAEL-CYLLLKVCFRRSKRAQTQK
         :: ..:::..::::::... .:. ..:.. .::..:.: : :      :: .:     
CCDS71 RPPCTGVVDCYVSRPTEKSLLMLFLWAVSALSFLLGLADLVCSL-----RRRMRRRPGPP
        180       190       200       210       220            230 

     230       240       250       260                             
pF1KB7 NHPNHALKESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS                            
       . :.                                                        
CCDS71 TSPSIRKQSGASGHAEGRRTDEEGGREEEGAPAPPGARAGGEGAGSPRRTSRVSGHTKIP
             240       250       260       270       280       290 

>>CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6               (223 aa)
 initn: 782 init1: 451 opt: 469  Z-score: 606.1  bits: 119.6 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 784; 49.3% identity (77.2% similar) in 219 aa overlap (1-219:1-206)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
       :.:  :. ...::::.::. : .:..:.:.::... .:::..:: :::..: ::. ::::
CCDS50 MSWMFLRDLLSGVNKYSTGTGWIWLAVVFVFRLLVYMVAAEHVWKDEQKEFECNSRQPGC
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
       ::::.: :::.:..::::::::.::::.:::..::::  ::        :::.  :    
CCDS50 KNVCFDDFFPISQVRLWALQLIMVSTPSLLVVLHVAY--HEGR------EKRHRKK----
               70        80        90         100                  

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pF1KB7 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
       .  .   ..:.::..:  :.. .  :: .:. .:: ::.:. .:...:: . :::: :::
CCDS50 LYVSPGTMDGGLWYAYLISLIVKTGFEIGFLVLFYKLYDGFSVPYLIKCDLKPCPNTVDC
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KB7 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKESK
       :::.:::::.: .:.. .: .:..::  :: .:.:: ::                     
CCDS50 FISKPTEKTIFILFLVITSCLCIVLNFIELSFLVLK-CFIKCCLQKYLKKPQVLSV    
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              250       260 
pF1KB7 QNEMNELISDSGQNAITGFPS




261 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:50:53 2016 done: Fri Nov  4 04:50:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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