Result of FASTA (ccds) for pF1KB7091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7091, 184 aa
  1>>>pF1KB7091 184 - 184 aa - 184 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3762+/-0.000836; mu= 11.9915+/- 0.050
 mean_var=57.7330+/-11.685, 0's: 0 Z-trim(106.2): 16  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.168796
 statistics sampled from 8838 (8845) to 8838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  1.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS985.1 TNFAIP8L2 gene_id:79626|Hs108|chr1       ( 184) 1181 295.6 1.1e-80
CCDS81881.1 TNFAIP8L3 gene_id:388121|Hs108|chr15   ( 204)  682 174.1 4.7e-44
CCDS32241.1 TNFAIP8L3 gene_id:388121|Hs108|chr15   ( 292)  682 174.2 6.6e-44
CCDS12132.1 TNFAIP8L1 gene_id:126282|Hs108|chr19   ( 186)  678 173.1 8.6e-44
CCDS47257.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5       ( 188)  675 172.4 1.4e-43
CCDS47258.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5       ( 198)  675 172.4 1.5e-43
CCDS68933.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5       ( 210)  675 172.4 1.6e-43


>>CCDS985.1 TNFAIP8L2 gene_id:79626|Hs108|chr1            (184 aa)
 initn: 1181 init1: 1181 opt: 1181  Z-score: 1561.8  bits: 295.6 E(32554): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 1181; 100.0% identity (100.0% similar) in 184 aa overlap (1-184:1-184)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTHSRPQAQRVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTHSRPQAQRVI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTALSFGEVDFTFEAAVLAGLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTALSFGEVDFTFEAAVLAGLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 TECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYGPDFTQHLGKICDGLRKLLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYGPDFTQHLGKICDGLRKLLD
              130       140       150       160       170       180

           
pF1KB7 EGKL
       ::::
CCDS98 EGKL
           

>>CCDS81881.1 TNFAIP8L3 gene_id:388121|Hs108|chr15        (204 aa)
 initn: 688 init1: 632 opt: 682  Z-score: 904.3  bits: 174.1 E(32554): 4.7e-44
Smith-Waterman score: 682; 55.6% identity (87.2% similar) in 180 aa overlap (4-181:22-201)

                                 10        20        30        40  
pF1KB7                   MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDEL
                            ::::::::::.::.:::.:...::...::.::::..:::
CCDS81 MDSDSGEQSEGEPVTAAGPDVFSSKSLALQAQKKILSKIASKTVANMLIDDTSSEIFDEL
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB7 YRVSKEYTHSRPQAQRVIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTAL
       :.:.::.::.. .:....:::::::::...:.::..:.  ::... .::.:: : ::: .
CCDS81 YKVTKEHTHNKKEAHKIMKDLIKVAIKIGILYRNNQFSQEELVIVEKFRKKLNQTAMTIV
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB7 SFGEVDFTFEAAVLAGLLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYG-
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CCDS81 SFYEVEYTFDRNVLSNLLHECKDLVHELVQRHLTPRTHGRINHVFNHFADVEFLSTLYSL
              130       140       150       160       170       180

              170       180    
pF1KB7 -PDFTQHLGKICDGLRKLLDEGKL
         :   .: .::.:. :::::   
CCDS81 DGDCRPNLKRICEGINKLLDEKVL
              190       200    

>>CCDS32241.1 TNFAIP8L3 gene_id:388121|Hs108|chr15        (292 aa)
 initn: 688 init1: 632 opt: 682  Z-score: 901.8  bits: 174.2 E(32554): 6.6e-44
Smith-Waterman score: 682; 55.6% identity (87.2% similar) in 180 aa overlap (4-181:110-289)

                                          10        20        30   
pF1KB7                            MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDE
                                     ::::::::::.::.:::.:...::...::.
CCDS32 VDAQPAARSMDSDSGEQSEGEPVTAAGPDVFSSKSLALQAQKKILSKIASKTVANMLIDD
      80        90       100       110       120       130         

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB7 TSSEVLDELYRVSKEYTHSRPQAQRVIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQK
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CCDS32 TSSEIFDELYKVTKEHTHNKKEAHKIMKDLIKVAIKIGILYRNNQFSQEELVIVEKFRKK
     140       150       160       170       180       190         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB7 LRQGAMTALSFGEVDFTFEAAVLAGLLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDP
       : : ::: .:: ::..::.  ::..:: ::.:.. :::..::::..:::: :::.::.: 
CCDS32 LNQTAMTIVSFYEVEYTFDRNVLSNLLHECKDLVHELVQRHLTPRTHGRINHVFNHFADV
     200       210       220       230       240       250         

           160         170       180    
pF1KB7 GLLTALYG--PDFTQHLGKICDGLRKLLDEGKL
        .:..::.   :   .: .::.:. :::::   
CCDS32 EFLSTLYSLDGDCRPNLKRICEGINKLLDEKVL
     260       270       280       290  

>>CCDS12132.1 TNFAIP8L1 gene_id:126282|Hs108|chr19        (186 aa)
 initn: 676 init1: 607 opt: 678  Z-score: 899.7  bits: 173.1 E(32554): 8.6e-44
Smith-Waterman score: 678; 57.0% identity (83.3% similar) in 186 aa overlap (1-184:1-186)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTHSRPQAQRVI
       :..::.:::::::.::::::::...:. ...:.:::::::::::...:.:.:: .::...
CCDS12 MDTFSTKSLALQAQKKLLSKMASKAVVAVLVDDTSSEVLDELYRATREFTRSRKEAQKML
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTALSFGEVDFTFEAAVLAGLL
       :.:.:::.:...: :. ..:  ::::  :::.. :  ::::.:: .:::::.  :::. :
CCDS12 KNLVKVALKLGLLLRGDQLGGEELALLRRFRHRARCLAMTAVSFHQVDFTFDRRVLAAGL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160         170        
pF1KB7 TECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYGP--DFTQHLGKICDGLRKL
        ::::.: . :  ::: :::::: ::: :..:  .:.:::::   . .:: .::.:: ..
CCDS12 LECRDLLHQAVGPHLTAKSHGRINHVFGHLADCDFLAALYGPAEPYRSHLRRICEGLGRM
              130       140       150       160       170       180

      180    
pF1KB7 LDEGKL
       ::::.:
CCDS12 LDEGSL
             

>>CCDS47257.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5            (188 aa)
 initn: 687 init1: 593 opt: 675  Z-score: 895.7  bits: 172.4 E(32554): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 675; 55.0% identity (87.8% similar) in 180 aa overlap (4-181:6-185)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKEYTHSRPQAQR
            :.::.::.::.::.:.::...:.:  .::.::::::::::::..:::... .:..
CCDS47 MATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTREYTQNKKEAEK
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 VIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTALSFGEVDFTFEAAVLAG
       .::.:::..::.:.:.::..:. .::::  .:..:..: :::..:: .::.::.  ::. 
CCDS47 IIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSR
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160         170      
pF1KB7 LLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYGP--DFTQHLGKICDGLR
       ::.:::..: .....::: :::::. .:::::::  .:.:::.:  .:  :: :.:::. 
CCDS47 LLNECREMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSDCEFLAALYNPFGNFKPHLQKLCDGIN
              130       140       150       160       170       180

        180    
pF1KB7 KLLDEGKL
       :.:::   
CCDS47 KMLDEENI
               

>>CCDS47258.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5            (198 aa)
 initn: 687 init1: 593 opt: 675  Z-score: 895.3  bits: 172.4 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 675; 55.0% identity (87.8% similar) in 180 aa overlap (4-181:16-195)

                           10        20        30        40        
pF1KB7             MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSSEVLDELYRVSKE
                      :.::.::.::.::.:.::...:.:  .::.::::::::::::..:
CCDS47 MHSEAEESKEVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSSEVLDELYRVTRE
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB7 YTHSRPQAQRVIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQGAMTALSFGEVD
       ::... .:...::.:::..::.:.:.::..:. .::::  .:..:..: :::..:: .::
CCDS47 YTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQLAMTVVSFHQVD
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB7 FTFEAAVLAGLLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLLTALYGP--DFTQ
       .::.  ::. ::.:::..: .....::: :::::. .:::::::  .:.:::.:  .:  
CCDS47 YTFDRNVLSRLLNECREMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSDCEFLAALYNPFGNFKP
              130       140       150       160       170       180

        170       180    
pF1KB7 HLGKICDGLRKLLDEGKL
       :: :.:::. :.:::   
CCDS47 HLQKLCDGINKMLDEENI
              190        

>>CCDS68933.1 TNFAIP8 gene_id:25816|Hs108|chr5            (210 aa)
 initn: 687 init1: 593 opt: 675  Z-score: 894.9  bits: 172.4 E(32554): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 675; 55.0% identity (87.8% similar) in 180 aa overlap (4-181:28-207)

                                       10        20        30      
pF1KB7                         MESFSSKSLALQAEKKLLSKMAGRSVAHLFIDETSS
                                  :.::.::.::.::.:.::...:.:  .::.:::
CCDS68 MTLPRYCEVVLLIAHGEKMLKLVATDVFNSKNLAVQAQKKILGKMVSKSIATTLIDDTSS
               10        20        30        40        50        60

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB7 EVLDELYRVSKEYTHSRPQAQRVIKDLIKVAIKVAVLHRNGSFGPSELALATRFRQKLRQ
       :::::::::..:::... .:...::.:::..::.:.:.::..:. .::::  .:..:..:
CCDS68 EVLDELYRVTREYTQNKKEAEKIIKNLIKTVIKLAILYRNNQFNQDELALMEKFKKKVHQ
               70        80        90       100       110       120

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB7 GAMTALSFGEVDFTFEAAVLAGLLTECRDVLLELVEHHLTPKSHGRIRHVFDHFSDPGLL
        :::..:: .::.::.  ::. ::.:::..: .....::: :::::. .:::::::  .:
CCDS68 LAMTVVSFHQVDYTFDRNVLSRLLNECREMLHQIIQRHLTAKSHGRVNNVFDHFSDCEFL
              130       140       150       160       170       180

        160         170       180    
pF1KB7 TALYGP--DFTQHLGKICDGLRKLLDEGKL
       .:::.:  .:  :: :.:::. :.:::   
CCDS68 AALYNPFGNFKPHLQKLCDGINKMLDEENI
              190       200       210




184 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:38:24 2016 done: Fri Nov  4 04:38:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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