Result of FASTA (ccds) for pF1KB7052
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7052, 539 aa
  1>>>pF1KB7052 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1573+/-0.000913; mu= -5.6883+/- 0.055
 mean_var=381.0682+/-79.795, 0's: 0 Z-trim(117.9): 871  B-trim: 120 in 1/52
 Lambda= 0.065701
 statistics sampled from 17803 (18730) to 17803 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.831), E-opt: 0.2 (0.575), width:  16
 Scan time:  3.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1         ( 539) 3787 372.6 6.4e-103
CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1        ( 573) 3787 372.6 6.7e-103
CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19       ( 584)  751 84.9 2.9e-16
CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18      ( 619)  726 82.5 1.6e-15
CCDS46691.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22        ( 537)  599 70.4 5.9e-12
CCDS13895.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22        ( 641)  599 70.5 6.7e-12
CCDS13894.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22        ( 687)  599 70.5   7e-12


>>CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1              (539 aa)
 initn: 3787 init1: 3787 opt: 3787  Z-score: 1961.2  bits: 372.6 E(32554): 6.4e-103
Smith-Waterman score: 3787; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 EELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 MHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAAS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530         
pF1KB7 PAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
              490       500       510       520       530         

>>CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1             (573 aa)
 initn: 3787 init1: 3787 opt: 3787  Z-score: 1960.9  bits: 372.6 E(32554): 6.7e-103
Smith-Waterman score: 3787; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:35-573)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPHPPSPQAAAPGEAWPGPSQAPWQSLEEKMGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQL
           10        20        30        40        50        60    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 GHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFKKLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFKKLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCE
           70        80        90       100       110       120    

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 LDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPS
          130       140       150       160       170       180    

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 PDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDEDDCERARQYLEAFATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPPPPPPRPVARRSRKPRKAFLQ
          190       200       210       220       230       240    

              220       230       240       250       260       270
pF1KB7 TKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSY
          250       260       270       280       290       300    

              280       290       300       310       320       330
pF1KB7 EPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGL
          310       320       330       340       350       360    

              340       350       360       370       380       390
pF1KB7 DSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
          370       380       390       400       410       420    

              400       410       420       430       440       450
pF1KB7 IHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLK
          430       440       450       460       470       480    

              460       470       480       490       500       510
pF1KB7 GQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGP
          490       500       510       520       530       540    

              520       530         
pF1KB7 PVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
          550       560       570   

>>CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19            (584 aa)
 initn: 1448 init1: 627 opt: 751  Z-score: 405.5  bits: 84.9 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 1093; 40.2% identity (59.8% similar) in 535 aa overlap (6-483:6-519)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
            :  ::::::::::..:: :::::  : :::..: ..: :. :::.::::::.:::
CCDS12 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
       ::::   .:::.              .: :.:::. ::: ::..::::::::.:.::.  
CCDS12 KLFT---SGAVVDQ-----------QNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGD
                  70                   80        90       100      

              130       140       150                   160        
pF1KB7 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSP------------DEDDCERARQYLEAF--
       .:.:::::::: :  .: ..:. . : : .             :. .  ::..::: :  
CCDS12 ILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQS
        110       120       130       140       150       160      

                 170               180                             
pF1KB7 ---------ATATASGVP--------NGEDSPPQV--------------------PLPPP
                :.:.:.. :        .  :.  ..                    : :: 
CCDS12 NPMNSLPPAAAAAAASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPA
        170       180       190       200       210       220      

     190       200            210       220       230       240    
pF1KB7 PPPPPRPVARRSRKP-----RKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGS
         ::     . . .:     :     : :     ..: . :  .:     :::.:.   :
CCDS12 ERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASL--S
        230       240       250       260       270       280      

          250       260       270       280       290        300   
pF1KB7 SGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPL-SPEEL
        ..  :::: .  .:.:   :: ..  :         :.     .....:.    : :: 
CCDS12 EAAPEPGDSPGFLSGAA---EGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEES
          290       300          310       320       330       340 

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB7 GSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPR
        .:. ..    . :.:. :. .. :.  :: :. .: :..  :.::.:.:.:.:::::::
CCDS12 RADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAW-SQ-KVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPR
             350       360        370        380       390         

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB7 HMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHL
       :.::::::::. :..: :::::.::::.::::::::.:: : .: : : :.:::::::..
CCDS12 HIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRV
     400       410       420       430       440       450         

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB7 HTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAG
       ::: :::.:  : :.:.. :::.:::: ..:  : .:: ::  .    : :: .:..  :
CCDS12 HTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATPG
     460       470       480       490       500       510         

           490       500       510       520       530             
pF1KB7 LDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS    
                                                                   
CCDS12 APAQPSSPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNF
     520       530       540       550       560       570         

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CCDS32 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
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       :::: :              : ..   : :.::: ::::.:.::::::.::: ...:.  
CCDS32 KLFTAG--------------TLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKH
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       .:.:::.::: :.. .:.::..  :.: :  . ..:: ..    ..  :       .   
CCDS32 ILNAARMLEIQCIVNVCLEIMEPGGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDD
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       . ::   :  :: :        :     ....  :  ::    . ...  .:: : .  .
CCDS32 DTEDFADQENLPDPQDISCHQSPSKTDHLTEKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFS
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       . .  .   : . ..  :  : .  .:  .. :   :   :. :. :: :..  : .   
CCDS32 IESLLRENLYPKANIPDRRPSLSPFAP--DFFPHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVI
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             :::.:::  ::   . .     . :.  :.    :  . :  :::. :   .:.
CCDS32 KNRKIKEEEKEELPPPPPPPFPNDFFKDMFPDLPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLG
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        ::     ::  :: . .  :.::.:::.: :::::::::::::::::. : .: :::::
CCDS32 -GLFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTR
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pF1KB7 NDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHL
       .:::::::::::::::: : :: :.:.:.:::::::..::: :::.:..:.:.:.. :::
CCDS32 QDKLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHL
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pF1KB7 QRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDA--------PPHYPPPSTAA-ASPAGLDLSNGHLDTFRL
       .::.: :.:  .: :: ::  :         :  : :. :: . : .:   .:::     
CCDS32 HRHIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAV
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CCDS32 CLPGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLAFALAENVA
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>>CCDS46691.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22             (537 aa)
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CCDS46 MERVNDASCGPSGCYTYQVSRHSTEMLHNLNQQRKNGGRFCDVLLRVGDESFPAHRAVLA
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       :::. ...   ..: .. ::..: .  ::  :.:... :...   :       ::  .  
CCDS46 AYTSRIVVRLESFPELMTAAKFLLMRSVIEICQEVIKQSNVQILVPP------ARADIML
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pF1KB7 R--FWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS
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CCDS46 RQDLWQQRRPEMLTSGSD                        
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>>CCDS13895.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22             (641 aa)
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CCDS13 MERVNDASCGPSGCYTYQVSRHSTEMLHNLNQQRKNGGRFCDVLLRVGDESFPAHRAVLA
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CCDS13 ACSEYFESVFSAQLGDGGAADGGPADVGGATAAPGGGAGGSRELEMHTISSKVFGDILDF
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pF1KB7 AYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSPDEDDCERARQYLEA
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CCDS13 PGVDRLPM------VAGPLSPQLLTSP----FPSVASSAPPLTGKRGRGRPRKANLLDSM
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pF1KB7 YPPAYGLAQGGGPPLSPE-ELGSDEDAIDPDLMAY-LSSLHQD--NLAP------GLD-S
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CCDS13 FGSPGGLREAGILPCGLCGKVFTDANRLRQHEAQHGVTSLQLGYIDLPPPRLGENGLPIS
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pF1KB7 QDKLVRKRRSQMPQE--CPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLK
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CCDS13 EDPDGPRKRSRTRKQVACEICGKIFRDVYHLNRHKLSHSGEKPYSCPVCGLRFKRKDRMS
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pF1KB7 IHMRKHTGE--RPYSCPHCPARFLHSYDLKNHM-HLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQR
        :.:.: :   .:: :  :   : .   :..:. ..::..::..:. :. .:: .:.:. 
CCDS13 YHVRSHDGSVGKPYICQSCGKGFSRPDHLNGHIKQVHTSERPHKCQTCNASFATRDRLRS
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pF1KB7 HLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAP
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CCDS13 HLACHEDKVPCQVCGKYLRAAYMADHLKKHSEGPSNFCSICNREGQKCSHQDPIESSDSY
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>>CCDS13894.1 PATZ1 gene_id:23598|Hs108|chr22             (687 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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