Result of FASTA (ccds) for pF1KB6006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6006, 2468 aa
  1>>>pF1KB6006 2468 - 2468 aa - 2468 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.5660+/-0.00137; mu= -17.5170+/- 0.083
 mean_var=475.3120+/-95.610, 0's: 0 Z-trim(112.1): 65  B-trim: 11 in 1/54
 Lambda= 0.058828
 statistics sampled from 12911 (12950) to 12911 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.398), width:  16
 Scan time:  5.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4012.1 MAP1B gene_id:4131|Hs108|chr5           (2468) 15986 1373.3       0
CCDS42031.1 MAP1A gene_id:4130|Hs108|chr15         (2803) 1896 177.5 8.5e-43
CCDS32954.1 MAP1S gene_id:55201|Hs108|chr19        (1059) 1320 128.4 1.9e-28
CCDS77262.1 MAP1S gene_id:55201|Hs108|chr19        (1033) 1299 126.6 6.4e-28


>>CCDS4012.1 MAP1B gene_id:4131|Hs108|chr5                (2468 aa)
 initn: 15986 init1: 15986 opt: 15986  Z-score: 7345.5  bits: 1373.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 15986; 100.0% identity (100.0% similar) in 2468 aa overlap (1-2468:1-2468)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 STEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 STEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 ANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 VPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 EMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 AEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 AEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRAD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 SRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 SVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 AKKEDKTPIKKEEKPKKEEVKKEVKKEIKKEEKKEPKKEVKKETPPKEVKKEVKKEEKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 AKKEDKTPIKKEEKPKKEEVKKEVKKEIKKEEKKEPKKEVKKETPPKEVKKEVKKEEKKE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 VKKEEKEPKKEIKKLPKDAKKSSTPLSEAKKPAALKPKVPKKEESVKKDSVAAGKPKEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VKKEEKEPKKEIKKLPKDAKKSSTPLSEAKKPAALKPKVPKKEESVKKDSVAAGKPKEKG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB6 KIKVIKKEGKAAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KIKVIKKEGKAAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB6 EELKAEEVDVTKDIKPQLELIEDEEKLKETEPVEAYVIQKEREVTKGPAESPDEGITTTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EELKAEEVDVTKDIKPQLELIEDEEKLKETEPVEAYVIQKEREVTKGPAESPDEGITTTE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB6 GEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB6 HVCVSASKHSPTEDEESAKAEADAYIREKRESVASGDDRAEEDMDEAIEKGEAEQSEEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 HVCVSASKHSPTEDEESAKAEADAYIREKRESVASGDDRAEEDMDEAIEKGEAEQSEEEA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB6 DEEDKAEDAREEEYEPEKMEAEDYVMAVVDKAAEAGGAEEQYGFLTTPTKQLGAQSPGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DEEDKAEDAREEEYEPEKMEAEDYVMAVVDKAAEAGGAEEQYGFLTTPTKQLGAQSPGRE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB6 PASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB6 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITKYESSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSKTDATDGKDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITKYESSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSKTDATDGKDY
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB6 NASASTISPPSSMEEDKFSRSALRDAYCSEVKASTTLDIKDSISAVSSEKVSPSKSPSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NASASTISPPSSMEEDKFSRSALRDAYCSEVKASTTLDIKDSISAVSSEKVSPSKSPSLS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB6 PSPPSPLEKTPLGERSVNFSLTPNEIKVSAEAEVAPVSPEVTQEVVEEHCASPEDKTLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PSPPSPLEKTPLGERSVNFSLTPNEIKVSAEAEVAPVSPEVTQEVVEEHCASPEDKTLEV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB6 VSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPM
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB6 DEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLIGSESAYESFLSADDKASGRGAESPFEEKSGKQGSPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLIGSESAYESFLSADDKASGRGAESPFEEKSGKQGSPD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB6 QVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALDERKLGDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALDERKLGDV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB6 SPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB6 SFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSIS
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB6 PPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEQSLAMDFSRQSPDHPTVGAGVLHIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEQSLAMDFSRQSPDHPTVGAGVLHIT
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KB6 ENGPTEVDYSPSDMQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ENGPTEVDYSPSDMQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQ
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KB6 IASPLQEDTLSDVAPPRDMSLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLYSPTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IASPLQEDTLSDVAPPRDMSLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLYSPTF
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KB6 SDSTSAVKEKTATCHSSSSPPIDAASAEPYGFRASVLFDTMQHHLALNRDLSTPGLEKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SDSTSAVKEKTATCHSSSSPPIDAASAEPYGFRASVLFDTMQHHLALNRDLSTPGLEKDS
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KB6 GGKTPGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYESYEKTTRTSDVGGYYYEKIERTTKSPSDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GGKTPGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYESYEKTTRTSDVGGYYYEKIERTTKSPSDSG
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
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CCDS40 YSYETIGKTTKTPEDGDYSYEIIEKTTRTPEEGGYSYDISEKTTSPPEVSGYSYEKTERS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TTKTTKSSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVRSSYYVVSGNDPAAEEPSRA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDES
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       ::::::::
CCDS40 FPACKIEL
               

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       :::::::::::::::::::::::::::::.:..:::.::::::::.:::::.::.:::::
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       : :::::::..::::.:::::::::::.. :::.::::::.:::::.::::.:. :. . 
CCDS42 GADNLPGINGLLQRKVAELEEEQSQGSSSYSDWVKNLISPELGVVFFNVPEKLRLPDASR
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CCDS42 KAKRSIEEACLTLQHLNRLGIQAEPLYRVVSNTIEPLTLFHKMGVGRLDMYVLNPVKDSK
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       :::..::.:.:..: :. ..::::.:... . ::::...:.:: ::::.:::.:::::::
CCDS42 EMQFLMQKWAGNSKAKTGIVLPNGKEAEISVPYLTSITALVVWLPANPTEKIVRVLFPGN
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pF1KB6 STQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDL-TGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKP
       . : .::::::::.:::::. :.:::::: .: ::: . : .:.::::::.:::: ..: 
CCDS42 APQNKILEGLEKLRHLDFLRYPVATQKDLASGAVPTNL-KPSKIKQRADSKESLKATTKT
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pF1KB6 LPSK-SVRKESKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKPSVTEKEVPSK
         :: . :.:  ::  . .. . ...  :.:.: :         ..  ::     : :.:
CCDS42 AVSKLAKREEVVEEGAKEARSELAKELAKTEKKAK---------ESSEKPP----EKPAK
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         :  ::.: .:        :: :.: .:        ::          :.::. :  :.
CCDS42 --PERVKTESSEAL------KAEKRKLIK--------DK----------VGKKHLKEKIS
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       : :. : .:     :::::::     .::.::.   :: ::..:::::.      :. : 
CCDS42 KLEEKKDKE-----KKEIKKE-----RKELKKDEGRKEEKKDAKKEEKR------KDTKP
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       :.::. :   :  ::  :..: .  : :::                   :..:. ..  .
CCDS42 ELKKISKPDLKPFTP--EVRK-TLYKAKVP-------------------GRVKIDRS--R
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       : ..     .   :  :  ... . .:.  .::     ..:::::::.::::.: ::   
CCDS42 AIRGEKELSSEPQTPPAQKGTVPLPTISGHREL-----VLSSPEDLTQDFEEMKREE---
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           .  :   .:     .  :...        . .::  .  .:   .. : :. :.. 
CCDS42 ----RALLAEQRDTGLGDKPFPLDT--------AEEGPPSTAIQGTPPSVPGLGQEEHVM
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       .: : :    :.::  :  .  : ::  :: ..:  .::: . :  . :           
CCDS42 KEKELVPEVPEEQGSKD--RGLDSGAETEEEKDT--WEEKKQREAERLP-----------
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               :.  :. :..  ..:                 ..:::.: :. ::    ...
CCDS42 --------DRTEAREESEPEVKE-----------------DVIEKAELEEMEEVHPSDEE
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CCDS42 EEDATKAEGFYQKHMQEP--LKVTPRSREAFGGRELGLQGKAPEKETSLFLSSLTTPAGA
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        : .: :.:::.:: ::.: : :::: . :.:::  :   .  :: ..          .:
CCDS42 TEHVSYIQDETIPGYSETEQTISDEEIH-DEPEERPAPPRFHTSTYDLPGPEGAGPFEAS
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       .:              ::  :.. : ....    .::  : .    :  ..... .:.  
CCDS42 QPADSAVPATSGKVYGTPETELTYPTNIVAAPLAEEEHVSSATSITECDKLSSFATSVAE
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       ..   :  :  :  .: :           .:.:.::.: ::  ::.:::: ::.::::  
CCDS42 DQSVASLTAPQTEETGKSSLLLDTVTSIPSSRTEATQGLDYVPSAGTISPTSSLEEDK--
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         ....  : . ...   . .  :  ...:.:..   .    .        .. ..:.  
CCDS42 --GFKSPPCEDFSVTGESEKRGEIIGKGLSGERAVEEEEEETA--------NVEMSEKLC
           910       920       930       940               950     

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       .   ::  .  .    . :  : . .  .::.: ::.:.:....::  :   :: :::..
CCDS42 SQYGTP--VFSAPGHALHPGEPALGE--AEERCLSPDDSTVKMASPPPSGPPSATHTPFH
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pF1KB6 QSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPMDEPVPDSESPIEKVLSP
       :::..:::   : .  :      ..   . .:..  . .:.:   :   .    :::  :
CCDS42 QSPVEEKSE--PQDFQEADSWGDTKRTPGVGKEDAAEETVKP--GPEEGTLEKEEKV-PP
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pF1KB6 LRSP-----PLI---GSESAYESFLSADDKA-------SGR------GAES-PFEEKSGK
        :::     :.    :  .   ..: :.:::       .:.      :::. :   ..  
CCDS42 PRSPQAQEAPVNIDEGLTGCTIQLLPAQDKAIVFEIMEAGEPTGPILGAEALPGGLRTLP
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pF1KB6 Q--GSPDQVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALD
       :  :.: : . : .. . ::  .  :. :.  .:  .  .::    .  ... :    : 
CCDS42 QEPGKP-QKDEVLRYPDRSLSPEDAESLSVLSVPSPDTANQEPTPKSPCGLTEQ---YLH
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CCDS42 KDRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSKE-TSLDVSSKQLSPESLGTLQFGELNLGKEEMGHLM
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        . ..:  . :  : ::: .  .::   . .    .:.. ::::.    ..: ..:... 
CCDS42 QAEDTSHHT-APMSVPEPHAATASPPTDGTTRYSAQTDITDDSLDR---KSPASSFSHS-
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        .:: .    : .:. ::   ..: .. :..: .       ...:.. .. :  .   : 
CCDS42 -TPSGNGKYLPGAITSPDEHILTPDSSFSKSPESLPGPALEDIAIKWEDKVPGLK---DR
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       . ..  .:     ::.               ..:..: ::  . : .   : .:. :  .
CCDS42 TSEQKKEPEPKDEVLQ---------------QKDKTLEHKEVVEPKDTAIYQKDEALHVK
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         .:.: . .   ..    .. ..  :.:   .   :.: .:      :: ..:: .   
CCDS42 NEAVKQQDKALEQKGRDLEQKDTALEQKDKALE---PKDKDL-----EEKDKALEQKDKI
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        . .  .:  .: .   ::. .  :.:      .:  :.  .  ...:   :.   .   
CCDS42 KAPEDTVAEMKDRD---LEQTD--KAP---EQKHQAQEQKDKVSEKKDQALEQKYWALGQ
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CCDS42 KD------EALEQNIQALEENHQTQE---QESLVQEDKTRKPKMLEE--KSPEKVKAMEE
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CCDS42 KLEALLEKTKALGLEESLVQEGRAREQEEKYWRGQDVVQEWQET--SPTREEPAGEQKEL
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CCDS42 APAWEDTSPEQDNRYWRGREDVALEQDTYWRELSCERKVWFPHE---LDGQGARPHYTEE
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pF1KB6 RQDVDLCLVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTE--ESEKPLTQSG-GAPPPP
       :... :    . : . :  : .      . .. :    : .  : :. :..:  : ::  
CCDS42 RESTFLDEGPDDEQEVPLREHATRSPWASDFKDFQESSPQKGLEVERWLAESPVGLPPEE
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CCDS42 EDKLTRSPFEIISPPASPPEMVGQRVPSAPGQESPIPDPKLMPHMKNEPTTPSWLADIPP
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pF1KB6 TIPTDKTVTYKHMDP---PPAPV-QDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQN-----------
        .: :. .    ..:   ::.:. ....:.:    ..  :  . :....           
CCDS42 WVPKDRPLPPAPLSPAPGPPTPAPESHTPAPFSWGTAEYDSVVAAVQEGAAELEGGPYSP
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pF1KB6 LGKALKK---DLKEKTKTKKPGTKTKSSS-P-VKKSDGKSKPLAASPKPAGLKESSDKVS
       :::  .:   . .:. ... :  ...::. : ..:: . ..:  . :.        :. :
CCDS42 LGKDYRKAEGEREEEGRAEAPDKSSHSSKVPEASKSHATTEPEQTEPEQREPTPYPDERS
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pF1KB6 -RVASPKKKESVEK--AAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNAANASASKSAKTATAGPGTT
        . :.  ..  .     : ::  : . ::        ::.:: :. . ::.   ..: . 
CCDS42 FQYADIYEQMMLTGLGPACPTREPPLGAAGDWPPCLSTKEAA-AGRNTSAEKELSSPISP
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pF1KB6 KTTKSSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVRSSYYVVSGNDPAAEEPSRAVL
       :. .:                                                       
CCDS42 KSLQSDTPTFSYAALAGPTVPPRPEPGPSMEPSLTPPAVPPRAPILSKGPSPPLNGNILS
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>--
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CCDS42 AEKELSSPISPKSLQSDTPTFSYAALAGPTVPPRPEPGPSMEPSLTPPAVPPR---APIL
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pF1KB6 SSAHTPSQIASPLQEDTLSDVAPPRDMSLYASLTSEKVQSLE-GEKLSPKSDISPLTPRE
       :.. .:   .. :. .       :.. .      : . . :: : . .:... .  .: .
CCDS42 SKGPSPPLNGNILSCSPDRRSPSPKESGRSHWDDSTSDSELEKGAREQPEKEAQSPSPPH
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         :. :::.   : :        :   :::.:.  . :.:   : ::.. :...:     
CCDS42 PIPMGSPTLWPETEA--------HV--SPPLDSHLGPARPSLDFPASAFGFSSLQ---PA
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pF1KB6 NRDLSTPGLEKDSGGKT---PGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYE-------SYEKTTR
         .: .:.  ...   .    :: . :   :   ::.  .:  .         :  .   
CCDS42 PPQLPSPAEPRSAPCGSLAFSGDRALALA-PGPPTRTRHDEYLEVTKAPSLDSSLPQLPS
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pF1KB6 TSDVGGYYYEKIERTTKSPSDSGYSYE-TIGKTTKTPEDGDYSYEIIEKTTRTPEEG---
        :. :.    .. : ..   . : : : :    ... :  . : :  :. .   . :   
CCDS42 PSSPGAPLLSNLPRPASPALSEGSSSEATTPVISSVAERFSPSLEAAEQESGELDPGMEP
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pF1KB6 -GYS-YDISEKTTSPPEVSGYSYEKTERSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETT
        ..: .:..  . .::     .   .     :  :...:        :       :  .:
CCDS42 AAHSLWDLTPLSPAPPASLDLALAPAPS---LPGDMGDGILPC----HL----ECSEAAT
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pF1KB6 EKITSFP-ESEGYSYETSTKTTRTP----------DTSTYC--YETA---EKITRTPQAS
       :: . :   ::  . .  :.:. .:          . .. :  .: .   :   :. . .
CCDS42 EKPSPFQVPSEDCAANGPTETSPNPPGPAPAKAENEEAAACPAWERGAWPEGAERSSRPD
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       :     . .: .. . .: : :  .:.    ..:  : .  . ::::::.:: ::    .
CCDS42 TLLSPEQPVCPAGGSGGPPSSASPEVE-AGPQGCATEPRPHRGELSPSFLNP-PLPPSID
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pF1KB6 EEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQC---DETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEEC
       ..     :  :.  ::     :    :  :   :::::::.:.:. ::.:::::::::::
CCDS42 DRDLSTEEVRLVGRGGRRRVGGPGTTGGPCPVTDETPPTSASDSGSSQSDSDVPPETEEC
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pF1KB6 PSITADANIDSEDESETIPTDKT--VTYKHM-----DPPPAPVQDRSPSPRHPDVSMVDP
       :::::.: .::..... .:.::.  :.  :      :::: :  :  ::: .::: :.::
CCDS42 PSITAEAALDSDEDGDFLPVDKAGGVSGTHHPRPGHDPPPLPQPDPRPSPPRPDVCMADP
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pF1KB6 EALAIEQNLGKALKKDLKEKTK----TKKPGTKTKSSSPVKKSDGKSKPLAASPKPAGLK
       :.:. :.  :.. .   :::..     . :: :.: .::... : ..:    :: :.  :
CCDS42 EGLSSES--GRVERLREKEKVQGRVGRRAPG-KAKPASPARRLDLRGK---RSPTPG--K
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pF1KB6 ESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNAANASASKS-AKTATA
         .:..:: : :. .         .:: .:  :  ::::      ...  ::. ..   :
CCDS42 GPADRASR-APPRPR---------STTSQVTPA--EEKD------GHSPMSKGLVNGLKA
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pF1KB6 GPGTTKTTKSSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVRSSYYVVSGNDPAAEEP
       :: . ..  ::    : :::.:: ::::: ..:..:..::.:::.:::::::::::  ::
CCDS42 GPMALSSKGSS----GAPVYVDLAYIPNHCSGKTADLDFFRRVRASYYVVSGNDPANGEP
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pF1KB6 SRAVLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQ
       :::::::::::::::: :.:::::::::.:: :::::.:::.::.::..:::::::::::
CCDS42 SRAVLDALLEGKAQWGENLQVTLIPTHDTEVTREWYQQTHEQQQQLNVLVLASSSTVVMQ
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pF1KB6 DESFPACKIEL
       ::::::::::.
CCDS42 DESFPACKIEF
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>>CCDS32954.1 MAP1S gene_id:55201|Hs108|chr19             (1059 aa)
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Smith-Waterman score: 1514; 43.5% identity (70.2% similar) in 591 aa overlap (39-618:16-565)

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CCDS32                MAAVAGSGAAAAPSSLLLVVGSEFGSPGLLTYVLEELERGIRSWD
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       ..   ::::..::.::::::: ::  : ::. ::::.: :::.::.::::...  :.: .
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       . : : ::::::.: :.:.::::.::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: :  .   :
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       :. ::  ::: .      .::  .  ...::  . ::. ::: :: ::..::.: ::::.
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       .::::::::::.:..::::::::: ::.:.::::::..:.::::. :: ::::.::::::
CCDS32 LLEPPTSGGFLRLGRPCCYIFPGGLGDAAFFAVNGFTVLVNGGSNPKSSFWKLVRHLDRV
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       :..:.:: : :.:::.::.:.::.:: . : . :. . .: .. ::::.:::::.:. : 
CCDS32 DAVLVTHPGADSLPGLNSLLRRKLAE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEA
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        .      .. :. .:: ..:. : .:.. : :: :.      :..::.:::::.:.:::
CCDS32 AS------RLARGEDEAELALSLLAQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYV
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       :.: ... :                                :.:: .:.:::::.:.::.
CCDS32 LHPPSAGAERT------------------------------LASVCALLVWHPAGPGEKV
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       .:::::: .    .:.:: .:.:: ::..:..: .:: :  :  . .. .. .: .:.. 
CCDS32 VRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHLRFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKRE
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          :..: :..     .::: .. :.:. :. .... : ....  :  :.. .: ...  
CCDS32 GLLATHPRPGQERPGVARKEPARAEAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRA
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CCDS77                  MAGMIDRFSPANTGIRSWDVDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFS
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CCDS77 AE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEAAS------RLARGEDEAELALSLL
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CCDS77 AQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYVLHPPSAGAERT-------------
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