Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5685, 402 aa
1>>>pF1KB5685 402 - 402 aa - 402 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8801+/-0.00107; mu= 13.3094+/- 0.064
mean_var=61.3621+/-12.478, 0's: 0 Z-trim(102.3): 51 B-trim: 34 in 1/48
Lambda= 0.163728
statistics sampled from 6857 (6908) to 6857 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 2644 633.4 1.1e-181
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 1012 247.9 1.2e-65
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 1012 247.9 1.2e-65
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 1001 245.3 7.3e-65
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 786 194.6 1.4e-49
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 724 179.9 3.7e-45
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 724 179.9 3.8e-45
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 642 160.5 2.6e-39
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 640 160.1 3.9e-39
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 632 158.2 1.2e-38
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 614 153.9 2.3e-37
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 614 153.9 2.3e-37
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 614 153.9 2.4e-37
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 612 153.5 3.2e-37
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 594 149.2 6.9e-36
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 591 148.5 9.8e-36
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 582 146.4 4.4e-35
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 570 143.5 3.4e-34
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 569 143.3 4e-34
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 567 142.8 5.4e-34
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 567 142.8 5.8e-34
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 558 140.7 2.1e-33
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 550 138.8 8.3e-33
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 550 138.8 8.9e-33
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 531 134.3 1.9e-31
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 525 132.9 5.1e-31
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 522 132.2 8.4e-31
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 521 132.0 9.6e-31
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 515 130.5 2.7e-30
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 515 130.6 2.8e-30
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 514 130.3 3e-30
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 513 130.1 3.7e-30
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 510 129.4 5.6e-30
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 503 127.7 1.9e-29
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 471 120.2 3.7e-27
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 466 119.0 8.5e-27
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 452 115.6 5.8e-26
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 450 115.2 1.4e-25
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 423 108.8 9.6e-24
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 401 103.6 2.8e-22
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 380 98.6 6.5e-21
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 373 97.0 4e-20
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 346 90.6 2.1e-18
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 334 87.8 2.4e-17
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 328 86.3 2.6e-17
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 322 85.0 1.5e-16
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 303 80.5 3.3e-15
>>CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 (402 aa)
initn: 2644 init1: 2644 opt: 2644 Z-score: 3375.4 bits: 633.4 E(32554): 1.1e-181
Smith-Waterman score: 2644; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRNVVFSPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRNVVFSPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVASVLAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPALRHLYKELMGPWNKDEISTTDAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GVASVLAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPALRHLYKELMGPWNKDEISTTDAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FVQRDLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNLLGKGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FVQRDLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNLLGKGAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DQLTRLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNYTEFTTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DQLTRLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNYTEFTTPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GHYYDILELPYHGDTLSMFIAAPYEKEVPLSALTNILSAQLISHWKGNMTRLPRLLVLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GHYYDILELPYHGDTLSMFIAAPYEKEVPLSALTNILSAQLISHWKGNMTRLPRLLVLPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FSLETEVDLRKPLENLGMTDMFRQFQADFTSLSDQEPLHVAQALQKVKIEVNESGTVASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FSLETEVDLRKPLENLGMTDMFRQFQADFTSLSDQEPLHVAQALQKVKIEVNESGTVASS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB5 STAVIVSARMAPEEIIMDRPFLFVVRHNPTGTVLFMGQVMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 STAVIVSARMAPEEIIMDRPFLFVVRHNPTGTVLFMGQVMEP
370 380 390 400
>>CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 (397 aa)
initn: 986 init1: 706 opt: 1012 Z-score: 1292.1 bits: 247.9 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1012; 41.4% identity (73.9% similar) in 379 aa overlap (25-402:21-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRNVVFSPY
: : . .:.:. :..::.:.... :.:.::.
CCDS46 MNWHLPLFLLASVTLPSICSHFNPLSLEELGSNTGIQVFNQIVKSRPHDNIVISPH
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70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GVASVLAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPALRHLYKELMGPWNKDEISTTDAI
:.::::.:::: . :.:..:. .: . .. :.. :... : ... ::: .....:.
CCDS46 GIASVLGMLQLGADGRTKKQLAMVMRYGVN--GVGKILKKINKAIVSKKNKDIVTVANAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FVQRDLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNLLGKGAV
::. .. :. . .:. :..:.: . : :: :::..:. ::.:::. .
CCDS46 FVKNASEIEVPFVTRNKDVFQCEVRNVNFEDPASACDSINAWVKNETRDMIDNLLSPDLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 DQ-LTRLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNYTEFTTP
: :::::::::.::.: ::. : .:..: : .::.. .:::.:: . : ..:
CCDS46 DGVLTRLVLVNAVYFKGLWKSRFQPENTKKRTFVAADGKSYQVPMLAQLSVFRCGSTSAP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DGHYYDILELPYHGDTLSMFIAAPYEKEVPLSALTNILSAQLISHWKGNMTRLPRLLVLP
. .:...::::::...::.:: : :. .::::. .:.. :. : . :. ..::
CCDS46 NDLWYNFIELPYHGESISMLIALPTESSTPLSAIIPHISTKTIDSWMSIMVPKRVQVILP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KFSLETEVDLRKPLENLGMTDMFRQFQADFTSLSDQEPLHVAQALQKVKIEVNESGTVAS
::. ...::..::. ::.:::: . .:.:.... .: :::.. :::.::::.:.:: ::
CCDS46 KFTAVAQTDLKEPLKVLGITDMFDSSKANFAKITRSENLHVSHILQKAKIEVSEDGTKAS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB5 SSTAVIVSARMAPEEIIMDRPFLFVVRHNPTGTVLFMGQVMEP
..:..:. :: .: .:.:::::: .::::::.::::::. .:
CCDS46 AATTAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHNPTGAVLFMGQINKP
360 370 380 390
>>CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 (409 aa)
initn: 986 init1: 706 opt: 1012 Z-score: 1291.9 bits: 247.9 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1012; 41.4% identity (73.9% similar) in 379 aa overlap (25-402:33-409)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRN
: : . .:.:. :..::.:.... :
CCDS46 DCRSSLVEGTMNWHLPLFLLASVTLPSICSHFNPLSLEELGSNTGIQVFNQIVKSRPHDN
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 VVFSPYGVASVLAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPALRHLYKELMGPWNKDEI
.:.::.:.::::.:::: . :.:..:. .: . .. :.. :... : ... ::: .
CCDS46 IVISPHGIASVLGMLQLGADGRTKKQLAMVMRYGVN--GVGKILKKINKAIVSKKNKDIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 STTDAIFVQRDLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNL
....:.::. .. :. . .:. :..:.: . : :: :::..:. ::.::
CCDS46 TVANAVFVKNASEIEVPFVTRNKDVFQCEVRNVNFEDPASACDSINAWVKNETRDMIDNL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LGKGAVDQ-LTRLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNY
:. .: :::::::::.::.: ::. : .:..: : .::.. .:::.:: . :
CCDS46 LSPDLIDGVLTRLVLVNAVYFKGLWKSRFQPENTKKRTFVAADGKSYQVPMLAQLSVFRC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TEFTTPDGHYYDILELPYHGDTLSMFIAAPYEKEVPLSALTNILSAQLISHWKGNMTRLP
..:. .:...::::::...::.:: : :. .::::. .:.. :. : . :.
CCDS46 GSTSAPNDLWYNFIELPYHGESISMLIALPTESSTPLSAIIPHISTKTIDSWMSIMVPKR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RLLVLPKFSLETEVDLRKPLENLGMTDMFRQFQADFTSLSDQEPLHVAQALQKVKIEVNE
..::::. ...::..::. ::.:::: . .:.:.... .: :::.. :::.::::.:
CCDS46 VQVILPKFTAVAQTDLKEPLKVLGITDMFDSSKANFAKITRSENLHVSHILQKAKIEVSE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB5 SGTVASSSTAVIVSARMAPEEIIMDRPFLFVVRHNPTGTVLFMGQVMEP
.:: ::..:..:. :: .: .:.:::::: .::::::.::::::. .:
CCDS46 DGTKASAATTAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHNPTGAVLFMGQINKP
370 380 390 400
>>CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 (398 aa)
initn: 954 init1: 418 opt: 1001 Z-score: 1278.0 bits: 245.3 E(32554): 7.3e-65
Smith-Waterman score: 1001; 41.3% identity (73.7% similar) in 380 aa overlap (25-402:21-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQMSPALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRNVVFSPY
: : . .:.:. :..::.:.... :.:.::.
CCDS24 MNWHLPLFLLASVTLPSICSHFNPLSLEELGSNTGIQVFNQIVKSRPHDNIVISPH
10 20 30 40 50
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pF1KB5 GVASVLAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPALRHLYKELMGPWNKDEISTTDAI
:.::::.:::: . :.:..:. .: . .. :.. :... : ... ::: .....:.
CCDS24 GIASVLGMLQLGADGRTKKQLAMVMRYGVN--GVGKILKKINKAIVSKKNKDIVTVANAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FVQRDLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNLLGKGAV
::. .. :. . .:. :..:.: . : :: :::..:. ::.:::. .
CCDS24 FVKNASEIEVPFVTRNKDVFQCEVRNVNFEDPASACDSINAWVKNETRDMIDNLLSPDLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 DQ-LTRLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNYTEFTTP
: :::::::::.::.: ::. : .:..: : .::.. .:::.:: . : ..:
CCDS24 DGVLTRLVLVNAVYFKGLWKSRFQPENTKKRTFVAADGKSYQVPMLAQLSVFRCGSTSAP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DGHYYDILELPYHGDTLSMFIAAPYEKEVPLSALTNILSAQLISHWKGNMTRLPRLLVLP
. .:...::::::...::.:: : :. .::::. .:.. :. : . :. ..::
CCDS24 NDLWYNFIELPYHGESISMLIALPTESSTPLSAIIPHISTKTIDSWMSIMVPKRVQVILP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KFSLETEVDLRKPLENLGMTDMFRQFQADFTSLSD-QEPLHVAQALQKVKIEVNESGTVA
::. ...::..::. ::.:::: . .:.:.... .: :::.. :::.::::.:.:: :
CCDS24 KFTAVAQTDLKEPLKVLGITDMFDSSKANFAKITTGSENLHVSHILQKAKIEVSEDGTKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB5 SSSTAVIVSARMAPEEIIMDRPFLFVVRHNPTGTVLFMGQVMEP
:..:..:. :: .: .:.:::::: .::::::.::::::. .:
CCDS24 SAATTAILIARSSPPWFIVDRPFLFFIRHNPTGAVLFMGQINKP
360 370 380 390
>>CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 (410 aa)
initn: 719 init1: 267 opt: 786 Z-score: 1003.3 bits: 194.6 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 786; 33.4% identity (72.5% similar) in 374 aa overlap (36-402:27-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 ALTCLVLGLALVFGEGSAVHHPPSYVAHLASDFGVRVFQQVAQASKDRNVVFSPYGVASV
.:..: ..... ...:.:..::: ..: .
CCDS32 MAFLGLFSLLVLQSMATGATFPEEAIADLSVNMYNRLRATGEDENILFSPLSIALA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAMLQLTTGGETQQQIQAAMGFKIDDKGMAPA-LRHLYKELMGPWNKDEISTTDAIFVQR
..:..: . : ::..:. .::. .: . :... . . . .. .. ....:::
CCDS32 MGMMELGAQGSTQKEIRHSMGYDSLKNGEEFSFLKEFSNMVTAKESQYVMKIANSLFVQN
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 DLKLVQGFMPHFFRLFRSTVKQVDFSEVERARFIINDWVKTHTKGMISNLLGKGAVDQLT
... . :. . . : ..:..::::. . :: ::...:......:.. : :
CCDS32 GFHVNEEFLQMMKKYFNAAVNHVDFSQNVAVANYINKWVENNTNNLVKDLVSPRDFDAAT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RLVLVNALYFNGQWKTPFPDSSTHRRLFHKSDGSTVSVPMMAQTNKFNYTEFTTPD---G
:.:.::.::.:.::. : .:. : :.: : :..::: : ..: : ::. . :
CCDS32 YLALINAVYFKGNWKSQFRPENTRTFSFTKDDESEVQIPMMYQQGEFYYGEFSDGSNEAG
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250 260 270 280 290 300
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CCDS75 STGIHIPVIMSLAQSQFIANHPFLFIMKHNPTESILFMGRVTNPDTQEIKGRDLDSL
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CCDS53 SGATALLLLKRSRIPIFKADRPFIYFLREPNTGITVFFDRIQIIYQCLSSNKGSFVHYPL
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CCDS53 KNKHSF
420
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CCDS13 EAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
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CCDS11 FLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKL
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CCDS11 VLVNAIYFKGKWNEQF-DRKYTRGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKF---KMGYADEVHTQV
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CCDS11 LELPYVEEELSMVILLP-DDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLE
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CCDS11 ESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAV
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CCDS11 VRNSRCSRMEPR-FCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
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402 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]