Result of FASTA (ccds) for pF1KB5484
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5484, 650 aa
  1>>>pF1KB5484 650 - 650 aa - 650 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9929+/-0.000731; mu= 9.0830+/- 0.044
 mean_var=163.5646+/-32.082, 0's: 0 Z-trim(115.7): 15  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.100284
 statistics sampled from 16278 (16293) to 16278 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.804), E-opt: 0.2 (0.5), width:  16
 Scan time:  4.760

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32997.1 APLP1 gene_id:333|Hs108|chr19          ( 651) 4434 653.2 3.2e-187
CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 695)  798 127.2 7.6e-29
CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 522)  762 121.9 2.2e-27
CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11           ( 763)  764 122.3 2.5e-27
CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 751)  761 121.9 3.3e-27
CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 761)  761 121.9 3.3e-27
CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 639)  719 115.7   2e-25
CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 660)  719 115.7   2e-25
CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 695)  719 115.8 2.1e-25
CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 746)  702 113.3 1.2e-24
CCDS33523.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 751)  702 113.3 1.2e-24
CCDS46639.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 714)  683 110.6 7.9e-24
CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 752)  683 110.6 8.2e-24
CCDS13576.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 770)  683 110.6 8.4e-24


>>CCDS32997.1 APLP1 gene_id:333|Hs108|chr19               (651 aa)
 initn: 3573 init1: 3573 opt: 4434  Z-score: 3474.8  bits: 653.2 E(32554): 3.2e-187
Smith-Waterman score: 4434; 99.8% identity (99.8% similar) in 651 aa overlap (1-650:1-651)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGPASPAARGLSRRPGQPPLPLLLPLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGPASPAARGLSRRPGQPPLPLLLPLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 GRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 CSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPPGTPDPSGTAVGDPSTRSWPPGSRVEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPPGTPDPSGTAVGDPSTRSWPPGSRVEGA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDEEEEESFPQPVDDYFVEPPQAEEEEETVPPPSSHTLAVVGKVTPTPRPTDGVDIYFGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDEEEEESFPQPVDDYFVEPPQAEEEEETVPPPSSHTLAVVGKVTPTPRPTDGVDIYFGM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRAE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 QKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510        520       530         
pF1KB5 IQELLHSEHLGPSELEAPAPGGSSEDKGGLQPPDSKD-DTPMTLPKGSTEQDAASPEKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQELLHSEHLGPSELEAPAPGGSSEDKGGLQPPDSKDADTPMTLPKGSTEQDAASPEKEK
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB5 MNPLEQYERKVNASVPRGFPFHSSEIQRDELAPAGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNPLEQYERKVNASVPRGFPFHSSEIQRDELAPAGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLS
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650
pF1KB5 MLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP
              610       620       630       640       650 

>>CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (695 aa)
 initn: 1612 init1: 768 opt: 798  Z-score: 631.4  bits: 127.2 E(32554): 7.6e-29
Smith-Waterman score: 1602; 40.6% identity (69.3% similar) in 684 aa overlap (23-648:15-692)

               10        20        30        40              50    
pF1KB5 MGPASPAARGLSRRPGQPPLPLLLPLLLLLLRAQPAIGSLAG------GSPGAAEAPGSA
                             :: :::. : : ::. .:::      .. :.. : .  
CCDS44         MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTA-PAL-ALAGYIEALAANAGTGFAVAEP
                       10        20          30        40        50

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB5 QVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAI
       :.: .::.:..: ...::.:::::  .. :..  ..::.::..:::::::. : .:.: .
CCDS44 QIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRV
               60        70        80        90       100       110

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 PMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRH
        .. ::  ... .:    . :.::.:: :::::..::::: :.:.:.:::. ::.  . :
CCDS44 SIDNWCRRDKK-QCK--SRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWH
              120          130       140       150       160       

          180       190       200       210                 220    
pF1KB5 QEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPP---GT-------PDPSGTAVG
         ..::: .::. :.. ::::::: :.:.:.::::::     :.        :       
CCDS44 TVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEE
       170       180       190       200       210       220       

                      230       240       250         260       270
pF1KB5 D------------PSTRSWPPGSRVEGAEDEEEEESFPQPVDD--YFVEPPQAEEEEETV
       :            :.  .    ...   ::.:.::   . :.:  :. .  .... .:  
CCDS44 DEEEDYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEEN
       230       240       250       260       270       280       

                   280         290       300       310       320   
pF1KB5 P--PPSSHTLA---VVG--KVTPTPRPTDGVDIYFGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMR
       :  : :. :..   ..   :: ::: ::. ::.::   .. .::  : .:: .:: :.  
CCDS44 PTEPGSDGTMSDKEITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRN
       290       300       310       320       330       340       

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB5 QINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIAL
       ....: .::  :. :.::::::.::.: .:::.....::.....:.:.::::: .:: :.
CCDS44 RMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAM
       350       360       370       380       390       400       

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB5 INDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQ
       .::.:: :::..:::::.:::. .:.: :::::.:::.:.. ::.:::::: ::::::: 
CCDS44 LNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAA
       410       420       430       440       450       460       

           450       460       470       480       490             
pF1KB5 QMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRPQIQELLHSEHLGPSEL-----EAP
       ::. :: :::.::::: ::::.:: . :..:::.. .:.:::. ..   ...     :.:
CCDS44 QMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETP
       470       480       490       500       510       520       

      500       510       520           530         540         550
pF1KB5 APGGSSEDKGGLQPPDSKDDTPMTLPK----GSTEQDAA--SPEKEKMNPLEQYERK--V
       .    : ...   ::        .::.    :  :::..  . :.. .:  .. ...  .
CCDS44 VDVRVSSEESEEIPPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVI
       530       540       550       560       570       580       

               560            570         580       590       600  
pF1KB5 NASVP-RGFPFHSSEI-----QRDELAP--AGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLL
       . ..  . . :.. ..     .:. ..:     ..:  :. :::..... ...::.:...
CCDS44 DETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVM
       590       600       610       620       630       640       

            610       620       630       640       650 
pF1KB5 LRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP 
       :: :. ::.::::.:::::::: ::..: ..: ::::::::..::.   
CCDS44 LR-KRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
        650       660       670       680       690     

>>CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (522 aa)
 initn: 1253 init1: 762 opt: 762  Z-score: 605.0  bits: 121.9 E(32554): 2.2e-27
Smith-Waterman score: 1023; 33.7% identity (57.7% similar) in 653 aa overlap (23-648:15-519)

               10        20        30        40              50    
pF1KB5 MGPASPAARGLSRRPGQPPLPLLLPLLLLLLRAQPAIGSLAG------GSPGAAEAPGSA
                             :: :::. : : ::. .:::      .. :.. : .  
CCDS44         MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTA-PAL-ALAGYIEALAANAGTGFAVAEP
                       10        20          30        40        50

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB5 QVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAI
       :.: .::.:..: ...::.:::::  .. :..  ..::.::..:::::::. : .:.: .
CCDS44 QIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRV
               60        70        80        90       100       110

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 PMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRH
        .. ::  ... .:    . :.::.::          ::                     
CCDS44 SIDNWCRRDKK-QCKS--RFVTPFKCL----------VP---------------------
              120          130                                     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 QEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPPGTPDPSGTAVGDPSTRSWPPG
                                                                   
CCDS44 ------------------------------------------------------------
                                                                   

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 SRVEGAEDEEEEESFPQPVDDYFVEPPQAEEEEETVPPPSSHTLAVVGKVTPTPRPTDGV
                                                          ::: ::. :
CCDS44 ---------------------------------------------------PTPLPTNDV
                                                           140     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 DIYFGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHF
       :.::   .. .::  : .:: .:: :.  ....: .::  :. :.::::::.::.: .::
CCDS44 DVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHF
         150       160       170       180       190       200     

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 QSILQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALR
       :.....::.....:.:.::::: .:: :..::.:: :::..:::::.:::. .:.: :::
CCDS44 QAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQALR
         210       220       230       240       250       260     

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB5 RYLRAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLA
       ::.:::.:.. ::.:::::: ::::::: ::. :: :::.::::: ::::.:: . :..:
CCDS44 RYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVA
         270       280       290       300       310       320     

          480       490            500       510       520         
pF1KB5 QELRPQIQELLHSEHLGPSEL-----EAPAPGGSSEDKGGLQPPDSKDDTPMTLPK----
       ::.. .:.:::. ..   ...     :.:.    : ...   ::        .::.    
CCDS44 QEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPFPALPENEGS
         330       340       350       360       370       380     

         530         540         550        560            570     
pF1KB5 GSTEQDAA--SPEKEKMNPLEQYERK--VNASVP-RGFPFHSSEI-----QRDELAP--A
       :  :::..  . :.. .:  .. ...  .. ..  . . :.. ..     .:. ..:   
CCDS44 GVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLRE
         390       400       410       420       430       440     

           580       590       600       610       620       630   
pF1KB5 GTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLREL
         ..:  :. :::..... ...::.:...:: :. ::.::::.:::::::: ::..: ..
CCDS44 DFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLR-KRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKM
         450       460       470        480       490       500    

           640       650 
pF1KB5 QRHGYENPTYRFLEERP 
       : ::::::::..::.   
CCDS44 QNHGYENPTYKYLEQMQI
          510       520  

>>CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11                (763 aa)
 initn: 1605 init1: 761 opt: 764  Z-score: 604.2  bits: 122.3 E(32554): 2.5e-27
Smith-Waterman score: 1474; 37.8% identity (64.0% similar) in 714 aa overlap (55-648:51-760)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KB5 PLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRC
                                     :.: .::.:..: ...::.:::::  .. :
CCDS84 VGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSC
               30        40        50        60        70        80

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB5 LRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGE
       ..  ..::.::..:::::::. : .:.: . .. ::  ... .:      :.::.:: ::
CCDS84 FETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKK-QCKSRF--VTPFKCLVGE
               90       100       110       120          130       

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB5 FVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRG
       :::..::::: :.:.:.:::. ::.  . :  ..::: .::. :.. ::::::: :.:.:
CCDS84 FVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHG
       140       150       160       170       180       190       

          210                       220       230             240  
pF1KB5 VEYVCCPPP---GT-------------PDPSGTAVGDPSTRSWPPGSRVEG------AED
       .::::::     :.              . .     :     .:  . .:        ::
CCDS84 TEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDED
       200       210       220       230       240       250       

            250         260       270                              
pF1KB5 EEEEESFPQPVDD--YFVEPPQAEEEEETVP--PPSSHTL--------------------
       .:.::   . :.:  :. .  .... .:  :  : :. :.                    
CCDS84 DEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKAVCSQEAMTG
       260       270       280       290       300       310       

         280                                             290       
pF1KB5 ---AVV---------GK-----------------------------VTPTPRPTDGVDIY
          ::.         ::                             . ::: ::. ::.:
CCDS84 PCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKAMIPPTPLPTNDVDVY
       320       330       340       350       360       370       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 FGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSI
       :   .. .::  : .:: .:: :.  ....: .::  :. :.::::::.::.: .:::..
CCDS84 FETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAM
       380       390       400       410       420       430       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 LQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYL
       ...::.....:.:.::::: .:: :..::.:: :::..:::::.:::. .:.: :::::.
CCDS84 VKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYV
       440       450       460       470       480       490       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 RAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQEL
       :::.:.. ::.:::::: ::::::: ::. :: :::.::::: ::::.:: . :..:::.
CCDS84 RAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEI
       500       510       520       530       540       550       

       480       490          500          510                 520 
pF1KB5 RPQIQELLHSEHLGPSELEAP---APGG---SSEDKGGLQP----------PDSKDDTP-
       . .:.:::. ..   ... :    .:     :::..  . :          :...:  : 
CCDS84 QEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPFPALPENEDTQPE
       560       570       580       590       600       610       

                  530         540         550        560           
pF1KB5 --MTLPKGST--EQDAA--SPEKEKMNPLEQYERK--VNASVP-RGFPFHSSEI-----Q
           . :::   :::..  . :.. .:  .. ...  .. ..  . . :.. ..     .
CCDS84 LYHPMKKGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEE
       620       630       640       650       660       670       

        570         580       590       600       610       620    
pF1KB5 RDELAP--AGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLT
       :. ..:     ..:  :. :::..... ...::.:...:: :. ::.::::.::::::::
CCDS84 RESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLR-KRQYGTISHGIVEVDPMLT
       680       690       700       710        720       730      

          630       640       650 
pF1KB5 LEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP 
        ::..: ..: ::::::::..::.   
CCDS84 PEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
        740       750       760   

>>CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (751 aa)
 initn: 1605 init1: 761 opt: 761  Z-score: 601.9  bits: 121.9 E(32554): 3.3e-27
Smith-Waterman score: 1473; 38.1% identity (64.4% similar) in 703 aa overlap (55-648:51-748)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KB5 PLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRC
                                     :.: .::.:..: ...::.:::::  .. :
CCDS44 VGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSC
               30        40        50        60        70        80

           90       100       110       120       130       140    
pF1KB5 LRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGE
       ..  ..::.::..:::::::. : .:.: . .. ::  ... .:      :.::.:: ::
CCDS44 FETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKK-QCKSRF--VTPFKCLVGE
               90       100       110       120          130       

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB5 FVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRG
       :::..::::: :.:.:.:::. ::.  . :  ..::: .::. :.. ::::::: :.:.:
CCDS44 FVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHG
       140       150       160       170       180       190       

          210                       220       230             240  
pF1KB5 VEYVCCPPP---GT-------------PDPSGTAVGDPSTRSWPPGSRVEG------AED
       .::::::     :.              . .     :     .:  . .:        ::
CCDS44 TEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDED
       200       210       220       230       240       250       

            250         260       270                              
pF1KB5 EEEEESFPQPVDD--YFVEPPQAEEEEETVP--PPSSHTL--------------------
       .:.::   . :.:  :. .  .... .:  :  : :. :.                    
CCDS44 DEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKAVCSQEAMTG
       260       270       280       290       300       310       

         280                                             290       
pF1KB5 ---AVV---------GK-----------------------------VTPTPRPTDGVDIY
          ::.         ::                             . ::: ::. ::.:
CCDS44 PCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKAMIPPTPLPTNDVDVY
       320       330       340       350       360       370       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 FGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSI
       :   .. .::  : .:: .:: :.  ....: .::  :. :.::::::.::.: .:::..
CCDS44 FETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAM
       380       390       400       410       420       430       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 LQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYL
       ...::.....:.:.::::: .:: :..::.:: :::..:::::.:::. .:.: :::::.
CCDS44 VKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYV
       440       450       460       470       480       490       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 RAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQEL
       :::.:.. ::.:::::: ::::::: ::. :: :::.::::: ::::.:: . :..:::.
CCDS44 RAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEI
       500       510       520       530       540       550       

       480       490          500          510       520           
pF1KB5 RPQIQELLHSEHLGPSELEAP---APGG---SSEDKGGLQPPDSKDDTPMTLPK----GS
       . .:.:::. ..   ... :    .:     :::..  . :       : .::.    : 
CCDS44 QEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPFP-ALPENEGSGV
       560       570       580       590       600        610      

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pF1KB5 TEQDAA--SPEKEKMNPLEQYERK--VNASVP-RGFPFHSSEI-----QRDELAP--AGT
        :::..  . :.. .:  .. ...  .. ..  . . :.. ..     .:. ..:     
CCDS44 GEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDF
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pF1KB5 GVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQR
       ..:  :. :::..... ...::.:...:: :. ::.::::.:::::::: ::..: ..: 
CCDS44 SLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLR-KRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQN
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pF1KB5 HGYENPTYRFLEERP 
       ::::::::..::.   
CCDS44 HGYENPTYKYLEQMQI
         740       750 

>>CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (761 aa)
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CCDS58 WRCLPASVDRGNPLWALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSC
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       ..  ..::.::..:::::::. : .:.: . .. ::  ... .:      :.::.:: ::
CCDS58 FETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKK-QCKSRF--VTPFKCLVGE
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pF1KB5 FVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRG
       :::..::::: :.:.:.:::. ::.  . :  ..::: .::. :.. ::::::: :.:.:
CCDS58 FVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHG
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pF1KB5 VEYVCCPPP---GT-------------PDPSGTAVGDPSTRSWPPGSRVEG------AED
       .::::::     :.              . .     :     .:  . .:        ::
CCDS58 TEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDED
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pF1KB5 EEEEESFPQPVDD--YFVEPPQAEEEEETVP--PPSSHTL--------------------
       .:.::   . :.:  :. .  .... .:  :  : :. :.                    
CCDS58 DEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKAVCSQEAMTG
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pF1KB5 ---AVV---------GK-----------------------------VTPTPRPTDGVDIY
          ::.         ::                             . ::: ::. ::.:
CCDS58 PCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKAMIPPTPLPTNDVDVY
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pF1KB5 FGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSI
       :   .. .::  : .:: .:: :.  ....: .::  :. :.::::::.::.: .:::..
CCDS58 FETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAM
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pF1KB5 LQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYL
       ...::.....:.:.::::: .:: :..::.:: :::..:::::.:::. .:.: :::::.
CCDS58 VKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYV
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pF1KB5 RAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQEL
       :::.:.. ::.:::::: ::::::: ::. :: :::.::::: ::::.:: . :..:::.
CCDS58 RAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEI
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pF1KB5 RPQIQELLHSEHLGPSELEAP---APGG---SSEDKGGLQPPDSKDDTPMTLPK----GS
       . .:.:::. ..   ... :    .:     :::..  . :       : .::.    : 
CCDS58 QEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPFP-ALPENEGSGV
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        :::..  . :.. .:  .. ...  .. ..  . . :.. ..     .:. ..:     
CCDS58 GEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDF
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pF1KB5 GVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQR
       ..:  :. :::..... ...::.:...:: :. ::.::::.:::::::: ::..: ..: 
CCDS58 SLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLR-KRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQN
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pF1KB5 HGYENPTYRFLEERP 
       ::::::::..::.   
CCDS58 HGYENPTYKYLEQMQI
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                                     ..::::::. : .:.: . .. ::  .:. 
CCDS46             MLPGLALLLLAAWTARALEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQ
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pF1KB5 SCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGL
         .:::  :.:.::: :::::.:::::. :.:::::::: ::.  . :  :.:.:: .. 
CCDS46 CKTHPHF-VIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKST
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pF1KB5 ILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPPGTPD--PSGTAVGDPSTRSW-------PPGSR-
        ::  ::::::: :.:::::.::::     :   :. :  : :   :         ::. 
CCDS46 NLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSED
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pF1KB5 --VEGAEDEEEEESFPQPVDDYFVEPPQAEEEEETVPP---PSSHTLAVVGKVTPTPR--
         :: ::.::  :   . .::   .    : :::.  :    . .: ...  .: : .  
CCDS46 KVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESV
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pF1KB5 ------PT------DGVDIYFGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADN
             ::      :.:: :.  ::. .::  : .::  :: .. .....:::::  :. 
CCDS46 EEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAER
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pF1KB5 QSKNLPKADRQALNEHFQSILQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLA
       :.:::::::..:. .:::  ...::.....:::.::::: .:: :..::.:: :::....
CCDS46 QAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYIT
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pF1KB5 ALQADPPQAERVLLALRRYLRAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIE
       :::: ::. ..:.  :..:.:::::...:::.:..::  :::.:: :.: :: :::.:: 
CCDS46 ALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIY
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pF1KB5 ERVNQSLGLLDQNPHLAQELRPQIQELLHSEH----------------------LGPSEL
       ::.::::.:: . : .:.:.. ...:::..:.                      : ::  
CCDS46 ERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLT
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       :.       :. :  : :   :::  :   :..: .  .. .:   : :  ..     : 
CCDS46 ETKTTVELLPVNGEFSLDD--LQPWHSFGADSVPANT-ENEVEPVDARPAADRGLTTRPG
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pF1KB5 --LEQYERKVNASVPRGFPF-HSS--EIQRDELA--PAGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSL
         : . . .  . :     : :.:  :.....:.     .: .. :. ::.. :.  ...
CCDS46 SGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATV
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pF1KB5 IVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP 
       ::.....:. :: : .: :::::::  .: ::..: ..:..:::::::.       
CCDS46 IVITLVMLK-KKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
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>>CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (660 aa)
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pF1KB5 LLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDP
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CCDS56                              MFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTK
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pF1KB5 QRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSE
       . .:.::...::::::. : .:.: . .. ::  .:.   .:::  :.:.::: :::::.
CCDS56 EGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHF-VIPYRCLVGEFVSD
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pF1KB5 ALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYV
       :::::. :.:::::::: ::.  . :  :.:.:: ..  ::  ::::::: :.:::::.:
CCDS56 ALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFV
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pF1KB5 CCPPPGTPD--PSGTAVGDPSTRSW-------PPGSR---VEGAEDEEEEESFPQPVDDY
       :::     :   :. :  : :   :         ::.   :: ::.::  :   . .:: 
CCDS56 CCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDD
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        260       270          280               290               
pF1KB5 FVEPPQAEEEEETVPP---PSSHTLAVVGKVTPTPR--------PT------DGVDIYFG
         .    : :::.  :    . .: ...  .: : .        ::      :.:: :. 
CCDS56 EDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLE
              220       230       240       250       260       270

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 MPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQ
        ::. .::  : .::  :: .. .....:::::  :. :.:::::::..:. .:::  ..
CCDS56 TPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVE
              280       290       300       310       320       330

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 TLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRA
       .::.....:::.::::: .:: :..::.:: :::....:::: ::. ..:.  :..:.::
CCDS56 SLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRA
              340       350       360       370       380       390

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 EQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRP
       :::...:::.:..::  :::.:: :.: :: :::.:: ::.::::.:: . : .:.:.. 
CCDS56 EQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQD
              400       410       420       430       440       450

     480                             490              500       510
pF1KB5 QIQELLHSEH----------------------LGPSELEA-------PAPGGSSEDKGGL
       ...:::..:.                      : ::  :.       :. :  : :   :
CCDS56 EVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLD--DL
              460       470       480       490       500          

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pF1KB5 QPPDS--KDDTPMTLPKGSTEQDAASPEKEK---MNP---LEQYERKVNASVPRGFPF-H
       ::  :   :..: .  .. .:   : :  ..     :   : . . .  . :     : :
CCDS56 QPWHSFGADSVPANT-ENEVEPVDARPAADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRH
      510       520        530       540       550       560       

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pF1KB5 SS--EIQRDELA--PAGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVV
       .:  :.....:.     .: .. :. ::.. :.  ...::.....:..:. : .: ::::
CCDS56 DSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQ-YTSIHHGVV
       570       580       590       600       610        620      

       620       630       640       650 
pF1KB5 EVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEERP 
       :::  .: ::..: ..:..:::::::.       
CCDS56 EVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
        630       640       650       660

>>CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (695 aa)
 initn: 1263 init1: 684 opt: 719  Z-score: 569.6  bits: 115.8 E(32554): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 1495; 39.4% identity (64.1% similar) in 693 aa overlap (23-644:1-688)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGPASPAARGLSRRPGQPPLPLLLPLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLC
                             .:: : ::: :  .  .:   . : :   .  :.: .:
CCDS13                       MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFC
                                     10        20        30        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 GRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRCLRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWC
       :::..: ....:.:. ::. .. :.   . .:.::...::::::. : .:.: . .. ::
CCDS13 GRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWC
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KB5 GGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGEFVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEA
         .:.   .:::  :.:.::: :::::.:::::. :.:::::::: ::.  . :  :.:.
CCDS13 KRGRKQCKTHPHF-VIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKET
      100       110        120       130       140       150       

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pF1KB5 CSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRGVEYVCCPPPGTPD--PSGTAVGDPSTRSW-------
       :: ..  ::  ::::::: :.:::::.::::     :   :. :  : :   :       
CCDS13 CSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDY
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KB5 PPGSR---VEGAEDEEEEESFPQPVDDYFVEPPQAEEEEETVPP---PSSHTLAVVGKVT
         ::.   :: ::.::  :   . .::   .    : :::.  :    . .: ...  .:
CCDS13 ADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTT
       220       230       240       250       260       270       

                 290             300       310       320       330 
pF1KB5 PTPR--------PT------DGVDIYFGMPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMRE
        : .        ::      :.:: :.  ::. .::  : .::  :: .. .....::::
CCDS13 TTTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMRE
       280       290       300       310       320       330       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB5 WAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQTLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAA
       :  :. :.:::::::..:. .:::  ...::.....:::.::::: .:: :..::.:: :
CCDS13 WEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLA
       340       350       360       370       380       390       

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB5 LEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRAEQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHT
       ::....:::: ::. ..:.  :..:.:::::...:::.:..::  :::.:: :.: :: :
CCDS13 LENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMT
       400       410       420       430       440       450       

             460       470       480                               
pF1KB5 HLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRPQIQELLHSEH----------------------
       ::.:: ::.::::.:: . : .:.:.. ...:::..:.                      
CCDS13 HLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDA
       460       470       480       490       500       510       

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pF1KB5 LGPSELEA-------PAPGGSSEDKGGLQPPDS--KDDTPMTLPKGSTEQDAASPEKEK-
       : ::  :.       :. :  : :   :::  :   :..: .  .. .:   : :  .. 
CCDS13 LMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDD--LQPWHSFGADSVPANT-ENEVEPVDARPAADRG
       520       530       540         550        560       570    

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pF1KB5 --MNP---LEQYERKVNASVPRGFPF-HSS--EIQRDELA--PAGTGVSREAVSGLLIMG
           :   : . . .  . :     : :.:  :.....:.     .: .. :. ::.. :
CCDS13 LTTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
          580       590       600       610       620       630    

     590       600       610       620       630       640         
pF1KB5 AGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVVEVDPMLTLEEQQLRELQRHGYENPTYRFLEER
       .  ...::.....:. :: : .: :::::::  .: ::..: ..:..:::::::.     
CCDS13 VVIATVIVITLVMLK-KKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQM
          640        650       660       670       680       690   

     650 
pF1KB5 P 
         
CCDS13 QN
         

>>CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (746 aa)
 initn: 1264 init1: 675 opt: 702  Z-score: 555.9  bits: 113.3 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 1375; 37.2% identity (60.3% similar) in 717 aa overlap (55-644:28-739)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KB5 PLLLLLLRAQPAIGSLAGGSPGAAEAPGSAQVAGLCGRLTLHRDLRTGRWEPDPQRSRRC
                                     :.: .::::..: ....:.:. ::. .. :
CCDS56    MDQLEDLLVLFINYVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTC
                  10        20        30        40        50       

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pF1KB5 LRDPQRVLEYCRQMYPELQIARVEQATQAIPMERWCGGSRSGSCAHPHHQVVPFRCLPGE
       .   . .:.::...::::::. : .:.: . .. ::  .:.   .:::  :.:.::: ::
CCDS56 IDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHF-VIPYRCLVGE
        60        70        80        90       100        110      

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB5 FVSEALLVPEGCRFLHQERMDQCESSTRRHQEAQEACSSQGLILHGSGMLLPCGSDRFRG
       :::.:::::. :.:::::::: ::.  . :  :.:.:: ..  ::  ::::::: :.:::
CCDS56 FVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRG
        120       130       140       150       160       170      

          210         220       230                 240            
pF1KB5 VEYVCCPPPGTPD--PSGTAVGDPSTRSW-------PPGSR---VEGAEDEE----EEES
       ::.::::     :   :. :  : :   :         ::.   :: ::.::    ::: 
CCDS56 VEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEE
        180       190       200       210       220       230      

      250              260                                   270   
pF1KB5 FPQPVDDY-------FVEPPQAE----------------------------EEEETVP--
         .  ::         .: :  :                            :. :: :  
CCDS56 ADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAETGPCR
        240       250       260       270       280       290      

                                           280       290           
pF1KB5 ---------------PP---------------SSHTLAVVGKVTPTPRPT--DGVDIYFG
                       :                 . .:: :.. ::   .  :.:: :. 
CCDS56 AMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAIPTTAASTPDAVDKYLE
        300       310       320       330       340       350      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 MPGEISEHEGFLRAKMDLEERRMRQINEVMREWAMADNQSKNLPKADRQALNEHFQSILQ
        ::. .::  : .::  :: .. .....:::::  :. :.:::::::..:. .:::  ..
CCDS56 TPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVE
        360       370       380       390       400       410      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 TLEEQVSGERQRLVETHATRVIALINDQRRAALEGFLAALQADPPQAERVLLALRRYLRA
       .::.....:::.::::: .:: :..::.:: :::....:::: ::. ..:.  :..:.::
CCDS56 SLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRA
        420       430       440       450       460       470      

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 EQKEQRHTLRHYQHVAAVDPEKAQQMRFQVHTHLQVIEERVNQSLGLLDQNPHLAQELRP
       :::...:::.:..::  :::.:: :.: :: :::.:: ::.::::.:: . : .:.:.. 
CCDS56 EQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQD
        480       490       500       510       520       530      

     480                             490              500       510
pF1KB5 QIQELLHSEH----------------------LGPSELEA-------PAPGGSSEDKGGL
       ...:::..:.                      : ::  :.       :. :  : :   :
CCDS56 EVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDD--L
        540       550       560       570       580       590      

                520       530          540          550       560  
pF1KB5 QPPDS--KDDTPMTLPKGSTEQDAASPEKEK---MNP---LEQYERKVNASVPRGFPF-H
       ::  :   :..: .  .. .:   : :  ..     :   : . . .  . :     : :
CCDS56 QPWHSFGADSVPANT-ENEVEPVDARPAADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVKMDAEFRH
          600        610       620       630       640       650   

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pF1KB5 SS--EIQRDELA--PAGTGVSREAVSGLLIMGAGGGSLIVLSMLLLRRKKPYGAISHGVV
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