Result of FASTA (ccds) for pF1KB5181
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5181, 656 aa
  1>>>pF1KB5181 656 - 656 aa - 656 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8326+/-0.000855; mu= -0.0839+/- 0.052
 mean_var=235.7488+/-49.174, 0's: 0 Z-trim(114.9): 25  B-trim: 160 in 2/52
 Lambda= 0.083531
 statistics sampled from 15440 (15461) to 15440 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.475), width:  16
 Scan time:  3.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 639) 3756 465.6 9.6e-131
CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 566) 3722 461.4 1.5e-129
CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22         ( 552) 1858 236.8 6.1e-62
CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 723) 1091 144.4 5.1e-34
CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16         ( 613) 1016 135.4 2.3e-31
CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 651)  742 102.4 2.1e-21
CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 690)  742 102.4 2.2e-21
CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17         ( 592)  569 81.5 3.7e-15


>>CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (639 aa)
 initn: 3756 init1: 3756 opt: 3756  Z-score: 2460.7  bits: 465.6 E(32554): 9.6e-131
Smith-Waterman score: 4173; 97.4% identity (97.4% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-639)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
       :::::::::                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WEAIQALTV-----------------LETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
           230       240       250       260       270       280   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
           290       300       310       320       330       340   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
           350       360       370       380       390       400   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
           410       420       430       440       450       460   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
           470       480       490       500       510       520   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
           530       540       550       560       570       580   

              610       620       630       640       650      
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
           590       600       610       620       630         

>>CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (566 aa)
 initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722  Z-score: 2439.4  bits: 461.4 E(32554): 1.5e-129
Smith-Waterman score: 3722; 100.0% identity (100.0% similar) in 566 aa overlap (91-656:1-566)

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54                               MKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                             10        20        30

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
               40        50        60        70        80        90

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
              100       110       120       130       140       150

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
              160       170       180       190       200       210

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
              220       230       240       250       260       270

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
              280       290       300       310       320       330

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
              340       350       360       370       380       390

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
              400       410       420       430       440       450

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
              460       470       480       490       500       510

              610       620       630       640       650      
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
              520       530       540       550       560      

>>CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22              (552 aa)
 initn: 2306 init1: 1854 opt: 1858  Z-score: 1225.5  bits: 236.8 E(32554): 6.1e-62
Smith-Waterman score: 3436; 84.1% identity (84.1% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-552)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
       :::::::::                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WEAIQALTV-----------------LETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
CCDS33 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEAL------
           230       240       250       260       270             

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
                                                                   
CCDS33 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ---------------------GLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
                            280       290       300       310      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
        320       330       340       350       360       370      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
        380       390       400       410       420       430      

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
        440       450       460       470       480       490      

              610       620       630       640       650      
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
        500       510       520       530       540       550  

>>CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (723 aa)
 initn: 1482 init1: 720 opt: 1091  Z-score: 724.3  bits: 144.4 E(32554): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 1824; 48.7% identity (69.4% similar) in 684 aa overlap (6-603:5-670)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
            : :.::. .:.:::: :.. ::  : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS11  MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQE
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
       :::.:::::                 ::.:::.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS11 WEALQALTV-----------------LEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
      60                         70        80        90       100  

              130       140       150       160        170         
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPP
       :.:.:::::.:..:::::::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: :::
CCDS11 GDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPP
            110       120       130       140       150       160  

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB5 RPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVN
       :::: .:.::::::.::.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....::::
CCDS11 RPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
            170       180       190       200       210       220  

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 NNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQ
       :::.::.::.. .::  .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::::..:..:::
CCDS11 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQ
            230       240        250       260       270       280 

     300       310       320       330               340           
pF1KB5 ANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------
       :.:::..::: :: ...:. .::.... ..: : .        .:.::. ::        
CCDS11 ASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSV
             290       300       310       320       330       340 

           350                     360           370       380     
pF1KB5 LPPAGTT----YPAMP----------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSD
       : :: :      : .:          .: . ::    .: . : ..: ::.::. :::.:
CCDS11 LAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLAD
             350       360       370       380       390       400 

           390       400                            410         420
pF1KB5 PTP--PSGPSLDGTGWNSFQ-------------------SSDAT--EPPAPALA--QAPS
       :.:  :   :  .. :. .:                   .:::   .: ::. .  ::: 
CCDS11 PAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPL
             410       420       430       440       450       460 

                430       440         450         460       470    
pF1KB5 MESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRD
           : :.  .:.:: :. ..:   :   .:  .  :  :  . .   ..      .: .
CCDS11 PPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQ
             470       480       490       500       510       520 

          480       490                 500              510       
pF1KB5 LQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE---------PPRPPQQPV-------PT---ELSL
       : ....  :.  . .:: :. :..:          :  :  ::.       :    ::::
CCDS11 LLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSL
             530       540       550       560       570       580 

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB5 ASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRN
       ::: :::::::::. ::::.::..:::::::::..  ::: ::::::::::.::: :...
CCDS11 ASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKS
             590       600       610       620       630       640 

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB5 IVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMG
       ::.:.:::: :::::::::::::  :.::                               
CCDS11 IVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALG
             650       660       670       680       690       700 

>>CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16              (613 aa)
 initn: 1276 init1: 706 opt: 1016  Z-score: 676.5  bits: 135.4 E(32554): 2.3e-31
Smith-Waterman score: 1735; 46.4% identity (70.5% similar) in 657 aa overlap (3-655:19-612)

                               10        20        30        40    
pF1KB5                 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGP
                         :     .::  .:.::.:  .: ::..:..::::.: : .::
CCDS10 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB5 PLATRLLAHKIQSPQEWEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGK
         :  ::::::::::: ::. ::::                 :: ::. ::..::.::.:
CCDS10 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTV-----------------LEMCMNHCGEKFHSEVAK
               70        80                         90       100   

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB5 FRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKS
       ::::::::::.::::::: .. :::....:.:.:::: .::..:: .::::::::::.:.
CCDS10 FRFLNELIKVLSPKYLGSWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQ
           110       120       130       140       150       160   

          170       180        190       200       210       220   
pF1KB5 DPKLPDDTTFPLPPPRPKNVIFE-DEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQK
       ::::: :  .: : : ::. ::. ::::::.:.:::::.:::::.:::.:::..:.:.:.
CCDS10 DPKLPVDKILPPPSPWPKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQE
           170       180       190       200       210       220   

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB5 RMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRL
       . ::.::::.:.::: ..::.: ::.  . . : :  ..: : . .:.:::..:::::::
CCDS10 KSEKVSKRVSAVEEVRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEAL-QVVYERCEKLRPTLFRL
           230       240       250       260        270       280  

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB5 ASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLD
       :::: :.:.:::::::::: ::: . ::::...:. . :. ...:. :.    . .: . 
CCDS10 ASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSL-GD----IPVSRVF
            290       300       310       320        330           

             350       360       370        380       390       400
pF1KB5 LPPAGT--TYPAMPTRPGEQASPEQPSASV-SLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWN
         :::   : : .  .  .  .: : .. : ::: ..: .::.:: .: .:     .: :
CCDS10 QNPAGCMKTCPLIDLEVDN--GPAQMGTVVPSLLHQDLAALGISD-APVTGMV---SGQN
       340       350         360       370       380           390 

              410       420       430       440       450       460
pF1KB5 SFQSSDATEPPAPALAQAPSMESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVR
         . .           . ::  . : . .. : :.  . ::::       :  :    . 
CCDS10 CCEEK-----------RNPSSSTLPGGGVQNP-SADRNLLDLL-------SAQPAPCPLN
                        400       410        420              430  

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 WEKQQPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVP
       . .:. .:.      .   .. :::. :  .     .:  : : .: .:    ::.. ::
CCDS10 YVSQKSVPK------EVPPGTKSSPGWSWEA-----GPLAPSPSSQNTP----LAQVFVP
            440             450            460       470           

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 LESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSA
       :::.:::.. :. :::..:::::.::..   ::. .: :....:.::::::. .:.:: :
CCDS10 LESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTAPQPVWDIMFQVA
       480       490       500       510       520       530       

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 VPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNE
       ::: :.::::: :...::::.:.. :..:.:.::: ::.:: .::::::::..: : ..:
CCDS10 VPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYKLTFNQGGQPFSE
       540       550       560       570       580       590       

              650      
pF1KB5 MGDVDQFPPPETWGSL
       .:.: .::   . :. 
CCDS10 VGEVKDFPDLAVLGAA
       600       610   

>>CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (651 aa)
 initn: 1453 init1: 715 opt: 742  Z-score: 497.6  bits: 102.4 E(32554): 2.1e-21
Smith-Waterman score: 1795; 49.8% identity (70.7% similar) in 652 aa overlap (91-656:1-651)

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                     ::.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS54                               MKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
                                             10        20        30

              130       140       150       160        170         
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPP
       :.:.:::::.:..:::::::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: :::
CCDS54 GDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPP
               40        50        60        70        80        90

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB5 RPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVN
       :::: .:.::::::.::.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....::::
CCDS54 RPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
              100       110       120       130       140       150

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 NNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQ
       :::.::.::.. .::  .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::::..:..:::
CCDS54 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQ
              160       170        180       190       200         

     300       310       320       330               340           
pF1KB5 ANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------
       :.:::..::: :: ...:. .::.... ..: : .        .:.::. ::        
CCDS54 ASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSV
     210       220       230       240       250       260         

           350                     360           370       380     
pF1KB5 LPPAGTT----YPAMP----------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSD
       : :: :      : .:          .: . ::    .: . : ..: ::.::. :::.:
CCDS54 LAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLAD
     270       280       290       300       310       320         

           390       400                            410         420
pF1KB5 PTP--PSGPSLDGTGWNSFQ-------------------SSDAT--EPPAPALA--QAPS
       :.:  :   :  .. :. .:                   .:::   .: ::. .  ::: 
CCDS54 PAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPL
     330       340       350       360       370       380         

                430       440         450         460       470    
pF1KB5 MESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRD
           : :.  .:.:: :. ..:   :   .:  .  :  :  . .   ..      .: .
CCDS54 PPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQ
     390       400       410       420       430       440         

          480       490                 500              510       
pF1KB5 LQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE---------PPRPPQQPV-------PT---ELSL
       : ....  :.  . .:: :. :..:          :  :  ::.       :    ::::
CCDS54 LLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSL
     450       460       470       480       490       500         

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pF1KB5 ASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRN
       ::: :::::::::. ::::.::..:::::::::..  ::: ::::::::::.::: :...
CCDS54 ASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKS
     510       520       530       540       550       560         

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB5 IVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMG
       ::.:.:::: :::::::::::::  :.::  :.:::::.::::: ::::::::::::..:
CCDS54 IVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALG
     570       580       590       600       610       620         

          640       650      
pF1KB5 DQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
       .:  .:.:.:::::: : ::.:
CCDS54 EQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
     630       640       650 

>>CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (690 aa)
 initn: 1558 init1: 715 opt: 742  Z-score: 497.3  bits: 102.4 E(32554): 2.2e-21
Smith-Waterman score: 1804; 46.3% identity (66.2% similar) in 737 aa overlap (6-656:5-690)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
            : :.::. .:.:::: :.. ::  : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS11  MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQE
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
       :::.::::                                                  ::
CCDS11 WEALQALT--------------------------------------------------YL
      60                                                           

              130       140       150       160        170         
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPP
       :.:.:::::.:..:::::::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: :::
CCDS11 GDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPP
      70        80        90       100       110       120         

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pF1KB5 RPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVN
       :::: .:.::::::.::.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....::::
CCDS11 RPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
     130       140       150       160       170       180         

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pF1KB5 NNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQ
       :::.::.::.. .::  .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::::..:..:::
CCDS11 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQ
     190       200       210        220       230       240        

     300       310       320       330               340           
pF1KB5 ANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------
       :.:::..::: :: ...:. .::.... ..: : .        .:.::. ::        
CCDS11 ASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSV
      250       260       270       280       290       300        

           350                     360           370       380     
pF1KB5 LPPAGTT----YPAMP----------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSD
       : :: :      : .:          .: . ::    .: . : ..: ::.::. :::.:
CCDS11 LAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLAD
      310       320       330       340       350       360        

           390       400                            410         420
pF1KB5 PTP--PSGPSLDGTGWNSFQ-------------------SSDAT--EPPAPALA--QAPS
       :.:  :   :  .. :. .:                   .:::   .: ::. .  ::: 
CCDS11 PAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPL
      370       380       390       400       410       420        

                430       440         450         460       470    
pF1KB5 MESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRD
           : :.  .:.:: :. ..:   :   .:  .  :  :  . .   ..      .: .
CCDS11 PPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQ
      430       440       450       460       470       480        

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pF1KB5 LQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE---------PPRPPQQPV-------PT---ELSL
       : ....  :.  . .:: :. :..:          :  :  ::.       :    ::::
CCDS11 LLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSL
      490       500       510       520       530       540        

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pF1KB5 ASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRN
       ::: :::::::::. ::::.::..:::::::::..  ::: ::::::::::.::: :...
CCDS11 ASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKS
      550       560       570       580       590       600        

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB5 IVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMG
       ::.:.:::: :::::::::::::  :.::  :.:::::.::::: ::::::::::::..:
CCDS11 IVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALG
      610       620       630       640       650       660        

          640       650      
pF1KB5 DQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
       .:  .:.:.:::::: : ::.:
CCDS11 EQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
      670       680       690

>>CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17              (592 aa)
 initn: 1010 init1: 542 opt: 569  Z-score: 385.6  bits: 81.5 E(32554): 3.7e-15
Smith-Waterman score: 1327; 45.5% identity (67.1% similar) in 569 aa overlap (141-623:1-568)

              120       130       140       150       160          
pF1KB5 LIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-
                                     ..::::.:: .::.:::.::::.::: .: 
CCDS58                               MALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPV
                                             10        20        30

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB5 DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKIS
       : : .: ::::::: .:.::::::.::.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..
CCDS58 DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
               40        50        60        70        80        90

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB5 KRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTED
       ::....:::::::.::.::.. .::  .. :. : :::::...::  : :::.:::.:::
CCDS58 KRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETED
              100       110       120        130       140         

     290       300       310       320       330               340 
pF1KB5 NDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSG
       ::..:..::::.:::..::: :: ...:. .::.... ..: : .        .:.::. 
CCDS58 NDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAE
     150       160       170       180       190       200         

                     350                     360           370     
pF1KB5 LD--------LPPAGTT----YPAMP----------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLD
       ::        : :: :      : .:          .: . ::    .: . : ..: ::
CCDS58 LDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLD
     210       220       230       240       250       260         

         380         390       400                            410  
pF1KB5 DELMSLGLSDPTP--PSGPSLDGTGWNSFQ-------------------SSDAT--EPPA
       .::. :::.::.:  :   :  .. :. .:                   .:::   .: :
CCDS58 EELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSA
     270       280       290       300       310       320         

              420         430       440         450         460    
pF1KB5 PALA--QAPSMESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQ
       :. .  :::     : :.  .:.:: :. ..:   :   .:  .  :  :  . .   ..
CCDS58 PSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNS
     330       340       350       360       370       380         

          470       480       490                 500              
pF1KB5 QPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE---------PPRPPQQPV------
             .: .: ....  :.  . .:: :. :..:          :  :  ::.      
CCDS58 ALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQG
     390       400       410       420       430       440         

       510          520       530       540       550       560    
pF1KB5 -PT---ELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSM
        :    ::::::: :::::::::. ::::.::..:::::::::..  ::: :::::::::
CCDS58 SPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSM
     450       460       470       480       490       500         

          570       580       590       600       610       620    
pF1KB5 LSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVR
       :.::: :...::.:.:::: :::::::::::::  :.::  :.:::::.::::: :..: 
CCDS58 LNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKKQVL
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          630       640       650      
pF1KB5 LRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
                                       
CCDS58 SFLGKACLQPWGQAILLTTSCLA         
     570       580       590           




656 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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