Result of FASTA (ccds) for pF1KB4406
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4406, 2214 aa
  1>>>pF1KB4406 2214 - 2214 aa - 2214 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7071+/-0.00152; mu= 13.0661+/- 0.092
 mean_var=176.3043+/-33.212, 0's: 0 Z-trim(102.7): 185  B-trim: 10 in 1/50
 Lambda= 0.096592
 statistics sampled from 6884 (7074) to 6884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.217), width:  16
 Scan time:  5.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11          (2214) 15423 2164.4       0
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2            (4655) 1227 186.4 2.5e-45
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12           (4544) 1073 165.0 7.2e-39
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11           (1615)  821 129.5 1.2e-28
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1           ( 904)  814 128.3 1.6e-28
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 963)  814 128.3 1.7e-28
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12           (1613)  762 121.2 3.7e-26
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11          (1905)  726 116.3 1.4e-24
CCDS47008.1 SORCS2 gene_id:57537|Hs108|chr4        (1159)  709 113.7 4.9e-24
CCDS55618.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1          ( 694)  697 111.9 1.1e-23
CCDS798.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1            ( 831)  697 111.9 1.2e-23
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2          (4599)  677 109.8   3e-22
CCDS7558.1 SORCS3 gene_id:22986|Hs108|chr10        (1222)  664 107.5 3.9e-22
CCDS7559.1 SORCS1 gene_id:114815|Hs108|chr10       (1168)  652 105.8 1.2e-21
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1165)  556 92.4 1.3e-17
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 819)  546 90.9 2.6e-17
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 858)  540 90.1 4.8e-17
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 860)  540 90.1 4.8e-17
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 682)  535 89.3 6.5e-17
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9          ( 845)  534 89.2 8.4e-17
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9           ( 873)  534 89.2 8.6e-17
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4             (1207)  535 89.5   1e-16
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 700)  526 88.0 1.6e-16
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1166)  519 87.3 4.6e-16
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22        ( 252)  438 75.4 3.6e-13
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 793)  440 76.1   7e-13
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14          (1375)  441 76.4 9.6e-13
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1            (1247)  426 74.3 3.8e-12
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391)  404 71.7 8.2e-11


>>CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11               (2214 aa)
 initn: 15423 init1: 15423 opt: 15423  Z-score: 11622.8  bits: 2164.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 15423; 99.9% identity (100.0% similar) in 2214 aa overlap (1-2214:1-2214)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MATRSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTQRLHGGSAPLPQDRGFLVVQGDPRELRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MATRSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTQRLHGGSAPLPQDRGFLVVQGDPRELRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 WARGDARGASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 WARGDARGASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 ARDSLALARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKRYIFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ARDSLALARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKRYIFA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 DAYAQYLWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DAYAQYLWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 WIMIQEHVKSFSWGIDPYDKPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSRENQEVILEEVRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 WIMIQEHVKSFSWGIDPYDKPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSRENQEVILEEVRDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 QLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIADASEDQVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIADASEDQVF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 VCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 QGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 LSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSAGARWREALPGPHYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSAGARWREALPGPHYY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 TWGDHGGIITAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TWGDHGGIITAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 GSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRTPHATC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRTPHATC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 TYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 QLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 PLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 GIYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GIYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 PHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 CVPRPCSLLCLPKANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEENTCLR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS84 CVPRPCSLLCLPKANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKQENTCLR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KB4 NQYRCSNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NQYRCSNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KB4 EDDCGDNSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 EDDCGDNSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KB4 ASNFQCRNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ASNFQCRNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB4 DCSDGSDEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 DCSDGSDEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB4 FHKVCDEFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FHKVCDEFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGH
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KB4 CIPNRWKCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CIPNRWKCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB4 YRDCADGSDEEACPLLANVTAASTPTQLGRCDRFEFECHQPKTCIPNWKRCDGHQDCQDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS22 GSTYC-MPM---------------CSSTQFLCANNEKCI-PIWWKCDGQKDCSDGSDELA
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CCDS22 ----NICVNLSVVCDGIFDCPNGTDES--PLCNGNSCSDFNGGCTHECVQEPFGAKCLCP
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pF1KB4 ---------KTCIPNWKRCD--GH--QDCQDGRDEANCPTHSTLTCMSREFQCEDGEACI
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CCDS22 LGFLLANDSKTC-EDIDECDILGSCSQHCYNMRGSFRC------SCDTGYMLESDGRTCK
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CCDS22 VTASESLLLLVASQNKIIADSVTSQVHNIYSLVENGSYIVAVDFDSISGRIFWSDATQGK
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pF1KB4 SASCVYN-VYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKVLKPDTTYQVK-VQVQCLSKAHNTND
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CCDS22    MDRGPAAVACTLLLALVACLAPASGQECDSAHFRCGSGHCIPADWRCDGTKDCSDDA
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CCDS89 LLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRLERGVGGAPPTVTLLRSER
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         .......  . ...:.: :      :: :::   . ::.: : ::   .:: .  . :
CCDS89 PPIFEIRMYDAQQQQVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPG-SRQCACAED---QVLDADGVTC
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CCDS89 -------LANPSYVPPPQ-CQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQHT
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CCDS89 CPSD-RFKC-ENNRCIPNRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIPIS
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CCDS89 ------------RPPG-------GCHTDE----------FQCRLDGLCIPLRWRCDGDTD
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CCDS89 CMDSSDEKSCEGVTHV--CDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDGDNDCEDNSDEENCESLAC
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        : : :    :  :     ...:.    .:::  ::.::::: : :   . :  . :   
CCDS89 RPPSHP----CANN-----TSVCLPPDKLCDGNDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNC
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       ...  . .   :       :. . :. .. : .  .   .:  .. .. :   :      
CCDS89 SVAPGEGIVCSCPLGMELGPDNHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYEGWVLEP
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CCDS89 DGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRIDLHKGDYSVLVPGLRNTIALDFHLSQSALYWTDV
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CCDS89 QFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDERGCHINECLSRK--LSGCSQDCEDLKIGFKCR
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CCDS89 CRPGFRLKDDG--RTCADVDECS-----TTFPC--SQRCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGD
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        ..        :  ...:. :...: :  . . .: .:..  :   ::  ::::::::..
CCDS89 PHS--------CKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNL-DGSNYTLLKQGLNNAVALDFDYRE
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       . .::.:.. .  .:.:. ::::. : :.  .:: . ..:: . ..  ::: : :   ::
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       :.. .: .: :.. :: : .:::::.  :.: ..:::::: .  : : .::::.   .:.
CCDS89 VSKLNGAYR-TVLVSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGD-HSLIGRIGMDGSSRSVIVD
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pF1KB4 EDVKWPNGISVD--DQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILD-NLPHPYAIAVFKNEIY
         . ::::...:   . :::.::  . ::  ...:..: :.:. ..:: .:...:.. .:
CCDS89 TKITWPNGLTLDYVTERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVY
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pF1KB4 WDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNACVP-RPCSLLCLPK
       : ::   :: :: : .:..  .: . :   ::...:.  ..      :: .::      :
CCDS89 WTDWETKSINRAHKTTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPD----VPNHPC------K
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pF1KB4 ANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNN--TCVKEENTCLRNQYRCSNGNCI
       .::. .:     .:    :.:   : :: .. : ..  :::   ..:  .:. :.: .::
CCDS89 VNNG-GCSNLCLLS----PGGGHKCACPTNFYLGSDGRTCV---SNCTASQFVCKNDKCI
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pF1KB4 NSIWW-CDFDNDCGDMSDER-NCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDLEDDCGDNSD
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CCDS89 -PFWWKCDTEDDCGDHSDEPPDCPEFKCR-PGQFQCS-TGICTNPAFICDGDNDCQDNSD
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pF1KB4 ESHCEMHQCRSDEYNCS-SGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCEASNFQCR-
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CCDS89 EANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCIPGIFRCNGQDNCGDGEDERDCPEV--TCAPNQFQCSI
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pF1KB4 NGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNG---FRCPN-GTCIPSSKHCDGLRDCS
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CCDS89 TKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDE-PANCTQMTCGVDEFRCKDSGRCIPARWKCDGEDDCG
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       :::::  ..:.    . ..: ::: ..:.     ::   .: :.:::..    :.  :  
CCDS89 DGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKN-NRCVPGRWQCDYDNDCGDNSDEES----CTPRP--
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pF1KB4 HKVCDEFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGHC
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pF1KB4 IPNRWKCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDGY
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CCDS89 IPLRWRCDADADCMDGSDEEACGT---------GVRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGE
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pF1KB4 RDCADGSDE--EACPLLANVTAASTPTQLGRCDRFEFECHQPKTCIPNWKRCDGHQDCQD
        ::.:.:::  : :  .  :   . :          :.:.. ..:.   ..::: ..: :
CCDS89 DDCGDNSDENPEECARF--VCPPNRP----------FRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGD
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       : :: .:  ::  :  : .. :: :.. . :.  : ::. : ::.: :::. :: .    
CCDS89 GTDEEDCEPPTAHTTHCKDKKEFLCRN-QRCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSID---P
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pF1KB4 KVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSASCVYNVYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKV
       :. .   .:.. :: .   .: .:    .:  . .. : :.                   
CCDS89 KLTSCATNASICGDEARC-VRTEKAAYCAC-RSGFHTVPGQPGCQDINECLRFGTCSQLC
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pF1KB4 LKPDTTYQVKVQVQCLSKAHNTNDFVTLRTPEGLPDAPRNLQLSLPREAEGVIVGHWAPP
                                                                   
CCDS89 NNTKGGHLCSCARNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLFPGHPHSAYEQAFQGDE
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CCDS89 KDIKVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACA---CAHG----MLAEDGASC-
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pF1KB4 LAEENEFILYAVR---KSIYRYDLASGATEQLPLTG---LRAAVALDFDYEH-------N
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CCDS89 -REYAGYLLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPN
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pF1KB4 CLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVAN
        ...::. .  ::..  .::    .. : :  .::.::..   . :::..   . :   .
CCDS89 RIFFSDIHFGNIQQINDDGSRRITIVENVG--SVEGLAYHRGWDTLYWTSYTTSTITRHT
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pF1KB4 PD----GDF-RLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKPGIYRSNMDGSAAYHL
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CCDS89 VDQTRPGAFERETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTL
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pF1KB4 VSEDVKWPNGISVDD--QWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNLP-HPYAIAVFKNE
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CCDS89 IEKDIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEH
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pF1KB4 IYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNACVPRPCSL----
       :.: :: . .. ::.:. ::.:..:  ..   . : :.  ...:  :.:   :: .    
CCDS89 IFWTDWVRRAVQRANKHVGSNMKLLRVDIPQ-QPMGIIAVANDT--NSCELSPCRINNGG
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pF1KB4 ---LCLPKANNSRSCRC------PEDVSSSVLPSG-----------------DLMCD---
          :::   ..  .: :       .:..  .. :.                 .: ::   
CCDS89 CQDLCLLTHQGHVNCSCRGGRILQDDLTCRAVNSSCRAQDEFECANGECINFSLTCDGVP
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pF1KB4 -CPQGYQLKNNTCVKEENTCLRNQYRCSNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICD
        : .  . : . :  .   : ..  .:::: :.... ::.  .:::: :::  :  : : 
CCDS89 HCKDKSDEKPSYC--NSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPCNKTACG
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pF1KB4 LDTQFRCQESGTCIPLSYKCDLEDDCGDNSDESHCEMHQCRSDEY---------NCS-SG
       .  .:::.. ::::  : .:.   :: : ::: .:   .: :             :  ..
CCDS89 VG-EFRCRD-GTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRLGVKGVLFQPCERTS
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pF1KB4 MCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHT-CEASNFQCRNGHCIPQRWACDGDTDCQDG
       .:   :::::: ::: :.::: .: .. .  :  . : : .:.:::. :.:: . ::. :
CCDS89 LCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNYFACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHG
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pF1KB4 SDEDPVNCEKKCN--GFRCPNGTCIPSSKHCDGLRDCSDGSDEQ-HCEPLCTHFMDFVCK
        ::  ..:.: :.   :.: :  :: ..  :::  ::.:::::  :::       .: : 
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       . . :. .  .:::  .: ::.::. : :::     ....::.  :.:::  ::   . :
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       : ::.:.... .:.:: ::   .. .:.:..: .. ..    :  .:..... ...  . 
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       :.: ::  ::::  .:.:: ...... ::.:::... :..: .:::.::.  : : :: .
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CCDS89 -----------------LSPSGPV-CTCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPR--PGTCN
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CCDS89 ---LQCFNGGSC--FLNARRQPK--C------RCQPRYT----GDKCEL-DQCWEHCRNG
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CCDS89 GTCAASPSGMPTCRCPTGFTGPKCTQQVC---AGYCANNSTCTVNQGNQPQCRCLPGFLG
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CCDS89 DRCQYRQC--SGY-CENFGTC---QMAADGSRQCRCTAYFEGSRCEVNKCS--RCLEGAC
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CCDS89 VVNKQSGDVTCNCTDGRVAPSCLTCVGH-----CSNGGSCTMNSKMMPECQCPPHMTGPR
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CCDS89 SHLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYIISF
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CCDS89 SRNLFWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQG--LEQPHGLVVHPLRGKLYWTD-GD---
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CCDS81 GKLFWVD-ADLKRI-ESCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVE
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CCDS81 KTTG---DKRTRIQGRVAHLTGIHAVEEVSLEEFSAHPCA-------RDNGGC---SHIC
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CCDS81          MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGV
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CCDS81 CSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAE-EVLLLARRTDLRRISLDTPDFTD
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CCDS81 IVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGS-GAQTLVNTEINDPDGIAV
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CCDS81 DWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILV-SEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGE-N
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CCDS81 PKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTLL
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CCDS81 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL
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CCDS30 MTRTVPATTRAPGTTVHRSTYQNHSTETPSLTAAVPSSVSVPRAPSISPSTLSPATSNHS
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pF1KB4 CIVLSERCDGFLDCSDESDEKACSDELTVYKVQNLQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSASC
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pF1KB4 YWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKPGIYRSN
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CCDS31         MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACG-RSHFTCAVSALGECTCIPAQWQC
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CCDS31 DGDNDCGDHSDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPP--RE
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CCDS31 CEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQ---CDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWY
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       :::  ::.:::::..:      : : .. .: :    .:..  . :::  .: : :::  
CCDS31 CDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPC-NLEEFQCA-YGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDE--
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         . ::.    :. :    :.:..:.::.  :.:::  :: : ::: :: .      :. 
CCDS31 --SDCSS----HQPCRSGEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSM----CTA
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         ::::..:.:.   :.:: :.::.: :::..: ..        :   :  . . : .: 
CCDS31 E-QFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENT--------GSPQCALDQFLCWNGR
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       :. .  .:.:  ::.:.:::   . : :  .. .  ...     .:.  :   .:    :
CCDS31 CIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQC----T
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       :  ...   :::  :::  .:     . .  : . :  :::                   
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CCDS31 HFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLP----SGQNYT--CACPTG--------
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       .::::. .:. .                  ..:.:.: : .: :  .:  . . . .::.
CCDS31 FRKISSHACAQS-----------------LDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLA
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        .:.:::::.: . . .::.:.. :.:.:   .: :::::.....::.  .::.. ... 
CCDS31 DVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDG-TGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNK
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CCDS31 MENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIP
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CCDS31 MQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCAC-PTGIQLKGDGKTCDPSPET-YL
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       :. .:..:. ::.:...:: . ... :::.:.: . ::..  ::. : ...:.: ::.::
CCDS31 SN-METVIGRGLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNS-LDEPR
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       :... :..: .:::::: .   : :.:.:::    :.. :. ::::...:   . :::.:
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CCDS31 GLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSND
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CCDS31 LRSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPIN
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pF1KB4 -GLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFEPLSQ
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CCDS31 ITMKNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQ-HEDIITTGLQTTDGLAVDAIGR
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pF1KB4 LLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKPGIYR
        .::.:.: ..:::.: ::..: ..: .. :: :::.::  . : :.:::::. .  . :
CCDS31 KVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQN-LDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGE-NAKLER
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pF1KB4 SNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVD--DQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNLPH
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CCDS31 SGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQH
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CCDS31 SRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDH
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pF1KB4 YRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATEQ
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CCDS31 GYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDI-RQVLPHRSEYT
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CCDS31 LLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVV-STGLESPGGLAVDW
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pF1KB4 LSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKPG
       . . :::.:.: ..::::: ::  : ... .. :..:::..: :.::...:::::.  : 
CCDS31 VHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQN-LEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNT-PR
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pF1KB4 IYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVD--DQWIYWTDAYLECIERITFSGQQR-SVILD
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CCDS31 IEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQ
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CCDS47 SQVFVAVQEWYQMDTYNLYQSDPRGVRYALVLQDV--RSSRQAEESVLI---------DI
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pF1KB4 HRVEGLQGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCS
        .:.:..::..:   : ... . : ..::..::  :..:. :..   :.  ::.    : 
CCDS47 LEVRGVKGVFLA---NQKIDGKVM-TLITYNKGRDWDYLRPPSMDMNGKPTNCK-PPDCH
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CCDS47 LHLHLRWA---DNPYVSGTVHTKDTAPGLIMGAGNLGSQLVEYKEEMYITSDCGHTWRQV
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       .   :.  . ::::.:.:: . ..  . ::.:..:: ::.:  :.   ::: :::.:::.
CCDS47 FEEEHHILYLDHGGVIVAIKDTSIPLKILKFSVDEGLTWSTHNFTSTSVFVDGLLSEPGD
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CCDS55                          MTFGQSKLYRSEDYGKNFKDITDLIN-NTFIRTEF
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CCDS55 DYLLALSTENG---LWVSKNFGGKWEEIHKAVCLAKWGSD-----NTIFFTTYANGSCTD
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CCDS55 HLYTTTGGE--------------TDFTNVTSLRGVYITSVLS---EDNSIQTMITFDQGG
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CCDS55 RWTHLRKP------ENSECDATAKNKNECSLHIHASYSISQKLNVP---MAPLSEPNAVG
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CCDS55 IKFSTDEGQCWQTYTFTRDPIYFTGLASEPGARSMNISIWGFTESFLTSQWVSYTIDFKD
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pF1KB4 GDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATEQLPLTGLRAAVA
       :: :.::                                                     
CCDS55 GDKCQGGVNPVREVKDLKKKCTSNFLSPEKQNSKSNSVPIILAIVGLMLVTVVAGVLIVK
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2214 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 02:58:55 2016 done: Fri Nov  4 02:58:57 2016
 Total Scan time:  5.730 Total Display time:  1.360

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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