Result of FASTA (ccds) for pF1KB4343
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4343, 364 aa
  1>>>pF1KB4343 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5809+/-0.00128; mu= 12.4382+/- 0.076
 mean_var=269.0547+/-49.856, 0's: 0 Z-trim(111.7): 873  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.078190
 statistics sampled from 11536 (12565) to 11536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.386), width:  16
 Scan time:  2.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43085.1 ZNF589 gene_id:51385|Hs108|chr3        ( 364) 2568 303.1 2.4e-82
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5         ( 894)  649 87.3 5.6e-17
CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 591)  612 82.8 8.2e-16
CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20       ( 509)  611 82.6 8.2e-16
CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 635)  612 82.9 8.5e-16
CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 653)  612 82.9 8.7e-16
CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 654)  612 82.9 8.7e-16
CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 657)  612 82.9 8.7e-16
CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20        ( 667)  612 82.9 8.7e-16
CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20       ( 599)  611 82.7   9e-16
CCDS74693.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20       ( 640)  611 82.8 9.3e-16
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19       ( 665)  606 82.2 1.4e-15
CCDS75563.1 ZNF316 gene_id:100131017|Hs108|chr7    (1004)  594 81.2 4.4e-15
CCDS12844.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19       ( 581)  588 80.1 5.3e-15
CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19       ( 617)  588 80.1 5.5e-15
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19        ( 652)  586 80.0 6.6e-15
CCDS12847.1 ZNF614 gene_id:80110|Hs108|chr19       ( 585)  582 79.4 8.5e-15
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19        ( 598)  581 79.3 9.3e-15
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19        ( 640)  581 79.4 9.7e-15
CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19        ( 641)  581 79.4 9.7e-15
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19        ( 659)  581 79.4 9.8e-15
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738)  579 79.3 1.2e-14
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19      ( 742)  579 79.3 1.2e-14
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714)  578 79.1 1.3e-14
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769)  578 79.2 1.3e-14
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19      ( 769)  578 79.2 1.3e-14
CCDS46062.1 ZNF793 gene_id:390927|Hs108|chr19      ( 406)  568 77.6 2.1e-14
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568)  568 77.8 2.5e-14
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604)  568 77.9 2.6e-14
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620)  568 77.9 2.6e-14
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 533)  567 77.7 2.6e-14
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 657)  567 77.8 2.9e-14
CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3       ( 422)  564 77.2 2.9e-14
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19      ( 533)  564 77.3 3.3e-14
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19      ( 731)  564 77.6 3.9e-14
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19      ( 736)  564 77.6 3.9e-14
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11        ( 606)  561 77.1 4.5e-14
CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9        ( 603)  554 76.3 7.7e-14
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19      ( 636)  553 76.2 8.6e-14
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 816)  554 76.5   9e-14
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 852)  554 76.5 9.3e-14
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 854)  554 76.5 9.3e-14
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20       ( 751)  552 76.2   1e-13
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19       ( 372)  547 75.2   1e-13
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  548 75.8 1.4e-13
CCDS12837.1 ZNF175 gene_id:7728|Hs108|chr19        ( 711)  542 75.1 2.2e-13
CCDS12843.1 ZNF649 gene_id:65251|Hs108|chr19       ( 505)  536 74.1 2.9e-13
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX         ( 506)  536 74.1 2.9e-13
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  538 74.6 2.9e-13
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  537 74.4   3e-13


>>CCDS43085.1 ZNF589 gene_id:51385|Hs108|chr3             (364 aa)
 initn: 2568 init1: 2568 opt: 2568  Z-score: 1591.8  bits: 303.1 E(32554): 2.4e-82
Smith-Waterman score: 2568; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MWAPREQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPRYLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MWAPREQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPRYLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQFLSQDELHNHPIPGFHAGNQLHPGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQFLSQDELHNHPIPGFHAGNQLHPGN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFRQKAVTAEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFRQKAVTAEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 SSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 EKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPY
              310       320       330       340       350       360

           
pF1KB4 VCRD
       ::::
CCDS43 VCRD
           

>>CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5              (894 aa)
 initn: 5786 init1: 628 opt: 649  Z-score: 418.2  bits: 87.3 E(32554): 5.6e-17
Smith-Waterman score: 653; 63.3% identity (80.3% similar) in 147 aa overlap (219-364:724-864)

      190       200       210       220       230        240       
pF1KB4 LSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFR-QKAVTAEKSSDKRQS
                                     ::. .:..::.:.: :.. :.::       
CCDS43 CRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKP------
           700       710       720       730       740             

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB4 QVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCS
        :::::::::  ::.:. ::::::::::::: ::::::  .: : .:  ::.::::::: 
CCDS43 YVCRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCR
       750       760       770       780       790       800       

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB4 HCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD   
       .:::::: : .:.::::::: :: ..:  ::::::.::.:..::: :::.::::::.   
CCDS43 ECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGR
       810       820       830       840       850       860       

CCDS43 GFSDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE
       870       880       890    

>--
 initn: 5786 init1: 628 opt: 649  Z-score: 418.2  bits: 87.3 E(32554): 5.6e-17
Smith-Waterman score: 864; 45.7% identity (67.2% similar) in 293 aa overlap (79-364:385-668)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB4 WKRLSLEQRNLYKEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQFLSQDELHNHP--
                                     ::.: :::: :::.::.::::   .::   
CCDS43 VWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQ
          360       370       380       390       400       410    

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB4 -IPGFHAGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWSTNERGALV
        .::  : . :.: :::: :: : :.  : . :. ... :...   . :    :.:    
CCDS43 NFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLL----NKRTWQR
          420       430       440       450       460           470

         170       180           190       200       210       220 
pF1KB4 GFSSLFQRPPISSWG----GNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECA
        .:  :. :: .. :    :.::.: .   .:...  .. ..   .    .. : .:::.
CCDS43 EISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAKVKYGECG
              480       490       500       510       520       530

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB4 LAFNQKSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGEC
        .:. ::..     .: ...   ..  :::::::::: ::.:.:::: ::::::::: ::
CCDS43 QGFSVKSDV-----ITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCREC
                   540       550       560       570       580     

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB4 GRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGF
       ::::  .::: .:  ::.::::::: .:::::: .  :. ::: :: :: ..:  :::::
CCDS43 GRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGF
         590       600       610       620       630       640     

             350       360                                         
pF1KB4 REKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD                                     
        ..: :. ::: :::.::::::.                                     
CCDS43 SRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSWQS
         650       660       670       680       690       700     

>>CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (591 aa)
 initn: 2170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 397.3  bits: 82.8 E(32554): 8.2e-16
Smith-Waterman score: 921; 46.0% identity (69.8% similar) in 324 aa overlap (67-364:3-323)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB4 FEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLYKEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQF
                                     : :. : ::. .::..  : :: .:.::.:
CCDS63                             MCNGRKTV-LADPEPELYLDPFCPPGFSSQKF
                                            10        20        30 

        100       110          120       130       140       150   
pF1KB4 LSQDELHNHPIPGFH---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRP
         :  : :::   :    : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  . ::.. :
CCDS63 PMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGAM-P
              40        50        60        70        80         90

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB4 LFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFG
       ::  :..: .: .::   :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. :: :. :::
CCDS63 LFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFG
               100       110       120       130       140         

           220       230                       240              250
pF1KB4 AVTFGECALAFNQKSNLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ-------VC
       .:. :::.:.:.. .::.                 .:. . .::  ..:.        ::
CCDS63 TVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVC
     150       160       170       180       190       200         

              260       270       280       290       300       310
pF1KB4 RECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCG
       :::::::.::: ::::.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  :::::::::: .::
CCDS63 RECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECG
     210       220       230       240       250       260         

              320       330       340       350       360          
pF1KB4 RGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD      
       .::: :  ..:::::: .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:..      
CCDS63 KGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFR
     270       280       290       300       310       320         

CCDS63 QRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSH
     330       340       350       360       370       380         

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.6  bits: 81.0 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:357-519)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS63 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
        330       340       350       360       370       380      

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS63 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
        390          400         410       420       430       440 

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS63 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
             450       460       470       480       490       500 

        350       360                                              
pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS63 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
             510       520       530       540       550       560 

>>CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20            (509 aa)
 initn: 3681 init1: 580 opt: 611  Z-score: 397.3  bits: 82.6 E(32554): 8.2e-16
Smith-Waterman score: 642; 44.4% identity (62.9% similar) in 248 aa overlap (142-364:78-323)

             120       130       140       150         160         
pF1KB4 AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWS--TNERGALVGFSS
                                     :: :.  :: .:  ::  :.:: .  .: :
CCDS74 ENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKP--WSARTEERETSRAFPS
        50        60        70        80          90       100     

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB4 LFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSN
        .::   :   :: ..: . : ::  .  ..:.  :. ::  :::..  :     : .::
CCDS74 PLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGAINCREYEPDHNLESN
         110       120       130       140       150       160     

     230                              240       250       260      
pF1KB4 L---------------------FRQKA--VTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIH
       .                     :....  .  ..  . ..  :: :::::::.::.:  :
CCDS74 FITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGFSQKSNLSRH
         170       180       190       200       210       220     

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB4 QRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTH
       ::::. ::::.: :::..:  .:.:  :  ::: :::::::.:::::: :  .:::::::
CCDS74 QRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKSSFIRHQRTH
         230       240       250       260       270       280     

        330       340       350       360                          
pF1KB4 TREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD                      
       . :: ..:  :::.: .:: : ::::::.:.::::::.                      
CCDS74 SGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQRTHLDEK
         290       300       310       320       330       340     

CCDS74 PYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVC
         350       360       370       380       390       400     

>--
 initn: 2202 init1: 580 opt: 603  Z-score: 392.5  bits: 81.7 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 603; 57.9% identity (75.9% similar) in 145 aa overlap (220-364:324-463)

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB4 SPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQV
                                     :. .:.:.:.:....     ..   ..  :
CCDS74 LECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQ-----RTHLDEKPYV
           300       310       320       330            340        

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB4 CRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHC
       ::::::::  :: ::::.:::.::::::::::::::  .:.:  :  :::::: ::: .:
CCDS74 CRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCREC
      350       360       370       380       390       400        

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB4 GRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD     
        :::: :  ::::::::. :: ..:  ::::: .:: :: :.: :.:.::::: .     
CCDS74 RRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGEKPYVCSECGRGF
      410       420       430       440       450       460        

CCDS74 SRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH
      470       480       490       500         

>>CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (635 aa)
 initn: 2170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 397.1  bits: 82.9 E(32554): 8.5e-16
Smith-Waterman score: 914; 45.9% identity (69.9% similar) in 316 aa overlap (75-364:54-367)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB4 TEAEWKRLSLEQRNLYKEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQFLSQDELHN
                                     :. .::..  : :: .:.::.:  :  : :
CCDS74 VPRIRGSVVLAPRWRSSPAGGWSDPLFFGGADPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCN
            30        40        50        60        70        80   

          110          120       130       140       150       160 
pF1KB4 HPIPGFH---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWSTNER
       ::   :    : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  . ::.. :::  :..:
CCDS74 HPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGAM-PLFGRTKKR
            90       100       110       120       130        140  

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB4 GALVGFSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECA
        .: .::   :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. :: :. :::.:. :::.
CCDS74 -TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECG
             150       160       170       180       190       200 

             230                       240              250        
pF1KB4 LAFNQKSNLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ-------VCRECGRGFS
       :.:.. .::.                 .:. . .::  ..:.        :::::::::.
CCDS74 LSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFN
             210       220       230       240       250       260 

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB4 RKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPY
       ::: ::::.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  :::::::::: .::.::: :  
CCDS74 RKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSA
             270       280       290       300       310       320 

      320       330       340       350       360                  
pF1KB4 LIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD              
       ..:::::: .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:..              
CCDS74 VVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNH
             330       340       350       360       370       380 

CCDS74 QRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQNIH
             390       400       410       420       430       440 

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.3  bits: 81.1 E(32554): 3e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:401-563)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS74 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
              380       390       400       410       420       430

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS74 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
              440            450       460       470       480     

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS74 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
         490       500       510       520       530       540     

        350       360                                              
pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS74 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
         550       560       570       580       590       600     

>>CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (653 aa)
 initn: 2170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 396.9  bits: 82.9 E(32554): 8.7e-16
Smith-Waterman score: 1004; 45.0% identity (66.1% similar) in 387 aa overlap (35-364:1-385)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB4 REQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPRYLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLYKEVM
                                     ..:.:::: ::. ::. ::  ::.::.:::
CCDS13                               MAFRDVAVDFTQDEWRLLSPAQRTLYREVM
                                             10        20        30

           70          80                                     90   
pF1KB4 LENLRNLVSL--AESKPEV-------------------HTCPS----------CPLAFGS
       :::  :::::  . ::::.                    :::.          :: .:.:
CCDS13 LENYSNLVSLGISFSKPELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPDPEPELYLDPFCPPGFSS
               40        50        60        70        80        90

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pF1KB4 QQFLSQDELHNHPIPGFH---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGG
       :.:  :  : :::   :    : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  . ::.
CCDS13 QKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGA
              100       110       120       130       140       150

              160       170       180       190       200       210
pF1KB4 VRPLFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETP
       . :::  :..: .: .::   :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. :: :. 
CCDS13 M-PLFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVL
               160        170       180       190       200        

              220       230                       240              
pF1KB4 GFGAVTFGECALAFNQKSNLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ------
       :::.:. :::.:.:.. .::.                 .:. . .::  ..:.       
CCDS13 GFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKP
      210       220       230       240       250       260        

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB4 -VCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCS
        :::::::::.::: ::::.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  :::::::::: 
CCDS13 IVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCR
      270       280       290       300       310       320        

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB4 HCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD   
       .::.::: :  ..:::::: .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:..   
CCDS13 ECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGR
      330       340       350       360       370       380        

CCDS13 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
      390       400       410       420       430       440        

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.2  bits: 81.1 E(32554): 3e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:419-581)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS13 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
      390       400       410       420       430       440        

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS13 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
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pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS13 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
           510       520       530       540       550       560   

        350       360                                              
pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS13 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
           570       580       590       600       610       620   

>>CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (654 aa)
 initn: 3170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 396.9  bits: 82.9 E(32554): 8.7e-16
Smith-Waterman score: 1003; 44.8% identity (66.0% similar) in 388 aa overlap (35-364:1-386)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB4 REQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPRYLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLYKEVM
                                     ..:.:::: ::. ::. ::  ::.::.:::
CCDS63                               MAFRDVAVDFTQDEWRLLSPAQRTLYREVM
                                             10        20        30

           70          80                                      90  
pF1KB4 LENLRNLVSL--AESKPEV-------------------HTCPS-----------CPLAFG
       :::  :::::  . ::::.                    :::.           :: .:.
CCDS63 LENYSNLVSLGISFSKPELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPADPEPELYLDPFCPPGFS
               40        50        60        70        80        90

            100       110          120       130       140         
pF1KB4 SQQFLSQDELHNHPIPGFH---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEG
       ::.:  :  : :::   :    : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  . ::
CCDS63 SQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEG
              100       110       120       130       140       150

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB4 GVRPLFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAET
       .. :::  :..: .: .::   :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. :: :.
CCDS63 AM-PLFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEV
               160        170       180       190       200        

     210       220       230                       240             
pF1KB4 PGFGAVTFGECALAFNQKSNLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ-----
        :::.:. :::.:.:.. .::.                 .:. . .::  ..:.      
CCDS63 LGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEK
      210       220       230       240       250       260        

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB4 --VCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVC
         :::::::::.::: ::::.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  ::::::::::
CCDS63 PIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVC
      270       280       290       300       310       320        

        310       320       330       340       350       360      
pF1KB4 SHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD  
        .::.::: :  ..:::::: .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:..  
CCDS63 RECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECG
      330       340       350       360       370       380        

CCDS63 RCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFS
      390       400       410       420       430       440        

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.2  bits: 81.1 E(32554): 3e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:420-582)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS63 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
     390       400       410       420       430       440         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS63 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
     450          460         470       480       490       500    

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS63 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
          510       520       530       540       550       560    

        350       360                                              
pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS63 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
          570       580       590       600       610       620    

>>CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (657 aa)
 initn: 3170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 396.9  bits: 82.9 E(32554): 8.7e-16
Smith-Waterman score: 1004; 44.5% identity (66.0% similar) in 391 aa overlap (32-364:1-389)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB4 WAPREQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPRYLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRLSLEQRNLYK
                                     .. ..:.:::: ::. ::. ::  ::.::.
CCDS63                               MAHMAFRDVAVDFTQDEWRLLSPAQRTLYR
                                             10        20        30

              70          80                                       
pF1KB4 EVMLENLRNLVSL--AESKPEV-------------------HTCPS-----------CPL
       ::::::  :::::  . ::::.                    :::.           :: 
CCDS63 EVMLENYSNLVSLGISFSKPELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPADPEPELYLDPFCPP
               40        50        60        70        80        90

      90       100       110          120       130       140      
pF1KB4 AFGSQQFLSQDELHNHPIPGFH---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQR
       .:.::.:  :  : :::   :    : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  .
CCDS63 GFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPE
              100       110       120       130       140       150

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB4 VEGGVRPLFWSTNERGALVGFSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKR
        ::.. :::  :..: .: .::   :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. ::
CCDS63 GEGAM-PLFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKR
               160        170       180       190       200        

        210       220       230                       240          
pF1KB4 AETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ--
        :. :::.:. :::.:.:.. .::.                 .:. . .::  ..:.   
CCDS63 IEVLGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHS
      210       220       230       240       250       260        

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB4 -----VCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKP
            :::::::::.::: ::::.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  :::::::
CCDS63 GEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKP
      270       280       290       300       310       320        

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB4 YVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCR
       ::: .::.::: :  ..:::::: .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:.
CCDS63 YVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACK
      330       340       350       360       370       380        

                                                                   
pF1KB4 D                                                           
       .                                                           
CCDS63 ECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGR
      390       400       410       420       430       440        

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.2  bits: 81.1 E(32554): 3e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:423-585)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS63 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
            400       410       420       430       440       450  

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pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS63 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
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pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS63 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
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pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS63 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
       570       580       590       600       610       620       

>>CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20             (667 aa)
 initn: 2170 init1: 584 opt: 612  Z-score: 396.9  bits: 82.9 E(32554): 8.7e-16
Smith-Waterman score: 925; 42.0% identity (67.5% similar) in 369 aa overlap (25-364:37-399)

                     10        20        30          40        50  
pF1KB4       MWAPREQLLGWTAEALPAKDSAWPWEEKPR--YLGPVTFEDVAVLFTEAEWKRL
                                     :. .:   .  :. :  ... :.. :    
CCDS74 QGAPGGAEHPGRCGPGAVPRIRGSVVLAPRWRSSPAGGWSDPLFFGGAGISFSKPELIT-
         10        20        30        40        50        60      

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB4 SLEQ-RNLYKEVMLENLRNLVSLAESKPEVHTCPSCPLAFGSQQFLSQDELHNHPIPGFH
       .::: .. ..:   :.  . ..  . .::..  : :: .:.::.:  :  : :::   : 
CCDS74 QLEQGKETWRE---EKKCSPATCPDPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFT
          70           80        90       100       110       120  

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pF1KB4 ---AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWSTNERGALVGFS
          : ....::.: : :: ..:. :.    . .::  . ::.. :::  :..: .: .::
CCDS74 CLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPEGEGAM-PLFGRTKKR-TLGAFS
            130       140       150       160        170        180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB4 SLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKS
          :: :.:: .: : .:.. ::::... ::.:.. :: :. :::.:. :::.:.:.. .
CCDS74 RPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSFSKMT
              190       200       210       220       230       240

      230                       240              250       260     
pF1KB4 NLFR----------------QKAVTAEKSSDKRQSQ-------VCRECGRGFSRKSQLII
       ::.                 .:. . .::  ..:.        :::::::::.::: :::
CCDS74 NLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLII
              250       260       270       280       290       300

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB4 HQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRT
       :.:::.:::::.:.::::::  .: :  :  :::::::::: .::.::: :  ..:::::
CCDS74 HERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRT
              310       320       330       340       350       360

         330       340       350       360                         
pF1KB4 HTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD                     
       : .::...:. :: :: ..:.::.::: :.:.:::.:..                     
CCDS74 HLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKE
              370       380       390       400       410       420

CCDS74 KPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQNIHSGEKPIV
              430       440       450       460       470       480

>--
 initn: 1571 init1: 558 opt: 596  Z-score: 387.1  bits: 81.1 E(32554): 3.1e-15
Smith-Waterman score: 596; 52.4% identity (72.0% similar) in 168 aa overlap (197-364:433-595)

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB4 FSSLFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQ
                                     :..   ::.:    :    . : :. .:. 
CCDS74 CFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSL
            410       420       430       440       450       460  

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pF1KB4 KSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFI
       ::.: :.. .   .:..:    ::..::::::..:.:: :::::.::::.::::::::: 
CCDS74 KSHLNRHQNI---HSGEK--PIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFS
            470            480       490       500       510       

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pF1KB4 VESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSE
        .: :  :  :::::.:::: .:::::: .  ::::.: :.::: .::  :: :: .:: 
CCDS74 QKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSA
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pF1KB4 LIKHQRIHTGDKPYVCRD                                          
       :: :.: :. .:: :::.                                          
CCDS74 LITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRH
       580       590       600       610       620       630       

>>CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20            (599 aa)
 initn: 3681 init1: 580 opt: 611  Z-score: 396.7  bits: 82.7 E(32554): 9e-16
Smith-Waterman score: 642; 44.4% identity (62.9% similar) in 248 aa overlap (142-364:168-413)

             120       130       140       150         160         
pF1KB4 AGNQLHPGNPCPEDQPQSQHPSDKNHRGAEAEDQRVEGGVRPLFWS--TNERGALVGFSS
                                     :: :.  :: .:  ::  :.:: .  .: :
CCDS13 ENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKP--WSARTEERETSRAFPS
       140       150       160       170         180       190     

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB4 LFQRPPISSWGGNRILEIQLSPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSN
        .::   :   :: ..: . : ::  .  ..:.  :. ::  :::..  :     : .::
CCDS13 PLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGAINCREYEPDHNLESN
         200       210       220       230       240       250     

     230                              240       250       260      
pF1KB4 L---------------------FRQKA--VTAEKSSDKRQSQVCRECGRGFSRKSQLIIH
       .                     :....  .  ..  . ..  :: :::::::.::.:  :
CCDS13 FITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGFSQKSNLSRH
         260       270       280       290       300       310     

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB4 QRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHCGRGFSCKPYLIRHQRTH
       ::::. ::::.: :::..:  .:.:  :  ::: :::::::.:::::: :  .:::::::
CCDS13 QRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKSSFIRHQRTH
         320       330       340       350       360       370     

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pF1KB4 TREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD                      
       . :: ..:  :::.: .:: : ::::::.:.::::::.                      
CCDS13 SGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQRTHLDEK
         380       390       400       410       420       430     

CCDS13 PYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVC
         440       450       460       470       480       490     

>--
 initn: 2202 init1: 580 opt: 603  Z-score: 391.8  bits: 81.8 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 603; 57.9% identity (75.9% similar) in 145 aa overlap (220-364:414-553)

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB4 SPAQNASSEEVDRISKRAETPGFGAVTFGECALAFNQKSNLFRQKAVTAEKSSDKRQSQV
                                     :. .:.:.:.:....     ..   ..  :
CCDS13 LECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQ-----RTHLDEKPYV
           390       400       410       420            430        

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB4 CRECGRGFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYVCGECGRGFIVESVLRNHLSTHSGEKPYVCSHC
       ::::::::  :: ::::.:::.::::::::::::::  .:.:  :  :::::: ::: .:
CCDS13 CRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCREC
      440       450       460       470       480       490        

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB4 GRGFSCKPYLIRHQRTHTREKSFMCTVCGRGFREKSELIKHQRIHTGDKPYVCRD     
        :::: :  ::::::::. :: ..:  ::::: .:: :: :.: :.:.::::: .     
CCDS13 RRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGEKPYVCSECGRGF
      500       510       520       530       540       550        

CCDS13 SRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH
      560       570       580       590         




364 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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