Result of FASTA (ccds) for pF1KB3424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3424, 440 aa
  1>>>pF1KB3424 440 - 440 aa - 440 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1678+/-0.000796; mu= 14.7114+/- 0.048
 mean_var=96.2161+/-18.888, 0's: 0 Z-trim(110.1): 56  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.130753
 statistics sampled from 11286 (11342) to 11286 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time:  2.410

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14         ( 440) 2863 550.1 1.6e-156
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14         ( 367) 2364 455.9 2.9e-128
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19         ( 418) 1311 257.3   2e-68
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19         ( 387) 1284 252.2 6.5e-67
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17         ( 406) 1161 229.0 6.5e-60
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17         ( 398) 1158 228.5 9.5e-60
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11          ( 439) 1120 221.3 1.5e-57
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7           ( 433) 1050 208.1 1.4e-53
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14          ( 403) 1021 202.6 5.8e-52
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9             ( 806)  681 138.7 2.1e-32
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18       ( 797)  662 135.1 2.4e-31
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2        (1458)  656 134.1 8.7e-31
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8          (1390)  642 131.5 5.2e-30
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16          ( 795)  598 123.0   1e-27
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4        ( 893)  590 121.6 3.3e-27
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1            ( 667)  578 119.2 1.2e-26
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6            ( 980)  576 118.9 2.2e-26
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1             ( 750)  572 118.1   3e-26
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1            ( 765)  572 118.1   3e-26
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1             ( 856)  572 118.1 3.3e-26
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6         ( 491)  560 115.7   1e-25
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7           (1226)  563 116.5 1.4e-25
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7            (1283)  563 116.6 1.5e-25
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13      ( 490)  552 114.2 2.9e-25
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10       ( 683)  551 114.1 4.3e-25
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10        ( 716)  551 114.1 4.5e-25
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10        ( 773)  551 114.2 4.8e-25
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7         ( 674)  518 107.9 3.2e-23
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18      ( 466)  510 106.3 6.8e-23
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2           ( 584)  492 102.9 8.6e-22
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16        ( 437)  490 102.5 8.8e-22
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2           ( 616)  492 103.0 8.9e-22
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18         ( 444)  485 101.6 1.7e-21
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10         ( 361)  466 97.9 1.7e-20
CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17           ( 744)  463 97.5 4.6e-20
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2           ( 759)  410 87.6 4.8e-17
CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16          ( 489)  370 79.9 6.3e-15
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15     ( 620)  366 79.2 1.3e-14
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15     ( 753)  366 79.3 1.5e-14
CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6        ( 311)  349 75.8 6.8e-14


>>CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14              (440 aa)
 initn: 2863 init1: 2863 opt: 2863  Z-score: 2923.7  bits: 550.1 E(32554): 1.6e-156
Smith-Waterman score: 2863; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 KLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 AIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 QETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 NQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFK
              370       380       390       400       410       420

              430       440
pF1KB3 KSKENVLYKKQEGTPEGLYL
       ::::::::::::::::::::
CCDS32 KSKENVLYKKQEGTPEGLYL
              430       440

>>CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14              (367 aa)
 initn: 2364 init1: 2364 opt: 2364  Z-score: 2416.1  bits: 455.9 E(32554): 2.9e-128
Smith-Waterman score: 2364; 100.0% identity (100.0% similar) in 367 aa overlap (74-440:1-367)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB3 DAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81                               MEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLR
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 GTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVL
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 MDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVI
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 LYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVF
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB3 IDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIR
              220       230       240       250       260       270

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB3 PGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAG
              280       290       300       310       320       330

           410       420       430       440
pF1KB3 LMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL
              340       350       360       

>>CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19              (418 aa)
 initn: 1255 init1: 1226 opt: 1311  Z-score: 1341.8  bits: 257.3 E(32554): 2e-68
Smith-Waterman score: 1311; 50.7% identity (83.2% similar) in 369 aa overlap (64-432:46-412)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB3 GKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQE
                                     ::..  ..: ..::.:....  : :...  
CCDS12 PALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKKLQQELEFLEVQEEYIKDEQ--KNLKKEFL
          20        30        40        50        60          70   

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB3 EERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLN
       . . .:  ... :. .: . : .:.: :::....::..:: ::: .:..::.:. :: :.
CCDS12 HAQEEVKRIQSIPLVIGQFLEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALH
            80        90       100       110       120       130   

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB3 HKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEE
       .. .:.. ::  ..:  . ..  .. :.  ::::::.: : ::..:.::::::: : :..
CCDS12 KHSNALVDVLPPEADSSIMMLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQ
           140       150       160       170       180       190   

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB3 MGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRV
       .:: ::.::..::::: :::.::::::..:.:.:.::::::..:::::.::..::..::.
CCDS12 IGIDPPRGVLMYGPPGCGKTMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRL
           200       210       220       230       240       250   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB3 AEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNR
       :.:.::.:.::::::::.:::.:...:..::.:: .::::::.::::.  .:::::::::
CCDS12 AKENAPAIIFIDEIDAIATKRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNR
           260       270       280       290       300       310   

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB3 IETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGA
        .::::::.::::.::::::::::.. :. ::.  ::.:.:...: :.: .   : .:::
CCDS12 ADTLDPALLRPGRLDRKIEFPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGA
           320       330       340       350       360       370   

           400       410       420       430       440
pF1KB3 DIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL
       ::..:: :.:..:.:: :. :  .::.:. ..:. : ..        
CCDS12 DINSICQESGMLAVRENRYIVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK  
           380       390       400       410          

>>CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19              (387 aa)
 initn: 1226 init1: 1226 opt: 1284  Z-score: 1314.8  bits: 252.2 E(32554): 6.5e-67
Smith-Waterman score: 1284; 52.0% identity (83.7% similar) in 350 aa overlap (83-432:35-381)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB3 TPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTL
                                     :... :  . .:: ......   :. .: .
CCDS46 GILVEKAQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSRYKEEVKRIQSI---PLVIGQF
           10        20        30        40        50           60 

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB3 EEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVT
        : .:.: :::....::..:: ::: .:..::.:. :: :... .:.. ::  ..:  . 
CCDS46 LEAVDQNTAIVGSTTGSNYYVRILSTIDRELLKPNASVALHKHSNALVDVLPPEADSSIM
              70        80        90       100       110       120 

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB3 VMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGK
       ..  .. :.  ::::::.: : ::..:.::::::: : :...:: ::.::..::::: ::
CCDS46 MLTSDQKPDVMYADIGGMDIQKQEVREAVELPLTHFELYKQIGIDPPRGVLMYGPPGCGK
             130       140       150       160       170       180 

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB3 TLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGT
       :.::::::..:.:.:.::::::..:::::.::..::..::.:.:.::.:.::::::::.:
CCDS46 TMLAKAVAHHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEIDAIAT
             190       200       210       220       230       240 

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB3 KRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIE
       ::.:...:..::.:: .::::::.::::.  .::::::::: .::::::.::::.:::::
CCDS46 KRFDAQTGADREVQRILLELLNQMDGFDQNVNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIE
             250       260       270       280       290       300 

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB3 FPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRM
       :::::.. :. ::.  ::.:.:...: :.: .   : .:::::..:: :.:..:.:: :.
CCDS46 FPLPDRRQKRLIFSTITSKMNLSEEVDLEDYVARPDKISGADINSICQESGMLAVRENRY
             310       320       330       340       350       360 

            420       430       440
pF1KB3 KVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL
        :  .::.:. ..:. : ..        
CCDS46 IVLAKDFEKAYKTVIKKDEQEHEFYK  
             370       380         

>>CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17              (406 aa)
 initn: 1096 init1: 1073 opt: 1161  Z-score: 1189.1  bits: 229.0 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 1161; 46.3% identity (74.8% similar) in 393 aa overlap (44-432:4-396)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KB3 GKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLL
                                     :.  .. :   ..   :.   : .:..  :
CCDS11                            MALDGPEQMELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQL
                                          10        20        30   

                80        90       100       110       120         
pF1KB3 M----EEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGS
       .     ... : : : . :. : .  : ... :.     :: . . .: ....:..   .
CCDS11 IVNDKSQNLRRLQAQRNELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEG
            40        50        60        70        80        90   

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB3 EHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGG
       .  :.. . .: . . :.: : : .  ...  .: . .::::..: :::.:. ::  :::
CCDS11 KFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGG
           100       110       120       130       140       150   

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB3 LDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLR
       ::.::.:::: .:::. ::: .: .::  ::::.:::::::::::::.:::..:. ::.:
CCDS11 LDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIR
           160       170       180       190       200       210   

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB3 VVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTM
       : ::::.::..:.: ..::::: .:.::::::.:.::::.::..: ...:::. :.::::
CCDS11 VSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTM
           220       230       240       250       260       270   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB3 LELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHT
       ::::::::::..  ..:::::::::. :: ::.:::::::::::: :.:...  :..::.
CCDS11 LELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHS
           280       290       300       310       320       330   

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB3 SRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYK
        .:.:.  ..:  .       :::..:..:::::..::::::..::.:::. .  .:. :
CCDS11 RKMNLTRGINLRKIAELMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQK
           340       350       360       370       380       390   

     430       440  
pF1KB3 KQEGTPEGLYL  
        .:          
CCDS11 DSEKNMSIKKLWK
           400      

>>CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17              (398 aa)
 initn: 1096 init1: 1073 opt: 1158  Z-score: 1186.1  bits: 228.5 E(32554): 9.5e-60
Smith-Waterman score: 1158; 47.7% identity (76.1% similar) in 377 aa overlap (60-432:12-388)

      30        40        50        60        70            80     
pF1KB3 PTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLM----EEEFIRNQEQM
                                     :.   : .:..  :.     ... : : : 
CCDS56                    MELEEGKAGSGLRQYYLSKIEELQLIVNDKSQNLRRLQAQR
                                  10        20        30        40 

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB3 KPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLE
       . :. : .  : ... :.     :: . . .: ....:..   ..  :.. . .: . . 
CCDS56 NELNAKVRLLREELQLLQEQGSYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVT
              50        60        70        80        90       100 

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB3 PGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPL
       :.: : : .  ...  .: . .::::..: :::.:. ::  :::::.::.:::: .:::.
CCDS56 PNCRVALRNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPV
             110       120       130       140       150       160 

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB3 THPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPK
        ::: .: .::  ::::.:::::::::::::.:::..:. ::.:: ::::.::..:.: .
CCDS56 KHPELFEALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGAR
             170       180       190       200       210       220 

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB3 LVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDV
       .::::: .:.::::::.:.::::.::..: ...:::. :.::::::::::::::..  ..
CCDS56 MVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNI
             230       240       250       260       270       280 

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB3 KVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIM
       :::::::::. :: ::.:::::::::::: :.:...  :..::. .:.:.  ..:  .  
CCDS56 KVIMATNRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINLRKIAE
             290       300       310       320       330       340 

         390       400       410       420       430       440  
pF1KB3 AKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL  
            :::..:..:::::..::::::..::.:::. .  .:. : .:          
CCDS56 LMPGASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
             350       360       370       380       390        

>>CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11               (439 aa)
 initn: 1107 init1: 1107 opt: 1120  Z-score: 1146.8  bits: 221.3 E(32554): 1.5e-57
Smith-Waterman score: 1146; 42.8% identity (72.2% similar) in 432 aa overlap (27-431:5-432)

               10        20        30        40               50   
pF1KB3 MGQSQSGGHGPGGGKKDDKDKKKKYEPPVPTRVGKKKKKTKGPDAASK-------LPLVT
                                 : . . : ...: .   : : .       : . :
CCDS79                       MNLLPNIESPVTRQEKMATVWDEAEQDGIGEEVLKMST
                                     10        20        30        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB3 PHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLE
        .   : .::  : ::   .:. : .:  .... ...: .:.  :.   .  :. :... 
CCDS79 EEIIQRTRLLDSE-IK---IMKSEVLRVTHELQAMKDKIKENSEKIKVNKTLPYLVSNVI
       40        50            60        70        80        90    

                          120            130       140       150   
pF1KB3 EIID---------------DNH-----AIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLN
       :..:               :..     :...::. . ... ....:: . :.::  : .:
CCDS79 ELLDVDPNDQEEDGANIDLDSQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVN
          100       110       120       130       140       150    

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB3 HKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEE
       .  . .. .:  . :  : .:.:.. : : :.::::::.::::. :.. ::..: : .:.
CCDS79 KDSYLILETLPTEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELVEAIVLPMNHKEKFEN
          160       170       180       190       200       210    

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB3 MGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRV
       .::.:::::..::::::::::::.: : ::.::::...: .:.: ..::: ::::. : .
CCDS79 LGIQPPKGVLMYGPPGTGKTLLARACAAQTKATFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFAL
          220       230       240       250       260       270    

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB3 AEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNR
       :.:.::::.::::.:::::::.::...:.::.::::::::::::::.   .:::: ::::
CCDS79 AKEKAPSIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFQPNTQVKVIAATNR
          280       290       300       310       320       330    

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB3 IETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKDDLSGA
       .. :::::.: ::.:::::::.:.:... ::.:::. .:... ::. ..:    ::..::
CCDS79 VDILDPALLRSGRLDRKIEFPMPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELARCTDDFNGA
          340       350       360       370       380       390    

           400       410       420       430       440
pF1KB3 DIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL
       . ::.:.:::..:::.   ..:.::. ..  .:  ::.         
CCDS79 QCKAVCVEAGMIALRRGATELTHEDYMEGILEVQAKKKANLQYYA  
          400       410       420       430           

>>CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7                (433 aa)
 initn: 1022 init1: 1022 opt: 1050  Z-score: 1075.5  bits: 208.1 E(32554): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 1050; 47.3% identity (76.2% similar) in 336 aa overlap (106-435:92-427)

          80        90       100       110           120       130 
pF1KB3 EEFIRNQEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIID----DNHAIVSTSVGSEH
                                     :..:.   .::.    : . :....  .. 
CCDS57 LTGIKESDTGLAPPALWDLAADKQTLQSEQPLQVARCTKIINADSEDPKYIINVKQFAKF
              70        80        90       100       110       120 

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pF1KB3 YVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLD
        :.. . :    .: :  : .... . .   :    :: ::.:.::. :. ::.:.::  
CCDS57 VVDLSDQVAPTDIEEGMRVGVDRNKYQIHIPLPPKIDPTVTMMQVEEKPDVTYSDVGGCK
             130       140       150       160       170       180 

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pF1KB3 NQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVV
       .::....: :: :: ::: . ..::.:::::.:.::::::::: :.::::.:.: :.::.
CCDS57 EQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGTGKTLCARAVANRTDACFIRVI
             190       200       210       220       230       240 

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pF1KB3 GSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLE
       ::::.:::.:.: ..:::::..:. .   ..:.:::::::  :.:...::. :.::::::
CCDS57 GSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACLIFFDEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLE
             250       260       270       280       290       300 

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pF1KB3 LLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSR
       :.::::::: ::..::.::::: .::::::.::::.:::::: ::: . . .::.::.  
CCDS57 LINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRPGRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARS
             310       320       330       340       350       360 

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pF1KB3 MTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVL--YK
       :..  :. .. :     . .::.:...:::::..:.: ::  .:..:: .. ..:.  : 
CCDS57 MSVERDIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAGMFAIRARRKIATEKDFLEAVNKVIKSYA
             370       380       390       400       410       420 

     430       440 
pF1KB3 KQEGTPEGLYL 
       :  .::      
CCDS57 KFSATPRYMTYN
             430   

>>CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14               (403 aa)
 initn: 1015 init1: 1015 opt: 1021  Z-score: 1046.4  bits: 202.6 E(32554): 5.8e-52
Smith-Waterman score: 1021; 42.6% identity (75.9% similar) in 373 aa overlap (59-431:27-393)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB3 VPTRVGKKKKKTKGPDAASKLPLVTPHTQCRLKLLKLERIKDYLLMEEEFIRNQEQMKPL
                                     : :::. ..:   :   .:.   .::.: :
CCDS97     MAIPGIPYERRLLIMADPRDKALQDYRKKLLEHKEIDGRL---KEL---REQLKEL
                   10        20        30        40              50

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pF1KB3 EEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDKDLLEPGC
        .. :. .. .  :... . :: . . . ... ::... : .. :.    .::. :.:: 
CCDS97 TKQYEKSENDLKALQSVGQIVGEVLKQLTEEKFIVKATNGPRYVVGCRRQLDKSKLKPGT
               60        70        80        90       100       110

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB3 SVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDNQIQEIKESVELPLTHP
        : :.  . ...  :  ..::::  :. :   . .:..::::..::.:..: .:::::.:
CCDS97 RVALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNP
              120       130       140       150       160       170

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB3 EYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVR
       : ....:: :::: .:::::::::::::.:::.: . .::.::.: ...::.:.. .:.:
CCDS97 ELFQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIR
              180       190       200       210       220       230

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pF1KB3 ELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVI
       :.:  :..: : :.:.::::::: .:.. .....::::::..:::::.::::.   ::.:
CCDS97 EMFNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMI
              240       250       260       270       280       290

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pF1KB3 MATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRMTLADDVTLDDLIMAKD
       ::::: .::::::.::::.::::.. ::.:...  :..::.. .:   ..  . ..  .:
CCDS97 MATNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSD
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      390       400       410       420       430       440 
pF1KB3 DLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQEGTPEGLYL 
        ..:::.. .:::::..:.:  .  :..::: :. ..:  .:.          
CCDS97 GFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV
              360       370       380       390       400   

>>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9                  (806 aa)
 initn: 684 init1: 652 opt: 681  Z-score: 695.4  bits: 138.7 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 681; 33.6% identity (67.9% similar) in 336 aa overlap (112-436:396-730)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB3 QEQMKPLEEKQEEERSKVDDLRGTPMSVGTLEEIIDDNHAIVSTSVGSEHYVSILSFVDK
                                     ::.. ...:. :......    . :. . :
CCDS65 EVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRK
         370       380       390       400       410       420     

               150       160              170       180       190  
pF1KB3 --DLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDD-------TDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLDN
         ::..   .  .. .:   ..: :::       ..: .    : ..:: :. :::::..
CCDS65 KMDLIDLE-DETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLED
         430        440       450       460       470       480    

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB3 QIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVVG
         .:..: :. :. ::. . ..:. : :::..::::: ::::::::.::. .:.:. . :
CCDS65 VKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKG
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pF1KB3 SELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLEL
        ::.  ..:..   :::.:  :.. :: ..:.::.:.:.  :  . . :    .:.. ..
CCDS65 PELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQI
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pF1KB3 LNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSRM
       :...::.... .: .: :::: . .:::..::::.:. : .::::::..  :.. .  . 
CCDS65 LTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKS
          610       620       630       640       650       660    

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pF1KB3 TLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRER-RMKVTNEDFKKSKENVL-YKK
        .: :: :. :    . .::::.  :: .:  .:.::  . ..  :  .... ...  ..
CCDS65 PVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEE
          670       680       690       700       710       720    

              440                                                  
pF1KB3 QEGTPEGLYL                                                  
       .. .::                                                      
CCDS65 DDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPS
          730       740       750       760       770       780    

>--
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Smith-Waterman score: 639; 46.1% identity (74.7% similar) in 217 aa overlap (162-378:181-394)

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pF1KB3 YVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGGLD
                                     :.  . .:.    . :.  .  : ::::  
CCDS65 IFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCR
              160       170       180       190       200       210

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 NQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRVV
       .:. .::: ::::: ::  .. .:.:::.:..:::::::::::.:.::::.:.: :. . 
CCDS65 KQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLIN
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB3 GSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLE
       : :...:  :.. . .:. :. ::..::.:.::::.:::. ::  ..  :: : .: . .
CCDS65 GPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTH--GEVE-RRIVSQ
              280       290       300       310         320        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB3 LLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKRIFQIHTSR
       ::. .::. .:. : :. :::: ...:::: : ::.::.... .::   . .:.::::. 
CCDS65 LLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKN
       330       340       350       360       370       380       

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB3 MTLADDVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKSKENVLYKKQ
       : :::::                                                     
CCDS65 MKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAV
       390       400       410       420       430       440       




440 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 02:22:47 2016 done: Fri Nov  4 02:22:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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