Result of SIM4 for pF1KB3391

seq1 = pF1KB3391.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB3391/gi568815594f_65473459.tfa (gi568815594f:65473459_65674325), 200867 bp

>pF1KB3391 864
>gi568815594f:65473459_65674325 (Chr4)

1-864  (100001-100867)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGTGAAAAAGTTGAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCCGA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGTGAAAAAGTTTAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAAGAAGGTTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAAG
        ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCAAGAAGACTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCATTGCAGCCGCAACCCTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCGTTGCAGCCGCAACCCTGTCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCCATGTATTCCAGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCCATGTATTCCAGAAAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGTACAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGTACAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGGAGAAGGTTCTCGCAACTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGGAGAAGGTTCTTGCAACTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACGGCGGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATATTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACGGCGGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATATTATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACGGCAAAAAA   CCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||
 100351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACGGCAAAAAAAAACCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    398 TCAGTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAGTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    448 CTGATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    498 GCAGCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAGCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    548 GAGTTCCTCTACGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACTTCAACC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100551 GAGTTCCTCTATGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACCTCAACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598 AAAATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    648 CTTCAAGAAGAAGAAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCAAGAAGAAGCAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    698 TCGACACAGAAAAAGAGAAATATGAGATTACGGAGCAGCGCAAGATTGAT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCGACACAGAAAAAGGGAAATATGAGATTACGGAGCAGCGCAAGATTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748 CAGAAAGCTGTGGACTCACAAATTTTACCAAAAATCAAAGCTATTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100751 CAGAAAGCTGTGGACTCACAAATTTTATCAAAAATCAAAGCTATTCCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    798 GCTCCAGGGCTACCTGCGATCTGTGTTTGCTCTGACGAATGGAATTTATC
        ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100801 GCTCCAGGGCTAGTTGCGATCTGTGTTTGCCCTGACGAATGGAATTTATC

    850     .    :    .
    848 CTCACAAATTGGTGTTC
        |||||||||||||||||
 100851 CTCACAAATTGGTGTTC

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