Result of FASTA (ccds) for pF1KB3233
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3233, 780 aa
  1>>>pF1KB3233 780 - 780 aa - 780 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3496+/-0.00106; mu= 19.4658+/- 0.063
 mean_var=59.3320+/-11.407, 0's: 0 Z-trim(101.9): 25  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.166506
 statistics sampled from 6700 (6714) to 6700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.206), width:  16
 Scan time:  3.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12           ( 780) 5164 1249.6       0
CCDS53786.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12          ( 851) 5164 1249.6       0
CCDS7059.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10           ( 784) 3788 919.0       0
CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21          ( 780) 3761 912.5       0
CCDS55698.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10          ( 776) 3446 836.9       0


>>CCDS8760.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12                (780 aa)
 initn: 5164 init1: 5164 opt: 5164  Z-score: 6694.9  bits: 1249.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5164; 100.0% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 GGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 AMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 STVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 STVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 ISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFSV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEEPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEEPF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 TIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 HMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRALVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 HMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRALVF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 QPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 QPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEAAV
              730       740       750       760       770       780

>>CCDS53786.1 PFKM gene_id:5213|Hs108|chr12               (851 aa)
 initn: 5164 init1: 5164 opt: 5164  Z-score: 6694.3  bits: 1249.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5164; 100.0% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:72-851)

                                             10        20        30
pF1KB3                               MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPKTDILKSLDTMDDPDTVGSIPVFKTEWIMTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGM
              50        60        70        80        90       100 

               40        50        60        70        80        90
pF1KB3 NAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCK
             110       120       130       140       150       160 

              100       110       120       130       140       150
pF1KB3 DFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEA
             170       180       190       200       210       220 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB3 TKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGR
             230       240       250       260       270       280 

              220       230       240       250       260       270
pF1KB3 HCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKN
             290       300       310       320       330       340 

              280       290       300       310       320       330
pF1KB3 GKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPD
             350       360       370       380       390       400 

              340       350       360       370       380       390
pF1KB3 TPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAH
             410       420       430       440       450       460 

              400       410       420       430       440       450
pF1KB3 VRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEE
             470       480       490       500       510       520 

              460       470       480       490       500       510
pF1KB3 AGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELME
             530       540       550       560       570       580 

              520       530       540       550       560       570
pF1KB3 GRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFSVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFSVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFII
             590       600       610       620       630       640 

              580       590       600       610       620       630
pF1KB3 ETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEEPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEEPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEK
             650       660       670       680       690       700 

              640       650       660       670       680       690
pF1KB3 CNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGK
             710       720       730       740       750       760 

              700       710       720       730       740       750
pF1KB3 IKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRALVFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRALVFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILK
             770       780       790       800       810       820 

              760       770       780
pF1KB3 ILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEAAV
             830       840       850 

>>CCDS7059.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10                (784 aa)
 initn: 3842 init1: 2032 opt: 3788  Z-score: 4908.5  bits: 919.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3788; 72.5% identity (91.1% similar) in 761 aa overlap (13-770:22-779)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB3          MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFV
                            : ::::.::::::::::::::::::::.::..::.:.:.
CCDS70 MDADDSRAPKGSLRKFLEHLSGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRMGIYVGAKVYFI
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB3 HEGYQGLVDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGIT
       .:::::.::::..: :: ::::: .::.:::.::::::. :: :::::.:: ::..::::
CCDS70 YEGYQGMVDGGSNIAEADWESVSSILQVGGTIIGSARCQAFRTREGRLKAACNLLQRGIT
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB3 NLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCG
       ::::::::::::::. ::.::: :: .: . :.:  : . : .:::.::.::::::::::
CCDS70 NLCVIGGDGSLTGANLFRKEWSGLLEELARNGQIDKEAVQKYAYLNVVGMVGSIDNDFCG
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB3 TDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIP
       ::::::::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:
CCDS70 TDMTIGTDSALHRIIEVVDAIMTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALACGADWVFLP
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB3 ECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDT
       : ::.. :::..: .:::.:.: .::::::::::::: ..:::::: ::.::: .:::::
CCDS70 ESPPEEGWEEQMCVKLSENRARKKRLNIIIVAEGAIDTQNKPITSEKIKELVVTQLGYDT
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB3 RVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMEC
       :::.:::::::::::::::::.::::::::.::::.:::::::::::.::.:::::::::
CCDS70 RVTILGHVQRGGTPSAFDRILASRMGVEAVIALLEATPDTPACVVSLNGNHAVRLPLMEC
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380       390          400        
pF1KB3 VQVTKDVTKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPP---VSKSGSHTVAVMNV
       ::.:.:: :::::..:..:..:::::: .: ..:: :: .. :   . :.. . :::.::
CCDS70 VQMTQDVQKAMDERRFQDAVRLRGRSFAGNLNTYKRLA-IKLPDDQIPKTNCN-VAVINV
              370       380       390        400       410         

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB3 GAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLG
       :::::::::::::.::.:. .:.:.:...:::.:.:::::.: ::. :::::::::: ::
CCDS70 GAPAAGMNAAVRSAVRVGIADGHRMLAIYDGFDGFAKGQIKEIGWTDVGGWTGQGGSILG
      420       430       440       450       460       470        

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB3 TKRTLPKKSFEQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPAT
       :::.:: : .:.:....   .:..:.:::::::: : :::  .:.. .:.:.:.:..:::
CCDS70 TKRVLPGKYLEEIATQMRTHSINALLIIGGFEAYLGLLELSAAREKHEEFCVPMVMVPAT
      480       490       500       510       520       530        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB3 VSNNVPGSDFSVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAA
       :::::::::::.:::::::::  :::::::::.::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS70 VSNNVPGSDFSIGADTALNTITDTCDRIKQSASGTKRRVFIIETMGGYCGYLANMGGLAA
      540       550       560       570       580       590        

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB3 GADAAYIFEEPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEG
       :::::::::::: :::::.:::::..:::::..::::::::.:.::::::::..::::::
CCDS70 GADAAYIFEEPFDIRDLQSNVEHLTEKMKTTIQRGLVLRNESCSENYTTDFIYQLYSEEG
      600       610       620       630       640       650        

      650       660       670       680       690       700        
pF1KB3 KGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSG
       ::.:: ::::::::::::.:.::::::.::..:.::.:...:.::.   :. :. : :: 
CCDS70 KGVFDCRKNVLGHMQQGGAPSPFDRNFGTKISARAMEWITAKLKEARGRGKKFT-TDDSI
      660       670       680       690       700       710        

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB3 CVLGMRKRALVFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLE
       ::::. :: ..:::::::: :::::::::::::::::::..::::::. . :.:: ..::
CCDS70 CVLGISKRNVIFQPVAELKKQTDFEHRIPKEQWWLKLRPLMKILAKYKASYDVSDSGQLE
       720       730       740       750       760       770       

      770       780
pF1KB3 HITRKRSGEAAV
       :.          
CCDS70 HVQPWSV     
       780         

>>CCDS33582.1 PFKL gene_id:5211|Hs108|chr21               (780 aa)
 initn: 3744 init1: 2020 opt: 3761  Z-score: 4873.5  bits: 912.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3761; 70.3% identity (91.1% similar) in 761 aa overlap (13-773:13-772)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTHEEHHAAKTLGIGKAIAVLTSGGDAQGMNAAVRAVVRVGIFTGARVFFVHEGYQGLVD
                   : ::::.::::::::::::::::::.:.::..::.::...:::.:::.
CCDS33 MAAVDLEKLRASGAGKAIGVLTSGGDAQGMNAAVRAVTRMGIYVGAKVFLIYEGYEGLVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 GGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKRGITNLCVIGGDG
       ::..::.:.: ::: ..:::::.::::::: :  ::::  ::::::..::::::::::::
CCDS33 GGENIKQANWLSVSNIIQLGGTIIGSARCKAFTTREGRRAAAYNLVQHGITNLCVIGGDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS
       :::::. :::::..:: .:   :::..  :   :.:::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 SLTGANIFRSEWGSLLEELVAEGKISETTARTYSHLNIAGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWVFIPECPPDDDWE
       :::::::..:::::::::::::::::::::::::::::..:. ::::.:::: ::.: ::
CCDS33 ALHRIMEVIDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALASGADWLFIPEAPPEDGWE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLGYDTRVTVLGHVQ
       . .:.::.:::.:::::::::.::::::.:::::.:  .:.:::.:::.:::::::::::
CCDS33 NFMCERLGETRSRGSRLNIIIIAEGAIDRNGKPISSSYVKDLVVQRLGFDTRVTVLGHVQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPLMECVQVTKDVTK
       ::::::::::::.:.::.::::::::.:::::::::.:::::.::::::::::.::.: :
CCDS33 RGGTPSAFDRILSSKMGMEAVMALLEATPDTPACVVTLSGNQSVRLPLMECVQMTKEVQK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 AMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPPVSKSGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR
       :::.:.:::: .::: :: :::..:::::: .::  :: . ..:..::::::::::::::
CCDS33 AMDDKRFDEATQLRGGSFENNWNIYKLLAHQKPPKEKS-NFSLAILNVGAPAAGMNAAVR
              370       380       390        400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 STVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGSKLGTKRTLPKKSFEQ
       :.:: :. .:. : :::::::::::::..:.::  :.:: :.::: ::::::::: ..:.
CCDS33 SAVRTGISHGHTVYVVHDGFEGLAKGQVQEVGWHDVAGWLGRGGSMLGTKRTLPKGQLES
     420       430       440       450       460       470         

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 ISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVIPATVSNNVPGSDFSV
       :  ::  ..:..:...:::::: : :.:.:.: ...:::: . :::::.::::::.:::.
CCDS33 IVENIRIYGIHALLVVGGFEAYEGVLQLVEARGRYEELCIVMCVIPATISNNVPGTDFSL
     480       490       500       510       520       530         

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAGLAAGADAAYIFEEPF
       :.:::.:.   .::::::::.::::::::.::::::::::::..:.:.::::::.::.::
CCDS33 GSDTAVNAAMESCDRIKQSASGTKRRVFIVETMGGYCGYLATVTGIAVGADAAYVFEDPF
     540       550       560       570       580       590         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 TIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYSEEGKGIFDSRKNVLG
       .:.::..::::...:::: ..::::::::::.. :::.:..:::: ::::.:: : ::::
CCDS33 NIHDLKVNVEHMTEKMKTDIQRGLVLRNEKCHDYYTTEFLYNLYSSEGKGVFDCRTNVLG
     600       610       620       630       640       650         

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 HMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTPDSGCVLGMRKRALVF
       :.::::.:::::::..::.:.::: :.: :..: ::.::.:::.:::.::.:..:.:..:
CCDS33 HLQQGGAPTPFDRNYGTKLGVKAMLWLSEKLREVYRKGRVFANAPDSACVIGLKKKAVAF
     660       670       680       690       700       710         

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 QPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHAHLEHITRKRSGEAAV
       .::.::: .::::::.:.:::::.:: .::.::.:.:.. .   ..:::.::.       
CCDS33 SPVTELKKDTDFEHRMPREQWWLSLRLMLKMLAQYRISMAAYVSGELEHVTRRTLSMDKG
     720       730       740       750       760       770         

CCDS33 F
     780

>>CCDS55698.1 PFKP gene_id:5214|Hs108|chr10               (776 aa)
 initn: 3498 init1: 1696 opt: 3446  Z-score: 4464.6  bits: 836.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3446; 72.2% identity (90.8% similar) in 695 aa overlap (79-770:80-771)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB3 FFVHEGYQGLVDGGDHIKEATWESVSMMLQLGGTVIGSARCKDFREREGRLRAAYNLVKR
                                     .:::.::::::. :: :::::.:: ::..:
CCDS55 HPASGAVRGDWREKPGCWSHRFPCPGRHALVGGTIIGSARCQAFRTREGRLKAACNLLQR
      50        60        70        80        90       100         

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB3 GITNLCVIGGDGSLTGADTFRSEWSDLLSDLQKAGKITDEEATKSSYLNIVGLVGSIDND
       :::::::::::::::::. ::.::: :: .: . :.:  : . : .:::.::.:::::::
CCDS55 GITNLCVIGGDGSLTGANLFRKEWSGLLEELARNGQIDKEAVQKYAYLNVVGMVGSIDND
     110       120       130       140       150       160         

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB3 FCGTDMTIGTDSALHRIMEIVDAITTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVTSLSCGADWV
       :::::::::::::::::.:.:::: :::::::::::::::::::::::::..:.::::::
CCDS55 FCGTDMTIGTDSALHRIIEVVDAIMTTAQSHQRTFVLEVMGRHCGYLALVSALACGADWV
     170       180       190       200       210       220         

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB3 FIPECPPDDDWEEHLCRRLSETRTRGSRLNIIIVAEGAIDKNGKPITSEDIKNLVVKRLG
       :.:: ::.. :::..: .:::.:.: .::::::::::::: ..:::::: ::.::: .::
CCDS55 FLPESPPEEGWEEQMCVKLSENRARKKRLNIIIVAEGAIDTQNKPITSEKIKELVVTQLG
     230       240       250       260       270       280         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB3 YDTRVTVLGHVQRGGTPSAFDRILGSRMGVEAVMALLEGTPDTPACVVSLSGNQAVRLPL
       ::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::.:::::::::::.::.::::::
CCDS55 YDTRVTILGHVQRGGTPSAFDRILASRMGVEAVIALLEATPDTPACVVSLNGNHAVRLPL
     290       300       310       320       330       340         

      350       360       370       380       390          400     
pF1KB3 MECVQVTKDVTKAMDEKKFDEALKLRGRSFMNNWEVYKLLAHVRPP---VSKSGSHTVAV
       :::::.:.:: :::::..:..:..:::::: .: ..:: :: .. :   . :.. . :::
CCDS55 MECVQMTQDVQKAMDERRFQDAVRLRGRSFAGNLNTYKRLA-IKLPDDQIPKTNCN-VAV
     350       360       370       380       390        400        

         410       420       430       440       450       460     
pF1KB3 MNVGAPAAGMNAAVRSTVRIGLIQGNRVLVVHDGFEGLAKGQIEEAGWSYVGGWTGQGGS
       .:::::::::::::::.::.:. .:.:.:...:::.:.:::::.: ::. ::::::::::
CCDS55 INVGAPAAGMNAAVRSAVRVGIADGHRMLAIYDGFDGFAKGQIKEIGWTDVGGWTGQGGS
       410       420       430       440       450       460       

         470       480       490       500       510       520     
pF1KB3 KLGTKRTLPKKSFEQISANITKFNIQGLVIIGGFEAYTGGLELMEGRKQFDELCIPFVVI
        :::::.:: : .:.:....   .:..:.:::::::: : :::  .:.. .:.:.:.:..
CCDS55 ILGTKRVLPGKYLEEIATQMRTHSINALLIIGGFEAYLGLLELSAAREKHEEFCVPMVMV
       470       480       490       500       510       520       

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB3 PATVSNNVPGSDFSVGADTALNTICTTCDRIKQSAAGTKRRVFIIETMGGYCGYLATMAG
       ::::::::::::::.:::::::::  :::::::::.::::::::::::::::::::.:.:
CCDS55 PATVSNNVPGSDFSIGADTALNTITDTCDRIKQSASGTKRRVFIIETMGGYCGYLANMGG
       530       540       550       560       570       580       

         590       600       610       620       630       640     
pF1KB3 LAAGADAAYIFEEPFTIRDLQANVEHLVQKMKTTVKRGLVLRNEKCNENYTTDFIFNLYS
       ::::::::::::::: :::::.:::::..:::::..::::::::.:.::::::::..:::
CCDS55 LAAGADAAYIFEEPFDIRDLQSNVEHLTEKMKTTIQRGLVLRNESCSENYTTDFIYQLYS
       590       600       610       620       630       640       

         650       660       670       680       690       700     
pF1KB3 EEGKGIFDSRKNVLGHMQQGGSPTPFDRNFATKMGAKAMNWMSGKIKESYRNGRIFANTP
       :::::.:: ::::::::::::.:.::::::.::..:.::.:...:.::.   :. :. : 
CCDS55 EEGKGVFDCRKNVLGHMQQGGAPSPFDRNFGTKISARAMEWITAKLKEARGRGKKFT-TD
       650       660       670       680       690       700       

         710       720       730       740       750       760     
pF1KB3 DSGCVLGMRKRALVFQPVAELKDQTDFEHRIPKEQWWLKLRPILKILAKYEIDLDTSDHA
       :: ::::. :: ..:::::::: :::::::::::::::::::..::::::. . :.:: .
CCDS55 DSICVLGISKRNVIFQPVAELKKQTDFEHRIPKEQWWLKLRPLMKILAKYKASYDVSDSG
        710       720       730       740       750       760      

         770       780
pF1KB3 HLEHITRKRSGEAAV
       .:::.          
CCDS55 QLEHVQPWSV     
        770           




780 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 02:12:55 2016 done: Fri Nov  4 02:12:55 2016
 Total Scan time:  3.840 Total Display time:  0.140

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com