Result of FASTA (omim) for pF1KA1646
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1646, 537 aa
  1>>>pF1KA1646 537 - 537 aa - 537 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7125+/-0.00034; mu= 22.1242+/- 0.021
 mean_var=69.4202+/-14.191, 0's: 0 Z-trim(115.5): 35  B-trim: 981 in 1/49
 Lambda= 0.153933
 statistics sampled from 25887 (25922) to 25887 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time: 10.110

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_073603 (OMIM: 610307) ceramide kinase [Homo sap ( 537) 3722 835.8       0
XP_016884398 (OMIM: 610307) PREDICTED: ceramide ki ( 500) 3387 761.3       0
NP_963842 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase-li ( 532)  532 127.3 1.1e-28
NP_001025482 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase ( 558)  401 98.3 6.7e-20
NP_001191087 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 i ( 595)  347 86.3 2.9e-16
XP_006723355 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 618)  347 86.3 2.9e-16
XP_011525436 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 618)  347 86.3 2.9e-16
NP_001191089 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 i ( 618)  347 86.3 2.9e-16
XP_011525435 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 654)  347 86.3 3.1e-16
NP_001191088 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 i ( 654)  347 86.3 3.1e-16
NP_064511 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 isof ( 654)  347 86.3 3.1e-16
XP_016882497 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 716)  347 86.4 3.3e-16
NP_001136074 (OMIM: 603730) sphingosine kinase 1 i ( 384)  320 80.1 1.3e-14
NP_001136073 (OMIM: 603730) sphingosine kinase 1 i ( 384)  320 80.1 1.3e-14
XP_005257823 (OMIM: 603730) PREDICTED: sphingosine ( 384)  320 80.1 1.3e-14
NP_068807 (OMIM: 603730) sphingosine kinase 1 isof ( 398)  320 80.1 1.4e-14
NP_892010 (OMIM: 603730) sphingosine kinase 1 isof ( 470)  320 80.2 1.5e-14
XP_016882499 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 401)  247 63.9   1e-09
XP_016882498 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine ( 448)  246 63.8 1.3e-09
NP_001230805 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 i ( 448)  246 63.8 1.3e-09
NP_001025483 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase ( 419)  244 63.3 1.7e-09
NP_001025484 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase ( 463)  244 63.3 1.8e-09
NP_001153749 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase ( 514)  244 63.4   2e-09
XP_005250080 (OMIM: 212350,610345,614691) PREDICTE ( 350)  182 49.4 2.1e-05
NP_060708 (OMIM: 212350,610345,614691) acylglycero ( 422)  182 49.5 2.4e-05
XP_011514699 (OMIM: 212350,610345,614691) PREDICTE ( 422)  182 49.5 2.4e-05


>>NP_073603 (OMIM: 610307) ceramide kinase [Homo sapiens  (537 aa)
 initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722  Z-score: 4464.4  bits: 835.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3722; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWRSPGPGAGAPGADACSVPVSEIIAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWRSPGPGAGAPGADACSVPVSEIIAV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 TDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 EKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 EKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 LEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 LEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 ILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 ILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       
pF1KA1 GHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 GHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
              490       500       510       520       530       

>>XP_016884398 (OMIM: 610307) PREDICTED: ceramide kinase  (500 aa)
 initn: 3387 init1: 3387 opt: 3387  Z-score: 4062.7  bits: 761.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3387; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (48-537:11-500)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KA1 QQRCAVSLEPARALLRWWRSPGPGAGAPGADACSVPVSEIIAVEETDVHGKHQGSGKWQK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                     MTPLDPVGSRDACSVPVSEIIAVEETDVHGKHQGSGKWQK
                                   10        20        30        40

        80        90       100       110       120       130       
pF1KA1 MEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFI
               50        60        70        80        90       100

       140       150       160       170       180       190       
pF1KA1 NPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDGIVCVGGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDGIVCVGGD
              110       120       130       140       150       160

       200       210       220       230       240       250       
pF1KA1 GMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGSTDCVCYSTVGTSDAETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGSTDCVCYSTVGTSDAETS
              170       180       190       200       210       220

       260       270       280       290       300       310       
pF1KA1 ALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLK
              230       240       250       260       270       280

       320       330       340       350       360       370       
pF1KA1 TFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAED
              290       300       310       320       330       340

       380       390       400       410       420       430       
pF1KA1 VEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKCSRFNFLRFLIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKCSRFNFLRFLIR
              350       360       370       380       390       400

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 HTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSSHPSCCCTVSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSSHPSCCCTVSNS
              410       420       430       440       450       460

       500       510       520       530       
pF1KA1 SWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
              470       480       490       500

>>NP_963842 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase-like p  (532 aa)
 initn: 639 init1: 267 opt: 532  Z-score: 635.7  bits: 127.3 E(85289): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 756; 28.8% identity (59.6% similar) in 532 aa overlap (10-532:48-532)

                                    10        20        30         
pF1KA1                      MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWR-SP
                                     :.... . .. : : :   ::: ::   .:
NP_963 EEEAPPEAAAVPPALLTSPQQTEAAAERILLRGIFEIGRDSCDVVLSE-RAL-RWRPIQP
        20        30        40        50        60          70     

       40         50        60         70        80         90     
pF1KA1 GPGAGAPGADA-CSVPVSEIIAVEET-DVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVH-CVKRARRH
          ::    :  :.    :.: ...  .:. :.. : : :.     ..:.  :.:. ...
NP_963 ERPAGDSKYDLLCK---EEFIELKDIFSVKLKRRCSVKQQRSGTLLGITLFICLKK-EQN
          80           90       100       110       120        130 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KA1 RWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVA
       . : . . .    :. : .:.. ....:  . .::: : ...:: . : .. ..: .:: 
NP_963 KLKNSTLDLINLSEDHCDIWFRQFKKILAGFPNRPKSLKILLNPQSHKKEATQVYYEKVE
             140       150       160       170       180       190 

         160       170       180       190       200       210     
pF1KA1 PLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSA
       ::. ::.: ::. . :. ..:   : : ... .::.:::::::  ::: :.:. :.:..:
NP_963 PLLKLAGIKTDVTIMEYEGHALSLLKECELQGFDGVVCVGGDGSASEVAHALLLRAQKNA
             200       210       220       230       240       250 

         220         230       240       250       260       270   
pF1KA1 GVDQNHPRAVLVP--SSLRIGIIPAGSTDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSS
       :.. ..   .:.:  ..: .:.::::::. . .:  :.  . :..:::..:    .:: .
NP_963 GMETDR---ILTPVRAQLPLGLIPAGSTNVLAHSLHGVPHVITATLHIIMGHVQLVDVCT
                260       270       280       290       300        

           280       290       300        310       320       330  
pF1KA1 VHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLGLA-RYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFL
           . :::.. : . .:: :  .  .:: ::..   : ::. .:.. . .  .  .:::
NP_963 FSTAGKLLRFGFSAM-FGFGGRTLALAEKYRWMSPNQRRDFAVVKALAKLKAEDCEISFL
      310       320        330       340       350       360       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KA1 PAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAIN
       : . .                        .. :..   :   ..  ..::.. :.:: ..
NP_963 PFNSS------------------------DDVQERRAQGSPKSDCNDQWQMIQGQFLNVS
       370                               380       390       400   

            400       410       420       430       440       450  
pF1KA1 ATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEV
          . : :  .::::.: ..:..::  ::. :. :: .:.. : :... ..::.: :::.
NP_963 IMAIPCLCSVAPRGLAPNTRLNNGSMALIIARNTSRPEFIKHLKRYASVKNQFNFPFVET
           410       420       430       440       450       460   

            460       470       480       490       500        510 
pF1KA1 YRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLH-SPAI
       : :.. .   ..     .  .:  .       ..  .:        :: ::.... .  .
NP_963 YTVEEVKVHPRNNTGGYNPEEEEDE-------TASENCF------PWNVDGDLMEVASEV
           470       480              490             500       510

             520       530        
pF1KA1 EVRVHCQLVRLFARGIEEN-PKPDSHS
       ..:.: .:. :.. ..::  ::     
NP_963 HIRLHPRLISLYGGSMEEMIPK     
              520       530       

>>NP_001025482 (OMIM: 608380,608381) ceramide kinase-lik  (558 aa)
 initn: 664 init1: 234 opt: 401  Z-score: 478.2  bits: 98.3 E(85289): 6.7e-20
Smith-Waterman score: 694; 27.4% identity (56.8% similar) in 558 aa overlap (10-532:48-558)

                                    10        20        30         
pF1KA1                      MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWR-SP
                                     :.... . .. : : :   ::: ::   .:
NP_001 EEEAPPEAAAVPPALLTSPQQTEAAAERILLRGIFEIGRDSCDVVLSE-RAL-RWRPIQP
        20        30        40        50        60          70     

       40         50        60         70        80         90     
pF1KA1 GPGAGAPGADA-CSVPVSEIIAVEET-DVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVH-CVKRARRH
          ::    :  :.    :.: ...  .:. :.. : : :.     ..:.  :.:. ...
NP_001 ERPAGDSKYDLLCK---EEFIELKDIFSVKLKRRCSVKQQRSGTLLGITLFICLKK-EQN
          80           90       100       110       120        130 

         100       110       120       130       140       150     
pF1KA1 RWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVA
       . : . . .    :. : .:.. ....:  . .::: : ...:: . : .. ..: .:: 
NP_001 KLKNSTLDLINLSEDHCDIWFRQFKKILAGFPNRPKSLKILLNPQSHKKEATQVYYEKVE
             140       150       160       170       180       190 

         160       170       180       190                         
pF1KA1 PLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDG-------------------------
       ::. ::.: ::. . :. ..:   : : ... .::                         
NP_001 PLLKLAGIKTDVTIMEYEGHALSLLKECELQGFDGGHRKPLFAIHWSVQRLFTGMQTLEP
             200       210       220       230       240       250 

               200       210       220         230       240       
pF1KA1 -IVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVP--SSLRIGIIPAGSTDCVCYS
        .:::::::  ::: :.:. :.:..::.. ..   .:.:  ..: .:.::::::. . .:
NP_001 SVVCVGGDGSASEVAHALLLRAQKNAGMETDR---ILTPVRAQLPLGLIPAGSTNVLAHS
             260       270       280          290       300        

       250       260       270       280       290       300       
pF1KA1 TVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLG
         :.  . :..:::..:    .:: .    . :::.. : . .:: :  .  .:: ::..
NP_001 LHGVPHVITATLHIIMGHVQLVDVCTFSTAGKLLRFGFSAM-FGFGGRTLALAEKYRWMS
      310       320       330       340        350       360       

        310       320       330       340       350       360      
pF1KA1 LA-RYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQK
          : ::. .:.. . .  .  .:::: . .                        .. :.
NP_001 PNQRRDFAVVKALAKLKAEDCEISFLPFNSS------------------------DDVQE
       370       380       390                               400   

        370       380       390       400       410       420      
pF1KA1 KALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKC
       .   :   ..  ..::.. :.:: ..   . : :  .::::.: ..:..::  ::. :. 
NP_001 RRAQGSPKSDCNDQWQMIQGQFLNVSIMAIPCLCSVAPRGLAPNTRLNNGSMALIIARNT
           410       420       430       440       450       460   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KA1 SRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSS
       :: .:.. : :... ..::.: :::.: :.. .   ..     .  .:  .       ..
NP_001 SRPEFIKHLKRYASVKNQFNFPFVETYTVEEVKVHPRNNTGGYNPEEEEDE-------TA
           470       480       490       500       510             

        490       500        510       520       530        
pF1KA1 HPSCCCTVSNSSWNCDGEVLH-SPAIEVRVHCQLVRLFARGIEEN-PKPDSHS
         .:        :: ::.... .  ...:.: .:. :.. ..::  ::     
NP_001 SENCF------PWNVDGDLMEVASEVHIRLHPRLISLYGGSMEEMIPK     
        520             530       540       550             

>>NP_001191087 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 isofo  (595 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 413.1  bits: 86.3 E(85289): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:88-329)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
NP_001 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
        60        70        80        90          100          110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
NP_001 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
             120       130       140       150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
NP_001 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
             180       190       200               210             

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
NP_001 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
     220       230       240       250       260       270         

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
NP_001 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
     280       290       300       310       320       330         

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
NP_001 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
     340       350       360       370       380       390         

>>XP_006723355 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine kin  (618 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 412.9  bits: 86.3 E(85289): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:111-352)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
XP_006 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
               90       100       110       120             130    

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
XP_006 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
          140       150       160       170       180       190    

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
XP_006 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
          200       210       220               230           240  

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
XP_006 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
            250       260       270       280       290       300  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
XP_006 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
            310       320       330       340       350       360  

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
XP_006 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
            370       380       390       400       410       420  

>>XP_011525436 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine kin  (618 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 412.9  bits: 86.3 E(85289): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:111-352)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
XP_011 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
               90       100       110       120             130    

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
XP_011 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
          140       150       160       170       180       190    

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
XP_011 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
          200       210       220               230           240  

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
XP_011 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
            250       260       270       280       290       300  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
XP_011 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
            310       320       330       340       350       360  

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
XP_011 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
            370       380       390       400       410       420  

>>NP_001191089 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 isofo  (618 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 412.9  bits: 86.3 E(85289): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:111-352)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
NP_001 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
               90       100       110       120             130    

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
NP_001 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
          140       150       160       170       180       190    

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
NP_001 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
          200       210       220               230           240  

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
NP_001 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
            250       260       270       280       290       300  

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
NP_001 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
            310       320       330       340       350       360  

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
NP_001 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
            370       380       390       400       410       420  

>>XP_011525435 (OMIM: 607092) PREDICTED: sphingosine kin  (654 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 412.5  bits: 86.3 E(85289): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:147-388)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
XP_011 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
        120       130       140       150             160       170

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
XP_011 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
              180       190       200       210       220       230

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
XP_011 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
              240       250       260               270            

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
XP_011 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
      280       290       300       310       320       330        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
XP_011 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
      340       350       360       370       380       390        

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
XP_011 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
      400       410       420       430       440       450        

>>NP_001191088 (OMIM: 607092) sphingosine kinase 2 isofo  (654 aa)
 initn: 344 init1: 241 opt: 347  Z-score: 412.5  bits: 86.3 E(85289): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:147-388)

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
                                     ::. .::  : .   :    :  : :    
NP_001 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
        120       130       140       150             160       170

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
       :.   :  :: .::...:::::.: . .  . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
NP_001 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
              180       190       200       210       220       230

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
         ......:::: :.:::.. :::.::. :         .  .:: .:    .::.: ::
NP_001 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
              240       250       260               270            

                       250       260       270       280       290 
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
        . .  ..         .: .   . .: .  : .  .:. ::   :    .:   ...:
NP_001 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
      280       290       300       310       320       330        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
       : .:.  .::. : :: ::. .. .  . . : :.: .:.:::    .::          
NP_001 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
      340       350       360       370       380       390        

             360       370       380       390       400       410 
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
                                                                   
NP_001 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
      400       410       420       430       440       450        




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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