seq1 = pF1KA1401.tfa, 2412 bp seq2 = pF1KA1401/gi568815581r_2224199.tfa (gi568815581r:2224199_2436427), 212229 bp >pF1KA1401 2412 >gi568815581r:2224199_2436427 (Chr17) (complement) 1-97 (100001-100097) 100% -> 98-201 (100288-100391) 100% -> 202-421 (100698-100917) 100% -> 422-556 (101034-101168) 100% -> 557-981 (101532-101956) 100% -> 982-1141 (102712-102871) 100% -> 1142-1305 (103304-103467) 100% -> 1306-1496 (104069-104259) 100% -> 1497-1659 (105319-105481) 100% -> 1660-1770 (105803-105913) 100% -> 1771-1903 (106953-107085) 100% -> 1904-2020 (111008-111124) 100% -> 2021-2161 (111599-111739) 100% -> 2162-2236 (111850-111924) 97% -> 2237-2412 (112054-112229) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCGGCCCACCGCCCCGGCCCGCTCAAGCAGCAGAATAAAGCTCATAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCGGCCCACCGCCCCGGCCCGCTCAAGCAGCAGAATAAAGCTCATAA 50 . : . : . : . : . : 51 AGGCGGACGGCATCGGGGTCGGGGATCTGCACAGCGGGACGGCAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 100051 AGGCGGACGGCATCGGGGTCGGGGATCTGCACAGCGGGACGGCAAGGGTA 100 . : . : . : . : . : 98 GCCGTCTGGCACTGAAAACCCTAAGCAAGAAGGTGAGAAAAGAA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 ...CAGGCCGTCTGGCACTGAAAACCCTAAGCAAGAAGGTGAGAAAAGAA 150 . : . : . : . : . : 142 CTCAGCAGAGTCGACCAGAGGCATCGCGCCAGCCAGCTCCGAAAGCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100332 CTCAGCAGAGTCGACCAGAGGCATCGCGCCAGCCAGCTCCGAAAGCAGAA 200 . : . : . : . : . : 192 GAAGGAGGCG GTTCTGGCAGAGAAGAGACAGCTGGGTGGCA ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 100382 GAAGGAGGCGGTG...CAGGTTCTGGCAGAGAAGAGACAGCTGGGTGGCA 250 . : . : . : . : . : 233 AGGATGGCCCTCCTCATCAGGTACTGGTGGTGCCCCTGCACAGCAGAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100729 AGGATGGCCCTCCTCATCAGGTACTGGTGGTGCCCCTGCACAGCAGAATT 300 . : . : . : . : . : 283 TCCCTGCCAGAGGCCATGCAGCTGCTTCAAGATAGGGACACTGGAACAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100779 TCCCTGCCAGAGGCCATGCAGCTGCTTCAAGATAGGGACACTGGAACAGT 350 . : . : . : . : . : 333 ACACTTGAATGAATTGGGAAACACCCAGAACTTTATGCTGCTGTGCCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100829 ACACTTGAATGAATTGGGAAACACCCAGAACTTTATGCTGCTGTGCCCCC 400 . : . : . : . : . : 383 GCTTGAAACATCGGTGGTTTTTCACCTCAGCAAGGCCAG GG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 100879 GCTTGAAACATCGGTGGTTTTTCACCTCAGCAAGGCCAGGTT...CAGGG 450 . : . : . : . : . : 424 GATCTGCACGTTGTGTTAGACATGGCTAAAGTAGCTGATACCATCCTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101036 GATCTGCACGTTGTGTTAGACATGGCTAAAGTAGCTGATACCATCCTGTT 500 . : . : . : . : . : 474 CCTCCTTGATCCACTAGAAGGCTGGGACAGCACCGGTGATTACTGTCTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101086 CCTCCTTGATCCACTAGAAGGCTGGGACAGCACCGGTGATTACTGTCTTT 550 . : . : . : . : . : 524 CCTGCCTCTTTGCTCAGGGCCTTCCGACCTATA CACTAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 101136 CCTGCCTCTTTGCTCAGGGCCTTCCGACCTATAGTA...CAGCACTAGCT 600 . : . : . : . : . : 565 GTCCAGGGGATTTCTGGCCTCCCACTGAAGAAACAAATAGATACCAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101540 GTCCAGGGGATTTCTGGCCTCCCACTGAAGAAACAAATAGATACCAGGAA 650 . : . : . : . : . : 615 GAAGCTAAGTAAAGCAGTGGAGAAGCGCTTTCCGCATGACAAACTCCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101590 GAAGCTAAGTAAAGCAGTGGAGAAGCGCTTTCCGCATGACAAACTCCTCT 700 . : . : . : . : . : 665 TGTTAGACACTCAACAGGAGGCAGGGATGCTGCTTAGGCAGTTGGCTAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101640 TGTTAGACACTCAACAGGAGGCAGGGATGCTGCTTAGGCAGTTGGCTAAC 750 . : . : . : . : . : 715 CAGAAGCAACAGCATCTTGCTTTTCGAGATCGGCGGGCCTACCTATTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101690 CAGAAGCAACAGCATCTTGCTTTTCGAGATCGGCGGGCCTACCTATTTGC 800 . : . : . : . : . : 765 CCATGCTGTTGATTTTGTTCCTAGTGAAGAGAATAACTTGGTGGGCACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101740 CCATGCTGTTGATTTTGTTCCTAGTGAAGAGAATAACTTGGTGGGCACCT 850 . : . : . : . : . : 815 TGAAAATTTCAGGCTATGTTCGAGGGCAGACTCTGAATGTCAATAGGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101790 TGAAAATTTCAGGCTATGTTCGAGGGCAGACTCTGAATGTCAATAGGTTG 900 . : . : . : . : . : 865 CTGCATATCGTTGGATATGGTGATTTCCAGATGAAACAGATAGATGCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101840 CTGCATATCGTTGGATATGGTGATTTCCAGATGAAACAGATAGATGCCCC 950 . : . : . : . : . : 915 CGGAGACCCTTTCCCTTTAAATCCTAGAGGAATTAAACCCCAAAAGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101890 CGGAGACCCTTTCCCTTTAAATCCTAGAGGAATTAAACCCCAAAAGGACC 1000 . : . : . : . : . : 965 CAGACATGGCAATGGAG ATTTGTGCTACGGATGCTGTAGAT |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 101940 CAGACATGGCAATGGAGGTA...CAGATTTGTGCTACGGATGCTGTAGAT 1050 . : . : . : . : . : 1006 GATATGGAAGAAGGTCTTAAAGTCCTAATGAAGGCAGACCCTGGTAGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102736 GATATGGAAGAAGGTCTTAAAGTCCTAATGAAGGCAGACCCTGGTAGACA 1100 . : . : . : . : . : 1056 GGAATCCTTGCAAGCAGAGGTTATCCCAGATCCAATGGAGGGAGAGCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102786 GGAATCCTTGCAAGCAGAGGTTATCCCAGATCCAATGGAGGGAGAGCAAA 1150 . : . : . : . : . : 1106 CCTGGCCCACTGAGGAGGAGCTGAGCGAGGCAAAGG ATTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 102836 CCTGGCCCACTGAGGAGGAGCTGAGCGAGGCAAAGGGTC...CAGATTTC 1200 . : . : . : . : . : 1147 TTGAAGGAAAGTTCTAAGGTGGTAAAGAAGGTCCCCAAAGGAACATCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103309 TTGAAGGAAAGTTCTAAGGTGGTAAAGAAGGTCCCCAAAGGAACATCCAG 1250 . : . : . : . : . : 1197 TTACCAAGCTGAATGGATTTTGGATGGTGGCAGCCAAAGTGGTGGGGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103359 TTACCAAGCTGAATGGATTTTGGATGGTGGCAGCCAAAGTGGTGGGGAAG 1300 . : . : . : . : . : 1247 GAGATGAATATGAATATGATGATATGGAACATGAGGATTTTATGGAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103409 GAGATGAATATGAATATGATGATATGGAACATGAGGATTTTATGGAGGAG 1350 . : . : . : . : . : 1297 GAATCTCAG GATGAGAGTAGTGAAGAAGAGGAAGAATATGA |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 103459 GAATCTCAGGTA...CAGGATGAGAGTAGTGAAGAAGAGGAAGAATATGA 1400 . : . : . : . : . : 1338 AACTATGACTATTGGGGAGTCTGTGCATGATGATCTGTATGATAAGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104101 AACTATGACTATTGGGGAGTCTGTGCATGATGATCTGTATGATAAGAAAG 1450 . : . : . : . : . : 1388 TAGATGAAGAAGCTGAGGCAAAAATGTTGGAGAAATATAAACAAGAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104151 TAGATGAAGAAGCTGAGGCAAAAATGTTGGAGAAATATAAACAAGAAAGA 1500 . : . : . : . : . : 1438 CTGGAAGAGATGTTTCCAGATGAAGTGGACACGCCCCGTGATGTGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104201 CTGGAAGAGATGTTTCCAGATGAAGTGGACACGCCCCGTGATGTGGCTGC 1550 . : . : . : . : . : 1488 TCGAATTCG ATTTCAGAAATACAGAGGCCTTAAGAGCTTCC |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 104251 TCGAATTCGGTT...TAGATTTCAGAAATACAGAGGCCTTAAGAGCTTCC 1600 . : . : . : . : . : 1529 GGACATCTCCATGGGATCCTAAGGAAAACCTTCCTCAAGATTATGCTCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105351 GGACATCTCCATGGGATCCTAAGGAAAACCTTCCTCAAGATTATGCTCGA 1650 . : . : . : . : . : 1579 ATATTTCAGTTTCAGAACTTTACTAACACTAGGAAAAGCATCTTTAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105401 ATATTTCAGTTTCAGAACTTTACTAACACTAGGAAAAGCATCTTTAAAGA 1700 . : . : . : . : . : 1629 GGTTGAAGAAAAAGAGGTTGAAGGAGCTGAG GTTGGCTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 105451 GGTTGAAGAAAAAGAGGTTGAAGGAGCTGAGGTA...CAGGTTGGCTGGT 1750 . : . : . : . : . : 1670 ATGTCACACTTCATGTCTCTGAAGTCCCCGTCTCAGTGGTCGAGTGCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105813 ATGTCACACTTCATGTCTCTGAAGTCCCCGTCTCAGTGGTCGAGTGCTTC 1800 . : . : . : . : . : 1720 AGGCAAGGAACACCCTTGATTGCATTTTCTTTACTACCTCATGAACAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105863 AGGCAAGGAACACCCTTGATTGCATTTTCTTTACTACCTCATGAACAGAA 1850 . : . : . : . : . : 1770 G ATGTCAGTATTGAATATGGTGGTGAGGCGTGACCCTGGCA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105913 GGTA...CAGATGTCAGTATTGAATATGGTGGTGAGGCGTGACCCTGGCA 1900 . : . : . : . : . : 1811 ACACTGAACCTGTGAAAGCCAAGGAAGAGCTCATATTTCACTGTGGATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106993 ACACTGAACCTGTGAAAGCCAAGGAAGAGCTCATATTTCACTGTGGATTC 1950 . : . : . : . : . : 1861 AGGCGCTTCCGAGCCTCACCTTTATTCTCTCAGCACACTGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 107043 AGGCGCTTCCGAGCCTCACCTTTATTCTCTCAGCACACTGCAGGTT...C 2000 . : . : . : . : . : 1904 CGGACAAACATAAATTGCAGAGATTCCTGACTGCTGACATGGCCCTGG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111006 AGCGGACAAACATAAATTGCAGAGATTCCTGACTGCTGACATGGCCCTGG 2050 . : . : . : . : . : 1952 TGGCGACAGTCTATGCGCCAATCACTTTTCCTCCTGCATCTGTGCTGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111056 TGGCGACAGTCTATGCGCCAATCACTTTTCCTCCTGCATCTGTGCTGCTT 2100 . : . : . : . : . : 2002 TTCAAGCAAAAAAGCAATG GAATGCACAGCCTCATTGCTAC |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 111106 TTCAAGCAAAAAAGCAATGGTA...TAGGAATGCACAGCCTCATTGCTAC 2150 . : . : . : . : . : 2043 AGGCCATCTTATGTCAGTAGATCCAGACAGAATGGTCATCAAGAGAGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111621 AGGCCATCTTATGTCAGTAGATCCAGACAGAATGGTCATCAAGAGAGTTG 2200 . : . : . : . : . : 2093 TTCTGAGTGGTCATCCTTTCAAAATTTTTACTAAGATGGCAGTAGTACGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111671 TTCTGAGTGGTCATCCTTTCAAAATTTTTACTAAGATGGCAGTAGTACGT 2250 . : . : . : . : . : 2143 TACATGTTCTTCAACAGAG AGGATGTGCTGTGGTTCAAACC |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| ||||| 111721 TACATGTTCTTCAACAGAGGTG...AAGAGGATGTGCTGTGGTTTAAACC 2300 . : . : . : . : . : 2184 AGTGGAACTGAGAACGAAGTGGGGCTGGAGAGGACATATCAAGGAACCTT ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 111872 AGTGGAACTGAGAACGAAGTGGGGCCGGAGAGGACATATCAAGGAACCTT 2350 . : . : . : . : . : 2234 TAG GTACCCATGGCCACATGAAATGCAGCTTTGATGGGAAG |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111922 TAGGTA...TAGGTACCCATGGCCACATGAAATGCAGCTTTGATGGGAAG 2400 . : . : . : . : . : 2275 CTAAAATCTCAAGACACAGTACTGATGAACCTGTATAAACGAGTCTTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112092 CTAAAATCTCAAGACACAGTACTGATGAACCTGTATAAACGAGTCTTCCC 2450 . : . : . : . : . : 2325 CAAATGGACTTATGATCCATATGTACCAGAACCAGTACCCTGGCTGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112142 CAAATGGACTTATGATCCATATGTACCAGAACCAGTACCCTGGCTGAAAA 2500 . : . : . : . 2375 GTGAGATTTCTTCAACAGTGCCTCAAGGGGGCATGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112192 GTGAGATTTCTTCAACAGTGCCTCAAGGGGGCATGGAG