seq1 = pF1KA1181.tfa, 870 bp seq2 = pF1KA1181/gi568815593f_172788697.tfa (gi568815593f:172788697_173050813), 262117 bp >pF1KA1181 870 >gi568815593f:172788697_173050813 (Chr5) 1-20 (45718-45737) 100% -> 21-82 (100003-100064) 100% -> 83-155 (108306-108378) 100% -> 156-250 (120971-121065) 100% -> 251-375 (126018-126142) 100% -> 376-480 (135309-135413) 100% -> 481-541 (137813-137873) 100% -> 542-642 (143740-143840) 100% -> 643-765 (146492-146614) 100% -> 766-870 (162013-162117) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCCCTTTGACTTCAGGAG GTTTGACATCTACAGGAAGGT ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 45718 ATGCCCTTTGACTTCAGGAGGTG...CAGGTTTGACATCTACAGGAAGGT 50 . : . : . : . : . : 42 GCCCAAGGACCTTACGCAGCCAACGTACACCGGGGCCATTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 100024 GCCCAAGGACCTTACGCAGCCAACGTACACCGGGGCCATTAGTG...CAG 100 . : . : . : . : . : 83 TCTCCATCTGCTGCTGCCTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCGGAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108306 TCTCCATCTGCTGCTGCCTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCGGAGCTC 150 . : . : . : . : . : 133 ACCGGATTTATAACGACAGAAGT TGTGAACGAGCTCTATGT |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 108356 ACCGGATTTATAACGACAGAAGTGTA...TAGTGTGAACGAGCTCTATGT 200 . : . : . : . : . : 174 CGATGACCCAGACAAGGACAGCGGTGGCAAGATCGACGTCAGTCTGAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120989 CGATGACCCAGACAAGGACAGCGGTGGCAAGATCGACGTCAGTCTGAACA 250 . : . : . : . : . : 224 TCAGTTTACCCAATCTGCACTGCGAGT TGGTTGGGCTTGAC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 121039 TCAGTTTACCCAATCTGCACTGCGAGTGTG...CAGTGGTTGGGCTTGAC 300 . : . : . : . : . : 265 ATTCAGGATGAGATGGGCAGGCACGAAGTGGGCCACATCGACAACTCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126032 ATTCAGGATGAGATGGGCAGGCACGAAGTGGGCCACATCGACAACTCCAT 350 . : . : . : . : . : 315 GAAGATCCCGCTGAACAATGGGGCAGGCTGCCGCTTCGAGGGGCAGTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126082 GAAGATCCCGCTGAACAATGGGGCAGGCTGCCGCTTCGAGGGGCAGTTCA 400 . : . : . : . : . : 365 GCATCAACAAG GTCCCCGGCAACTTCCACGTGTCCACACAC |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 126132 GCATCAACAAGGTA...CAGGTCCCCGGCAACTTCCACGTGTCCACACAC 450 . : . : . : . : . : 406 AGTGCCACAGCCCAGCCACAGAACCCAGACATGACGCATGTCATCCACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135339 AGTGCCACAGCCCAGCCACAGAACCCAGACATGACGCATGTCATCCACAA 500 . : . : . : . : . : 456 GCTCTCCTTTGGGGACACGCTACAG GTCCAGAACATCCACG |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 135389 GCTCTCCTTTGGGGACACGCTACAGGTG...CAGGTCCAGAACATCCACG 550 . : . : . : . : . : 497 GAGCTTTCAATGCTCTCGGGGGAGCAGACAGACTCACCTCCAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 137829 GAGCTTTCAATGCTCTCGGGGGAGCAGACAGACTCACCTCCAACCGTA.. 600 . : . : . : . : . : 542 CCCTGGCCTCCCACGACTACATCCTGAAGATTGTGCCCACGGTTTA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 137879 .CAGCCCTGGCCTCCCACGACTACATCCTGAAGATTGTGCCCACGGTTTA 650 . : . : . : . : . : 588 TGAGGACAAGAGTGGCAAGCAGCGGTACTCCTACCAGTACACGGTGGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143786 TGAGGACAAGAGTGGCAAGCAGCGGTACTCCTACCAGTACACGGTGGCCA 700 . : . : . : . : . : 638 ACAAG GAATACGTCGCCTACAGCCACACGGGCCGCATCATC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 143836 ACAAGGTG...CAGGAATACGTCGCCTACAGCCACACGGGCCGCATCATC 750 . : . : . : . : . : 679 CCTGCAATCTGGTTCCGCTACGACCTCAGCCCCATCACGGTCAAGTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146528 CCTGCAATCTGGTTCCGCTACGACCTCAGCCCCATCACGGTCAAGTACAC 800 . : . : . : . : . : 729 AGAGAGACGGCAGCCGCTGTACAGATTCATCACCACG ATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 146578 AGAGAGACGGCAGCCGCTGTACAGATTCATCACCACGGTG...CAGATCT 850 . : . : . : . : . : 770 GTGCCATCATTGGCGGGACCTTCACCGTCGCCGGCATCCTGGACTCATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 162017 GTGCCATCATTGGCGGGACCTTCACCGTCGCCGGCATCCTGGACTCATGC 900 . : . : . : . : . : 820 ATCTTCACAGCCTCTGAGGCCTGGAAGAAGATCCAGCTGGGCAAGATGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 162067 ATCTTCACAGCCTCTGAGGCCTGGAAGAAGATCCAGCTGGGCAAGATGCA 950 870 T | 162117 T