seq1 = pF1KA1041.tfa, 1866 bp seq2 = pF1KA1041/gi568815597r_42079713.tfa (gi568815597r:42079713_42411093), 331381 bp >pF1KA1041 1866 >gi568815597r:42079713_42411093 (Chr1) (complement) 1-44 (100001-100044) 100% -> 45-369 (132422-132746) 100% -> 370-444 (145905-145979) 100% -> 445-528 (183128-183211) 98% -> 529-630 (205231-205332) 100% -> 631-759 (211864-211992) 100% -> 760-934 (216030-216204) 100% -> 935-1351 (219375-219791) 99% -> 1352-1453 (221690-221791) 100% -> 1454-1645 (222166-222357) 100% -> 1646-1753 (229070-229177) 100% -> 1754-1866 (231269-231381) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGTTTGTATGGACAGGCTTGTCCATCTGTAACTTCATTAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 100001 ATGGGTTTGTATGGACAGGCTTGTCCATCTGTAACTTCATTAAGGTG... 50 . : . : . : . : . : 45 GATGACATCTGAACTGGAGAGCAGCCTAACGTCTATGGACTGGTTAC >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132419 CAGGATGACATCTGAACTGGAGAGCAGCCTAACGTCTATGGACTGGTTAC 100 . : . : . : . : . : 92 CACAGCTCACCATGAGAGCAGCCATCCAAAAATCTGATGCTACACAAAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132469 CACAGCTCACCATGAGAGCAGCCATCCAAAAATCTGATGCTACACAAAAT 150 . : . : . : . : . : 142 GCACATGGAACAGGAATTTCTAAGAAGAATGCACTCCTTGACCCAAATAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132519 GCACATGGAACAGGAATTTCTAAGAAGAATGCACTCCTTGACCCAAATAC 200 . : . : . : . : . : 192 AACTCTGGACCAGGAAGAAGTCCAACAGCACAAAGATGGGAAACCTCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132569 AACTCTGGACCAGGAAGAAGTCCAACAGCACAAAGATGGGAAACCTCCAT 250 . : . : . : . : . : 242 ACAGTTATGCCAGCCTCATTACATTTGCAATTAATAGCTCACCCAAAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132619 ACAGTTATGCCAGCCTCATTACATTTGCAATTAATAGCTCACCCAAAAAG 300 . : . : . : . : . : 292 AAAATGACTTTAAGTGAAATTTATCAGTGGATTTGTGATAACTTCCCATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 132669 AAAATGACTTTAAGTGAAATTTATCAGTGGATTTGTGATAACTTCCCATA 350 . : . : . : . : . : 342 TTATAGAGAGGCTGGCAGTGGTTGGAAG AATTCCATACGAC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 132719 TTATAGAGAGGCTGGCAGTGGTTGGAAGGTA...CAGAATTCCATACGAC 400 . : . : . : . : . : 383 ATAATCTGTCATTGAACAAATGTTTCCTTAAAGTGCCTCGATCTAAGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 145918 ATAATCTGTCATTGAACAAATGTTTCCTTAAAGTGCCTCGATCTAAGGAT 450 . : . : . : . : . : 433 GACCCTGGAAAG GGGTCCTACTGGGCAATAGACACCAATCC ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 145968 GACCCTGGAAAGGTA...TAGGGGTCCTACTGGGCAATAGACACCAATCC 500 . : . : . : . : . : 474 GAAGGAAGATGCGCTGCCTACTCGGCCAAAGAAGAGGGCACGATCTGTAG ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183157 GAAGGAAGATGTGCTGCCTACTCGGCCAAAGAAGAGGGCACGATCTGTAG 550 . : . : . : . : . : 524 AACGG GCCTCAACTCCATATAGCATAGATTCAGATTCTTTG |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183207 AACGGGTA...TAGGCCTCAACTCCATATAGCATAGATTCAGATTCTTTG 600 . : . : . : . : . : 565 GGAATGGAGTGTATTATTTCGGGAAGTGCCTCTCCAACTCTGGCAATCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205267 GGAATGGAGTGTATTATTTCGGGAAGTGCCTCTCCAACTCTGGCAATCAA 650 . : . : . : . : . : 615 CACTGTGACTAACAAA GTAACATTGTATAACACTGATCAGG ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 205317 CACTGTGACTAACAAAGTA...TAGGTAACATTGTATAACACTGATCAGG 700 . : . : . : . : . : 656 ATGGTAGTGATAGCCCACGCAGTAGCCTTAACAACAGTCTCTCAGACCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211889 ATGGTAGTGATAGCCCACGCAGTAGCCTTAACAACAGTCTCTCAGACCAG 750 . : . : . : . : . : 706 AGTTTGGCATCTGTTAATTTGAACAGTGTTGGAAGTGTGCATAGTTATAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211939 AGTTTGGCATCTGTTAATTTGAACAGTGTTGGAAGTGTGCATAGTTATAC 800 . : . : . : . : . : 756 ACCG GTGACAAGCCATCCAGAATCAGTCTCTCAATCATTAA ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211989 ACCGGTA...TAGGTGACAAGCCATCCAGAATCAGTCTCTCAATCATTAA 850 . : . : . : . : . : 797 CTCCTCAGCAGCAACCACAGTACAACCTTCCAGAAAGAGACAAGCAACTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216067 CTCCTCAGCAGCAACCACAGTACAACCTTCCAGAAAGAGACAAGCAACTA 900 . : . : . : . : . : 847 CTTTTCTCAGAATATAATTTTGAAGATCTTAGTGCCTCATTTCGGAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216117 CTTTTCTCAGAATATAATTTTGAAGATCTTAGTGCCTCATTTCGGAGCCT 950 . : . : . : . : . : 897 TTATAAGTCAGTTTTTGAGCAGTCACTTAGTCAACAAG GTT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 216167 TTATAAGTCAGTTTTTGAGCAGTCACTTAGTCAACAAGGTG...TAGGTT 1000 . : . : . : . : . : 938 TGATGAACATCCCTTCTGAATCTTCCCAGCAGTCCCACACTTCATGTACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219378 TGATGAACATCCCTTCTGAATCTTCCCAGCAGTCCCACACTTCATGTACC 1050 . : . : . : . : . : 988 TATCAGCACTCTCCCAGCAGTACAGTGAGCACTCACCCACACAGCAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219428 TATCAGCACTCTCCCAGCAGTACAGTGAGCACTCACCCACACAGCAACCA 1100 . : . : . : . : . : 1038 AAGCAGCCTGTCCAACAGTCATGGCAGTGGCCTCAACACCACAGGCAGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219478 AAGCAGCCTGTCCAACAGTCATGGCAGTGGCCTCAACACCACAGGCAGTA 1150 . : . : . : . : . : 1088 ATTCGGTTGCACAGGTCTCACTGTCTCACCCCCAGATGCACCCACAGCCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 219528 ATTCGGTTGCACAGGTCTCACTGTCTCACCCCCAGATGCACACACAGCCA 1200 . : . : . : . : . : 1138 TCTCCACATCCTCCCCATCGACCGCATGGTTTACCGCAGCATCCGCAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219578 TCTCCACATCCTCCCCATCGACCGCATGGTTTACCGCAGCATCCGCAGCG 1250 . : . : . : . : . : 1188 TTCCCCACACCCAGCACCACACCCACAGCAACACAGCCAGCTCCAGTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219628 TTCCCCACACCCAGCACCACACCCACAGCAACACAGCCAGCTCCAGTCCC 1300 . : . : . : . : . : 1238 CTCACCCCCAGCATCCCTCTCCACATCAACACATACAGCACCATCCGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219678 CTCACCCCCAGCATCCCTCTCCACATCAACACATACAGCACCATCCGAAC 1350 . : . : . : . : . : 1288 CATCAGCATCAGACGTTAACACATCAGGCACCCCCACCCCCACAACAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219728 CATCAGCATCAGACGTTAACACATCAGGCACCCCCACCCCCACAACAGGT 1400 . : . : . : . : . : 1338 ATCCTGTAATTCTG GTGTTTCAAATGATTGGTATGCGACAC ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 219778 ATCCTGTAATTCTGGTA...TAGGTGTTTCAAATGATTGGTATGCGACAC 1450 . : . : . : . : . : 1379 TTGATATGCTAAAAGAAAGCTGTCGAATTGCCAGCAGTGTTAATTGGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221717 TTGATATGCTAAAAGAAAGCTGTCGAATTGCCAGCAGTGTTAATTGGTCA 1500 . : . : . : . : . : 1429 GATGTAGACCTTTCACAGTTTCAAG GTCTGATGGAGAGTAT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 221767 GATGTAGACCTTTCACAGTTTCAAGGTG...TAGGTCTGATGGAGAGTAT 1550 . : . : . : . : . : 1470 GAGACAGGCAGATCTCAAGAACTGGTCTTTAGACCAGGTTCAGTTTGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222182 GAGACAGGCAGATCTCAAGAACTGGTCTTTAGACCAGGTTCAGTTTGCCG 1600 . : . : . : . : . : 1520 ATCTTTGTTCTTCTCTTAATCAGTTCTTTACACAAACTGGCCTTATACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222232 ATCTTTGTTCTTCTCTTAATCAGTTCTTTACACAAACTGGCCTTATACAT 1650 . : . : . : . : . : 1570 TCACAGAGTAATGTTCAACAAAATGTTTGTCATGGTGCCATGCATCCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222282 TCACAGAGTAATGTTCAACAAAATGTTTGTCATGGTGCCATGCATCCAAC 1700 . : . : . : . : . : 1620 AAAACCTTCCCAACACATTGGAACAG GAAATTTGTACATAG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 222332 AAAACCTTCCCAACACATTGGAACAGGTA...TAGGAAATTTGTACATAG 1750 . : . : . : . : . : 1661 ATTCTAGGCAAAATCTCCCTCCTTCAGTGATGCCACCCCCTGGTTATCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 229085 ATTCTAGGCAAAATCTCCCTCCTTCAGTGATGCCACCCCCTGGTTATCCT 1800 . : . : . : . : . : 1711 CATATCCCACAGGCACTCAGCACTCCAGGAACAACGATGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 229135 CATATCCCACAGGCACTCAGCACTCCAGGAACAACGATGGCAGGTA...C 1850 . : . : . : . : . : 1754 GCCATCACAGAGCCATGAACCAGCAGCACATGATGCCTTCCCAAGCCT >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231267 AGGCCATCACAGAGCCATGAACCAGCAGCACATGATGCCTTCCCAAGCCT 1900 . : . : . : . : . : 1802 TCCAGATGCGGCGTTCCCTGCCTCCAGATGACATCCAGGATGACTTTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231317 TCCAGATGCGGCGTTCCCTGCCTCCAGATGACATCCAGGATGACTTTGAT 1950 . : . 1852 TGGGATTCAATTGTG ||||||||||||||| 231367 TGGGATTCAATTGTG