Result of FASTA (ccds) for pF1KA1006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1006, 1186 aa
  1>>>pF1KA1006 1186 - 1186 aa - 1186 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0493+/-0.00104; mu= 14.5480+/- 0.063
 mean_var=113.7620+/-23.192, 0's: 0 Z-trim(107.5): 26  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.120247
 statistics sampled from 9588 (9605) to 9588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.295), width:  16
 Scan time:  3.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43137.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3        (1186) 7980 1396.2       0
CCDS77799.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3        (1162) 4747 835.3       0
CCDS5211.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6        (1115) 3405 602.5 1.8e-171
CCDS47499.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6       (1151) 3399 601.5 3.8e-171


>>CCDS43137.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3             (1186 aa)
 initn: 7980 init1: 7980 opt: 7980  Z-score: 7480.9  bits: 1396.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7980; 100.0% identity (100.0% similar) in 1186 aa overlap (1-1186:1-1186)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLREEIQETLTSEYFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLREEIQETLTSEYFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 ICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQFL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 INEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 INEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 IVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLKS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 KRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREGR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVEF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 LTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFAD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 CPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDASA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 ITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 YKFSRHEITTEIVSLEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDLSAQLPSSRSLSGSTNTVASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YKFSRHEITTEIVSLEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDLSAQLPSSRSLSGSTNTVASE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 GVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVAFGNCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVAFGNCN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 GLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIADNFCMRGLSNFYPDLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIADNFCMRGLSNFYPDLTK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 RIRTSYQSLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADVSKVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIRTSYQSLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADVSKVNR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 WGPGRPPFRKAQSAACMEISLPVTTEENRENSYNRSRSSSISSIDKDSKEAITALYFMDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WGPGRPPFRKAQSAACMEISLPVTTEENRENSYNRSRSSSISSIDKDSKEAITALYFMDS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 FARKNDSTISPCLFVGTSLGMVLIISLNLPLADEQRFTEPVMVLPSGTFLSLKGAVLTFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FARKNDSTISPCLFVGTSLGMVLIISLNLPLADEQRFTEPVMVLPSGTFLSLKGAVLTFS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 CMDRMGGLMQPPYEVWRDPNNIDENEKSWRRKVVMNSSSASQEIGDHQYTIICSEKQAKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CMDRMGGLMQPPYEVWRDPNNIDENEKSWRRKVVMNSSSASQEIGDHQYTIICSEKQAKV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 FSLPSQTCLYVHNITETSFILQANVVVMCSSACLACFCANGHIMIMSLPSLRPMLDVNYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSLPSQTCLYVHNITETSFILQANVVVMCSSACLACFCANGHIMIMSLPSLRPMLDVNYL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 PLTDMRIARTFCFTNEGQALYLVSPTEIQRLTYSQEMCDNLQDMLGDLFTPIETPEAQNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLTDMRIARTFCFTNEGQALYLVSPTEIQRLTYSQEMCDNLQDMLGDLFTPIETPEAQNR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 GFLKGLFGGSGQTFDREELFGEASAGKASRSLAQHIPGPGSIEGMKGAAGGVMGELTRAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFLKGLFGGSGQTFDREELFGEASAGKASRSLAQHIPGPGSIEGMKGAAGGVMGELTRAR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      
pF1KA1 IALDERGQRLGELEEKTAGMMTSAEAFSKHAHELMLKYKDKKWYQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IALDERGQRLGELEEKTAGMMTSAEAFSKHAHELMLKYKDKKWYQF
             1150      1160      1170      1180      

>>CCDS77799.1 STXBP5L gene_id:9515|Hs108|chr3             (1162 aa)
 initn: 7792 init1: 4747 opt: 4747  Z-score: 4449.9  bits: 835.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7748; 97.9% identity (98.0% similar) in 1186 aa overlap (1-1186:1-1162)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLREEIQETLTSEYFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLREEIQETLTSEYFQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 ICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQFL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 INEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 INEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 IVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLKS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 KRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREGR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVEF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 LTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFAD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 CPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDASA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 ITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 YKFSRHEITTEIVSLEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDLSAQLPSSRSLSGSTNTVASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YKFSRHEITTEIVSLEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDLSAQLPSSRSLSGSTNTVASE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 GVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVAFGNCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVAFGNCN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 GLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIADNFCMRGLSNFYPDLTK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                 
CCDS77 GLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIA-----------------
              670       680       690       700                    

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 RIRTSYQSLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADVSKVNR
              .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 -------GLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADVSKVNR
                  710       720       730       740       750      

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 WGPGRPPFRKAQSAACMEISLPVTTEENRENSYNRSRSSSISSIDKDSKEAITALYFMDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WGPGRPPFRKAQSAACMEISLPVTTEENRENSYNRSRSSSISSIDKDSKEAITALYFMDS
        760       770       780       790       800       810      

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 FARKNDSTISPCLFVGTSLGMVLIISLNLPLADEQRFTEPVMVLPSGTFLSLKGAVLTFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FARKNDSTISPCLFVGTSLGMVLIISLNLPLADEQRFTEPVMVLPSGTFLSLKGAVLTFS
        820       830       840       850       860       870      

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 CMDRMGGLMQPPYEVWRDPNNIDENEKSWRRKVVMNSSSASQEIGDHQYTIICSEKQAKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CMDRMGGLMQPPYEVWRDPNNIDENEKSWRRKVVMNSSSASQEIGDHQYTIICSEKQAKV
        880       890       900       910       920       930      

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 FSLPSQTCLYVHNITETSFILQANVVVMCSSACLACFCANGHIMIMSLPSLRPMLDVNYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FSLPSQTCLYVHNITETSFILQANVVVMCSSACLACFCANGHIMIMSLPSLRPMLDVNYL
        940       950       960       970       980       990      

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 PLTDMRIARTFCFTNEGQALYLVSPTEIQRLTYSQEMCDNLQDMLGDLFTPIETPEAQNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PLTDMRIARTFCFTNEGQALYLVSPTEIQRLTYSQEMCDNLQDMLGDLFTPIETPEAQNR
       1000      1010      1020      1030      1040      1050      

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 GFLKGLFGGSGQTFDREELFGEASAGKASRSLAQHIPGPGSIEGMKGAAGGVMGELTRAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GFLKGLFGGSGQTFDREELFGEASAGKASRSLAQHIPGPGSIEGMKGAAGGVMGELTRAR
       1060      1070      1080      1090      1100      1110      

             1150      1160      1170      1180      
pF1KA1 IALDERGQRLGELEEKTAGMMTSAEAFSKHAHELMLKYKDKKWYQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IALDERGQRLGELEEKTAGMMTSAEAFSKHAHELMLKYKDKKWYQF
       1120      1130      1140      1150      1160  

>>CCDS5211.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6             (1115 aa)
 initn: 4885 init1: 2803 opt: 3405  Z-score: 3191.9  bits: 602.5 E(32554): 1.8e-171
Smith-Waterman score: 5199; 64.5% identity (84.1% similar) in 1194 aa overlap (1-1186:1-1115)

               10        20        30        40         50         
pF1KA1 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLRE-EIQETLTSEYF
       :.:::.:::::::::     ::::.:..     . . :: :.    :: :::::: ::.:
CCDS52 MRKFNIRKVLDGLTA-----GSSSASQQ-----QQQQHPPGN----REPEIQETLQSEHF
               10             20             30            40      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 QICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQF
       :.:::::::::.::.::::::::::::.::.:::.:..:::::.:::::.:::::.::::
CCDS52 QLCKTVRHGFPYQPSALAFDPVQKILAVGTQTGALRLFGRPGVECYCQHDSGAAVIQLQF
         50        60        70        80        90       100      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 LINEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNT
       :::::::::: .:::::::::::::::::::::: :::.:.:::::::::::::::::: 
CCDS52 LINEGALVSALADDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFCRERVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNI
        110       120       130       140       150       160      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 HIVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLK
       ::::.::: :::::::::::::::.:.:::::::.::.: ::::::::.:.::::.::::
CCDS52 HIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLK
        170       180       190       200       210       220      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 SKRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREG
       ::.:. :  :::::::. ::::::::.::::::.::.::..::..: ::  ::::. ..:
CCDS52 SKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPAKPVQTITPHGKQLKDG
        230       240       250       260       270       280      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 RKSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVE
       .: : ::::::::.:: ...:::::.::::::: . ::: ::.::::. .:::::. ::.
CCDS52 KKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVD
        290       300       310       320       330       340      

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA1 FLTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFA
       :::::::::::.:::::::::::::::...::.:...::::::::..::::::::  :::
CCDS52 FLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFA
        350       360       370       380       390       400      

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA1 DCPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDAS
       ::: ::: .:::.:...:.::::.:::::.:: :.::::.:::::::::::::.::::::
CCDS52 DCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDAS
        410       420       430       440       450       460      

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA1 AITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVI
       :::::.::::::::::::..  . . . .::.:::.:::.: ::::::..:..::::.::
CCDS52 AITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVI
        470       480       490       500       510       520      

     540       550        560       570       580          590     
pF1KA1 IYKFSRHEITTEIVS-LEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDL---SAQLPSSRSLSGSTN
       ::.::..:. ::..  ::::: :...:. ::: :  ::.:     :   :   .   ::.
CCDS52 IYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVETPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTS
        530       540       550       560       570       580      

         600       610       620       630       640       650     
pF1KA1 TVASEGVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVA
       . .:.:. .:..:::.::. :... ::::.::::::::: ::::::::::::.:.::.:.
CCDS52 SSSSDGL-RDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVV
        590        600       610       620       630       640     

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA1 FGNCNGLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIADNFCMRGLSNFY
       ::::::.:.::..::.:::..:::.:: :.: :.:.::::::..:  . ..:        
CCDS52 FGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLC--------
         650       660       670       680       690               

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA1 PDLTKRIRTSYQSLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADV
        :...              . ::   .::::::: ... . . ::             :.
CCDS52 -DISE-------------GTVVPE--DRCKSPTSAKMSRKLSLPT-------------DL
        700                      710       720                     

         780       790       800       810       820       830     
pF1KA1 SKVNRWGPGRPPFRKAQSAACMEISLPVTTEENRENSYNRSRSSSISSIDKDSKEAITAL
                .: .                  . ..::..::::::..::::.:.:::.::
CCDS52 ---------KPDL------------------DVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISAL
               730                         740       750       760 

         840       850       860       870       880       890     
pF1KA1 YFMDSFARKNDSTISPCLFVGTSLGMVLIISLNLPLADEQRFTEPVMVLPSGTFLSLKGA
       .: ..:.::.::. ::::.:::.:: ::.:.:::: . :::. .::.: ::::.: ::::
CCDS52 HFCETFTRKTDSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTILRLKGA
             770       780       790       800       810       820 

         900       910          920       930       940       950  
pF1KA1 VLTFSCMDRMGGLMQPPYEVWRD---PNNIDENEKSWRRKVVMNSSSASQEIGDHQYTII
       .: .. .:  : :. : :: ::.   :.. ::.::  .:. :  : :.::::...::..:
CCDS52 ILRMAFLDTTGCLIPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISENQYAVI
             830       840       850       860       870       880 

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KA1 CSEKQAKVFSLPSQTCLYVHNITETSFILQANVVVMCSSACLACFCANGHIMIMSLPSLR
       ::::::::.:::.:.: : .:::::::.:....:.. .: :::::::::::: .::::::
CCDS52 CSEKQAKVISLPTQNCAYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLR
             890       900       910       920       930       940 

           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KA1 PMLDVNYLPLTDMRIARTFCFTNEGQALYLVSPTEIQRLTYSQEMCDNLQDMLGDLFTPI
       :.::: :::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: :.:::.:::.::::.
CCDS52 PLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPV
             950       960       970       980       990      1000 

           1080      1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KA1 ETPEAQNRGFLKGLFGGSGQTFDREELFGEASAGKASRSLAQHIPGPGSIEGMKGAAGGV
       ::::: ::::.::::::..:..::::::::.:.:::::::::::::::.:::.::::.::
CCDS52 ETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGV
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

           1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KA1 MGELTRARIALDERGQRLGELEEKTAGMMTSAEAFSKHAHELMLKYKDKKWYQF
       .:::.:::.:::::::.::.:::.::.:..:::.:::::::.::::::::::::
CCDS52 VGELARARLALDERGQKLGDLEERTAAMLSSAESFSKHAHEIMLKYKDKKWYQF
            1070      1080      1090      1100      1110     

>>CCDS47499.1 STXBP5 gene_id:134957|Hs108|chr6            (1151 aa)
 initn: 4838 init1: 2803 opt: 3399  Z-score: 3186.1  bits: 601.5 E(32554): 3.8e-171
Smith-Waterman score: 5252; 64.6% identity (85.1% similar) in 1199 aa overlap (1-1186:1-1151)

               10        20        30        40         50         
pF1KA1 MKKFNFRKVLDGLTASSPGSGSSSGSNSGGGAGSGSVHPAGTAGVLRE-EIQETLTSEYF
       :.:::.:::::::::     ::::.:..     . . :: :.    :: :::::: ::.:
CCDS47 MRKFNIRKVLDGLTA-----GSSSASQQ-----QQQQHPPGN----REPEIQETLQSEHF
               10             20             30            40      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 QICKTVRHGFPHQPTALAFDPVQKILAIGTRTGAIRILGRPGVDCYCQHESGAAVLQLQF
       :.:::::::::.::.::::::::::::.::.:::.:..:::::.:::::.:::::.::::
CCDS47 QLCKTVRHGFPYQPSALAFDPVQKILAVGTQTGALRLFGRPGVECYCQHDSGAAVIQLQF
         50        60        70        80        90       100      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 LINEGALVSASSDDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFNRERITYCHLPFQSKWLYVGTERGNT
       :::::::::: .:::::::::::::::::::::: :::.:.:::::::::::::::::: 
CCDS47 LINEGALVSALADDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFCRERVTFCHLPFQSKWLYVGTERGNI
        110       120       130       140       150       160      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 HIVNIESFILSGYVIMWNKAIELSTKTHPGPVVHLSDSPRDEGKLLIGYENGTVVFWDLK
       ::::.::: :::::::::::::::.:.:::::::.::.: ::::::::.:.::::.::::
CCDS47 HIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVHISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLK
        170       180       190       200       210       220      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 SKRAELRVYYDEAIHSIDWHHEGKQFMCSHSDGSLTLWNLKSPSRPFQTTIPHGKSQREG
       ::.:. :  :::::::. ::::::::.::::::.::.::..::..: ::  ::::. ..:
CCDS47 SKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGKQFICSHSDGTLTIWNVRSPAKPVQTITPHGKQLKDG
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pF1KA1 RKSESCKPILKVEYKTCKNSEPFIIFSGGLSYDKACRRPSLTIMHGKAITVLEMDHPIVE
       .: : ::::::::.:: ...:::::.::::::: . ::: ::.::::. .:::::. ::.
CCDS47 KKPEPCKPILKVEFKTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVD
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pF1KA1 FLTLCETPYPNEFQEPYAVVVLLEKDLIVVDLTQSNFPIFENPYPMDIHESPVTCTAYFA
       :::::::::::.:::::::::::::::...::.:...::::::::..::::::::  :::
CCDS47 FLTLCETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVTCCEYFA
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pF1KA1 DCPPDLILVLYSIGVKHKKQGYSNKEWPISGGAWNLGAQTYPEIIITGHADGSIKFWDAS
       ::: ::: .:::.:...:.::::.:::::.:: :.::::.:::::::::::::.::::::
CCDS47 DCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEIIITGHADGSVKFWDAS
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pF1KA1 AITLQMLYKLKTSKVFEKQKVGEGKQTCEIVEEDPFAIQMIYWCPESRIFCVSGVSAYVI
       :::::.::::::::::::..  . . . .::.:::.:::.: ::::::..:..::::.::
CCDS47 AITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDEDPYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVI
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pF1KA1 IYKFSRHEITTEIVS-LEVRLQYDVEDIITPEPETSPPFPDL---SAQLPSSRSLSGSTN
       ::.::..:. ::..  ::::: :...:. ::: :  ::.:     :   :   .   ::.
CCDS47 IYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYEINDVETPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTS
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pF1KA1 TVASEGVTKDSIPCLNVKTRPVRMPPGYQAELVIQLVWVDGEPPQQITSLAVSSAYGIVA
       . .:.:. .:..:::.::. :... ::::.::::::::: ::::::::::::.:.::.:.
CCDS47 SSSSDGL-RDNVPCLKVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVV
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pF1KA1 FGNCNGLAVVDFIQKTVLLSMGTIDLYRSSDLYQRQPRSPRKNKQFIADNFCMRGLSNFY
       ::::::.:.::..::.:::..:::.:: :.: :.:.::::::..:  . ..:        
CCDS47 FGNCNGIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLC--------
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pF1KA1 PDLTKRIRTSYQSLTELNDSPVPLELERCKSPTSDHVNGHCTSPTSQSCSSGKRLSSADV
        :...              . ::   .:::::::   . : ..  ..  .  ..... . 
CCDS47 -DISE-------------GTVVPE--DRCKSPTSGSSSPHNSDDEQKMNNFIEKVKTKS-
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pF1KA1 SKVNRWGPGRPPFRKAQSAACM--EISLPVTTEEN---RENSYNRSRSSSISSIDKDSKE
        : ..          :.. : :  ..:::.  . .   ..::..::::::..::::.:.:
CCDS47 RKFSKM--------VANDIAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESRE
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       ::.::.: ..:.::.::. ::::.:::.:: ::.:.:::: . :::. .::.: ::::.:
CCDS47 AISALHFCETFTRKTDSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGTIL
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CCDS47 RLKGAILRMAFLDTTGCLIPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVSVSPSSSQEISEN
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CCDS47 QYAVICSEKQAKVISLPTQNCAYKQNITETSFVLRGDIVALSNSICLACFCANGHIMTFS
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CCDS47 LPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTNNGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGE
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CCDS47 LFTPVETPEAPNRGFFKGLFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKG
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CCDS47 AASGVVGELARARLALDERGQKLGDLEERTAAMLSSAESFSKHAHEIMLKYKDKKWYQF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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