Result of FASTA (ccds) for pF1KA0603
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0603, 1299 aa
  1>>>pF1KA0603 1299 - 1299 aa - 1299 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6953+/-0.000907; mu= 7.8636+/- 0.055
 mean_var=153.6859+/-30.808, 0's: 0 Z-trim(112.1): 71  B-trim: 333 in 1/50
 Lambda= 0.103456
 statistics sampled from 12830 (12901) to 12830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.396), width:  16
 Scan time:  6.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1298) 8634 1301.1       0
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1290) 5747 870.1       0
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1235) 4629 703.3  1e-201
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1168) 2169 336.1 3.3e-91
CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1159) 1573 247.1   2e-64
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9        (1069)  778 128.5 9.6e-29
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1        ( 815)  683 114.3 1.4e-24
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 794)  602 102.2 5.9e-21
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 805)  602 102.2   6e-21
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 810)  587 99.9 2.9e-20
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 821)  582 99.2 4.8e-20
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 508)  404 72.5 3.1e-12
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16     ( 808)  408 73.2 3.1e-12
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 515)  404 72.5 3.2e-12
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22        ( 749)  398 71.7 8.3e-12
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 828)  391 70.7 1.9e-11
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 845)  391 70.7 1.9e-11


>>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1298 aa)
 initn: 5821 init1: 5821 opt: 8634  Z-score: 6965.2  bits: 1301.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8634; 99.8% identity (99.9% similar) in 1299 aa overlap (1-1299:1-1298)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS41 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
              850       860        870       880       890         

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
     900       910       920       930       940       950         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
     960       970       980       990      1000      1010         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
    1200      1210      1220      1230      1240      1250         

             1270      1280      1290         
pF1KA0 KTVEQLRKLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS41 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
    1260      1270      1280      1290        

>>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1290 aa)
 initn: 7776 init1: 4964 opt: 5747  Z-score: 4636.4  bits: 870.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8560; 99.2% identity (99.3% similar) in 1299 aa overlap (1-1299:1-1290)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVFIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
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pF1KA0 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
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pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
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       ::::::::::::        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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pF1KA0 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
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       :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS66 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
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>>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13             (1235 aa)
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 HKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQC
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pF1KA0 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVI
              430       440       450       460       470       480

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pF1KA0 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS
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pF1KA0 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS
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pF1KA0 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGR
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pF1KA0 AQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQN
       ::::::::::::::::::                                          
CCDS66 AQGVRSPLLRQSSSEQCS------------------------------------------
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pF1KA0 SGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ---------------------DGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRV
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pF1KA0 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS66 ASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELR
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pF1KA0 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLE-ASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN
       780       790       800        810       820       830      

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQL
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pF1KA0 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLL
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pF1KA0 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEIS
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pF1KA0 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFEN
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             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETL
       1080      1090      1100      1110      1120      1130      

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQ
       1140      1150      1160      1170      1180      1190      

             1270      1280      1290         
pF1KA0 KTVEQLRKLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS66 KTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
       1200      1210      1220      1230     

>>CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4             (1168 aa)
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                                     : :  ::.  .   ::.:::::..::.:: 
CCDS33           MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRL
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pF1KA0 SQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--IFEHKA
       :..        :....: : .:   ::: : ::          . : .: ..  ::: : 
CCDS33 SRQSTRK---EPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSIFECKP
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pF1KA0 QHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMK
       :.. ..:::::: .::: :::   :  . :  :.::.: : ..::..:::::: .: : .
CCDS33 QRVHKLIHNSHDPSYFACLIK--EDAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQ
      100       110         120       130       140       150      

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pF1KA0 EDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQ
       :. .  .. .:.:  :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::.       ...: .
CCDS33 EELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-------HVSG-S
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pF1KA0 RGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERILED
       :: .              ::    :. :         :.:...:.    :  : .  :..
CCDS33 RGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPVRRPMRKSFSQPGLRS
        210                     220                230       240   

           310       320       330       340       350       360   
pF1KA0 SGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGR
        .:  ..:...     .:     .:    :. . .  :. . :::.: :.:::::: .:.
CCDS33 LAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQ
             250       260           270       280       290       

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pF1KA0 FEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQCASE
        :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::   :  ...::::::..:
CCDS33 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KA0 SLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRH
       .::::.:.::::::..::. :.::.  .:::.::..:::::::::::.   ..:: .:.:
CCDS33 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
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pF1KA0 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
       :..::..::: :::.:::..: ..:.::::.:  :: : : ::: :.::::  .: .   
CCDS33 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
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pF1KA0 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
          .: .: .::   ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. ::      : . ..:
CCDS33 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
       480          490       500       510        520       530   

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pF1KA0 LASEKDYSPGDSPPGTPPASPPS-SAWQTF-PEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLN
       :.:  . .  .       : : : :... .   :: .:        . :: :        
CCDS33 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSD-------SESHLPEEP-----
           540       550       560       570              580      

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pF1KA0 LQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLK
                 .::    : .:     . ::   ..:. : .:        :.  .:.   
CCDS33 ----------APL----SPQQ-----AFRR---RANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGV--
                                590          600       610         

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA0 SFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQR
            : :   .:.. .  .:  : .: :..       .:.  . ::: :  :: ::::.
CCDS33 -----SQRKLMRYHS-VSTETPHERKDFESK-------ANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQ
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pF1KA0 IFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEERKK
       ::::::.:..   :. . .:  . .:: : ::: :. :. :.         :   :... 
CCDS33 IFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPEEKKRT
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pF1KA0 SKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWD
       :.::: ::.::: :::::::::::::::. ::...: ....::::::.  : :::  .:.
CCDS33 SRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQ-ASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWE
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pF1KA0 KKLLN-CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYK
       : : .  :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :. ::
CCDS33 KMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYK
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pF1KA0 ELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISF
       :::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.:::::::.::
CCDS33 ELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSF
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pF1KA0 VAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL
       :::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::::::::::::::
CCDS33 VAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHL
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pF1KA0 EENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIME
       ::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::::::::::::::::.:.. ::..
CCDS33 EEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQ
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         1140      1150      1160      1170      1180      1190    
pF1KA0 CESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSC
        :..:.::.:.:.:::...  .::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .::   
CCDS33 HENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PL
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

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pF1KA0 EDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQ
        :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. . ::: 
CCDS33 SDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLEL
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         1260        1270      1280      1290         
pF1KA0 EKMAYQKTVEQLRK--LLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
       :. :  .:::.::.    :.:   .:                     
CCDS33 ERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD             
         1140      1150      1160                     

>>CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4             (1159 aa)
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pF1KA0 CIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMAEIRRR
                                     : :  ::.  .   ::.:::::..::.:: 
CCDS58           MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRL
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pF1KA0 SQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--IFEHKA
       :..        :....: : .:   ::: : ::          . : .: ..  ::: : 
CCDS58 SRQSTRK---EPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSIFECKP
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pF1KA0 QHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMK
       :.. ..:::::: .::: :::   :  . :  :.::.: : ..::..:::::: .: : .
CCDS58 QRVHKLIHNSHDPSYFACLIK--EDAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQ
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pF1KA0 EDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQ
       :. .  .. .:.:  :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::.       ...: .
CCDS58 EELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-------HVSG-S
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pF1KA0 RGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERILED
       :: .              ::    :. :         :.:...:.    :  : .  :..
CCDS58 RGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPVRRPMRKSFSQPGLRS
        210                     220                230       240   

           310       320       330       340       350       360   
pF1KA0 SGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGR
        .:  ..:...     .:     .:    :. . .  :. . :::.: :.:::::: .:.
CCDS58 LAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQ
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pF1KA0 FEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQCASE
        :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::   :  ...::::::..:
CCDS58 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
       300       310       320       330       340       350       

           430       440       450       460       470       480   
pF1KA0 SLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRH
       .::::.:.::::::..::. :.::.  .:::.::..:::::::::::.   ..:: .:.:
CCDS58 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
       360       370       380       390       400       410       

           490       500       510       520       530       540   
pF1KA0 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
       :..::..::: :::.:::..: ..:.::::.:  :: : : ::: :.::::  .: .   
CCDS58 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
       420       430       440       450       460       470       

                 550       560       570       580       590       
pF1KA0 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
          .: .: .::   ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. ::      : . ..:
CCDS58 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
       480          490       500       510        520       530   

       600                    610         620       630            
pF1KA0 LAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASPP--SSAWQTFPEEDSD-SPQ--FRRR
       :.:            ::.  : ..:      .:    :.. . .::: .  :::  ::::
CCDS58 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRR
           540       550       560       570       580       590   

     640       650       660       670             680       690   
pF1KA0 AHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSS------SEQCSNLSSVRRMYKESNSS
       :.:.:: :   ..  .   :     .  :.:  :       :.  . : : .  :.  ..
CCDS58 ANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERNVDPSPVGES-KHRPGQ
           600       610       620       630       640        650  

           700       710       720               730       740     
pF1KA0 SSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQNS-----GRLSPQ---YENEIRQDTASESS----
       :: :.    .. :: ..:.:.: . .::     :   :.   :.: .:.   : ::    
CCDS58 SSAPAPPPRLN-PSASSPNFFKYLKHNSSGEQSGNAVPKSISYRNALRKKLHSSSSVPNF
            660        670       680       690       700       710 

                          750       760       770       780        
pF1KA0 -------------DGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSP
                    :  . ::   . .:.  . ::: :  :: ::::.::::::.:..   
CCDS58 LKFLAPVDENNTSDFMNTKRDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACD
             720       730       740       750       760       770 

      790       800       810       820       830       840        
pF1KA0 SAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIH
       :. . .:  . .:: : ::: :. :. :.         :   :... :.::: ::.::: 
CCDS58 SSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPEEKKRTSRELRELWQKAIL
             780       790       800               810       820   

      850       860       870       880       890       900        
pF1KA0 QQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLN-CRAKIRC
       :::::::::::::::. ::...: ....::::::.  : :::  .:.: : .  :.::. 
CCDS58 QQILLLRMEKENQKLQ-ASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKF
           830        840       850       860       870       880  

       910       920       930       940       950       960       
pF1KA0 DMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAI
       ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :. :::::::::.:::::
CCDS58 DMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAI
            890       900       910       920       930       940  

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KA0 LVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQ
       :.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.:::::::.:::::.::::::::.
CCDS58 LIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEE
            950       960       970       980       990      1000  

      1030      1040      1050      1060      1070      1080       
pF1KA0 AFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAP
       ::.::::::.:.:.::::::::. ::                                  
CCDS58 AFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQ----------------------------------
           1010      1020                                          

      1090      1100      1110      1120      1130      1140       
pF1KA0 WFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKN
                                                                   
CCDS58 ------------------------------------------------------------
                                                                   

      1150      1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KA0 TLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERAN
                ::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .::    :.. ..:::..:
CCDS58 ---------MEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTN
              1030      1040      1050      1060       1070        

      1210      1220      1230      1240      1250      1260       
pF1KA0 SQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLR
       :.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. . ::: :. :  .:::.::
CCDS58 SSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELR
     1080      1090      1100      1110      1120      1130        

        1270      1280      1290         
pF1KA0 K--LLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
       .    :.:   .:                     
CCDS58 RRSAEPSDREPECTQPEPTGD             
     1140      1150                      

>>CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9             (1069 aa)
 initn: 650 init1: 545 opt: 778  Z-score: 629.5  bits: 128.5 E(32554): 9.6e-29
Smith-Waterman score: 778; 37.0% identity (67.1% similar) in 392 aa overlap (886-1269:533-905)

         860       870       880       890       900       910     
pF1KA0 MEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMEDIHTL
                                     : ...: :: . : . . ..    ... .:
CCDS68 SSVIPSPPEDDEEEDNDEPLLSGSGDVSKECAEKILETWGELLSKWHLNLNVRPKQLSSL
            510       520       530       540       550       560  

         920       930       940       950       960       970     
pF1KA0 LKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTF
       ...:::.. :::.::.::  .   : : .:       :. :. . . :. ::  :..:::
CCDS68 VRNGVPEALRGEVWQLLAGCHNNDH-LVEK-------YRILITKESPQDSAITRDINRTF
            570       580        590              600       610    

         980       990      1000      1010      1020      1030     
pF1KA0 PTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFL
       :.: ::.   : :: ::... ::::. :.:.::::: ::.:.:::::: ::::: .:  .
CCDS68 PAHDYFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKI
          620       630       640       650       660       670    

        1040      1050      1060      1070      1080      1090     
pF1KA0 MYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFAS
       :.: :.:. .. .. .:. ..::: ::...:  :::::. .  .   .::. ::::::..
CCDS68 MFDYGLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTA
          680       690       700       710       720       730    

        1100      1110      1120       1130      1140      1150    
pF1KA0 QFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLL-SSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNT
       .: : .: ...:... .:  :::.:::.:: .:.. :..   .::. ..:..  ::    
CCDS68 KFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLT--DFEGALKFFRVQLPKRYR
          740       750       760       770         780       790  

           1160      1170       1180      1190      1200      1210 
pF1KA0 SE--MEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLK
       ::   .:..  . .: :: :.:. :: :::.....  ..    ::   .:..:: : .:.
CCDS68 SEENAKKLMELACNMKISQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQ----EDP--IERFERENRRLQ
            800       810       820       830             840      

             1220         1230      1240      1250      1260       
pF1KA0 RQNMDL-LEKLQVAHTKIQ---ALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLR
       . :: :  :. ..::  .    ::...:.:    : :  .: . : . :.    . :. :
CCDS68 EANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNA---EEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKR
        850       860       870          880       890       900   

      1270      1280      1290                                     
pF1KA0 KLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP                            
       .:                                                          
CCDS68 RLEEESAQLKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIR
           910       920       930       940       950       960   

>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1             (815 aa)
 initn: 630 init1: 519 opt: 683  Z-score: 554.8  bits: 114.3 E(32554): 1.4e-24
Smith-Waterman score: 688; 34.9% identity (68.9% similar) in 338 aa overlap (856-1189:479-803)

         830       840       850       860       870       880     
pF1KA0 DPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGA
                                     :  .... :  : .::.:    .. .    
CCDS13 NAGDAIYEVVSLQRESDKEEPVTPTSGGGPMSPQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKD----
      450       460       470       480       490       500        

         890       900       910       920       930       940     
pF1KA0 CQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNK
       : ...: .: . : . ....    . . ::.: :::.. :.:.::.::  .       ..
CCDS13 CPEKILYSWGELLGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVPEALRAEVWQLLAGCH-------DN
          510       520       530       540       550              

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KA0 QQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKE
       :   :  :. :. . .::. .:  :. ::::.: ::.   : :: ::... ::::. :..
CCDS13 QAMLD-RYRILITKDSAQESVITRDIHRTFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDED
       560        570       580       590       600       610      

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KA0 VGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHD
       .::::: ::.:.:::::: ::::: .:  .::: :.:  :: .. .:. ..::: ::...
CCDS13 IGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQE
        620       630       640       650       660       670      

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KA0 YHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLL
          ::..:. . ..   .::. ::::::...: : .: ...:... .: ..::.:::.::
CCDS13 QLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALL
        680       690       700       710       720       730      

        1130      1140      1150        1160       1170      1180  
pF1KA0 SSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSE--MEKIITQVFEMDI-SKQLHAYEVEYHV
       ....  ... . ::. ..:..  ::    .:   .... :. .. . .:.:. :: ::..
CCDS13 KTSKEDLLQAD-FEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQT
        740        750       760       770       780       790     

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KA0 LQD-ELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTR
       ... .::.                                                    
CCDS13 MRESQLQQEDPMDRYKFVYL                                        
         800       810                                             

>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19            (794 aa)
 initn: 595 init1: 512 opt: 602  Z-score: 489.6  bits: 102.2 E(32554): 5.9e-21
Smith-Waterman score: 656; 29.6% identity (63.2% similar) in 470 aa overlap (805-1268:6-445)

          780       790       800       810       820        830   
pF1KA0 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGED-DPEKIEER
                                     ::: : ..:       ::.   .: .  : 
CCDS12                          MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
                                        10              20         

           840       850       860       870       880         890 
pF1KA0 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYE--EVGACQKEVL
        .  ::. : .  ...:  ::. ......  ..:: .  :  :. .    ...  .... 
CCDS12 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
      30        40          50        60        70        80       

             900       910        920       930       940       950
pF1KA0 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
       : : . . :   . :   : . . :...:.:.  :. .::.:         .: :.:   
CCDS12 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATD----MPVKNQ---
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pF1KA0 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
         :.::::. .  .. :  :..::.: : .:. : . ::  :::..:::::.:.::::::
CCDS12 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
       140       150       160       170       180       190       

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KA0 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
       : .:..:.::..: ::.:: ..  :: .  .:. ..:.:  : . .::.  .:..   ::
CCDS12 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
       200       210       220       230       240       250       

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA0 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
        .:.. . .  :.::. :::::: . : :  ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS12 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
       260       270       280       290       300       310       

             1140      1150      1160      1170       1180         
pF1KA0 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE
        .:. . .:.. .... ..: .  :  .:.. .....  . :...  : :: ...     
CCDS12 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK-----
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    1190      1200      1210      1220      1230      1240         
pF1KA0 SSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-KSL
        :   :..  ...: :....: .: .. ::: ::  :. :  : :   .. ::  . .. 
CCDS12 -SKEMEEQIEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQV--TRAQEAEENY--VIKRELAVVRQQ
              380        390       400         410         420     

     1250      1260      1270      1280      1290                  
pF1KA0 IRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP         
         .  .. .  :.:..::..                                        
CCDS12 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
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>>CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19            (805 aa)
 initn: 596 init1: 513 opt: 602  Z-score: 489.5  bits: 102.2 E(32554): 6e-21
Smith-Waterman score: 640; 28.6% identity (62.9% similar) in 472 aa overlap (805-1268:6-456)

          780       790       800       810       820        830   
pF1KA0 RIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVIFLSGED-DPEKIEER
                                     ::: : ..:       ::.   .: .  : 
CCDS54                          MASPTLSPDSSSQEA------LSAPTCSPTSDSEN
                                        10              20         

           840       850       860       870       880         890 
pF1KA0 KKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYE--EVGACQKEVL
        .  ::. : .  ...:  ::. ......  ..:: .  :  :. .    ...  .... 
CCDS54 LSPDELELLAK--LEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTW
      30        40          50        60        70        80       

             900       910        920       930       940       950
pF1KA0 ITWDKKLLNCRAKIRCDMEDI-HTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
       : : . . :   . :   : . . :...:.:.  :. .::.:         .: :.:   
CCDS54 ILWGR-IANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATD----MPVKNQ---
        90        100       110       120       130                

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pF1KA0 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
         :.::::. .  .. :  :..::.: : .:. : . ::  :::..:::::.:.::::::
CCDS54 --YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQ
       140       150       160       170       180       190       

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KA0 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
       : .:..:.::..: ::.:: ..  :: .  .:. ..:.:  : . .::.  .:..   ::
CCDS54 GSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDL
       200       210       220       230       240       250       

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pF1KA0 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
        .:.. . .  :.::. :::::: . : :  ..:::::.. .: :..:.:.:.::. ...
CCDS54 NTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQA
       260       270       280       290       300       310       

             1140      1150      1160      1170       1180         
pF1KA0 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDIS-KQLHAYEVEYHVLQDELQE
        .:. . .:.. .... ..: .  :  .:.. .....  . :...  : :: ..... .:
CCDS54 ELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEME
       320        330       340       350       360       370      

    1190      1200       1210      1220       1230      1240       
pF1KA0 SSYSCEDSETLEKLERANSQ-LKRQNMDLLEKL-QVAHTKIQALESNLENLLTRETKM-K
        .   .  .: ..: .   . :....  : ..: :   :. :  : :   .. ::  . .
CCDS54 EQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESAALADRLIQGQVTRAQEAEENY--VIKRELAVVR
        380       390       400       410       420         430    

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pF1KA0 SLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP       
       .   .  .. .  :.:..::..                                      
CCDS54 QQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQD
          440       450       460       470       480       490    

>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1                (810 aa)
 initn: 511 init1: 511 opt: 587  Z-score: 477.4  bits: 99.9 E(32554): 2.9e-20
Smith-Waterman score: 637; 27.2% identity (61.7% similar) in 507 aa overlap (770-1266:31-498)

     740       750       760       770       780          790      
pF1KA0 SSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNK---SPSAMQQQDG
                                     .:: .    ...: : .   :::.  .  .
CCDS30 MVTNKMTAAFRNPSGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTS
               10        20        30        40        50        60

        800        810       820       830       840       850     
pF1KA0 LDRNELLP-LSPLSPTMEEEPLVIFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLR
        . .   : ::: ::..     . .:.  .. ... :   :: :::.             
CCDS30 SSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETD-SKSLRSV-------------
               70        80        90        100                   

         860       870       880       890       900       910     
pF1KA0 MEKENQKLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDME-DIHT
         . ...  :.:    .: . .:.. :     ..  : : . ..:    .:   : ... 
CCDS30 --NGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLE-----EDSWILWGR-IVNEWEDVRKKKEKQVKE
          110       120       130            140        150        

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pF1KA0 LLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRT
       :...:.:.  :. .::.:       . .: :.:     :.::::. .  .. :  :..::
CCDS30 LVHKGIPHHFRAIVWQLLCSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIART
      160       170           180            190       200         

          980       990      1000      1010      1020      1030    
pF1KA0 FPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKF
       .: : .:. . . ::  :::..:::::.:.::::::: .:..:.::..: ::.:: ..  
CCDS30 YPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVK
     210       220       230       240       250       260         

         1040      1050      1060      1070      1080      1090    
pF1KA0 LMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFA
       :: :  .:. ..:.:  : . :::.  .....  .:. :.. . .  :.::. ::::.: 
CCDS30 LMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFL
     270       280       290       300       310       320         

         1100      1110      1120      1130      1140      1150    
pF1KA0 SQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNT
       . : : ...:.:::.. .: :..:.:.:.::. ... .:. . .:.... .....: .  
CCDS30 TTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFD
     330       340       350       360       370        380        

         1160       1170      1180      1190      1200      1210   
pF1KA0 SEMEKIITQVFEMDI-SKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQ
       .  .:.:  ....   ::...  : :: ... . .:     :. : ...: :....: .:
CCDS30 GVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEME-----EQVE-IKRL-RTENRLLKQ
      390       400       410       420             430        440 

          1220          1230      1240      1250      1260         
pF1KA0 NMDLLEKLQVAHTK----IQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRKL
        .. ::: . . .     .  ::..: .    :.. .  .. .... .  .:  ..:   
CCDS30 RIETLEKHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDE
             450       460       470       480       490       500 

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pF1KA0 LPADALANCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP                              
                                                                   
CCDS30 NNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNE
             510       520       530       540       550       560 




1299 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 00:50:03 2016 done: Fri Nov  4 00:50:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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