Result of FASTA (ccds) for pF1KA0456
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0456, 1071 aa
  1>>>pF1KA0456 1071 - 1071 aa - 1071 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2768+/-0.00133; mu= -1.6959+/- 0.079
 mean_var=253.4518+/-52.467, 0's: 0 Z-trim(108.2): 132  B-trim: 13 in 1/49
 Lambda= 0.080561
 statistics sampled from 9926 (10048) to 9926 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  5.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1        (1071) 7020 830.4       0
CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1        (1070) 7001 828.2       0
CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1        ( 789) 5141 612.0 1.7e-174
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3         (1075) 3353 404.2 7.7e-112
CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1      ( 459) 2871 348.0 2.8e-95
CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12        (1085) 2320 284.2 1.1e-75
CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1      ( 305) 1894 234.3   3e-61
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3          (1099) 1375 174.3 1.3e-42
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX         ( 946) 1082 140.2   2e-32
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX         ( 986) 1082 140.3 2.1e-32


>>CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1             (1071 aa)
 initn: 7020 init1: 7020 opt: 7020  Z-score: 4424.7  bits: 830.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7020; 99.9% identity (99.9% similar) in 1071 aa overlap (1-1071:1-1071)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS73 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KA0 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
             1030      1040      1050      1060      1070 

>>CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1             (1070 aa)
 initn: 5250 init1: 5250 opt: 7001  Z-score: 4412.8  bits: 828.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7001; 99.8% identity (99.8% similar) in 1071 aa overlap (1-1071:1-1070)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
              250       260       270        280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
     480       490       500       510       520       530         

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
     540       550       560       570       580       590         

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
     600       610       620       630       640       650         

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS76 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
     660       670       680       690       700       710         

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
     720       730       740       750       760       770         

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
     780       790       800       810       820       830         

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
     840       850       860       870       880       890         

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
     900       910       920       930       940       950         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
     960       970       980       990      1000      1010         

             1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KA0 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
    1020      1030      1040      1050      1060      1070

>>CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1             (789 aa)
 initn: 3390 init1: 3390 opt: 5141  Z-score: 3246.4  bits: 612.0 E(32554): 1.7e-174
Smith-Waterman score: 5141; 99.7% identity (99.7% similar) in 787 aa overlap (1-787:1-786)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
              250       260       270        280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
     360       370       380       390       400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
     420       430       440       450       460       470         

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
     480       490       500       510       520       530         

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
     540       550       560       570       580       590         

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
     600       610       620       630       640       650         

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS76 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
     660       670       680       690       700       710         

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
     720       730       740       750       760       770         

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
       :::::::                                                     
CCDS76 YIVVQDTLIS                                                  
     780                                                           

>>CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3              (1075 aa)
 initn: 2974 init1: 1036 opt: 3353  Z-score: 2121.3  bits: 404.2 E(32554): 7.7e-112
Smith-Waterman score: 4211; 59.8% identity (83.9% similar) in 1094 aa overlap (1-1071:1-1075)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :.: .::::::::::::..:.::::.::.::.:::.:: : :.:::::::.:::.:::::
CCDS33 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ..:::.:::::::: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:..::::::.::.::.
CCDS33 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       .::.: :. :.:::  ::::::::.: :....:.:: ::::.::::::::.:.::::.::
CCDS33 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210        220       230         
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       :::::::::::..::            : . :. : :..  :::::::::::::::::::
CCDS33 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
              190                  200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
       .:::::  ::::.::: : ::::.. ::::::.::::: :::::.:::: :..::.::::
CCDS33 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLID-CCDLGFHASLARTFRTYLSAE
     230       240       250       260        270       280        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
        ::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::
CCDS33 YNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQ
      290       300       310       320       330       340        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
       ::::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: : 
CCDS33 QPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRST
      350       360       370       380       390       400        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
       :::::..:::.::: .::::::::::::.:::::.:::..: :::::::::::::..:::
CCDS33 ESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLG
      410       420       430       440       450       460        

     480       490         500       510       520       530       
pF1KA0 ESQRTDCSLAR--RSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
       :..:..:. .:  :.. .:.:::.::::::::::::.:. .:::..::::: ::::::::
CCDS33 EGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVND
      470       480       490       500       510       520        

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
       :::.::::::::. :::..:..:.::::::::::::.:::::. :.::.. . ..:  ::
CCDS33 IKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAER
      530       540       550       560       570       580        

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
       . .:...:..::......:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: .:.:.: 
CCDS33 VHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDP
      590       600       610       620       630       640        

       660       670       680       690          700       710    
pF1KA0 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSR---GGSMEDYCDSPHGETTPVEDST
       ::::::.::.::::::.:: ::::::::::::: .   ::  :.::::::.:   ...  
CCDS33 VSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGG--EEYCDSPHSEPGAIDEVD
      650       660       670       680         690       700      

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 QDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGID
       .:  .: ::::.: : :::::::::.::. ::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS33 HDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVD
        710       720       730       740       750       760      

          780       790       800        810       820       830   
pF1KA0 GLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPP-EEKVTARAGASCPSGGHVADIYLAN
       :::::::::::: .:.  .  : :.. :. : :  ..:....   . :.  :..:  ...
CCDS33 GLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTE-HISDYGFGG
        770       780       790       800       810        820     

            840        850       860        870       880          
pF1KA0 I-NKQRKRPESGSI-RKTFRSDSHGLSSSLTDS-SSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPK-EG
       . .. : : ....: :.   .:.:.   .:  : ..:  .:.: :::   .  .  . :.
CCDS33 VMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAAC-PSSPHKIPLTRGRIES
         830       840       850       860        870       880    

     890       900       910       920       930       940         
pF1KA0 PDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEAT
       :.:  ..  :: .::. . . :   .. ..:.:  . : .:...:. .. :..:.::: :
CCDS33 PEKRRMATFGSAGSIN-YPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKT
          890       900        910       920       930       940   

     950       960       970       980        990      1000        
pF1KA0 MNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAP-TSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
       :..::.::::::::..::..::::::::::::. :  .: .:::.::::: ...::. :.
CCDS33 MSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPP--GPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAM
           950       960       970         980       990      1000 

     1010      1020      1030       1040       1050        1060    
pF1KA0 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMA-APVKPPATRP-KPTVFPKTNATSP-GVNS-STSP--
       .::.:.. ..  .:.:. :...: : ..::  :: .:.:  .....:  ::.: ...:  
CCDS33 RRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTE
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

                1070 
pF1KA0 -----QSTDKSCTV
            .:.::: :.
CCDS33 KMFPNSSADKSGTM
            1070     

>>CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1           (459 aa)
 initn: 2870 init1: 2870 opt: 2871  Z-score: 1824.0  bits: 348.0 E(32554): 2.8e-95
Smith-Waterman score: 2871; 98.0% identity (98.9% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS81 MDYSRNLEKLAEHFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKWESRDHTTLSDIY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
       :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS81 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPCSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKHQAKYT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ENKLKAIKAQNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::  . :                       
CCDS81 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF                     
              430       440       450                              

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN

>>CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12             (1085 aa)
 initn: 3871 init1: 1604 opt: 2320  Z-score: 1472.4  bits: 284.2 E(32554): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 4732; 66.6% identity (84.0% similar) in 1108 aa overlap (1-1071:1-1085)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
CCDS89 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80         90       100       110         
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
        .::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
CCDS89 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
       ::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS89 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       ::::::::::::::           :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
CCDS89 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
              190                  200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
       .:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS89 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
     230       240       250       260        270       280        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
        ::: :.::::: :::::.::.  :::::.::::  .:::::::::: :::: . :. ::
CCDS89 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
      290       300       310       320       330       340        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
       ::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: : 
CCDS89 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
      350       360       370       380       390       400        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
       ::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
CCDS89 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
      410       420       430       440       450       460        

     480       490                                 500       510   
pF1KA0 ESQRTDCSLAR-----------RSSTVRKQ---------------DSSQAIPLVVESCIR
       :..:..   .:           :.:  :.:               ::.:.:::.::::::
CCDS89 EGHRAEYMTTRPPNVPPKPQKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIR
      470       480       490       500       510       520        

           520       530       540       550       560       570   
pF1KA0 FISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLE
       ::. .::::.:::::::::::::::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::
CCDS89 FINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLE
      530       540       550       560       570       580        

           580       590       600       610       620       630   
pF1KA0 HPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEEN
       .:::::. :.::..:. .::: ::::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.::
CCDS89 NPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDEN
      590       600       610       620       630       640        

           640       650       660       670       680       690   
pF1KA0 MMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRG
       :::::::::::::.:: ::: .:::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: . 
CCDS89 MMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKC
      650       660       670       680       690       700        

           700       710       720       730       740       750   
pF1KA0 GSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGA
        . .::::::..:   .:.  ::. .: :::.:::::::::::::::::.::::::::::
CCDS89 MAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGA
      710       720       730       740       750       760        

           760       770       780       790       800       810   
pF1KA0 SLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVT
       :::::.:::.:::::::::::::.::::::::: .:   .  : :.. :. : :  :  .
CCDS89 SLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKS
      770       780       790       800       810       820        

           820       830       840        850               860    
pF1KA0 ARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDS
       .    . :.  :  : :::   .:::: :    .:.  : ::.:       .::.: .: 
CCDS89 SSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDL
      830       840           850       860       870       880    

          870       880       890       900       910       920    
pF1KA0 SSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTAT
       .::....  :   :   ...: ...:..    :::::..::::.::: ..::: ::....
CCDS89 GSPSLASHPRGLLQ---NRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTS
          890          900       910       920        930       940

          930       940       950       960       970       980    
pF1KA0 AGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSP
       .:.  .::.:.:.:::.:::::: :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::
CCDS89 SGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSP
              950       960       970       980       990      1000

          990      1000      1010      1020      1030      1040    
pF1KA0 VVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPT
       . : ..:  ::::.  :.. :: ..::.:...:   .:.:. . .:.. .:::: ::::.
CCDS89 TPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPA
             1010      1020      1030      1040      1050      1060

         1050      1060       1070 
pF1KA0 VFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDKSCTV
       :.::::   : .. .  ::. ::::::.
CCDS89 VLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDKSCTM
                1070      1080     

>>CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1           (305 aa)
 initn: 1137 init1: 1137 opt: 1894  Z-score: 1213.0  bits: 234.3 E(32554): 3e-61
Smith-Waterman score: 1894; 98.0% identity (98.7% similar) in 304 aa overlap (154-457:1-303)

           130       140       150       160       170       180   
pF1KA0 IIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81                               MKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
                                             10        20        30

           190       200       210       220       230       240   
pF1KA0 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTENK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTENK
               40        50        60        70        80        90

           250       260       270       280       290       300   
pF1KA0 LKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLE
              100       110       120        130       140         

           310       320       330       340       350       360   
pF1KA0 QSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQ
     150       160       170       180       190       200         

           370       380       390       400       410       420   
pF1KA0 SELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVK
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SELLQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVK
     210       220       230       240       250       260         

           430       440       450       460       470       480   
pF1KA0 STVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQR
       :::::::::::::::::::::::::::::  . :                          
CCDS81 STVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF                        
     270       280       290       300                             

           490       500       510       520       530       540   
pF1KA0 TDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFE

>>CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3               (1099 aa)
 initn: 3666 init1: 1032 opt: 1375  Z-score: 878.7  bits: 174.3 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 4142; 58.7% identity (82.5% similar) in 1102 aa overlap (1-1062:1-1083)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :.: .::::::::::::..:.::::.::.::.:::.:: : :.:::::::.:::.:::::
CCDS25 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
       ..:::.:::::::: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:..::::::.::.::.
CCDS25 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
       .::.: :. :.:::  ::::::::.: :....:.:: ::::.::::::::.:.::::.::
CCDS25 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210        220       230         
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
       :::::::::::..::            : . :. : :..  :::::::::::::::::::
CCDS25 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
              190                  200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
       .:::::  ::::.::: : ::::.. ::::::.::::: :::::.:::: :..::.::::
CCDS25 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLID-CCDLGFHASLARTFRTYLSAE
     230       240       250       260        270       280        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
        ::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::
CCDS25 YNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQ
      290       300       310       320       330       340        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
       ::::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: : 
CCDS25 QPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRST
      350       360       370       380       390       400        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
       :::::..:::.::: .::::::::::::.:::::.:::..: :::::::::::::..:::
CCDS25 ESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLG
      410       420       430       440       450       460        

     480       490                                 500       510   
pF1KA0 ESQRTDCSLAR------RSSTVRK--------------------QDSSQAIPLVVESCIR
       :..:..:. .:      . . .:.                    .::.::::::::::::
CCDS25 EGERAECGTTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIR
      470       480       490       500       510       520        

           520       530       540       550       560       570   
pF1KA0 FISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLE
       .:. .:::..::::: :::::::::::.::::::::. :::..:..:.::::::::::::
CCDS25 YINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLE
      530       540       550       560       570       580        

           580       590       600       610       620       630   
pF1KA0 HPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEEN
       .:::::. :.::.. . ..:  ::. .:...:..::......:::::::::::::.:.::
CCDS25 NPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDEN
      590       600       610       620       630       640        

           640       650       660       670       680       690   
pF1KA0 MMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSR-
       :::::::::::::.:: .:.:.: ::::::.::.::::::.:: ::::::::::::: . 
CCDS25 MMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKC
      650       660       670       680       690       700        

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 --GGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFK
         ::  :.::::::.:   ...  .:  .: ::::.: : :::::::::.::. ::::::
CCDS25 MAGG--EEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFK
      710         720       730       740       750       760      

              760       770       780       790       800          
pF1KA0 KGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPP-E
       ::::::::.:::.:::::::::.::::::::::::: .:.  .  : :.. :. : :  .
CCDS25 KGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLD
        770       780       790       800       810       820      

     810       820       830        840        850       860       
pF1KA0 EKVTARAGASCPSGGHVADIYLANI-NKQRKRPESGSI-RKTFRSDSHGLSSSLTDS-SS
       .:....   . :.  :..:  .... .. : : ....: :.   .:.:.   .:  : ..
CCDS25 DKASSKNDLQSPTE-HISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDT
        830       840        850       860       870       880     

        870       880        890       900       910       920     
pF1KA0 PGVGASCRPSSQPIMSQSLPK-EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATA
       :  .:.: :::   .  .  . :.:.:  ..  :: .::. . . :   .. ..:.:  .
CCDS25 PPRAAAC-PSSPHKIPLTRGRIESPEKRRMATFGSAGSIN-YPDKKALSEGHSMRSTCGS
         890        900       910       920        930       940   

         930       940       950       960       970       980     
pF1KA0 GRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPV
        : .:...:. .. :..:.::: ::..::.::::::::..::..::::::::::::. : 
CCDS25 TRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPP-
           950       960       970       980       990      1000   

          990      1000      1010      1020      1030       1040   
pF1KA0 VAP-TSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMA-APVKPPATRP-K
        .: .:::.::::: ...::. :..::.:.. ..  .:.:. :...: : ..::  :: .
CCDS25 -GPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVR
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

           1050        1060      1070        
pF1KA0 PTVFPKTNATSP-GVNS-STSPQSTDKSCTV       
       :.:  .....:  ::.: ...:                
CCDS25 PVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
            1070      1080      1090         

>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX              (946 aa)
 initn: 2343 init1: 801 opt: 1082  Z-score: 695.6  bits: 140.2 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 2481; 43.0% identity (72.3% similar) in 942 aa overlap (1-890:1-925)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
       :.. .:..... . :::.:::::.: ::.::..::. : ::: .:::.: .:.:..::.:
CCDS14 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
               10        20        30        40        50        60

               70            80        90       100       110      
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
       ..:::.:::::::: ..      : . :.:.:. ..:::..:: .::......::. ..:
CCDS14 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 SDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSIS
       :..  . .  :. ...:: ::: :::... :::::.:..:..:: .. :::. :. .:..
CCDS14 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KA0 AQSKLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQ
       :..::.:::.::::. :.::          : .::..  :   .:.::.::  .. ::::
CCDS14 AEAKLREAERQEEKRAGRSV----------PTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQ
              190       200                  210       220         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA0 AKYTENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFL
       ::. :.:::  ::::::::.: ..::.: .::.::. ::.: ::: :.: .:...::.. 
CCDS14 AKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMD-CCDTGFHLALGQVLRSYT
     230       240       250       260       270        280        

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA0 SAELNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQL
       .::   . :. .:: ..:.::: ::  .:: ...:.. .:::::..:...:: :: ....
CCDS14 AAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEI
      290       300       310       320       330       340        

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA0 CAQQPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYS
       :... ...:.. : :..::::.   ::.:::.::..::::.. ..:. .: :: : :: :
CCDS14 CVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTS
      350       360       370       380       390       400        

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 NSMESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQK
        : ::.::: :.   .. . ..::..::::: ::.::..::: ::....::::::. ::.
CCDS14 PSTESLKSTSSDP--GSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQE
      410       420         430       440       450       460      

        480       490                                 500       510
pF1KA0 TLGESQRTDCSLARRSSTVRK--------------------------QDSSQAIPLVVES
       .: .... .  ..  . : ::                          :.:.: .::::::
CCDS14 ALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVES
        470       480       490       500       510       520      

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 CIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFR
       :::::. .::::::::::::.:..:..:..:::::::::.   . ::.::.:::::::::
CCDS14 CIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFR
        530       540       550       560       570       580      

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 GLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFS
       .:: :::: :.: .:.:   ..   ::. :. ..:  ::  .:...::::.:::::.:.:
CCDS14 SLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYS
        590       600       610       620       630       640      

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 EENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVY
       .::::::::::.::::.:. :: :.: :. :..::.:..:.:.: . .::    : ::::
CCDS14 DENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVY
        650       660       670       680       690       700      

               700       710       720       730        740        
pF1KA0 SRGGSMEDY-CDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPI-EAIAKFDYVGRTARELS
        .  .  .  : .     .   :.  .. ::  ...:. : . ::.: : :.::::.:::
CCDS14 EKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELS
        710       720       730       740       750       760      

      750       760       770       780        790                 
pF1KA0 FKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQ-DTEDGVV---------ERSSPK
       :..:  : :..:::.:::.:.:::. :::::.::..   ::  ::           :::.
CCDS14 FRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPE
        770       780       790       800       810       820      

      800         810       820       830         840       850    
pF1KA0 SEI--EVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRK--RPESGSIRKTFR---
       . .  :.. .:  :  :.   :  ::: .   .  :. ... .  .  . .. ..:.   
CCDS14 GLLASELVHRP--EPCTSPE-AMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELL
        830         840        850       860       870       880   

                860       870       880       890       900        
pF1KA0 ---SDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHS
          :  .::. . : : :::  .   : :. .  ..  ..::                  
CCDS14 GKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTP
           890       900       910       920       930       940   

      910       920       930       940       950       960        
pF1KA0 SLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKH
                                                                   
CCDS14 KPH                                                         
                                                                   

>>CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX              (986 aa)
 initn: 2287 init1: 801 opt: 1082  Z-score: 695.4  bits: 140.3 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 2321; 41.2% identity (69.1% similar) in 958 aa overlap (25-890:25-965)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
                               : ::.::..::. : ::: .:::.: .:.:..::.:
CCDS55 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
               10        20        30        40        50        60

               70            80        90       100       110      
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
       ..:::.:::::::: ..      : . :.:.:. ..:::..:: .::......::. ..:
CCDS55 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 SDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSIS
       :..  . .  :. ...:: ::: :::... :::::.:..:..:: .. :::. :. .:..
CCDS55 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220           230  
pF1KA0 AQSKLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKK----IEKM-
       :..::.:::.::::. :.::          : .::..  :   .:.::.::    .::. 
CCDS55 AEAKLREAERQEEKRAGRSV----------PTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKLW
              190       200                  210       220         

                                                240       250      
pF1KA0 -----------------------------------KEKRQAKYTENKLKAIKARNEYLLA
                                           ..::::. :.:::  ::::::::.
CCDS55 PPQRPVAASSCAPVCWLQAGFLVHPPWWGAMCAPSTHQRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLS
     230       240       250       260       270       280         

        260       270       280       290       300       310      
pF1KA0 LEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLEQSKHEGLDAIENA
       : ..::.: .::.::. ::.: ::: :.: .:...::.. .::   . :. .:: ..:.:
CCDS55 LASVNAAVSNYYLHDVLDLMD-CCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEA
     290       300       310        320       330       340        

        320       330       340       350       360       370      
pF1KA0 VENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQSELVQRCQQLQSR
       :: ::  .:: ...:.. .:::::..:...:: :: ....:... ...:.. : :..:::
CCDS55 VEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSR
      350       360       370       380       390       400        

        380       390       400       410       420       430      
pF1KA0 LSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVKSTVSETFMSKPSI
       :.   ::.:::.::..::::.. ..:. .: :: : :: : : ::.::: :.   .. . 
CCDS55 LDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDP--GSRQA
      410       420       430       440       450       460        

        440       450       460       470       480       490      
pF1KA0 AKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQRTDCSLARRSSTVR
       ..::..::::: ::.::..::: ::....::::::. ::..: .... .  ..  . : :
CCDS55 GRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQR
        470       480       490       500       510       520      

                                  500       510       520       530
pF1KA0 K--------------------------QDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSG
       :                          :.:.: .:::::::::::. .::::::::::::
CCDS55 KFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSG
        530       540       550       560       570       580      

              540       550       560       570       580       590
pF1KA0 SQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVT
       .:..:..:..:::::::::.   . ::.::.:::::::::.:: :::: :.: .:.:   
CCDS55 AQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSE
        590       600       610       620       630       640      

              600       610       620       630       640       650
pF1KA0 MDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMS
       ..   ::. :. ..:  ::  .:...::::.:::::.:.:.::::::::::.::::.:. 
CCDS55 LEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLP
        650       660       670       680       690       700      

              660       670       680       690        700         
pF1KA0 VPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDY-CDSPHGETTP
       :: :.: :. :..::.:..:.:.: . .::    : :::: .  .  .  : .     . 
CCDS55 VPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESL
        710       720       730       740       750       760      

     710       720       730        740       750       760        
pF1KA0 VEDSTQDVTAEHHTSDDECEPI-EAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEG
         :.  .. ::  ...:. : . ::.: : :.::::.::::..:  : :..:::.:::.:
CCDS55 GADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRG
        770       780       790       800       810       820      

      770       780        790                800         810      
pF1KA0 RHNGIDGLIPHQYIVVQ-DTEDGVV---------ERSSPKSEI--EVISEPPEEKVTARA
       .:::. :::::.::..   ::  ::           :::.. .  :.. .:  :  :.  
CCDS55 EHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRP--EPCTS-P
        830       840       850       860       870         880    

        820       830         840       850             860        
pF1KA0 GASCPSGGHVADIYLANINKQRK--RPESGSIRKTFR------SDSHGLSSSLTDSSSPG
        :  ::: .   .  :. ... .  .  . .. ..:.      :  .::. . : : :::
CCDS55 EAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPG
           890       900       910       920       930       940   

      870       880       890       900       910       920        
pF1KA0 VGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRS
         .   : :. .  ..  ..::                                      
CCDS55 PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH                 
           950       960       970       980                       




1071 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 00:42:56 2016 done: Fri Nov  4 00:42:57 2016
 Total Scan time:  5.110 Total Display time:  0.430

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com