Result of FASTA (ccds) for pF1KA0188
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0188, 890 aa
  1>>>pF1KA0188 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5035+/-0.00103; mu= 11.3758+/- 0.062
 mean_var=134.1007+/-26.940, 0's: 0 Z-trim(108.7): 29  B-trim: 291 in 1/50
 Lambda= 0.110754
 statistics sampled from 10397 (10409) to 10397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.32), width:  16
 Scan time:  4.070

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2          ( 890) 5963 964.9       0
CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 896) 5963 964.9       0
CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 975) 4396 714.5 2.2e-205
CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18         ( 896) 2214 365.9 1.9e-100
CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20        ( 852) 1903 316.2 1.6e-85
CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 459) 1633 272.9 9.5e-73


>>CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2               (890 aa)
 initn: 5963 init1: 5963 opt: 5963  Z-score: 5154.4  bits: 964.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5963; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 ICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 IEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 IEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVES
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 IMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 IMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 SDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 CEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 CEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 YCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 TDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890
pF1KA0 RLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
              850       860       870       880       890

>>CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2              (896 aa)
 initn: 5963 init1: 5963 opt: 5963  Z-score: 5154.3  bits: 964.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5963; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:7-896)

                     10        20        30        40        50    
pF1KA0       MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KA0 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KA0 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KA0 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA0 EWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330       340       350    
pF1KA0 PLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAA
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KA0 APLLPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APLLPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYF
              370       380       390       400       410       420

          420       430       440       450       460       470    
pF1KA0 PKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSD
              430       440       450       460       470       480

          480       490       500       510       520       530    
pF1KA0 HREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLP
              490       500       510       520       530       540

          540       550       560       570       580       590    
pF1KA0 KATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRV
              550       560       570       580       590       600

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA0 KHESSSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KHESSSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQ
              610       620       630       640       650       660

          660       670       680       690       700       710    
pF1KA0 YQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQ
              670       680       690       700       710       720

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 NGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEK
              730       740       750       760       770       780

          780       790       800       810       820       830    
pF1KA0 FKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKT
              790       800       810       820       830       840

          840       850       860       870       880       890
pF1KA0 NISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
              850       860       870       880       890      

>>CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2              (975 aa)
 initn: 4381 init1: 4381 opt: 4396  Z-score: 3800.6  bits: 714.5 E(32554): 2.2e-205
Smith-Waterman score: 5854; 96.1% identity (96.1% similar) in 922 aa overlap (5-890:54-975)

                                         10        20        30    
pF1KA0                           MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDII
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AWSWIPIMRDPGWIRNVWSSNINVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDII
            30        40        50        60        70        80   

           40        50        60        70        80        90    
pF1KA0 VIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDN
            90       100       110       120       130       140   

          100       110       120       130       140       150    
pF1KA0 DQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKK
           150       160       170       180       190       200   

          160       170       180       190       200       210    
pF1KA0 RRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPE
           210       220       230       240       250       260   

          220       230       240                                  
pF1KA0 ENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPS---------------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS58 ENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHP
           270       280       290       300       310       320   

                250       260       270       280       290        
pF1KA0 ---PSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSS
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SESPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSS
           330       340       350       360       370       380   

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 RKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLL
           390       400       410       420       430       440   

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 PMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNG
           450       460       470       480       490       500   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 DPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREI
           510       520       530       540       550       560   

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 TKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATV
           570       580       590       600       610       620   

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 ESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHES
           630       640       650       660       670       680   

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 SSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGT
           690       700       710       720       730       740   

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 CRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYK
           750       760       770       780       790       800   

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA0 FLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQ
           810       820       830       840       850       860   

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA0 CLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISS
           870       880       890       900       910       920   

      840       850       860       870       880       890
pF1KA0 YVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
           930       940       950       960       970     

>>CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18              (896 aa)
 initn: 2887 init1: 1347 opt: 2214  Z-score: 1916.9  bits: 365.9 E(32554): 1.9e-100
Smith-Waterman score: 2960; 51.5% identity (74.9% similar) in 919 aa overlap (1-885:1-895)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
       :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. :::::::::::.:::::
CCDS11 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KA0 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMEC
       .:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .:    . .. 
CCDS11 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
               70        80        90       100       110       120

      120       130         140       150       160       170      
pF1KA0 QLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTS
        : ... :.     ::  ...  .  .::  . : :::...::.: . :: :....  ..
CCDS11 PLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASA
              130           140       150       160        170     

        180       190       200       210       220       230      
pF1KA0 EDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREW
         ::   . .:::.  .  ...:   :       .. ::. .  ... ..  :: :: .:
CCDS11 AAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDW
         180       190        200             210       220        

        240         250       260       270       280       290    
pF1KA0 SPTPSPSGSRPST--PKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
       ::  .   . :.:  :::::::  : .:   ... .: : :: .:...: :. ..  .  
CCDS11 SPLET---TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHP
      230          240       250       260       270       280     

          300       310          320               330       340   
pF1KA0 PLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFV
         ..    ...::..: ::.   :.. .: :      :.:     ::  : .  : .  .
CCDS11 RTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAEL
         290       300       310       320       330       340     

           350           360       370       380         390       
pF1KA0 NEEDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRD--KRSRHLGADGV
        :  ::.   .. :    ::     . :: :  . : :.::::.:.   :::.: : : .
CCDS11 LEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDI
         350       360       370         380       390       400   

       400       410       420       430       440       450       
pF1KA0 YLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDG
       :::::  ..::::::::::. .  : ...  .. . :..::::::::...:::.:  ::.
CCDS11 YLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDS
           410       420        430       440       450       460  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KA0 LRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWT
         :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..::::.
CCDS11 AMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWA
            470       480       490       500       510       520  

       520       530       540       550       560            570  
pF1KA0 TAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ESKPEQ
        :::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :..  :.     :.: : 
CCDS11 LAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEGKSEA
            530       540       550       560        570       580 

            580       590       600       610        620           
pF1KA0 CLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NVSYKK
         :.   :....:     ..:  ...:::::     . : ..  .:  :     ..::::
CCDS11 PPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKK
             590           600       610       620       630       

        630       640       650       660       670       680      
pF1KA0 TLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRS
       .:::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.::::::::::.:
CCDS11 SLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKS
       640       650       660       670       680       690       

        690       700       710       720       730       740      
pF1KA0 DTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTV
       :.::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::..::.
CCDS11 DALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTI
       700       710       720       730       740       750       

        750       760       770       780       790       800      
pF1KA0 LPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVY
       ::.:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .:::::::::: :::
CCDS11 LPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVY
       760       770       780       790       800       810       

        810       820       830       840       850       860      
pF1KA0 SYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDT
       .: ::::   :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: ::: . 
CCDS11 AYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPE-
       820       830       840       850       860       870       

        870       880       890
pF1KA0 FSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
       ::.: .::.:.:  . .:.     
CCDS11 FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS    
        880       890          

>>CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20             (852 aa)
 initn: 2527 init1: 1206 opt: 1903  Z-score: 1648.7  bits: 316.2 E(32554): 1.6e-85
Smith-Waterman score: 2575; 48.4% identity (70.8% similar) in 900 aa overlap (1-878:1-844)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
       ::::::::  :: ::::::.::::::::: ::..:..: .:...::::::::::.:::::
CCDS33 MNYVGQLAETVFGTVKELYRGLNPATLSGGIDVLVVKQVDGSFRCSPFHVRFGKLGVLRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQL
       ::::::::.::: :::::::::.:::::::: ..:.: .:  : ::::   : : .  . 
CCDS33 REKVVDIELNGEPVDLHMKLGDSGEAFFVQELESDDEHVPPGLCTSPIPWGGLSGFPSDS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDED
       . :.... .::       :.:     ...:. ...:.:::: .    ...: . :    :
CCDS33 QLGTASEPEGL-------VMA-----GTASTGRRKRRRRRKPK----QKEDAVAT----D
              130                   140       150               160

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTP
         : :. .    ::    .  :.  :: . .. ::. ::    :..  :: :: :: :  
CCDS33 SSPEELEAGAESELSLPEKLRPE--PPGSVQL-EEKSSL---QPKDI-YPYSDGEWPPQA
              170       180         190           200        210   

              250       260        270       280                   
pF1KA0 SPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQK-NPEMLWLWGELPQAAKS---------------
       : :... ..:::::::  .. : .  . . .: : ::.::..:..               
CCDS33 SLSAGELTSPKSDSELEVRTPEPSPLRAESHMQWAWGRLPKVARAERPESSVVLEGRAGA
           220       230       240       250       260       270   

          290       300        310        320        330       340 
pF1KA0 SSPHKMKESSPLSSRKI-CDKSHFQAIHSES-SDTFSD-QSPTLVGGALLDQNKPQTEMQ
       .:: .   :.: .:     :   .   ..:. .:   : ..:::::  :   .  ... :
CCDS33 TSPPRGGPSTPSTSVAGGVDPLGLPIQQTEAGADLQPDTEDPTLVGPPLHTPETEESKTQ
           280       290       300       310       320       330   

             350       360       370       380       390       400 
pF1KA0 FVNEEDLETLGAAAPLLPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDD
         ..  :   . .     .  :.  :...  ...    ::     :::.::: . .::::
CCDS33 SSGDMGLPPASKSWSWATL--EVPVPTGQPERVSRGKGSP-----KRSQHLGPSDIYLDD
           340       350         360       370            380      

             410       420       430         440       450         
pF1KA0 LTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGAR--SANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLR
       : ..: : ::::::..   :::       :::  :  .: .:. . . .   : : :   
CCDS33 LPSLDSENAALYFPQSD--SGL-------GARRWSEPSSQKSLRDPNPEHEPEPTLD---
        390       400                410       420       430       

     460       470       480       490       500       510         
pF1KA0 DLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTA
        . .::.::::::.: :.:. . : ...::::... ::...:::::::::..:.:::..:
CCDS33 TVDTIALSLCGGLADSRDISLEKFNQHSVSYQDLTKNPGLLDDPNLVVKINGKHYNWAVA
          440       450       460       470       480       490    

     520       530       540       550       560       570         
pF1KA0 APLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAH
       ::..:..::::: :::.:.... :.:::.:::::::::: :.   .:.:  ..  :.: .
CCDS33 APMILSLQAFQKNLPKSTMDKLEREKMPRKGGRWWFSWRRRDFLAEERSAQKEKTAAKEQ
          500       510       520       530       540       550    

     580       590       600       610       620        630        
pF1KA0 STGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNV-SYKKTLRLTSEQLKSL
       . ::.   ::       .... :       ::     :  :.. .:::.:::.:.:.. :
CCDS33 Q-GEKTEVLS------SDDDAPDSPVILEIPSLPPSTP--PSTPTYKKSLRLSSDQIRRL
           560             570       580         590       600     

      640       650       660       670       680       690        
pF1KA0 KLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGK
       .:..: :::::::::::::::::..:::::.:::::.:::::::::.::.:::::: :::
CCDS33 NLQEGANDVVFSVTTQYQGTCRCKATIYLWKWDDKVVISDIDGTITKSDALGHILPQLGK
         610       620       630       640       650       660     

      700       710       720       730       740       750        
pF1KA0 DWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSS
       :::::::..::::.. :::::::::::::::::.:.:::.::.: :  ::.::.::::::
CCDS33 DWTHQGITSLYHKIQLNGYKFLYCSARAIGMADLTKGYLQWVSEGGCSLPKGPILLSPSS
         670       680       690       700       710       720     

      760       770       780       790       800       810        
pF1KA0 LFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRI
       ::::::::::::::: ::: ::.::..::.:. .:::::::::: ::..:.:::.  .::
CCDS33 LFSALHREVIEKKPEVFKVACLSDIQQLFLPHGQPFYAAFGNRPNDVFAYRQVGLPESRI
         730       740       750       760       770       780     

      820       830       840       850       860       870        
pF1KA0 FTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLP
       :::::.:::.::  :.. :.: :: :::. .:: . :. :.:.  .  .::: .::::::
CCDS33 FTVNPRGELIQELIKNHKSTYERLGEVVELLFPPVARGPSTDLA-NPEYSNFCYWREPLP
         790       800       810       820        830       840    

      880       890
pF1KA0 PFENQDIHSASA
                   
CCDS33 AVDLDTLD    
          850      

>>CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2              (459 aa)
 initn: 1598 init1: 1598 opt: 1633  Z-score: 1419.5  bits: 272.9 E(32554): 9.5e-73
Smith-Waterman score: 2675; 92.0% identity (92.0% similar) in 452 aa overlap (1-416:7-458)

                     10        20        30        40        50    
pF1KA0       MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KA0 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA0 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
              130       140       150       160       170       180

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pF1KA0 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
              190       200       210       220       230       240

          240                                           250        
pF1KA0 EWSPTPS------------------------------------PSGSRPSTPKSDSELVS
       :::::::                                    :::::::::::::::::
CCDS58 EWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDSELVS
              250       260       270       280       290       300

      260       270       280       290       300       310        
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTF
              310       320       330       340       350       360

      320       330       340       350       360       370        
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPMIEELKPPSASVVQTANKT
              370       380       390       400       410       420

      380       390       400       410       420       430        
pF1KA0 DSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                      
CCDS58 DSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKK                     
              430       440       450                              

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA0 PQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPA




890 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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