Result of SIM4 for pF1KA0044

seq1 = pF1KA0044.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KA0044/gi568815584f_101709973.tfa (gi568815584f:101709973_102025269), 315297 bp

>pF1KA0044 1425
>gi568815584f:101709973_102025269 (Chr14)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-264  (146714-146913)   100% ->
265-375  (172189-172299)   100% ->
376-468  (173285-173377)   100% ->
469-599  (173460-173590)   100% ->
600-659  (180265-180324)   100% ->
660-768  (183028-183136)   100% ->
769-822  (184535-184588)   100% ->
823-993  (191747-191917)   100% ->
994-1121  (196430-196557)   100% ->
1122-1223  (199617-199718)   100% ->
1224-1296  (202429-202501)   100% ->
1297-1425  (215169-215297)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGTGGATGCGGCCAACTCCAATGGGCCTTTCCAGCCCGTGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGTGGATGCGGCCAACTCCAATGGGCCTTTCCAGCCCGTGGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCCATATTCGAG         ATGTTCCTCCTGCTGATCAAGAGAAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCCATATTCGAGGTA...CAGATGTTCCTCCTGCTGATCAAGAGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTTTATCCAGAAGTTACGTCAGTGTTGCGTCCTCTTTGACTTTGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146741 TTTTTATCCAGAAGTTACGTCAGTGTTGCGTCCTCTTTGACTTTGTTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATCCACTAAGTGACCTAAAGTGGAAGGAAGTAAAACGAGCTGCTTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146791 GATCCACTAAGTGACCTAAAGTGGAAGGAAGTAAAACGAGCTGCTTTAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAATGGTAGAATATATCACCCATAATCGGAATGTGATCACAGAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146841 TGAAATGGTAGAATATATCACCCATAATCGGAATGTGATCACAGAGCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTACCCAGAAGTAGTCCATATG         TTTGCAGTTAACATGTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 146891 TTTACCCAGAAGTAGTCCATATGGTA...TAGTTTGCAGTTAACATGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGAACATTACCACCTTCCTCCAATCCTACGGGAGCGGAATTTGACCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172207 CGAACATTACCACCTTCCTCCAATCCTACGGGAGCGGAATTTGACCCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAGATGAACCAACGTTAGAAGCAGCCTGGCCTCATCTACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 172257 GGAAGATGAACCAACGTTAGAAGCAGCCTGGCCTCATCTACAGGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   CTTGTTTATGAATTTTTCTTAAGATTTTTAGAGTCTCCAGATTTCCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173283 AGCTTGTTTATGAATTTTTCTTAAGATTTTTAGAGTCTCCAGATTTCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTAATATAGCGAAGAAATATATTGATCAGAAGTTTGTATTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 173333 CCTAATATAGCGAAGAAATATATTGATCAGAAGTTTGTATTGCAGGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     CTTTTAGAGCTCTTTGACAGTGAAGATCCTCGGGAGAGAGATTTTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173383 .AAGCTTTTAGAGCTCTTTGACAGTGAAGATCCTCGGGAGAGAGATTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTAAAACCACCCTTCACAGAATCTATGGGAAATTCCTAGGCTTGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173506 TTAAAACCACCCTTCACAGAATCTATGGGAAATTCCTAGGCTTGAGAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACATCAGAAAACAGATAAATAATATATTTTATAG         GTTTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 173556 TACATCAGAAAACAGATAAATAATATATTTTATAGGTA...TAGGTTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTATGAAACAGAGCATCATAATGGCATAGCAGAGTTACTGGAAATATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180271 TTATGAAACAGAGCATCATAATGGCATAGCAGAGTTACTGGAAATATTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAAG         TATAATTAATGGATTTGCCTTACCACTAAAAGAAGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180321 GAAGGTA...CAGTATAATTAATGGATTTGCCTTACCACTAAAAGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CACAAGATTTTCTTATTGAAGGTGTTACTACCTTTGCACAAAGTGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183065 CACAAGATTTTCTTATTGAAGGTGTTACTACCTTTGCACAAAGTGAAATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTGAGTGTCTACCATCCCCAG         CTGGCATACTGTGTAGTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 183115 TCTGAGTGTCTACCATCCCCAGGTA...TAGCTGGCATACTGTGTAGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGTTTTTAGAAAAGGACAGCACCCTCACGGAACCA         GTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 184554 AGTTTTTAGAAAAGGACAGCACCCTCACGGAACCAGTA...TAGGTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ATGGCACTTCTCAAATACTGGCCAAAGACTCACAGTCCAAAAGAAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191753 ATGGCACTTCTCAAATACTGGCCAAAGACTCACAGTCCAAAAGAAGTAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GTTCTTAAACGAATTAGAAGAGATTTTAGATGTCATTGAACCATCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191803 GTTCTTAAACGAATTAGAAGAGATTTTAGATGTCATTGAACCATCAGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGTGAAGATCATGGAACCCCTCTTCCGGCAGTTGGCCAAATGTGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191853 TTGTGAAGATCATGGAACCCCTCTTCCGGCAGTTGGCCAAATGTGTCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGCCCACACTTCCAG         GTGGCAGAGCGAGCTCTCTATTACTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 191903 AGCCCACACTTCCAGGTA...CAGGTGGCAGAGCGAGCTCTCTATTACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GAATAATGAATACATCATGAGTTTAATCAGTGACAACGCAGCGAAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196456 GAATAATGAATACATCATGAGTTTAATCAGTGACAACGCAGCGAAGATTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TGCCCATCATGTTTCCTTCCTTGTACCGCAACTCAAAGACCCATTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196506 TGCCCATCATGTTTCCTTCCTTGTACCGCAACTCAAAGACCCATTGGAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AA         GACAATACATGGCTTGATATACAACGCCCTGAAGCTCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196556 AAGTA...TAGGACAATACATGGCTTGATATACAACGCCCTGAAGCTCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CATGGAGATGAACCAAAAGCTATTTGATGACTGTACACAACAGTTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199656 CATGGAGATGAACCAAAAGCTATTTGATGACTGTACACAACAGTTCAAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGAGAAACTAAA         AGAGAAGCTAAAAATGAAAGAACGGGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 199706 CAGAGAAACTAAAGTG...CAGAGAGAAGCTAAAAATGAAAGAACGGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAAGCATGGGTTAAAATAGAAAATCTAGCCAAAGCCAATCCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 202457 GAAGCATGGGTTAAAATAGAAAATCTAGCCAAAGCCAATCCCCAGGTA..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297     GCACAGAAAGATCCGAAGAAGGACCGTCCTCTTGCACGCCGCAAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202507 .CAGGCACAGAAAGATCCGAAGAAGGACCGTCCTCTTGCACGCCGCAAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CCGAGCTGCCTCAGGACCCCCACACCAAGAAAGCCTTGGAAGCTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215215 CCGAGCTGCCTCAGGACCCCCACACCAAGAAAGCCTTGGAAGCTCACTGC

   1500     .    :    .    :    .    :
   1393 AGGGCCGATGAGCTGGCCTCCCAGGACGGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 215265 AGGGCCGATGAGCTGGCCTCCCAGGACGGCCGC

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