Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0030, 904 aa
1>>>pF1KA0030 904 - 904 aa - 904 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6801+/-0.00101; mu= 10.1207+/- 0.061
mean_var=121.1828+/-24.109, 0's: 0 Z-trim(108.1): 35 B-trim: 133 in 1/49
Lambda= 0.116507
statistics sampled from 9976 (9996) to 9976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 5935 1009.3 0
CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 853) 1064 190.5 1.1e-47
CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 1008 181.1 7.3e-45
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 988 177.7 6.7e-44
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 932 168.3 3.6e-41
CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 824) 828 150.8 9.4e-36
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 827 150.7 9.6e-36
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 806 147.2 1.6e-34
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 772 141.4 6.4e-33
CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 ( 863) 752 138.1 6.9e-32
CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 635 118.4 5.6e-26
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 573 108.0 8e-23
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 427 83.4 1.8e-15
CCDS5121.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 ( 391) 377 74.9 3.2e-13
>>CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 (904 aa)
initn: 5935 init1: 5935 opt: 5935 Z-score: 5393.9 bits: 1009.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5935; 100.0% identity (100.0% similar) in 904 aa overlap (1-904:1-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTE
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CCDS30 MAESSESFTMASSPAQRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GPLEEEEDGEELIGDGMERDYRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQR
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CCDS30 GPLEEEEDGEELIGDGMERDYRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGH
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CCDS30 DREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NYDGSLNTANGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 HEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDIL
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CCDS30 HEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 CVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL
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CCDS30 CVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 HLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSHDLKRKMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSHDLKRKMI
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LQQF
::::
CCDS30 LQQF
>>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (853 aa)
initn: 872 init1: 699 opt: 1064 Z-score: 969.5 bits: 190.5 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 1105; 33.2% identity (63.2% similar) in 704 aa overlap (170-830:29-724)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DEEDEERPARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGP----RLEI
: : .:. : : ..::: .:.
CCDS49 MLPRSPPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLA-AGMAGTVVLDDVEL
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 HHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAEL
.. ...: : . ..... .. .. ..:. :.:: .:: ... : : . :
CCDS49 REAQRDYLDFLDDEEDQGIYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEE
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEEL--RSLRQLHLNQLIRTSGVVT
: :..: . : .. : . ....: . ... :.: . :. .. . :.::
CCDS49 LVAFQRALKDFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVT
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360
pF1KA0 SCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVK-PGSC--P-ECQSAGPFEVNMEETI
.:. : :.. . : . .. .. . : :.: : . . .:.:... ..
CCDS49 KCSLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSV
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTA
:...: : ::: : :. ::.:::: :.:: ::::. ::::.....: :. . . .
CCDS49 YKDHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYT
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NGFPVFATVILANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK--DQQIGEKIFASIAPSIYG
.: .: ::..: .: :. .: : .. ::. : ..:: ...: ... :.::::.:
CCDS49 SG--TFRTVLIACNV-KQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHG
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 HEDIKRGLALALFGGEPKN-PGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFT
:. .:... :.:: .. .:.: .:::::.:: :::..::::.:.:. .. ::: :
CCDS49 HDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSH-IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPT
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQ
::.:.:.::::: : . : :::::.::::::: :::::::.:.:::.:::.:::
CCDS49 TGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQ
420 430 440 450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDT
..:.:::: . :.:::.:.:::::. :::: : ::. : . ..::::.: .. :
CCDS49 GRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQ
480 490 500 510 520 530
670 680 690 700
pF1KA0 VDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAM---PN---------------
.:: ::. .. :. : . :.... ... :::.. ::
CCDS49 MDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKH
540 550 560 570 580 590
710 720 730 740 750
pF1KA0 ---TYGVEPLPQEV-----LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLR-KESMATGS
.:.. ... .:::: :: ..: :.: . .:. :: :: ..::.. .
CCDS49 DNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDT
600 610 620 630 640 650
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 I---PITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRK
:.:.: .:..::.: :::. .. : .:.. :.... ... .: .. ::
CCDS49 ARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYF--KKVLEKEKKRK
660 670 680 690 700 710
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHN
.. : .:..:
CCDS49 KRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKT
720 730 740 750 760 770
>>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (818 aa)
initn: 872 init1: 699 opt: 1008 Z-score: 918.9 bits: 181.1 E(32554): 7.3e-45
Smith-Waterman score: 1048; 36.3% identity (65.4% similar) in 573 aa overlap (295-830:124-689)
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 EVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSM
:.: . :. .. . :.::.:. : :..
CCDS75 VASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKVVR
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVK-PGSC--P-ECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQE
. : . .. .. . : :.: : . . .:.:... ..:...: : :::
CCDS75 SVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYKDHQTITIQE
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 SPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVIL
: :. ::.:::: :.:: ::::. ::::.....: :. . . ..: .: ::..
CCDS75 MPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGYTSG--TFRTVLI
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490
pF1KA0 ANHVAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK--DQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALA
: .: :. .: : .. ::. : ..:: ...: ... :.::::.::. .:...
CCDS75 ACNV-KQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGHDYVKKAILCL
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 LFGGEPKN-PGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLT
:.:: .. .:.: .:::::.:: :::..::::.:.:. .. ::: :::.:.:.::::
CCDS75 LLGGVERDLENGSH-IRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTGRGSSGVGLT
340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 AYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIV
: : . : :::::.::::::: :::::::.:.:::.:::.::: ..:.::::
CCDS75 AAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGRVTIAKAGIH
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 TSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLAR
. :.:::.:.:::::. :::: : ::. : . ..::::.: .. : .:: ::. ..
CCDS75 ARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMDPEQDREISD
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710
pF1KA0 FVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAM---PN------------------TYGVEPLP
:. : . :.... ... :::.. :: .:..
CCDS75 HVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHDNLLHGTKKKK
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760
pF1KA0 QEV-----LKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLR-KESMATGSI---PITVRHI
... .:::: :: ..: :.: . .:. :: :: ..::.. . :.:.: .
CCDS75 EKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTARTSPVTARTL
570 580 590 600 610 620
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRD
:..::.: :::. .. : .:.. :.... ... .: .. :: .. : .:
CCDS75 ETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYF--KKVLEKEKKRKKRSEDESETED
630 640 650 660 670 680
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 NNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFR
..:
CCDS75 EEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQETKESQK
690 700 710 720 730 740
>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (719 aa)
initn: 926 init1: 628 opt: 988 Z-score: 901.6 bits: 177.7 E(32554): 6.7e-44
Smith-Waterman score: 1099; 35.2% identity (65.8% similar) in 600 aa overlap (214-798:76-637)
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMCKENRESLVVNYEDLAAR-EH
.: . .... . .: ::: . : . ::
CCDS56 VALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVLDVYIEH
50 60 70 80 90 100
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPK--YDRITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQL
: . : .. : . .. .:: . :. ... :. : : .: .:
CCDS56 RL---MMEQRSR-----DPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRV--IREVRAD
110 120 130 140 150
310 320 330 340 350
pF1KA0 HLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPG-SCP--ECQ-
...:. . :.:: . : :.. .. :.:..:. . :. : :: :::
CCDS56 SVGKLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQT
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 --SAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIEL
:.: . .. . . . ..:....:: .: .: .::: ... .. . .:::.. .
CCDS56 NRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSV
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460
pF1KA0 TGIYHNNY-DGSLNTANGFPVFATVILANHVAK----KDNKVAVGELTDEDVKMITSLSK
:::. : ....:. . : . :....: .:.. ..:::: :....:.
CCDS56 TGIFLPILRTGFRQVVQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQIA----
280 290 300 310 320
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 DQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAK
.... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::. : ::::.::
CCDS56 EEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINICLMGDPGVAK
330 340 350 360 370 380
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEF
::.:.::.... :. .:::.:.:.::::: : : :: : :::.:::::::.::: ::::
CCDS56 SQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEF
390 400 410 420 430 440
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 DKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDL
::: . :::.:::.::::.:::.::::.:.:.:::...::::: :::.: .. .:..:
CCDS56 DKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQL
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pF1KA0 TEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNT
..::::.: ...: : .: ::. . ..:..: . .: :.
CCDS56 PAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHI--TYVHQH-------------SRQP--PSQ
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pF1KA0 YGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSIPIT-VRHIE
. ::: ......:: . .:. .: . . : .. : ..:.:. :. . : .: .
CCDS56 F--EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLL
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pF1KA0 SMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFRRDN
...:.. : ::... : : ..::: :::.:
CCDS56 AILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRE
610 620 630 640 650 660
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.:::.. .:::. : ....:. . : . :....: .:.. ..:::: :.
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...:. .... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::.
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: ::::.::::.:.::.... :. .:::.:.:.::::: : : :: : :::.:::::::
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.::: ::::::: . :::.:::.::::.:::.::::.:.:.:::...::::: :::.:
CCDS56 QGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPR
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.. .:..: ..::::.: ...: : .: ::. . ..:..:
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. .: :. . ::: ......:: . .:. .: . . : .. : ..:.:. :. .
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: .: . ...:.. : ::... : : ..::: :::.:
CCDS56 TYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA
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CCDS56 DVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITF
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CCDS13 RPDLSKTTGKRTSEQTPQFLLSTKTPQSMQSTLDRFIPYKGWKLYFSEVYSDSSPLIEKI
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CCDS13 QAFEKFFTRHIDLYD----KDEI-----ERKGSILVDFKELTEGGEVTNLIPDIATELRD
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:: . : :.. . : :.. .. . ..: :::.:. . . .:
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CCDS13 KNVRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLCAACGEIQS-FPLPDGKYSLPTKCPV
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: . .::: . .: . .:.....: . .. .: . :.. .:. :
CCDS13 DTVTITGIVKVSNAEEANSISNSKGQKTKSSEDGCKHGM-------LMEFSLKDLYAIQE
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.. .... . : :. : :.::: .: ::::::::: : :... ::: ..:. ::
CCDS13 IQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGSQKYADDKNRIPIRGDPHILVVGD
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CCDS13 PGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVLGDQGIC
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::. . ..::::.. .. :: . .:..:.. :.. . : . :. .
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.. . . .: ..:. ..:.:...:.::: ::.. :.:.:. . .:
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.:::.:. .: :::.:..::.::..::.::..::. . ..:.. ...: :.. :
CCDS13 LELRKQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTEARARLELREEATKEDAEDIVEIMKYSMLGTYS
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CCDS13 DEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNVAERTYNNIFQFHQLRQIAKELNIQVAD
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CCDS13 GEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFG-LTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVL
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CCDS13 GIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLL
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CCDS13 FGGSRKRLPDGLTR-RGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTA
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:.: : ::.. .:.::.:::: :: ::::::: ..::..::::::::.:::.::::.:
CCDS13 SVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITT
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CCDS13 TLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKH
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CCDS13 VITLHVS-------------------ALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSA
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.:. . : .: ..: .:::::::..:...:.::: ....:. .. : :
CCDS13 EAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEAD
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CCDS13 VEEALRLFQVSTLDA-------ALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQL------KRRF
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CCDS13 AIGSQVSEHSII-KDFTKQKYPEHAIHKVLQL----MLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
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CCDS56 IGEYFNMFPSEVLTIFDSALRRSALTILQSLSQPEAVSMKQNLHARISGLPVCPEL--VR
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CCDS56 E-HIPKT-KDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVFVIKADFEQYYTFCRP
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CCDS56 SSCPSLESCDSSKFTCLSGLSSSPTRCRDYQEIKIQEQVQRLSVGSIPRSMKVILEDDLV
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CCDS56 DSCKSGDDLTIYGIVMQRWKPFQQDVR---CEVEIVLKANYIQVNNEQSSGIIMDEEVQK
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CCDS56 EFEDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLVKLAVAMVLAGGIQRTDATGTRVRGES
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CCDS56 HLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLTVTAVKD--SGEWNLEAGALV
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CCDS56 LADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNP-KGQY
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CCDS56 DPQESVSVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFILEN--KGYPSKSEKL---
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CCDS56 -----------------WSMEKMKTYFCLIRN-LQPTLSDVG-NQVLLRYYQMQRQSDCR
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.. :.: .::.::.::::::. .:: : .:. .. :: :. .. . ... .
CCDS56 NAARTTIRLLESLIRLAEAHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]