Result of FASTA (ccds) for pF1KA0012
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0012, 786 aa
  1>>>pF1KA0012 786 - 786 aa - 786 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7343+/-0.00139; mu= 13.2556+/- 0.082
 mean_var=118.1403+/-25.737, 0's: 0 Z-trim(100.9): 132  B-trim: 297 in 2/49
 Lambda= 0.117998
 statistics sampled from 6164 (6301) to 6164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.194), width:  16
 Scan time:  3.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4           ( 786) 5165 891.8       0
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4           ( 796) 3630 630.5 3.2e-180
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4          ( 811) 2509 439.7 9.2e-123
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4            ( 784) 1183 213.9   8e-55
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX          (1041)  514 100.1 1.9e-20
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX          (1059)  514 100.1   2e-20
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1           ( 858)  454 89.9   2e-17
CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9            ( 839)  410 82.4 3.5e-15
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX          (1049)  406 81.7 6.6e-15
CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3           (1032)  369 75.4 5.2e-13


>>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4                (786 aa)
 initn: 5165 init1: 5165 opt: 5165  Z-score: 4761.2  bits: 891.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5165; 99.9% identity (99.9% similar) in 786 aa overlap (1-786:1-786)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNISQNYISEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNISQNYISEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 WTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTVNLKHLD
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTVNLKHLD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 PEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHLDFSNNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHLDFSNNLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 WTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 TDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNID
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 QVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 CSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 KEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 EGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKL
              730       740       750       760       770       780

             
pF1KA0 TEQAKK
       ::::::
CCDS33 TEQAKK
             

>>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4                (796 aa)
 initn: 3630 init1: 2821 opt: 3630  Z-score: 3348.9  bits: 630.5 E(32554): 3.2e-180
Smith-Waterman score: 3630; 69.4% identity (88.0% similar) in 777 aa overlap (5-781:12-786)

                      10        20        30        40        50   
pF1KA0        MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
                  :::. ....:.  :::.:. .:: ::.:: :::::::::  :: .:..:
CCDS34 MTKDKEPIVKSFHFVCLMIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMS
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KA0 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPT
       ::::.:: .::.  ::.: .: .::: :: ::.:::::::.:::::::::.: :::::: 
CCDS34 QNYIAELQVSDMSFLSELTVLRLSHNRIQLLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHPI
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KA0 VNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGE
       :...::::::: : ::::::::::.:::.:::::. .:.: ..::::::..: .:: : .
CCDS34 VSFRHLDLSFNDFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRN
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KA0 TYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYF
        : .... :.:: .:...::.::  .. : . ...::.:.. :.:.:::  :.:..:. :
CCDS34 YYIKENETESLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIK--LNDDNCQVF
              190       200       210       220         230        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KA0 LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFD
       ...:..:  .  : :.:::.:::::. ..:..:..:   : :..: :. .  ..  .:: 
CCDS34 IKFLSELTRGSTLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNIYNLTIIESIREEDFT
      240       250       260       270       280       290        

           300       310       320       330       340       350   
pF1KA0 YSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLHL
       :: :.::::.:......:: : :. .: .::.:::  .:.: : ..:::::   : :  :
CCDS34 YSKTTLKALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFL
      300       310       320       330       340       350        

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA0 DFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD
       .:..:..::..::.:. :..::::::: : ::.: :.. :: .: ::. ::.: ::.   
CCDS34 NFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWNSLESG
      360       370       380       390       400       410        

           420       430       440       450       460       470   
pF1KA0 EKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQEL
       ..: .:.:..:.. ::.:::.:::..::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 RHKENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVPKQVVKLEALQEL
      420       430       440       450       460       470        

           480       490       500       510       520       530   
pF1KA0 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS34 NVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELR
      480       490       500       510       520       530        

           540       550       560       570       580       590   
pF1KA0 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL
       :::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::: ::::::
CCDS34 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNITLLIVTIGATMLVL
      540       550       560       570       580       590        

           600       610       620       630       640       650   
pF1KA0 AVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKN
       :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::.
CCDS34 AVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSAWVKS
      600       610       620       630       640       650        

           660       670       680       690       700       710   
pF1KA0 ELLPNLEKEGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF
       ::.: :::: .::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELVPYLEKEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYF
      660       670       680       690       700       710        

           720       730       740       750       760       770   
pF1KA0 AHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLR
       :::::::::::.::::::::::: :::..:::::.::..::::.::::::::::::::.:
CCDS34 AHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIR
      720       730       740       750       760       770        

           780           
pF1KA0 AAINIKLTEQAKK     
       ::.:.:::          
CCDS34 AAFNMKLTLVTENNDVKS
      780       790      

>>CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4               (811 aa)
 initn: 2473 init1: 604 opt: 2509  Z-score: 2317.5  bits: 439.7 E(32554): 9.2e-123
Smith-Waterman score: 2509; 49.6% identity (77.1% similar) in 787 aa overlap (1-780:4-779)

                  10        20        30        40        50       
pF1KA0    MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNISQNYI
          . .:. :  : :       .: :: :.... :. .: .:: ::.  :: :..: : .
CCDS34 MRLIRNIYIFCSIVMTAEGDAPELPEERELMTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLSYNLL
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KA0 SELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTVNLK
        .: .::. :.::::.::. :: :: ::...:.::.::.:::::.:.: ... .  ..:.
CCDS34 FQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLKTFEFNKELRYLDLSNNRLKSVTWYLLAGLR
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KA0 HLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGE
       .:::::: ::..:::.: ::::.:..:::: ....::.   ::::... :.  ::     
CCDS34 YLDLSFNDFDTMPICEEAGNMSHLEILGLSGAKIQKSDFQKIAHLHLNTVF--LGFRTLP
              130       140       150       160       170          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KA0 KEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSIL
       . .  .:  .:: .::::.: . .:  .:  ..::   ::..::     :.: : :.:  
CCDS34 HYEEGSLPILNTTKLHIVLPMDTNFWVLLRDGIKTSKILEMTNI-----DGK-SQFVSYE
      180       190       200       210       220             230  

       240          250       260       270       280         290  
pF1KA0 AKLQT---NPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQ--LDFRDF
        . .    : : : : ::...  :.... :::.::::.: .:.: :: . :.  ::  .:
CCDS34 MQRNLSLENAKTSVLLLNKVDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQIRNVTFGGKAYLDHNSF
            240       250       260       270       280       290  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA0 DYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFLH
       :::.: ........:   :: . :. :: ....:.:.:.:.:...: ::: :.  . : .
CCDS34 DYSNTVMRTIKLEHVHFRVFYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQMPHMLFPNYPTKFQY
            300       310       320       330       340       350  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA0 LDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSY
       :.:.::.::: .:.   .: .:.::::. :.:. :: .. ....   :..::.::: ...
CCDS34 LNFANNILTDELFKRTIQLPHLKTLILNGNKLETLSLVSCFANNTP-LEHLDLSQNLLQH
            360       370       380       390        400       410 

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA0 DEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEALQE
        . . .::: ......:.: : :.:..:::::  :..:::..:.:...::....: ::.:
CCDS34 KNDE-NCSWPETVVNMNLSYNKLSDSVFRCLPKSIQILDLNNNQIQTVPKETIHLMALRE
              420       430       440       450       460       470

            480       490       500       510       520       530  
pF1KA0 LNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCEL
       ::.::: :::::::. :: :::: :. : .  :: :: ::::......:: :::.:::::
CCDS34 LNIAFNFLTDLPGCSHFSRLSVLNIEMNFILSPSLDFVQSCQEVKTLNAGRNPFRCTCEL
              480       490       500       510       520       530

            540       550       560       570       580       590  
pF1KA0 GEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLV
        .:.. ..  :  .. :: ::: :.:: . ::: ::: :. ::::: .:::::::. :::
CCDS34 KNFIQ-LETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLKDVHLHELSCNTALLIVTIVVIMLV
               540       550       560       570       580         

            600       610       620       630       640       650  
pF1KA0 LAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVK
       :...:.  : ..::::::::. : ::: .:.:.   :.:.::..:::::::: :::.:::
CCDS34 LGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHDSLWVK
     590       600       610       620       630       640         

            660         670       680       690       700       710
pF1KA0 NELLPNLEKE--GMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYE
       :::.::::::  .. :::.:  : ::::: :::.. :::::::::::::::::.::::::
CCDS34 NELIPNLEKEDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNEWCHYE
     650       660       670       680       690       700         

              720       730       740       750       760       770
pF1KA0 LYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWA
       .::::::::::.:. .::::::::: : ::. :::::.:. ...::::::.. : :::::
CCDS34 FYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKCGLFWA
     710       720       730       740       750       760         

              780                                
pF1KA0 NLRAAINIKLTEQAKK                          
       :::::::...                                
CCDS34 NLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTDCL
     770       780       790       800       810 

>>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4                 (784 aa)
 initn: 975 init1: 467 opt: 1183  Z-score: 1097.7  bits: 213.9 E(32554): 8e-55
Smith-Waterman score: 1249; 30.2% identity (65.3% similar) in 775 aa overlap (21-776:28-782)

                      10        20        30        40        50   
pF1KA0        MTSIFHFAIIFMLILQIRIQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNIS
                                  :: . . .   :...:  .:. :.. .  :..:
CCDS37 MPHTLWMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLS
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KA0 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISC---
       .: :. . .::.    .:. :... : :. .. . :.    ::.::::.: : ..:    
CCDS37 NNRITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSNLSSSWF
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150        160         
pF1KA0 HPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTH-LEKSSVLPIAHLNISKVLL
       .:  .:  :.:  : . .:   . :.....:..: ...   . : .   .: :.. . : 
CCDS37 KPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRKDFAGLTFLEELE
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA0 VLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCV-LEDN
       .   .  .. .:..:..... : :...   :.  ..:.. : ..     :...:. :.:.
CCDS37 I-DASDLQSYEPKSLKSIQNVS-HLILHM-KQHILLLEIFVDVT-----SSVECLELRDT
               190       200         210       220            230  

      230        240       250       260       270        280      
pF1KA0 KCSYF-LSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTT-VWYFSISNVKLQGQ
         . : .: :.  .::  ....:. :.. : .:......:. . . .  . ...  :.: 
CCDS37 DLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTLNGV
            240       250       260       270       280       290  

        290       300       310       320            330       340 
pF1KA0 LDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNM-----NIKNFTVSGTRMVHM
        .::  : .   .   ... ..   . .:. :..  .:..      .: .:: ....  .
CCDS37 GNFRASD-NDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVFLV
             300       310       320       330       340       350 

               350       360          370       380       390      
pF1KA0 LC--PSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFEN--C-GHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQ
        :   .... . .::.:.::...  ..:  :      :.::::..:.:  : : .:    
CCDS37 PCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGETLLT
             360       370       380       390       400       410 

        400       410       420       430       440       450      
pF1KA0 MKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLPPRIKVLDLHSNK
       .:.: ..:::.::  .      :.: ...  ::.::. .  ..  :.:  ...::. .:.
CCDS37 LKNLTNIDISKNS--FHSMPETCQWPEKMKYLNLSSTRI-HSVTGCIPKTLEILDVSNNN
             420         430       440        450       460        

        460       470       480       490       500       510      
pF1KA0 IKSIPKQVVKLEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKM
       .. .    ..:  :.:: .. :.:  ::  . .  : :: :..:...  : . ..: . .
CCDS37 LNLFS---LNLPQLKELYISRNKLMTLPDASLLPMLLVLKISRNAITTFSKEQLDSFHTL
      470          480       490       500       510       520     

        520       530       540       550       560       570      
pF1KA0 RSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELS
       ....:: : : :.::.  :... .:. ..::  :: .: :: :   ::  ..: ..:   
CCDS37 KTLEAGGNNFICSCEFLSFTQE-QQALAKVLIDWPANYLCDSPSHVRGQQVQDVRLSVSE
         530       540        550       560       570       580    

        580       590       600       610       620       630      
pF1KA0 CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQ
       :. : :.  .  ....: . .  ::  .   ::..:.  : :..:. :. :    .::. 
CCDS37 CHRTALVSGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQAKRKPRKAP----SRNIC
          590       600       610       620       630           640

        640       650       660         670       680       690    
pF1KA0 FHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLEKEG--MQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSI
       . ::.::: .:..::.: .. .::. .  ...:::.:.:.::: :..:::  ::::.:..
CCDS37 YDAFVSYSERDAYWVENLMVQELENFNPPFKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTV
              650       660       670       680       690       700

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA0 FVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRT
       :::: :::.::::.::: :.:  :: :.... :::::::: . .::. . ::...:  .:
CCDS37 FVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKT
              710       720       730       740       750       760

          760       770       780      
pF1KA0 YLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK
       ::::: ....:  ::.::::::          
CCDS37 YLEWPMDEAQREGFWVNLRAAIKS        
              770       780            

>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX               (1041 aa)
 initn: 459 init1: 181 opt: 514  Z-score: 480.5  bits: 100.1 E(32554): 1.9e-20
Smith-Waterman score: 604; 26.4% identity (57.0% similar) in 774 aa overlap (84-786:276-1029)

            60        70        80        90         100       110 
pF1KA0 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQ--ELEYLDLSHNKLVKISCH
                                     ..:. : :..  .:.::.:: ..: ::.  
CCDS14 INLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAA
         250       260       270       280       290       300     

                120       130        140       150       160       
pF1KA0 PTVNLKHL---DLSFNAFDALPICKEFGNM-SQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKV
          :. ::   :: :: . .      : .:  .:..: :: .... :   :  :.:::. 
CCDS14 WFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGS--YP-QHINISRN
         310       320       330       340       350          360  

          170              180           190       200       210   
pF1KA0 ---LLVL------GETYGE-KED---P-EGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTV
          :: :      : .. : .::   :   : ...: .: : :  . .:... . :   .
CCDS14 FSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFSNLEI
            370       380       390       400       410       420  

           220       230       240       250       260          270
pF1KA0 ANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRIL---QLVWH
         :  . :. ...:.. ::  :   . .   . :.    . ....  : : :   : . .
CCDS14 IYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAY
            430       440       450       460       470       480  

              280       290        300         310       320       
pF1KA0 TTVWYFSISNVKLQGQLDFRDF-DYSGTSLKALSIHQVVS--DVFGFPQSYIYEIFSN-M
         .  .:.... . :  .:... : .  .:.: :  ::.:  .  ..:.    .. .: .
CCDS14 GKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRL
            490       500       510       520       530       540  

        330        340       350              360       370        
pF1KA0 NIKNFT-VSGTRMVHMLCPSKISPFL-------HLDFSNNLLTDTVFENCGH-----LTE
       .. : . ..    ...:  :  : ..       ::.: .:. .  :. : .:     ::.
CCDS14 DFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVL-NLSHNNIYTLTD
            550       560       570       580        590       600 

                   380            390       400       410       420
pF1KA0 ---LET-----LILQMNQLKEL-----SKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCS
          ::.     :... :.:  :     ..   .   .:.: .::.: : ...  ...  .
CCDS14 KYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLN
             610       620       630       640       650       660 

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pF1KA0 WTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLP--PRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEA-LQELNVAF
          ::  :....:.:    .  :   ::...:::..::.  .  ..  . . :. : .. 
CCDS14 LPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSH
             670       680       690       700       710       720 

       480         490       500         510       520       530   
pF1KA0 NSLTDLP-GCGS-FSSLSVLIIDHNSVS--HPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG
       : .. :: :  :  :::. : .. : ..  . ::   ..  :.  ..   :::.:::..:
CCDS14 NRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIG
             730       740       750       760       770       780 

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pF1KA0 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTI----VAT
       .: . .:.  .  .    :   :  : . ::  . .....    ..: .:. .    ..:
CCDS14 DFRRWMDEHLNVKIPRLVDVI-CASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITT
             790       800        810       820       830       840

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pF1KA0 MLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFH-AFISYSGHDS
       :..::. .  :  : :. :..  ::        :.    . :. .  :. :.:::. .:.
CCDS14 MVMLAALAHHLF-YWDV-WFIYNVCL-------AKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
              850         860              870       880       890 

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pF1KA0 F---WVKNELLPNLEK---EGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFV
           :: :::  .::.   ... .::.::.. :: .:..:..  :..: :..:::. ...
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
             900       910       920       930       940       950 

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pF1KA0 QSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEK
       .:   .  .:.: . :. :. . .:.:::::. :.:   .: .:.. . . . :.:: . 
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWPDNP
             960       970       980          990      1000        

            770       780                  
pF1KA0 SKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK            
       . .:::: .::   :. :::. ..            
CCDS14 KAEGLFWQTLR---NVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
     1010         1020      1030      1040 

>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX               (1059 aa)
 initn: 459 init1: 181 opt: 514  Z-score: 480.3  bits: 100.1 E(32554): 2e-20
Smith-Waterman score: 604; 26.4% identity (57.0% similar) in 774 aa overlap (84-786:294-1047)

            60        70        80        90         100       110 
pF1KA0 QNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQ--ELEYLDLSHNKLVKISCH
                                     ..:. : :..  .:.::.:: ..: ::.  
CCDS14 INLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAA
           270       280       290       300       310       320   

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pF1KA0 PTVNLKHL---DLSFNAFDALPICKEFGNM-SQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKV
          :. ::   :: :: . .      : .:  .:..: :: .... :   :  :.:::. 
CCDS14 WFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGS--YP-QHINISRN
           330       340       350       360       370          380

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pF1KA0 ---LLVL------GETYGE-KED---P-EGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTV
          :: :      : .. : .::   :   : ...: .: : :  . .:... . :   .
CCDS14 FSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLFQNFSNLEI
              390       400       410       420       430       440

           220       230       240       250       260          270
pF1KA0 ANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRIL---QLVWH
         :  . :. ...:.. ::  :   . .   . :.    . ....  : : :   : . .
CCDS14 IYLSENRISPLVKDTRQSYANSSSFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPLIKPQCAAY
              450       460       470       480       490       500

              280       290        300         310       320       
pF1KA0 TTVWYFSISNVKLQGQLDFRDF-DYSGTSLKALSIHQVVS--DVFGFPQSYIYEIFSN-M
         .  .:.... . :  .:... : .  .:.: :  ::.:  .  ..:.    .. .: .
CCDS14 GKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRL
              510       520       530       540       550       560

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pF1KA0 NIKNFT-VSGTRMVHMLCPSKISPFL-------HLDFSNNLLTDTVFENCGH-----LTE
       .. : . ..    ...:  :  : ..       ::.: .:. .  :. : .:     ::.
CCDS14 DFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVL-NLSHNNIYTLTD
              570       580       590       600        610         

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pF1KA0 ---LET-----LILQMNQLKEL-----SKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCS
          ::.     :... :.:  :     ..   .   .:.: .::.: : ...  ...  .
CCDS14 KYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLN
     620       630       640       650       660       670         

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pF1KA0 WTKSLLSLNMSSNILTDTIFRCLP--PRIKVLDLHSNKIKSIPKQVVKLEA-LQELNVAF
          ::  :....:.:    .  :   ::...:::..::.  .  ..  . . :. : .. 
CCDS14 LPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSH
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pF1KA0 NSLTDLP-GCGS-FSSLSVLIIDHNSVS--HPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELG
       : .. :: :  :  :::. : .. : ..  . ::   ..  :.  ..   :::.:::..:
CCDS14 NRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIG
     740       750       760       770       780       790         

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pF1KA0 EFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNITLLIVTI----VAT
       .: . .:.  .  .    :   :  : . ::  . .....    ..: .:. .    ..:
CCDS14 DFRRWMDEHLNVKIPRLVDVI-CASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITT
     800       810       820        830       840       850        

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pF1KA0 MLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFH-AFISYSGHDS
       :..::. .  :  : :. :..  ::        :.    . :. .  :. :.:::. .:.
CCDS14 MVMLAALAHHLF-YWDV-WFIYNVCL-------AKVKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDA
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pF1KA0 F---WVKNELLPNLEK---EGMQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFV
           :: :::  .::.   ... .::.::.. :: .:..:..  :..: :..:::. ...
CCDS14 SVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYA
     910       920       930       940       950       960         

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pF1KA0 QSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEK
       .:   .  .:.: . :. :. . .:.:::::. :.:   .: .:.. . . . :.:: . 
CCDS14 KSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHS---QYLRLRQRICKSSILQWPDNP
     970       980       990      1000         1010      1020      

            770       780                  
pF1KA0 SKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK            
       . .:::: .::   :. :::. ..            
CCDS14 KAEGLFWQTLR---NVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
       1030         1040      1050         

>>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1                (858 aa)
 initn: 309 init1: 137 opt: 454  Z-score: 426.5  bits: 89.9 E(32554): 2e-17
Smith-Waterman score: 512; 23.6% identity (56.0% similar) in 736 aa overlap (89-785:141-845)

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA0 ELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTV----
                                     :.  . :  ::::.:.. ..  ::.     
CCDS31 HPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLN
              120       130       140       150       160       170

          120       130       140          150        160          
pF1KA0 NLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQ---LKFLGLSTTHL-EKSSVLPIAHLNISK--VL
       .:: .:.: : .  . .:..  .  :   :.:..:... :  . ::     .:  .  ::
CCDS31 SLKSIDFSSNQI--FLVCEHELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVL
              180         190       200       210       220        

      170        180               190       200       210         
pF1KA0 LVLGET-YGEKEDPEG--------LQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELS
        .:  .  :   :  :         : :.    : .. ..  :: : : . .: :.:  :
CCDS31 EILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNTFAGLARS
      230       240       250       260       270       280        

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA0 NIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWH--TTVWYFS
       ... .  : . .. .:. ...  .  :..: . :.  ..:.. .: . ...   ..  ..
CCDS31 SVRHL--DLSHGFVFSLNSRVFET--LKDLKVLNL--AYNKINKIADEAFYGLDNLQVLN
      290         300       310           320       330       340  

       280       290       300       310       320       330       
pF1KA0 ISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSGTR
       .:  .: :.:   .: :.  ..  .....   . ... :.  .... ...  ..  ..  
CCDS31 LS-YNLLGELYSSNF-YGLPKVAYIDLQK---NHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALT
             350        360          370       380       390       

       340       350       360       370       380       390       
pF1KA0 MVHMLCPSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQM
        .:.. ::  . ::  .   .:   ..  :  ::.:        :.:..:. :  .  ..
CCDS31 TIHFI-PSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSE--------NRLENLD-ILYFLLRV
       400        410       420       430                440       

       400       410       420       430               440         
pF1KA0 KSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILT---DT-----IFRCLPPRIKV
         :: : ..::  :        : . :: .: .. :.:    .:     .:. :  ...:
CCDS31 PHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLS-HLQV
       450       460       470       480       490       500       

     450       460        470       480       490       500        
pF1KA0 LDLHSNKIKSIPKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSAD
       : :. : ..:.:  : . : ::. :..  : :: :      ..: .: :..:..  :. :
CCDS31 LYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPD
        510       520       530       540       550       560      

      510       520       530       540       550       560        
pF1KA0 FFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLK
        : :   .  .    : : : :::. :.. ... .. .. : : .  : ::.:. :. : 
CCDS31 VFVS---LSVLDITHNKFICECELSTFINWLNH-TNVTIAGPPADIYCVYPDSFSGVSL-
        570          580       590        600       610       620  

      570       580       590         600         610       620    
pF1KA0 DFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL-AVTVTS-LCSYLDLPWY--LRMVCQWTQTRRRAR
        : .:  .:.   .. ..  ..... .::.:  : . : .  .  . ..:  :  :   .
CCDS31 -FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFK
              630       640       650       660       670       680

          630       640       650       660            670         
pF1KA0 NIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE-----KEGMQICLHERNFVPGKSI
       . :        .. :.. .:..:  ::.: :: .:.     .. ...:..::.::::.. 
CCDS31 DHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENR
              690       700       710       720       730       740

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA0 VENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSI
       . ::   : .: : . ..: .:... ::   . .:.   . . ...::....  . ::..
CCDS31 IANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL
              750       760       770       780       790       800

     740       750       760       770       780                  
pF1KA0 PSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK            
         ......... .. ::.::.. .  : :  .:   :  :  :. :             
CCDS31 -MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS
               810       820       830       840       850        

>>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9                 (839 aa)
 initn: 417 init1: 135 opt: 410  Z-score: 386.1  bits: 82.4 E(32554): 3.5e-15
Smith-Waterman score: 587; 25.8% identity (56.0% similar) in 771 aa overlap (49-776:82-815)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KA0 IQLSEESEFLVDRSKNGLIHVPKDLSQKTTILNISQNYISELWTSDILSLSKLRILIISH
                                     .:..:.  :. .  .   :::.:  ::.. 
CCDS68 LPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYSFFSFPELQVLDLSRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTG
              60        70        80        90       100       110 

       80        90       100       110          120       130     
pF1KA0 NTIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTVNLK---HLDLSFNAFDALPICKEF
       : :: : ...:.  . :. :   ...:...   :  .::   .:... : .... . . :
CCDS68 NPIQSLALGAFSGLSSLQKLVAVETNLASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYF
             120       130       140       150       160       170 

         140       150       160       170       180          190  
pF1KA0 GNMSQLKFLGLSTTHLEKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKEDPEGLQD---FNTESL
       .:...:. : ::......   .  . : . . . .:. .   . .: .. .   :.   :
CCDS68 SNLTNLEHLDLSSNKIQS---IYCTDLRVLHQMPLLNLSLDLSLNPMNFIQPGAFKEIRL
             180          190       200       210       220        

             200       210       220            230       240      
pF1KA0 H-IVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLELSNIKCVL-----EDNKCSYFLSILAKLQTNPKL
       : ... .: .   .. . .. .:.::.  .  ::     : :  ..  : :  :  :  .
CCDS68 HKLTLRNNFDSLNVMKTCIQGLAGLEVHRL--VLGEFRNEGNLEKFDKSALEGL-CNLTI
      230       240       250         260       270       280      

        250       260       270       280       290        300     
pF1KA0 SNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWHTTVWYFSISNVKLQGQLDFR-DFDYSGTSLKALSIH
        .. :  ..   ...: ... .  :.:  ::. .: ..   ::  .: ..   :   .. 
CCDS68 EEFRLAYLDYYLDDIIDLFNCL--TNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFG
         290       300         310       320       330       340   

               310       320       330          340           350  
pF1KA0 QVVS------DVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFT---VSGTRMVHMLCPSK----ISPFLH
       :  .        . : ..   . ::.... ..    .: . .    : :.     . . .
CCDS68 QFPTLKLKSLKRLTFTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKY
           350       360       370       380       390       400   

            360       370       380       390       400         410
pF1KA0 LDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNS--V
       ::.: : .  :.  :   : .:: : .: ..::..:... .  ....:  ::::..   :
CCDS68 LDLSFNGVI-TMSSNFLGLEQLEHLDFQHSNLKQMSEFS-VFLSLRNLIYLDISHTHTRV
           410        420       430       440        450       460 

              420       430           440       450       460      
pF1KA0 SYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNILTDT----IFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSI-PKQVV
       ...   :  .  .::  :.:..: . ..    ::  :   .  ::: . ..... :    
CCDS68 AFN---GIFNGLSSLEVLKMAGNSFQENFLPDIFTELR-NLTFLDLSQCQLEQLSPTAFN
                470       480       490        500       510       

         470          480        490       500       510        520
pF1KA0 KLEALQELNVAFN---SLTDLP-GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSC-QKMRSIK
       .: .:: ::.. :   ::  .:  :  ..::.::  . : .   . . .:   ...  ..
CCDS68 SLSSLQVLNMSHNNFFSLDTFPYKC--LNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAFLN
       520       530       540         550       560       570     

              530       540       550       560       570       580
pF1KA0 AGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTLLKDFHMSELSCNIT
         .: : ::::   :.. : .  . ..:   . ..:  : . .:       :  :: :::
CCDS68 LTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLVE--VERMECATPSDKQG-------MPVLSLNIT
         580       590       600         610              620      

              590       600       610       620        630         
pF1KA0 LLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWYLRMVCQWTQTRR-RARNIPLEELQRNLQFHA
         .   .  . ::.: :.:. . :   .:....      .  :..::          . :
CCDS68 CQMNKTIIGVSVLSVLVVSVVAVLVYKFYFHLMLLAGCIKYGRGENI----------YDA
        630       640       650       660       670                

     640       650       660          670       680        690     
pF1KA0 FISYSGHDSFWVKNELLPNLEKEGM---QICLHERNFVPGKSIVENII-TCIEKSYKSIF
       :. ::..:  ::.:::. ::: ::.   :.::: :.:.:: .:. :::   ..:: : : 
CCDS68 FVIYSSQDEDWVRNELVKNLE-EGVPPFQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKSRKVIV
        680       690        700       710       720       730     

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 VLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQYSIPSSYHKLKSLMARRTY
       :.: .:.::.:: .:  .:.   :  .  ..:.:.:. . . ..  .  .:  :..: ::
CCDS68 VVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEK-TLLRQQVELYRLLSRNTY
         740       750       760       770        780       790    

         760       770       780                    
pF1KA0 LEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK              
       :::      : .::  :: :.                        
CCDS68 LEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI
          800       810       820       830         

>>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX               (1049 aa)
 initn: 382 init1: 171 opt: 406  Z-score: 381.0  bits: 81.7 E(32554): 6.6e-15
Smith-Waterman score: 525; 24.5% identity (55.2% similar) in 803 aa overlap (67-776:288-1033)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KA0 IHVPKDLSQKTTILNISQNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNTIQYLDISVFKFNQELE
                                     .:..:..: .  :..:..    ::  ..:.
CCDS14 GNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPRWFKNINKLQ
       260       270       280       290       300       310       

        100            110       120       130       140       150 
pF1KA0 YLDLSHNKLVK-IS----CHPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHL
        ::::.: :.: :.     :   .: .:::::: :. : . .   :.::  : .:..   
CCDS14 ELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFN-FE-LQVYRASMNLSQ-AFSSLKSL--
       320       330       340       350         360        370    

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA0 EKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVK
                     :.: . : .. :      :..::   :: .   : :   .::....
CCDS14 --------------KILRIRGYVFKE------LKSFNLSPLHNL--QNLE---VLDLGTN
                          380             390         400          

             220       230       240       250        260          
pF1KA0 TVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTL-NNIETTWNSF-IRILQLVW
        .   .:: .:   . .. . .   . :.. .   :.. . .: .:. .:.  ..:. . 
CCDS14 FIKIANLSMFK---QFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQL-
       410          420       430       440       450       460    

     270       280       290       300           310       320     
pF1KA0 HTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLKALSIHQVV----SDVFGFPQSYIYEIFSN
       :    ::  ..   . ..  .. .. ... .  .  :..    ...: : .:  .. .: 
CCDS14 H----YFRYDKYARSCRFKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIF-FVKSSDFQHLSF
               470       480       490       500        510        

         330       340       350             360       370         
pF1KA0 MNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFL---HLDFSNN---LLTDTVFENCGHLTELETLIL
       .  : ...::. . . :  :...:.    .::::::   :: .:.::.   : .::.: .
CCDS14 L--KCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEE---LHKLEVLDI
        520       530       540       550       560          570   

     380           390       400       410                         
pF1KA0 QMN----QLKELSKIAEMTTQMKSLQQLDISQNSVSYD-------------EKKG---DC
       . :    : . .... ..: ..: ::.: ...:..: .             : .:   : 
CCDS14 SSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDV
           580       590       600       610       620       630   

     420                    430          440       450       460   
pF1KA0 SWT----------KSLLSL---NMSSNILT---DTIFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSIP-K
        :           :.::.:   ..:.: :.   . .:  .:: .: :.: .: .::.  :
CCDS14 LWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWK
           640       650       660       670       680       690   

            470       480           490       500       510        
pF1KA0 QVVKLEALQELNVAFNSLTDLP----GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRS
       ..  :. :. :... :.:: .:    .:.   ::. ::. .:..   .  :.:.  ..: 
CCDS14 KLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSNCS--RSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRY
           700       710       720         730       740       750 

      520                                 530       540       550  
pF1KA0 IKAGDNPFQ--------------------------CTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPD
       .  ..: .:                          :::.   ::  ....   .     :
CCDS14 LDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATD
             760       770       780       790       800       810 

            560         570        580       590       600         
pF1KA0 SYKCDYPESYRG--TLLKDFHMSELS-CNITLLIVTIVATMLVLAVTVTSLCSYLDLPWY
          :  : ...:  ..  :..  ::.  :. :. ..: ........ ..:   . :. ::
CCDS14 -VTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WY
              820       830       840       850       860          

     610       620       630       640          650       660      
pF1KA0 LRMVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHD---SFWVKNELLPNLE---KEG
       .   :. .. .   : :     . .  . ::: :. .:   . ::  ::. .::   .. 
CCDS14 IYHFCK-AKIKGYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKH
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       ...::.::...::. ..::.   :. : :..::.. .....:  .  .:..:. :. :  
CCDS14 FNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKV
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       . .:::.::   :    :.. .:.. .   . :::: . . .  ::  :. :.       
CCDS14 DVIILIFLEKPFQ---KSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVA
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CCDS14 YSQVFKETV
                

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        .:. ::::.: : :      . .  ..:..:.::::     .:  : .   ::..  ::
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CCDS28 ELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLR-LQMNFINQAQLGIFRAF--PGLRYVDLSD
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CCDS28 NRISGASELTA-TMGEADGGEKVWLQPGDLAPAPVDTPSSEDFRPNCSTLNFT-LDLSRN
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       ... .   ...  . .  . .:.  ..  ..  .:    :.:..:.. .   :..   .:
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        .    : .. ..: . : ..:.     .  ...  . ::....: . . : .. :.  :
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CCDS28 SLRALDFSGNALGHMWAEGDLYLHFFQGLSGLIWLDLSQNRLHTLLPQTLRNLPKSLQVL
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        . .: :.   .  :   :...:::: .:..:.. .  .   . :..:.:. ::.. . :
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CCDS28 GFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGPLASALQILDVSANPLHCACG-AAFMDFLLEV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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