Result of FASTA (omim) for pF1KB9538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9538, 352 aa
  1>>>pF1KB9538 352 - 352 aa - 352 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0868+/-0.000868; mu= 9.3741+/- 0.053
 mean_var=324.5577+/-66.782, 0's: 0 Z-trim(109.8): 2031  B-trim: 113 in 2/49
 Lambda= 0.071192
 statistics sampled from 15709 (18017) to 15709 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.211), width:  16
 Scan time:  7.270

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1218 140.2 1.1e-32
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1218 140.2 1.1e-32
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1218 140.3 1.1e-32
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1218 140.3 1.1e-32
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1211 139.6 1.9e-32
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 1211 139.7   2e-32
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 1211 139.7   2e-32
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1211 139.7 2.1e-32
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 1211 139.7 2.1e-32
NP_001007089 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 620) 1200 138.4   4e-32
NP_008893 (OMIM: 314993) zinc finger protein 182 i ( 639) 1200 138.4 4.1e-32
NP_001171570 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 639) 1200 138.4 4.1e-32
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1192 137.5 6.5e-32
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1192 137.5 6.5e-32
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1192 137.5 6.5e-32
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1192 137.5 6.5e-32
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1192 137.6 7.2e-32
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1192 137.7 7.4e-32
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1192 137.7 7.4e-32
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1192 137.7 7.4e-32
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1192 137.7 7.4e-32
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1192 137.7 7.6e-32
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1192 137.7 7.6e-32
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1192 137.7 7.6e-32
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1192 137.7 7.6e-32


>>NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 is  (568 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 708.1  bits: 140.2 E(85289): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:240-540)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
NP_001 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
     210       220       230       240       250       260         

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
NP_001 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
     270       280       290       300       310       320         

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
NP_001 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
     330       340       350       360       370       380         

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
NP_001 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
     390       400       410       420       430       440         

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
NP_001 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
     450       460       470       480       490       500         

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
NP_001 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
     510       520       530       540       550       560        

>>NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 isofo  (604 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 707.8  bits: 140.2 E(85289): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:276-576)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
NP_443 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
         250       260       270       280       290       300     

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
NP_443 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
         310       320       330       340       350       360     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
NP_443 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
         370       380       390       400       410       420     

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
NP_443 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
         430       440       450       460       470       480     

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
NP_443 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
         490       500       510       520       530       540     

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
NP_443 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
         550       560       570       580       590       600    

>>XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger pro  (609 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 707.8  bits: 140.3 E(85289): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:281-581)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
XP_011 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
              260       270       280       290       300       310

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
XP_011 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
              320       330       340       350       360       370

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
XP_011 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
              380       390       400       410       420       430

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
XP_011 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
              440       450       460       470       480       490

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
XP_011 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
              500       510       520       530       540       550

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
XP_011 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
              560       570       580       590       600         

>>NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 is  (620 aa)
 initn: 1173 init1: 1173 opt: 1218  Z-score: 707.7  bits: 140.3 E(85289): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 1218; 56.5% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (56-352:292-592)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB9 ERGDLFGKALNLNTDFVSLRQVPYKYDLYEKTLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKA
                                     :..  .:.:.  .: ..::.  .:.  :::
NP_001 CGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKA
             270       280       290       300       310       320 

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB9 L---LYLK-QEKTHSGVEYSEYNKSGKALSHKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFK
       .   ..:  ...::.: .  . .. :::.:.:.... ::....  .:. :. : :::: :
NP_001 FSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQK
             330       340       350       360       370       380 

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB9 SLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLI
       : :: :.:::::::::::  : :.::.:..:: :.: ::::::.:: :::::: ..:.::
NP_001 SPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLI
             390       400       410       420       430       440 

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB9 VHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQK
       .:.: :  .:::.:..: ..:..: :: ::: .::::.::::.::.::: .::.:::::.
NP_001 IHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQR
             450       460       470       480       490       500 

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB9 IHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTG
        ::::: :.::::::.: :.:.:: :.: ::::::: ::::::.:::.: :  : :::::
NP_001 THTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTG
             510       520       530       540       550       560 

             330       340       350                              
pF1KB9 EKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP                            
       :::: :.:::::::.:: : .:::.: ::.:                            
NP_001 EKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
             570       580       590       600       610       620

>>NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 703.4  bits: 139.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
        220       230       240       250       260       270      

         60        70        80             90       100       110 
pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
        280       290       300       310        320       330     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
         340       350       360       370       380       390     

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
         400       410       420       430       440       450     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
         460       470       480       490       500       510     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
         520       530       540       550       560       570     

                                                                   
pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
NP_001 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
         580       590       600       610       620       630     

>--
 initn: 486 init1: 486 opt: 500  Z-score: 308.7  bits: 66.6 E(85289): 1.9e-10
Smith-Waterman score: 502; 56.5% identity (79.1% similar) in 115 aa overlap (159-273:579-693)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
NP_001 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
      550       560       570       580       590       600        

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
      610       620       630       640       650       660        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
      670       680       690                                      

>--
 initn: 720 init1: 296 opt: 312  Z-score: 204.4  bits: 47.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 317; 31.4% identity (55.9% similar) in 188 aa overlap (144-330:68-246)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 AAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLI
                                     :.:: ..   :. :: .  .: .   ..:.
NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
        40        50        60        70        80        90       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 KH-QRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQ
          .:.:.         :   . :  :   :.:    :.  .    :..: ..   : ..
NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
       100                110       120       130       140        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 RIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHT
         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
NP_001 NAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHA
      150       160       170       180       190       200        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 GEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       :::  :: . .:.: :.  . .:  ..:::::: :..:                      
NP_001 GEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKP
      210       220       230       240       250       260        

NP_001 YKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECN
      270       280       290       300       310       320        

>>NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 703.4  bits: 139.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
        220       230       240       250       260       270      

         60        70        80             90       100       110 
pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
        280       290       300       310        320       330     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
         340       350       360       370       380       390     

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
         400       410       420       430       440       450     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
         460       470       480       490       500       510     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
         520       530       540       550       560       570     

                                                                   
pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
NP_001 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
         580       590       600       610       620       630     

>--
 initn: 486 init1: 486 opt: 500  Z-score: 308.7  bits: 66.6 E(85289): 1.9e-10
Smith-Waterman score: 502; 56.5% identity (79.1% similar) in 115 aa overlap (159-273:579-693)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
NP_001 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
      550       560       570       580       590       600        

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
      610       620       630       640       650       660        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
      670       680       690                                      

>--
 initn: 720 init1: 296 opt: 312  Z-score: 204.4  bits: 47.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 317; 31.4% identity (55.9% similar) in 188 aa overlap (144-330:68-246)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 AAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLI
                                     :.:: ..   :. :: .  .: .   ..:.
NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
        40        50        60        70        80        90       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 KH-QRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQ
          .:.:.         :   . :  :   :.:    :.  .    :..: ..   : ..
NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
       100                110       120       130       140        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 RIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHT
         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
NP_001 NAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHA
      150       160       170       180       190       200        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 GEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       :::  :: . .:.: :.  . .:  ..:::::: :..:                      
NP_001 GEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKP
      210       220       230       240       250       260        

NP_001 YKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECN
      270       280       290       300       310       320        

>>NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 703.4  bits: 139.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
        220       230       240       250       260       270      

         60        70        80             90       100       110 
pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
        280       290       300       310        320       330     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
         340       350       360       370       380       390     

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
         400       410       420       430       440       450     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
         460       470       480       490       500       510     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
         520       530       540       550       560       570     

                                                                   
pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
NP_001 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
         580       590       600       610       620       630     

>--
 initn: 486 init1: 486 opt: 500  Z-score: 308.7  bits: 66.6 E(85289): 1.9e-10
Smith-Waterman score: 502; 56.5% identity (79.1% similar) in 115 aa overlap (159-273:579-693)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
NP_001 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
      550       560       570       580       590       600        

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
      610       620       630       640       650       660        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
      670       680       690                                      

>--
 initn: 720 init1: 296 opt: 312  Z-score: 204.4  bits: 47.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 317; 31.4% identity (55.9% similar) in 188 aa overlap (144-330:68-246)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 AAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLI
                                     :.:: ..   :. :: .  .: .   ..:.
NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
        40        50        60        70        80        90       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB9 KH-QRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQ
          .:.:.         :   . :  :   :.:    :.  .    :..: ..   : ..
NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
       100                110       120       130       140        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 RIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHT
         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
NP_001 NAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHA
      150       160       170       180       190       200        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 GEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       :::  :: . .:.: :.  . .:  ..:::::: :..:                      
NP_001 GEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKP
      210       220       230       240       250       260        

NP_001 YKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECN
      270       280       290       300       310       320        

>>NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 703.4  bits: 139.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
        220       230       240       250       260       270      

         60        70        80             90       100       110 
pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
        280       290       300       310        320       330     

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
         340       350       360       370       380       390     

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
         400       410       420       430       440       450     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
         460       470       480       490       500       510     

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pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
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pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
NP_001 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
         580       590       600       610       620       630     

>--
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      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
NP_001 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
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      190       200       210       220       230       240        
pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
      610       620       630       640       650       660        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
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>--
 initn: 720 init1: 296 opt: 312  Z-score: 204.4  bits: 47.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 317; 31.4% identity (55.9% similar) in 188 aa overlap (144-330:68-246)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 AAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLI
                                     :.:: ..   :. :: .  .: .   ..:.
NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
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pF1KB9 KH-QRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQ
          .:.:.         :   . :  :   :.:    :.  .    :..: ..   : ..
NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
       100                110       120       130       140        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB9 RIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHT
         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
NP_001 NAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHA
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            300       310       320       330       340       350  
pF1KB9 GEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       :::  :: . .:.: :.  . .:  ..:::::: :..:                      
NP_001 GEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKP
      210       220       230       240       250       260        

NP_001 YKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECN
      270       280       290       300       310       320        

>>NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
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Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
        220       230       240       250       260       270      

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pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
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             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
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             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
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             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
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pF1KB9 TGEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEK
       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
         520       530       540       550       560       570     

                                                                   
pF1KB9 P                                                           
       :                                                           
NP_001 PNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECGDCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYEC
         580       590       600       610       620       630     

>--
 initn: 486 init1: 486 opt: 500  Z-score: 308.7  bits: 66.6 E(85289): 1.9e-10
Smith-Waterman score: 502; 56.5% identity (79.1% similar) in 115 aa overlap (159-273:579-693)

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB9 FICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLIKHQRIHTGEKPFECP
                                     :  : :.:. ..::: ::.::: :::.:: 
NP_001 YECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEKPNICAECGKAFTDRSNLITHQKIHTREKPYECG
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pF1KB9 ECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQRIHTGERPYECNECAK
       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
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pF1KB9 TFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHTGEKPYECTECGKTFSQ
       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
      670       680       690                                      

>--
 initn: 720 init1: 296 opt: 312  Z-score: 204.4  bits: 47.3 E(85289): 0.00012
Smith-Waterman score: 317; 31.4% identity (55.9% similar) in 188 aa overlap (144-330:68-246)

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 AAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKANLI
                                     :.:: ..   :. :: .  .: .   ..:.
NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
        40        50        60        70        80        90       

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pF1KB9 KH-QRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTHQ
          .:.:.         :   . :  :   :.:    :.  .    :..: ..   : ..
NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
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pF1KB9 RIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTHT
         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
NP_001 NAKTGANSCEHDHYEKHLSHKQAPTHHQKIHPEEKLYVCTECVMGFTQKSHLFEHQRIHA
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pF1KB9 GEKPYECTECGKTFSQRSTLRLHLRIHTGEKPYECSECGKAFSRKSRLSVHQRVHIGEKP
       :::  :: . .:.: :.  . .:  ..:::::: :..:                      
NP_001 GEKSRECDKSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKP
      210       220       230       240       250       260        

NP_001 YKCSECGKAFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQKTHTGEKHYECN
      270       280       290       300       310       320        

>>NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 iso  (693 aa)
 initn: 1148 init1: 1148 opt: 1211  Z-score: 703.4  bits: 139.6 E(85289): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 1218; 51.4% identity (77.6% similar) in 331 aa overlap (32-352:247-576)

              10        20        30        40             50      
pF1KB9 ERDHRNPDEQARQFLILKNQTPIEERGDLFGKALNLNTDFVSLRQV-----PYKYDLYEK
                                     ::...:...... ...     ::: .   :
NP_001 KSNKVFPQKPQVDVHPSVYTGEKPYLCTQCGKVFTLKSNLITHQKIHTGQKPYKCSECGK
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pF1KB9 TLKYNSDLLNSNRSYAGKQTDECNEFGKAL-----LYLKQEKTHSGVEYSEYNKSGKALS
       ..   :::.   : ..:..  ::.: ::..     : ..: :::.: .. : :. :::..
NP_001 AFFQRSDLFRHLRIHTGEKPYECSECGKGFSQNSDLSIHQ-KTHTGEKHYECNECGKAFT
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pF1KB9 HKAAIFKHQKIKNLVQPFICTYCDKAFSFKSLLISHKRIHTGEKPYECNVCKKTFSHKAN
       .:.:.  ::.:..  .:..:. : :::  :: . .:.:::::::::::. : :.:..:..
NP_001 RKSALRMHQRIHTGEKPYVCADCGKAFIQKSHFNTHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQ
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             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 LIKHQRIHTGEKPFECPECGKAFTHQSNLIVHQRAHMEKKPYECSECGKTFAQKFELTTH
       :  ::::::::::. : ::::.:::..:: .::..:  .::: :.::::.:... .:  :
NP_001 LHVHQRIHTGEKPYICTECGKVFTHRTNLTTHQKTHTGEKPYMCAECGKAFTDQSNLIKH
         400       410       420       430       440       450     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 QRIHTGERPYECNECAKTFFKKSNLIIHQKIHTGEKRYECSECGKSFIQNSQLIIHMRTH
       :. ::::.::.:: :.:.:. :: : :::: : ::..:::..:::.:::.: : .:.: :
NP_001 QKTHTGEKPYKCNGCGKAFIWKSRLKIHQKSHIGERHYECKDCGKAFIQKSTLSVHQRIH
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       :::::: : ::::.: :.: .  : ::::::::::::.::: :..::.: :::..: :::
NP_001 TGEKPYVCPECGKAFIQKSHFIAHHRIHTGEKPYECSDCGKCFTKKSQLRVHQKIHTGEK
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       :                                                           
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>--
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       .:::.:: .: : .::..:  .. ::::.:::.: ::  :. :: ::::..:: :.:: :
NP_001 DCGKTFTWKSRLNIHQKSHTGERHYECSKCGKAFIQKATLSMHQIIHTGKKPYACTECQK
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       .:  .:::: :::.:.:::::. :.                                   
NP_001 AFTDRSNLIKHQKMHSGEKRYKASD                                   
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NP_001 PIGEDSLCSILEELWQDNDQLEQRQENQNNLLSHVKVLIKERGYEHKNIEKIIHVTTKLV
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NP_001 PSIKRLHN---------CDTILKHTLNSHNHNRNSATKNLGKIFGNGNNFPHSPSSTKNE
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         .::    : ..  : . .:.    :::::  :: : :.::  .: :.:.:. :.: :.
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352 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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