Result of FASTA (ccds) for pF1KB9495
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9495, 836 aa
  1>>>pF1KB9495 836 - 836 aa - 836 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7760+/-0.000906; mu= 6.2746+/- 0.054
 mean_var=210.9061+/-42.131, 0's: 0 Z-trim(113.5): 19  B-trim: 7 in 1/50
 Lambda= 0.088314
 statistics sampled from 14081 (14095) to 14081 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.433), width:  16
 Scan time:  5.080

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9736.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14         ( 836) 5565 722.2 9.2e-208
CCDS41961.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14        ( 799) 3951 516.5 7.1e-146
CCDS12688.2 DACT3 gene_id:147906|Hs108|chr19       ( 629)  486 75.0 4.7e-13
CCDS74402.1 DACT3 gene_id:147906|Hs108|chr19       ( 404)  445 69.6 1.2e-11


>>CCDS9736.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14              (836 aa)
 initn: 5565 init1: 5565 opt: 5565  Z-score: 3843.5  bits: 722.2 E(32554): 9.2e-208
Smith-Waterman score: 5565; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830      
pF1KB9 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
              790       800       810       820       830      

>>CCDS41961.1 DACT1 gene_id:51339|Hs108|chr14             (799 aa)
 initn: 3948 init1: 3948 opt: 3951  Z-score: 2732.4  bits: 516.5 E(32554): 7.1e-146
Smith-Waterman score: 5234; 95.6% identity (95.6% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-799)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKPSPAGTAKELEPPAPARGEQRTAEPEGRWREKGEADTERQRTRERQEATLAGLAELEY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRQRQELLVRGALRGAGGAGAAAPRAGELLGEAAQRSRLEEKFLEENILLLRKQLNCLRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDAGLLNQLQELDKQISDLRLDVEKTSEEHLETDSRPSSGFYELSDGASGSLSNSSNSVF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSADLIGLLEYKEGHCEDQASGAVCRSLSTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                            
CCDS41 SECLSSCHSSTCFCSPLEATLSLSDGCPKSAD----------------------------
              190       200       210                              

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 FNSLDVIADVNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ---------VNPKYQCDLVSKNGNDVYRYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGN
                     220       230       240       250       260   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HASDICGGSELDAVKTDSSLPSPSSLWSASHPSSSKKMDGYILSLVQKKTHPVRTNKPRT
           270       280       290       300       310       320   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGGVSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWS
           330       340       350       360       370       380   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KESKAEQAESKRVPLPEGCPSGAASDLQSKHLPKTAKPASQEHARCSAIGTGESPKESAQ
           390       400       410       420       430       440   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSGASPKESPSRGPAPPQENKVVQPLKKMSQKNSLQGVPPATPPLLSTAFPVEERPALDF
           450       460       470       480       490       500   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KSEGSSQSLEEAHLVKAQFIPGQQPSVRLHRGHRNMGVVKNSSLKHRGPALQGLENGLPT
           510       520       530       540       550       560   

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VREKTRAGSKKCRFPDDLDTNKKLKKASSKGRKSGGGPEAGVPGRPAGGGHRAGSRAHGH
           570       580       590       600       610       620   

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GREAVVAKPKHKRTDYRRWKSSAEISYEEALRRARRGRRENVGLYPAPVPLPYASPYAYV
           630       640       650       660       670       680   

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ASDSEYSAECESLFHSTVVDTSEDEQSNYTTNCFGDSESSVSEGEFVGESTTTSDSEESG
           690       700       710       720       730       740   

              790       800       810       820       830      
pF1KB9 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GLIWSQFVQTLPIQTVTAPDLHNHPAKTFVKIKASHNLKKKILRFRSGSLKLMTTV
           750       760       770       780       790         

>>CCDS12688.2 DACT3 gene_id:147906|Hs108|chr19            (629 aa)
 initn: 534 init1: 177 opt: 486  Z-score: 347.9  bits: 75.0 E(32554): 4.7e-13
Smith-Waterman score: 487; 29.1% identity (52.2% similar) in 581 aa overlap (298-836:93-629)

       270       280       290       300          310       320    
pF1KB9 RYPSPLHAVAVQSPMFLLCLTGNPLREEDRLGNHASDIC---GGSELDAVKTDSSLPSPS
                                     ::.. .:.    :: : .. ....   .::
CCDS12 ADEDEDAAAARRAAAALEEQLEALPGLVWDLGQQLGDLSLESGGLEQESGRSSGFYEDPS
             70        80        90       100       110       120  

          330        340       350       360       370       380   
pF1KB9 SLWSASHPSSSKKMD-GYILSLVQKKTHPVRTNKPRTSVNADPTKGLLRNGSVCVRAPGG
       :  . . : :.   : :.  :    .  :   ..::    ..  :.:   :..   ::  
CCDS12 STGGPDSPPSTFCGDSGFSGSSSYGRLGP---SEPRGIYASERPKSL---GDASPSAPEV
            130       140       150          160          170      

           390       400       410       420                 430   
pF1KB9 VSQGNSVNLKNSKQACLPSGGIPSLNNGTFSPPKQWSKESKAE----------QAESKRV
       :  :  . .  : .:  :..:      :. .:    : : .:.          .: . : 
CCDS12 V--GARAAVPRSFSAPYPTAG------GSAGPEACSSAERRARAGPFLTPSPLHAVAMRS
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       : : : :       .::.  :..  . : .  .  .  . : :  :.  .:... ..   
CCDS12 PRPCGRPPTDSPDAGGAGRPLDGYISALLRRRRRRGAGQPRTSPGGADGGPRRQNSVRQR
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        :  ::: : : : ..  .. .          :  :..:  :: :.       .  .:: 
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          . .  .:  :..:::::.::: : ..:        :.   .. ..  :  .:  .:.
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       . :  ::. ::.... :. .      . . .::: :... :  :  ..::. :     ..
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       :   :     :  . .   .   . :::.:.:::.  .. ::.:   :  ..  :.: : 
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       : :      :. ..:::: ::       . .   ..   .. . . .:.::::.::::  
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       . :...:::. ::::.: .:.: .   .   :       :::.:::::::: ::::::::
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       ::::::.::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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