Result of FASTA (ccds) for pF1KB9460
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9460, 728 aa
  1>>>pF1KB9460 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3735+/-0.000981; mu= -5.9681+/- 0.059
 mean_var=356.8501+/-73.037, 0's: 0 Z-trim(115.8): 26  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.067894
 statistics sampled from 16305 (16329) to 16305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.502), width:  16
 Scan time:  4.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12371.1 PIK3R2 gene_id:5296|Hs108|chr19        ( 728) 4922 496.2 7.4e-140
CCDS3993.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5          ( 724) 2672 275.8 1.6e-73
CCDS3995.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5          ( 454) 2195 228.9 1.3e-59
CCDS3994.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5          ( 424) 2165 226.0 9.5e-59
CCDS529.1 PIK3R3 gene_id:8503|Hs108|chr1           ( 461) 2152 224.7 2.5e-58
CCDS76155.1 PIK3R3 gene_id:8503|Hs108|chr1         ( 507) 2136 223.2 7.8e-58
CCDS56374.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5         ( 361) 1869 196.9 4.5e-50
CCDS76154.1 PIK3R3 gene_id:8503|Hs108|chr1         ( 402) 1193 130.7 4.2e-30


>>CCDS12371.1 PIK3R2 gene_id:5296|Hs108|chr19             (728 aa)
 initn: 4922 init1: 4922 opt: 4922  Z-score: 2624.4  bits: 496.2 E(32554): 7.4e-140
Smith-Waterman score: 4922; 99.7% identity (99.7% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAGPEGFQYRALYPFRRERPEDLELLPGDVLVVSRAALQALGVAEGGERCPQSVGWMPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAGPEGFQYRALYPFRRERPEDLELLPGDVLVVSRAALQALGVAEGGERCPQSVGWMPGL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 NERTRQRGDFPGTYVEFLGPVALARPGPRPRGPRPLPARPRDGAPEPGLTLPDLPEQFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NERTRQRGDFPGTYVEFLGPVALARPGPRPRGPRPLPARPRDGAPEPGLTLPDLPEQFSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PDVAPPLLVKLVEAIERTGLDSESHYRPELPAPRTDWSLSDVDQWDTAALADGIKSFLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PDVAPPLLVKLVEAIERTGLDSESHYRPELPAPRTDWSLSDVDQWDTAALADGIKSFLLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LPAPLVTPEASAEARRALREAAGPVGPALEPPTLPLHRALTLRFLLQHLGRVARRAPALG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS12 LPAPLVTPEASAEARRALREAAGPVGPALEPPTLPLHRALTLRFLLQHLGRVASRAPALG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PAVRALGATFGPLLLRAPPPPSSPPPGGAPDGSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PAVRALGATFGPLLLRAPPPPSSPPPGGAPDGSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ALPPKPPKAKPAPTVLANGGSPPSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSK
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALPPKPPKAKPASTVLANGGSPPSLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 IQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGHYGFSEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGHYGFSEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 IEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYLERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYLERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 KLEQQLRAQASDNREIDKRMNSLKPDLMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLEQQLRAQASDNREIDKRMNSLKPDLMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 TEDQYALMEDEDDLPHHEERTWYVGKINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TEDQYALMEDEDDLPHHEERTWYVGKINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 VDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNLYGSLKELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNLYGSLKELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPG
              670       680       690       700       710       720

               
pF1KB9 PGPPPAAR
       ::::::::
CCDS12 PGPPPAAR
               

>>CCDS3993.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5               (724 aa)
 initn: 2525 init1: 1516 opt: 2672  Z-score: 1433.4  bits: 275.8 E(32554): 1.6e-73
Smith-Waterman score: 2823; 59.6% identity (80.0% similar) in 735 aa overlap (5-718:4-720)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MAGPEGFQYRALYPFRRERPEDLELLPGDVLVVSRAALQALGVAEGGERCPQSVGWMPGL
           ::.:::::: ...:: ::..:  ::.:.:....: ::: ..: :  :. .::. : 
CCDS39  MSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGY
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100            110     
pF1KB9 NERTRQRGDFPGTYVEFLGPVALARPGPRPRGPRPLPARPRDGAPEP-----GLTLPDLP
       :: : .::::::::::..:   .. : :.:: :::::. : ..  :      .:::::: 
CCDS39 NETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPPTPKPRPPRPLPVAPGSSKTEADVEQQALTLPDLA
      60        70        80        90       100       110         

         120       130       140           150           160       
pF1KB9 EQFSPPDVAPPLLVKLVEAIERTGLDSESHYRPE----LPAPRT----DWSLSDVDQWDT
       :::.:::.:::::.:::::::. ::.  . :: .    :   :     :    :... :.
CCDS39 EQFAPPDIAPPLLIKLVEAIEKKGLECSTLYRTQSSSNLAELRQLLDCDTPSVDLEMIDV
     120       130       140       150       160       170         

       170       180       190             200       210       220 
pF1KB9 AALADGIKSFLLALPAPLVTPEASAEA------RRALREAAGPVGPALEPPTLPLHRALT
        .:::..: .:: :: :..   . .:        .. .:    .   .. :..: .  ::
CCDS39 HVLADAFKRYLLDLPNPVIPAAVYSEMISLAPEVQSSEEYIQLLKKLIRSPSIPHQYWLT
     180       190       200       210       220       230         

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB9 LRFLLQHLGRVARRAPALGPAVRALGATFGPLLLRAPPPPSSPPPGGAPDGSEPSPDFPA
       :..::.:. .... .      .:.:.  :.:.:.:     :        :..:       
CCDS39 LQYLLKHFFKLSQTSSKNLLNARVLSEIFSPMLFRFSAASS--------DNTENLIK---
     240       250       260       270       280                   

             290       300       310       320         330         
pF1KB9 LLVEKLLQEHLEEQEVAPPALPPKPPKAKPAPTVLANGG--SPPSLQDAEWYWGDISREE
        ..: :.. . .:.. :: ::::::::    ::..::.:  .  ::::::::::::::::
CCDS39 -VIEILISTEWNERQPAP-ALPPKPPK----PTTVANNGMNNNMSLQDAEWYWGDISREE
       290       300        310           320       330       340  

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB9 VNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGHYGFSEPLTFCSVV
       :::::::: ::::::::::.:..:.:::::::::::::::.:::::.::::.:::: :::
CCDS39 VNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFSDPLTFSSVV
            350       360       370       380       390       400  

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB9 DLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVYHQQYQDKSRE
       .::::::.::::::: :::..::::::::::::.::::..:::: .:. :. :.:.::::
CCDS39 ELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYNTQFQEKSRE
            410       420       430       440       450       460  

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB9 YDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYLERFRREGNEKEMQ
       ::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::. ::::.:.:.:::::::.:
CCDS39 YDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFKREGNEKEIQ
            470       480       490       500       510       520  

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB9 RILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQQLRAQASDNREIDKRMNSLKPDLMQLRKIRDQYLV
       ::. : ..:::::.:: .:: .::..:. ::.. :::::::::.::::.:::: :::::.
CCDS39 RIMHNYDKLKSRISEIIDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQLRKTRDQYLM
            530       540       550       560       570       580  

     580       590       600       610       620       630         
pF1KB9 WLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQYALMEDEDDLPHHEERTWYVGKINRTQAEEMLSGK
       ::::::.::::.::::: .: :::::.:.::..:::::.:.:: ::. ::..::..: ::
CCDS39 WLTQKGVRQKKLNEWLGNEN-TEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGK
            590       600        610       620       630       640 

     640       650       660       670       680       690         
pF1KB9 RDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNLYGSLKELVLHYQHA
       ::::::.::::..:::::::::::..::::: .::::.:::::::::.:::::::::::.
CCDS39 RDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHT
             650       660       670       680       690       700 

     700       710       720        
pF1KB9 SLVQHNDALTVTLAHPVRAPGPGPPPAAR
       :::::::.:.::::.:: :          
CCDS39 SLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR      
             710       720          

>>CCDS3995.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5               (454 aa)
 initn: 2140 init1: 1511 opt: 2195  Z-score: 1183.7  bits: 228.9 E(32554): 1.3e-59
Smith-Waterman score: 2195; 76.0% identity (92.7% similar) in 425 aa overlap (296-718:31-450)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB9 PGGAPDGSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPPALPPKPPKAKPAPTVLANGG--SPP
                                     :. ::::::::::    ::..::.:  .  
CCDS39 MYNTVWNMEDLDLEYAKTDINCGTDLMFYIEMDPPALPPKPPK----PTTVANNGMNNNM
               10        20        30        40            50      

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB9 SLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHR
       :::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:..:.:::::::::::::::.:::
CCDS39 SLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHR
         60        70        80        90       100       110      

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 DGHYGFSEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVG
       ::.::::.:::: :::.::::::.::::::: :::..::::::::::::.::::..::::
CCDS39 DGKYGFSDPLTFSSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVG
        120       130       140       150       160       170      

           450       460       470       480       490       500   
pF1KB9 AQLKVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSK
        .:. :. :.:.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::. ::
CCDS39 KKLHEYNTQFQEKSREYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSK
        180       190       200       210       220       230      

           510       520       530       540       550       560   
pF1KB9 EYLERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQQLRAQASDNREIDKRMNSL
       ::.:.:.:::::::.:::. : ..:::::.:: .:: .::..:. ::.. :::::::::.
CCDS39 EYIEKFKREGNEKEIQRIMHNYDKLKSRISEIIDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSI
        240       250       260       270       280       290      

           570       580       590       600       610       620   
pF1KB9 KPDLMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQYALMEDEDDLPHHEERTWY
       ::::.:::: :::::.::::::.::::.::::: .: :::::.:.::..:::::.:.:: 
CCDS39 KPDLIQLRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNEN-TEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWN
        300       310       320       330        340       350     

           630       640       650       660       670       680   
pF1KB9 VGKINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPY
       ::. ::..::..: ::::::::.::::..:::::::::::..::::: .::::.::::::
CCDS39 VGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPY
         360       370       380       390       400       410     

           690       700       710       720        
pF1KB9 NLYGSLKELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPGPGPPPAAR
       :::.:::::::::::.:::::::.:.::::.:: :          
CCDS39 NLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR      
         420       430       440       450          

>>CCDS3994.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5               (424 aa)
 initn: 2140 init1: 1511 opt: 2165  Z-score: 1168.2  bits: 226.0 E(32554): 9.5e-59
Smith-Waterman score: 2165; 76.1% identity (92.8% similar) in 419 aa overlap (302-718:7-420)

             280       290       300       310       320           
pF1KB9 GSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPPALPPKPPKAKPAPTVLANGG--SPPSLQDAE
                                     :::::::    ::..::.:  .  ::::::
CCDS39                         MHNLQTLPPKPPK----PTTVANNGMNNNMSLQDAE
                                       10            20        30  

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB9 WYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGHYGF
       :::::::::::::::::: ::::::::::.:..:.:::::::::::::::.:::::.:::
CCDS39 WYWGDISREEVNEKLRDTADGTFLVRDASTKMHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGF
             40        50        60        70        80        90  

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB9 SEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVY
       :.:::: :::.::::::.::::::: :::..::::::::::::.::::..:::: .:. :
CCDS39 SDPLTFSSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEY
            100       110       120       130       140       150  

     450       460       470       480       490       500         
pF1KB9 HQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYLERF
       . :.:.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::. ::::.:.:
CCDS39 NTQFQEKSREYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKF
            160       170       180       190       200       210  

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB9 RREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQQLRAQASDNREIDKRMNSLKPDLMQ
       .:::::::.:::. : ..:::::.:: .:: .::..:. ::.. :::::::::.::::.:
CCDS39 KREGNEKEIQRIMHNYDKLKSRISEIIDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQ
            220       230       240       250       260       270  

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB9 LRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQYALMEDEDDLPHHEERTWYVGKINR
       ::: :::::.::::::.::::.::::: .: :::::.:.::..:::::.:.:: ::. ::
CCDS39 LRKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNEN-TEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNR
            280       290       300        310       320       330 

     630       640       650       660       670       680         
pF1KB9 TQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNLYGSL
       ..::..: ::::::::.::::..:::::::::::..::::: .::::.:::::::::.::
CCDS39 NKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSL
             340       350       360       370       380       390 

     690       700       710       720        
pF1KB9 KELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPGPGPPPAAR
       :::::::::.:::::::.:.::::.:: :          
CCDS39 KELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR      
             400       410       420          

>>CCDS529.1 PIK3R3 gene_id:8503|Hs108|chr1                (461 aa)
 initn: 2136 init1: 1599 opt: 2152  Z-score: 1160.8  bits: 224.7 E(32554): 2.5e-58
Smith-Waterman score: 2152; 72.5% identity (91.4% similar) in 429 aa overlap (296-721:31-457)

         270       280       290       300       310         320   
pF1KB9 PGGAPDGSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPPALPPKPPKAKPAPTVLANG--GSPP
                                     :. ::::::::::  :  ... ::   :  
CCDS52 MYNTVWSMDRDDADWREVMMPYSTELIFYIEMDPPALPPKPPK--PMTSAVPNGMKDSSV
               10        20        30        40          50        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB9 SLQDAEWYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHR
       ::::::::::::::::::.:::: :::::::::::.:.::.:::::::::::::::..::
CCDS52 SLQDAEWYWGDISREEVNDKLRDMPDGTFLVRDASTKMQGDYTLTLRKGGNNKLIKIYHR
       60        70        80        90       100       110        

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 DGHYGFSEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVG
       ::.::::.:::: :::.:::::.:::::::: :::..:.::::.:::::.::::...:::
CCDS52 DGKYGFSDPLTFNSVVELINHYHHESLAQYNPKLDVKLMYPVSRYQQDQLVKEDNIDAVG
      120       130       140       150       160       170        

           450       460       470       480       490       500   
pF1KB9 AQLKVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSK
        .:. ::.:::.::.:::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: .:::. ::
CCDS52 KKLQEYHSQYQEKSKEYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCHTQEQHSK
      180       190       200       210       220       230        

           510       520       530       540       550       560   
pF1KB9 EYLERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQQLRAQASDNREIDKRMNSL
       ::.:::::::::::..::..: ..::::..:::.:. .:::.:. :: :::::::.:::.
CCDS52 EYIERFRREGNEKEIERIMMNYDKLKSRLGEIHDSKMRLEQDLKNQALDNREIDKKMNSI
      240       250       260       270       280       290        

           570       580       590       600        610       620  
pF1KB9 KPDLMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQ-YALMEDEDDLPHHEERTW
       ::::.::::::::.::::..::.:::..: :::::::  :. : . :....:::..:.::
CCDS52 KPDLIQLRKIRDQHLVWLNHKGVRQKRLNVWLGIKNEDADENYFINEEDENLPHYDEKTW
      300       310       320       330       340       350        

            630       640       650       660       670       680  
pF1KB9 YVGKINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEP
       .:  :::.:::..: :: ::.:::::::..::::::::.::..:::::: :: :.:::::
CCDS52 FVEDINRVQAEDLLYGKPDGAFLIRESSKKGCYACSVVADGEVKHCVIYSTARGYGFAEP
      360       370       380       390       400       410        

            690       700       710       720        
pF1KB9 YNLYGSLKELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPGPGPPPAAR
       ::::.::::::::::..:::::::.:.: ::.::.:  :       
CCDS52 YNLYSSLKELVLHYQQTSLVQHNDSLNVRLAYPVHAQMPSLCR   
      420       430       440       450       460    

>>CCDS76155.1 PIK3R3 gene_id:8503|Hs108|chr1              (507 aa)
 initn: 2161 init1: 1583 opt: 2136  Z-score: 1151.8  bits: 223.2 E(32554): 7.8e-58
Smith-Waterman score: 2136; 72.5% identity (91.3% similar) in 426 aa overlap (299-721:80-503)

      270       280       290       300       310         320      
pF1KB9 APDGSEPSPDFPALLVEKLLQEHLEEQEVAPPALPPKPPKAKPAPTVLANG--GSPPSLQ
                                     : :::::::  ::  ... ::   :  :::
CCDS76 TASSAAINPATRAMGINNTHTDTTIVWIFPPQALPPKPP--KPMTSAVPNGMKDSSVSLQ
      50        60        70        80          90       100       

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB9 DAEWYWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGH
       :::::::::::::::.:::: :::::::::::.:.::.:::::::::::::::..::::.
CCDS76 DAEWYWGDISREEVNDKLRDMPDGTFLVRDASTKMQGDYTLTLRKGGNNKLIKIYHRDGK
       110       120       130       140       150       160       

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB9 YGFSEPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQL
       ::::.:::: :::.:::::.:::::::: :::..:.::::.:::::.::::...::: .:
CCDS76 YGFSDPLTFNSVVELINHYHHESLAQYNPKLDVKLMYPVSRYQQDQLVKEDNIDAVGKKL
       170       180       190       200       210       220       

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB9 KVYHQQYQDKSREYDQLYEEYTRTSQELQMKRTAIEAFNETIKIFEEQGQTQEKCSKEYL
       . ::.:::.::.:::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: .:::. ::::.
CCDS76 QEYHSQYQEKSKEYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCHTQEQHSKEYI
       230       240       250       260       270       280       

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB9 ERFRREGNEKEMQRILLNSERLKSRIAEIHESRTKLEQQLRAQASDNREIDKRMNSLKPD
       :::::::::::..::..: ..::::..:::.:. .:::.:. :: :::::::.:::.:::
CCDS76 ERFRREGNEKEIERIMMNYDKLKSRLGEIHDSKMRLEQDLKNQALDNREIDKKMNSIKPD
       290       300       310       320       330       340       

        570       580       590       600        610       620     
pF1KB9 LMQLRKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQ-YALMEDEDDLPHHEERTWYVG
       :.::::::::.::::..::.:::..: :::::::  :. : . :....:::..:.::.: 
CCDS76 LIQLRKIRDQHLVWLNHKGVRQKRLNVWLGIKNEDADENYFINEEDENLPHYDEKTWFVE
       350       360       370       380       390       400       

         630       640       650       660       670       680     
pF1KB9 KINRTQAEEMLSGKRDGTFLIRESSQRGCYACSVVVDGDTKHCVIYRTATGFGFAEPYNL
        :::.:::..: :: ::.:::::::..::::::::.::..:::::: :: :.::::::::
CCDS76 DINRVQAEDLLYGKPDGAFLIRESSKKGCYACSVVADGEVKHCVIYSTARGYGFAEPYNL
       410       420       430       440       450       460       

         690       700       710       720        
pF1KB9 YGSLKELVLHYQHASLVQHNDALTVTLAHPVRAPGPGPPPAAR
       :.::::::::::..:::::::.:.: ::.::.:  :       
CCDS76 YSSLKELVLHYQQTSLVQHNDSLNVRLAYPVHAQMPSLCR   
       470       480       490       500          

>>CCDS56374.1 PIK3R1 gene_id:5295|Hs108|chr5              (361 aa)
 initn: 1891 init1: 1262 opt: 1869  Z-score: 1012.5  bits: 196.9 E(32554): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1869; 76.0% identity (94.1% similar) in 358 aa overlap (361-718:1-357)

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 YWGDISREEVNEKLRDTPDGTFLVRDASSKIQGEYTLTLRKGGNNKLIKVFHRDGHYGFS
                                     ..:.:::::::::::::::.:::::.::::
CCDS56                               MHGDYTLTLRKGGNNKLIKIFHRDGKYGFS
                                             10        20        30

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 EPLTFCSVVDLINHYRHESLAQYNAKLDTRLLYPVSKYQQDQIVKEDSVEAVGAQLKVYH
       .:::: :::.::::::.::::::: :::..::::::::::::.::::..:::: .:. :.
CCDS56 DPLTFSSVVELINHYRNESLAQYNPKLDVKLLYPVSKYQQDQVVKEDNIEAVGKKLHEYN
               40        50        60        70        80        90

              460       470       480       490       500       510
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        :.:.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: ::::. ::::.:.:.
CCDS56 TQFQEKSREYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCQTQERYSKEYIEKFK
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       :::::::.:::. : ..:::::.:: .:: .::..:. ::.. :::::::::.::::.::
CCDS56 REGNEKEIQRIMHNYDKLKSRISEIIDSRRRLEEDLKKQAAEYREIDKRMNSIKPDLIQL
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pF1KB9 RKIRDQYLVWLTQKGARQKKINEWLGIKNETEDQYALMEDEDDLPHHEERTWYVGKINRT
       :: :::::.::::::.::::.::::: .: :::::.:.::..:::::.:.:: ::. ::.
CCDS56 RKTRDQYLMWLTQKGVRQKKLNEWLGNEN-TEDQYSLVEDDEDLPHHDEKTWNVGSSNRN
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       .::..: ::::::::.::::..:::::::::::..::::: .::::.:::::::::.:::
CCDS56 KAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLK
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       ::::::::.:::::::.:.::::.:: :          
CCDS56 ELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR      
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CCDS76 MYNTVWSMDRDDADWREVMMPYSTELIFYIEMDPPALPPKPPK--PMTSAVPNGMKDSSV
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       ::::::::::::::::::.:::: :::::::::::.:.::.:::::::::::::::..::
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       ::.::::.:::: :::.:::::.:::::::: :::..:.::::.:::::.::::...:::
CCDS76 DGKYGFSDPLTFNSVVELINHYHHESLAQYNPKLDVKLMYPVSRYQQDQLVKEDNIDAVG
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        .:. ::.:::.::.:::.:::::::::::.:::::::::::::::::::: .:::. ::
CCDS76 KKLQEYHSQYQEKSKEYDRLYEEYTRTSQEIQMKRTAIEAFNETIKIFEEQCHTQEQHSK
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       ::.:::::::::::..:                                           
CCDS76 EYIERFRREGNEKEIER-------------------------------------------
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                       ::..::.:::..: :::::::  :. : . :....:::..:.::
CCDS76 ----------------WLNHKGVRQKRLNVWLGIKNEDADENYFINEEDENLPHYDEKTW
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       .:  :::.:::..: :: ::.:::::::..::::::::.::..:::::: :: :.:::::
CCDS76 FVEDINRVQAEDLLYGKPDGAFLIRESSKKGCYACSVVADGEVKHCVIYSTARGYGFAEP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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