Result of FASTA (ccds) for pF1KB9426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9426, 683 aa
  1>>>pF1KB9426 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1068+/-0.00156; mu= -5.1794+/- 0.089
 mean_var=349.6679+/-81.130, 0's: 0 Z-trim(105.7): 662  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.068588
 statistics sampled from 7796 (8546) to 7796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14          ( 683) 4721 482.7 7.3e-136
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2           ( 737) 1747 188.5   3e-47
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3           ( 676) 1505 164.5 4.6e-40
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16         ( 671) 1367 150.8 5.8e-36
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17         ( 672) 1354 149.6 1.4e-35
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16         ( 673) 1345 148.7 2.7e-35
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10         ( 581) 1311 145.2 2.5e-34
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10          ( 706) 1311 145.3 2.8e-34
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19         ( 697) 1284 142.6 1.8e-33
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1          ( 409) 1193 133.4 6.3e-31
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1          ( 488) 1193 133.5 7.1e-31
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1             ( 592) 1193 133.6 8.2e-31
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19          ( 942) 1135 128.0   6e-29
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19          ( 948) 1135 128.0 6.1e-29
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1           ( 936) 1133 127.8 6.9e-29
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1             ( 984) 1133 127.9 7.1e-29
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19           ( 481) 1102 124.5 3.6e-28
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14            ( 480) 1097 124.0 5.1e-28
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1          ( 479) 1096 123.9 5.5e-28
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1          ( 465) 1086 122.9 1.1e-27
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3           ( 596) 1027 117.1 7.2e-26
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9           ( 889)  986 113.3 1.6e-24
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20         ( 367)  971 111.4 2.4e-24
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20         ( 427)  971 111.5 2.7e-24
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6            ( 431)  963 110.7 4.7e-24
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 445)  963 110.7 4.8e-24
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 459)  963 110.7 4.9e-24
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8           ( 496)  963 110.7 5.1e-24
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 526)  963 110.8 5.3e-24
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11       ( 482)  958 110.2 7.1e-24
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 451)  944 108.8 1.8e-23
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 472)  944 108.8 1.8e-23
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 525)  944 108.9   2e-23
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11       ( 765)  884 103.1 1.6e-21
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11        ( 772)  884 103.1 1.6e-21
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6         ( 733)  882 102.9 1.7e-21
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6        ( 741)  882 102.9 1.8e-21
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6        ( 758)  882 102.9 1.8e-21
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14       ( 549)  860 100.6 6.4e-21
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1        ( 719)  861 100.8 7.2e-21
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1          ( 735)  861 100.8 7.4e-21
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1        ( 744)  861 100.8 7.4e-21
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14        ( 802)  860 100.7 8.4e-21
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX        ( 740)  857 100.4 9.7e-21
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19        ( 343)  844 98.8 1.4e-20
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19        ( 351)  844 98.8 1.4e-20
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1         ( 338)  834 97.8 2.7e-20
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX       ( 745)  841 98.8 2.9e-20
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17       ( 502)  836 98.2 3.1e-20
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX       ( 745)  839 98.6 3.4e-20


>>CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14               (683 aa)
 initn: 4721 init1: 4721 opt: 4721  Z-score: 2552.6  bits: 482.7 E(32554): 7.3e-136
Smith-Waterman score: 4721; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 QKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 QKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 WVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRRVHQINGHKFMATYLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 WVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRRVHQINGHKFMATYLR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ELAKTLAGMGLQPGNISPTSKLVSRSTLRRQGKESSKEGNGIGVNSSNRLGIDNFEFIRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ELAKTLAGMGLQPGNISPTSKLVSRSTLRRQGKESSKEGNGIGVNSSNRLGIDNFEFIRV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDE
              610       620       630       640       650       660

              670       680   
pF1KB9 GHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
       :::::::::::::::::::::::
CCDS97 GHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
              670       680   

>>CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2                (737 aa)
 initn: 2498 init1: 1394 opt: 1747  Z-score: 961.8  bits: 188.5 E(32554): 3e-47
Smith-Waterman score: 3010; 61.4% identity (82.2% similar) in 718 aa overlap (27-683:23-737)

               10        20        30         40        50         
pF1KB9 MSSGTMKFNGYLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQ-LLDPYLTVSVDQVRVGQTST
                                 :::::..  . .  :::::....::. :.:::.:
CCDS18     MVVFNGLLKIKICEAVSLKPTAWSLRHAVGPRPQTFLLDPYIALNVDDSRIGQTAT
                   10        20        30        40        50      

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 KQKTNKPTYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFE
       :::::.:....:: ..: .: ..::::::..:.::: ::::::.::.:::..  .:  ::
CCDS18 KQKTNSPAWHDEFVTDVCNGRKIELAVFHDAPIGYDDFVANCTIQFEELLQN--GSRHFE
         60        70        80        90       100         110    

     120       130       140        150         160       170      
pF1KB9 GWVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQ-RDRIFKHFTR--KRQRAMRRRVHQINGHKFMA
        :.::::::.:.:.: :.::  ::  . ..:.:..  :  ::: :.::::::.:::::::
CCDS18 DWIDLEPEGRVYVIIDLSGSSGEAPKDNEERVFRERMRPRKRQGAVRRRVHQVNGHKFMA
          120       130       140       150       160       170    

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 TYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIA
       :::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::.::.: :.  .. .  : ...
CCDS18 TYLRQPTYCSHCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPD-QVG
          180       190       200       210       220       230    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCG
        :::..:.::::.:::::::::::::::::::..:::::::.:::::: ::..:::::::
CCDS18 SQRFSVNMPHKFGIHNYKVPTFCDHCGSLLWGLLRQGLQCKVCKMNVHRRCETNVAPNCG
           240       250       260       270       280       290   

        300       310                              320             
pF1KB9 VNAVELAKTLAGMGLQPGNI-----------------------SPTSKLVSRST------
       :.:  .::.:: .:. : .:                       ::. .  :.:.      
CCDS18 VDARGIAKVLADLGVTPDKITNSGQRRKKLIAGAESPQPASGSSPSEEDRSKSAPTSPCD
           300       310       320       330       340       350   

                330                        340        350       360
pF1KB9 ---------LRR------QGKE----SSKEG-------NG-IGVNSSNRLGIDNFEFIRV
                .:.      .:.:    :: .:       :: .  ....:::.:.:.::.:
CCDS18 QEIKELENNIRKALSFDNRGEEHRAASSPDGQLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFNFIKV
           360       370       380       390       400       410   

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 LGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLF
       ::::::::::::..:   ..:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::.::::.
CCDS18 LGKGSFGKVMLAELKGKDEVYAVKVLKKDVILQDDDVDCTMTEKRILALARKHPYLTQLY
           420       430       440       450       460       470   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 CCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDL
       ::::: ::::::::.::::::::.::.::.::: :.::::::. :::::::..:.:::::
CCDS18 CCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVIYRDL
           480       490       500       510       520       530   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 KLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAM
       ::::.::: :::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::. :::.:::::.
CCDS18 KLDNILLDAEGHCKLADFGMCKEGILNGVTTTTFCGTPDYIAPEILQELEYGPSVDWWAL
           540       550       560       570       580       590   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 GVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSL
       :::.:::. :. ::::.:::::::.::.:.:.::.:: ..:..:::.::::::  ::: .
CCDS18 GVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKRLGCV
           600       610       620       630       640       650   

               610       620       630       640       650         
pF1KB9 -TQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPID
        .:.:: :: .:::::::::. :....:.:::.::::...::.::: :: .:::::: .:
CCDS18 ASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVLTLVD
           660       670       680       690       700       710   

     660       670       680   
pF1KB9 EGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
       :. . .:::.::..::: . .:.:
CCDS18 EAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
           720       730       

>>CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3                (676 aa)
 initn: 1733 init1: 1078 opt: 1505  Z-score: 832.8  bits: 164.5 E(32554): 4.6e-40
Smith-Waterman score: 1907; 44.8% identity (74.3% similar) in 643 aa overlap (55-682:41-671)

           30        40        50        60         70        80   
pF1KB9 TRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQVRVGQTSTKQK-TNKPTYNEEFCANVTDGGHLE
                                     :.: ...: :  : ..  : :.. .:  ..
CCDS28 SYELGSLQAEDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTFDAHIYEGRVIQ
               20        30        40        50        60        70

            90       100       110       120       130         140 
pF1KB9 LAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELLRTTGASDTFEGWVDLEPEGKVFVVIT--LTGSFT
       ..... .    .. ... ..  ..  ...: .   : :.::.:..::.. .   :     
CCDS28 IVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKA---EFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDC
               80        90       100          110       120       

             150       160        170       180       190       200
pF1KB9 EATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQG
       . ... .   :  : .:. :... ..: :..:.:.::.. :::.:: :..:.::. .:::
CCDS28 KQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFVWGL-NKQG
       130       140       150       160       170       180       

              210       220       230       240       250       260
pF1KB9 YQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCD
       :.:. :. ..::.:   :.  ::  .  :. :. . ..::.:..::.:..:::  :::::
CCDS28 YKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCT-GTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYMSPTFCD
        190       200        210       220       230       240     

              270       280       290       300       310       320
pF1KB9 HCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVELAKTLAGMGLQPGNISPTS
       ::::::::...:::.:. : :::: .:. .::  ::.:   ::..:  .  . .  : ..
CCDS28 HCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEALNQVTQRASRRSDSA
         250       260       270       280       290       300     

              330         340                350       360         
pF1KB9 KLVSRSTLRRQG--KESSKEGNGIGVNS---------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKV
       .  :. .   ::  :...  :. .  ::         :.. .:.:: : .::::::::::
CCDS28 S--SEPVGIYQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIWEGSSKCNINNFIFHKVLGKGSFGKV
           310       320       330       340       350       360   

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB9 MLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRL
       .:...:  :. .:.:.:::::.: ::::::::.:::.:.:: ..::::.:.: ::: :.:
CCDS28 LLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHL
           370       380       390       400       410       420   

     430       440       450       460       470       480         
pF1KB9 FFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDH
       ::::::.::::::.::: . ::.  :: ::::::. .:.:::.::::::::::::::::.
CCDS28 FFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDR
           430       440       450       460       470       480   

     490       500       510       520       530       540         
pF1KB9 EGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLC
       .:: :.::::::::.: .   ..::::::::::::::: . :  .::::..:::::::: 
CCDS28 DGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLI
           490       500       510       520       530       540   

     550       560       570       580       590       600         
pF1KB9 GHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAIL
       :..::....::.:::.:  :   :: :. ...  ::.... ..:: :::     :.  : 
CCDS28 GQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVT---GNIKI-
           550       560       570       580       590             

     610       620       630       640       650       660         
pF1KB9 RHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQD
        ::::: :.:. :..:..::::::..:: .: :::: .:..:.  :.  :.. .  ..:.
CCDS28 -HPFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQS
      600       610       620       630       640       650        

     670       680       
pF1KB9 EFRNFSYVSPELQP    
        : .::.:.:...     
CCDS28 AFAGFSFVNPKFEHLLED
      660       670      

>>CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16              (671 aa)
 initn: 1770 init1: 1126 opt: 1367  Z-score: 759.1  bits: 150.8 E(32554): 5.8e-36
Smith-Waterman score: 1696; 44.2% identity (64.0% similar) in 656 aa overlap (158-681:22-667)

       130       140       150       160        170       180      
pF1KB9 GKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRR-VHQINGHKFMATYLRQPTYCS
                                     :. :.:.. ::....::: : ...:::.::
CCDS10          MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCS
                        10        20        30        40        50 

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB9 HCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPH
       :: .:::: :::::.:::::  :::::::.... .:   ..    :.  ..        :
CCDS10 HCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSK--------H
               60        70        80        90       100          

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB9 KFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVEL----
       ::.::.:. :::::::::::.:...::..:  : :::: ::  ::   ::.. .:     
CCDS10 KFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRI
            110       120       130       140       150       160  

                                310           320                  
pF1KB9 -----------------AKTLAGM---GLQPGNIS----PTSKLVSRS------------
                        ::.:. :   ::.   ..    :  :  :..            
CCDS10 YIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPE
            170       180       190       200       210       220  

           330                                                     
pF1KB9 ---TLRRQGKESSK---------------------------------------------E
          :.: : :::.:                                             :
CCDS10 WNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEE
            230       240       250       260       270       280  

      340                                                  350     
pF1KB9 GNGIGV-----------------------------------------NSSNR--LGIDNF
       :. ..:                                         :..::  . . .:
CCDS10 GEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDF
            290       300       310       320       330       340  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB9 EFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPF
       .:. ::::::::::::.. : : .:::::.:::::..:::::::::.:::.:.:  . ::
CCDS10 NFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPF
            350       360       370       380       390       400  

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB9 LTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGI
       ::::  :::: :::.::::.:::::::.:::.  :: : .: ::::::  .:.::..:::
CCDS10 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
            410       420       430       440       450       460  

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB9 IYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAV
       ::::::::::.:: ::: :.::::::::.: .:::: :::::::::::::.  . :: .:
CCDS10 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
            470       480       490       500       510       520  

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB9 DWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTM
       ::::.:::::::: :.::::.:.::.::..:.. .:.::  . ..:..: :..:::.:  
CCDS10 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
            530       540       550       560       570       580  

         600       610       620       630       640       650     
pF1KB9 RLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVL
       :::   .: :. : .: ::. ::: .:....:.::..:. ....:.:::: .: ..   :
CCDS10 RLGCGPEG-ERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTRQPVEL
            590        600       610       620       630       640 

         660       670       680     
pF1KB9 TPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP  
       :: :.  .  ..:.:: .:::..::.    
CCDS10 TPTDKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV
             650       660       670 

>>CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17              (672 aa)
 initn: 1748 init1: 1116 opt: 1354  Z-score: 752.1  bits: 149.6 E(32554): 1.4e-35
Smith-Waterman score: 1683; 43.5% identity (63.2% similar) in 669 aa overlap (142-681:9-663)

             120       130       140       150       160        170
pF1KB9 TGASDTFEGWVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRR-VHQIN
                                     ..: ..: . ..:.::   :.:.. ::...
CCDS11                       MADVFPGNDSTASQD-VANRFARK--GALRQKNVHEVK
                                     10         20          30     

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 GHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINK
        :::.: ...:::.:::: .:::: :::::.:::::  :::::::.... .:   ..   
CCDS11 DHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPD
          40        50         60        70        80        90    

              240       250       260       270       280       290
pF1KB9 VDSKIAEQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQAN
       .:.  ..        :::.::.:  :::::::::::.:...::..:  : :::: .:  :
CCDS11 TDDPRSK--------HKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVIN
          100               110       120       130       140      

              300                               310                
pF1KB9 VAPNCGVNAVEL---------------------AKTLAGM---GLQ-----------PGN
       :   ::.. .:                      ::.:  :   ::.           : :
CCDS11 VPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKN
        150       160       170       180       190       200      

         320       330                                             
pF1KB9 ISPTSKLVSRSTLRRQGKES----------------------------------------
        :  .  . ::::  : .::                                        
CCDS11 ESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSEL
        210       220       230       240       250       260      

                                    340                            
pF1KB9 ---------------------------SKEGN---------------GIGV---------
                                  ..:::               :  :         
CCDS11 MKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQ
        270       280       290       300       310       320      

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 --NSSNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMT
         :. .:. . .:.:. :::::::::::::  : : .:::.:.:::::..:::::::::.
CCDS11 PSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMV
        330       340       350       360       370       380      

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB9 EKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAE
       :::.:.:  . ::::::  :::: :::.::::.:::::::.:::.  .: : .: :::::
CCDS11 EKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAE
        390       400       410       420       430       440      

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB9 IISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIA
       :  .:.::: .::::::::::::.:: ::: :.:::::::: . .:::: ::::::::::
CCDS11 ISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIA
        450       460       470       480       490       500      

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 PEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDAT
       :::.  . :: .:::::.:::::::: :. ::..:.::.::..:.. .: ::  : ..:.
CCDS11 PEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAV
        510       520       530       540       550       560      

            590       600       610       620       630       640  
pF1KB9 GILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVS
       .. :..:::.:. :::   .: :. . .: ::..::: .:..:.:.:::.:.. ..  . 
CCDS11 SVCKGLMTKHPAKRLGCGPEG-ERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGK-GAE
        570       580        590       600       610       620     

            650       660       670       680          
pF1KB9 NFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP       
       :::  : . .::::: :.  .  :.:..:..::::.:..         
CCDS11 NFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
          630       640       650       660       670  

>>CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16              (673 aa)
 initn: 1741 init1: 1126 opt: 1345  Z-score: 747.3  bits: 148.7 E(32554): 2.7e-35
Smith-Waterman score: 1674; 44.5% identity (63.7% similar) in 659 aa overlap (158-683:22-669)

       130       140       150       160        170       180      
pF1KB9 GKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRR-VHQINGHKFMATYLRQPTYCS
                                     :. :.:.. ::....::: : ...:::.::
CCDS10          MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCS
                        10        20        30        40        50 

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB9 HCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPH
       :: .:::: :::::.:::::  :::::::.... .:   ..    :.  ..        :
CCDS10 HCTDFIWG-FGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSK--------H
               60        70        80        90       100          

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB9 KFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVEL----
       ::.::.:. :::::::::::.:...::..:  : :::: ::  ::   ::.. .:     
CCDS10 KFKIHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRI
            110       120       130       140       150       160  

                                310           320                  
pF1KB9 -----------------AKTLAGM---GLQPGNIS----PTSKLVSRS------------
                        ::.:. :   ::.   ..    :  :  :..            
CCDS10 YIQAHIDRDVLIVLVRDAKNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPE
            170       180       190       200       210       220  

           330                                                     
pF1KB9 ---TLRRQGKESSK---------------------------------------------E
          :.: : :::.:                                             :
CCDS10 WNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEE
            230       240       250       260       270       280  

      340                                                  350     
pF1KB9 GNGIGV-----------------------------------------NSSNR--LGIDNF
       :. ..:                                         :..::  . . .:
CCDS10 GEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDF
            290       300       310       320       330       340  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB9 EFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPF
       .:. ::::::::::::.. : : .:::::.:::::..:::::::::.:::.:.:  . ::
CCDS10 NFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPF
            350       360       370       380       390       400  

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB9 LTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGI
       ::::  :::: :::.::::.:::::::.:::.  :: : .: ::::::  .:.::..:::
CCDS10 LTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGI
            410       420       430       440       450       460  

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB9 IYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAV
       ::::::::::.:: ::: :.::::::::.: .:::: :::::::::::::.  . :: .:
CCDS10 IYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSV
            470       480       490       500       510       520  

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB9 DWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTM
       ::::.:::::::: :.::::.:.::.::..:.. .:.::  . ..:..: :..:::.:  
CCDS10 DWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGK
            530       540       550       560       570       580  

         600       610       620       630       640       650     
pF1KB9 RLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVL
       :::   .: :. : .: ::. ::: .:....:.::..:.  .: .. :::  : .. :::
CCDS10 RLGCGPEG-ERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGR-NAENFDRFFTRHPPVL
            590        600       610       620        630       640

         660       670       680        
pF1KB9 TPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPE-LQP    
       :: :.  .  :.:.::..::.:. : :.:    
CCDS10 TPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
              650       660       670   

>>CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10              (581 aa)
 initn: 1759 init1: 1049 opt: 1311  Z-score: 729.9  bits: 145.2 E(32554): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 1806; 46.5% identity (75.6% similar) in 566 aa overlap (157-682:19-577)

        130       140       150       160        170       180     
pF1KB9 EGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLRQPTYC
                                     .:. :... .::... :.: ::.. :::.:
CCDS60             MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFC
                           10        20        30        40        

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 SHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIP
       : :.::.::. .::::::. :. ..::.:   ... ::  . ::. .. . ..:: :..:
CCDS60 SVCHEFVWGL-NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCT-GSAINSRETMFHKERFKIDMP
       50         60        70        80         90       100      

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB9 HKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVELAKT
       :.:...::: ::::.:::.::::. ::::.:  : :::: :::..::  ::.:   .:..
CCDS60 HRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEA
        110       120       130       140       150       160      

          310       320                330             340         
pF1KB9 LAGM-GLQPGNISPTSKLVSRS---------TLRRQGKE------SSKEGNGIGVNS---
       :: . . : .     .. . :          ... ...       ...: .::. .:   
CCDS60 LAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLD
        170       180       190       200       210       220      

                            350       360       370       380      
pF1KB9 --------------------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVL
                           . .: :..: . ..:::::::::.::. :.:....:.:.:
CCDS60 EVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKAL
        230       240       250       260       270       280      

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB9 KKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQ
       ::::.:.::::::::.:::.:::: .:::::..:: ::: . ::::::..::::::.:::
CCDS60 KKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQ
        290       300       310       320       330       340      

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB9 KSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGIC
       . ..:: .:: ::::::: .:.:::.:::.::::::::.:::..:: :.::::::::.. 
CCDS60 SCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENML
        350       360       370       380       390       400      

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB9 NGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAI
       . . : ::::::::::::::  . :. .::::..:::::::: :..::....:..::..:
CCDS60 GDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSI
        410       420       430       440       450       460      

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB9 LNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQ
         :.  :: ::...:  .: ......:  :::  ..:    : .::.:.::.: .:....
CCDS60 RMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLG--VRGD---IRQHPLFREINWEELERKE
        470       480       490         500          510       520 

        630       640       650       660       670       680      
pF1KB9 IEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP   
       :.:::::..::  : :::: .:..:.: :.  :.. .  ..:. :::::...: ..    
CCDS60 IDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
             530       540       550       560       570       580 

>>CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10               (706 aa)
 initn: 1759 init1: 1049 opt: 1311  Z-score: 728.8  bits: 145.3 E(32554): 2.8e-34
Smith-Waterman score: 1859; 41.4% identity (71.3% similar) in 691 aa overlap (41-682:25-702)

               20        30        40        50           60       
pF1KB9 YLRVRIGEAVGLQPTRWSLRHSLFKKGHQLLDPYLTVSVDQV---RVGQTSTKQK-TNKP
                                     ..:: .: : .    . ::   ..: :  :
CCDS70       MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYP
                     10        20        30        40        50    

         70        80        90       100        110       120     
pF1KB9 TYNEEFCANVTDGGHLELAVFHETPLGYDHFVANCTLQFQELL-RTTGASDTFEGWVDLE
        ..  : :... :  ... :  ..    : .... :...  :  :    .   : :..:.
CCDS70 PWDSTFDAHINKGRVMQIIVKGKN---VD-LISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELK
           60        70           80         90       100       110

         130           140       150       160        170       180
pF1KB9 PEGKVFV----VITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRR-RVHQINGHKFMATYLR
       :.:....     . .. .     .. . .:    ..:. :... .::... :.: ::.. 
CCDS70 PQGRMLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFA--LHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFP
              120       130       140         150       160        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRF
       :::.:: :.::.::. .::::::. :. ..::.:   ... ::  . ::. .. . ..::
CCDS70 QPTFCSVCHEFVWGL-NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCT-GSAINSRETMFHKERF
      170       180        190       200       210        220      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 GINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAV
        :..::.:...::: ::::.:::.::::. ::::.:  : :::: :::..::  ::.:  
CCDS70 KIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK
        230       240       250       260       270       280      

               310       320                330             340    
pF1KB9 ELAKTLAGM-GLQPGNISPTSKLVSRS---------TLRRQGKE------SSKEGNGIGV
        .:..:: . . : .     .. . :          ... ...       ...: .::. 
CCDS70 LMAEALAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISW
        290       300       310       320       330       340      

                                 350       360       370       380 
pF1KB9 NS-----------------------SNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLY
       .:                       . .: :..: . ..:::::::::.::. :.:....
CCDS70 ESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFF
        350       360       370       380       390       400      

             390       400       410       420       430       440 
pF1KB9 AVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDL
       :.:.:::::.:.::::::::.:::.:::: .:::::..:: ::: . ::::::..:::::
CCDS70 AIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDL
        410       420       430       440       450       460      

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB9 MFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMC
       :.:::. ..:: .:: ::::::: .:.:::.:::.::::::::.:::..:: :.::::::
CCDS70 MYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMC
        470       480       490       500       510       520      

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB9 KEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDD
       ::.. . . : ::::::::::::::  . :. .::::..:::::::: :..::....:..
CCDS70 KENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEE
        530       540       550       560       570       580      

             570       580       590       600       610       620 
pF1KB9 LFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQ
       ::..:  :.  :: ::...:  .: ......:  :::  ..:    : .::.:.::.: .
CCDS70 LFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLG--VRGD---IRQHPLFREINWEE
        590       600       610       620            630       640 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB9 LNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPEL
       :....:.:::::..::  : :::: .:..:.: :.  :.. .  ..:. :::::...: .
CCDS70 LERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGM
             650       660       670       680       690       700 

            
pF1KB9 QP   
       .    
CCDS70 ERLIS
            

>>CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19              (697 aa)
 initn: 1880 init1: 814 opt: 1284  Z-score: 714.5  bits: 142.6 E(32554): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 1561; 41.6% identity (61.1% similar) in 671 aa overlap (158-681:21-680)

       130       140       150       160        170       180      
pF1KB9 GKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRRV-HQINGHKFMATYLRQPTYCS
                                     :. :.:..: :....::: : ...:::.::
CCDS12           MAGLGPGVGDSEGGPRPLFCRKGALRQKVVHEVKSHKFTARFFKQPTFCS
                         10        20        30        40        50

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB9 HCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINKVDSKIAEQRFGINIPH
       :: .::::. :::: :::::. :::.:::....  :   ..  ..:.   .        :
CCDS12 HCTDFIWGI-GKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNK--------H
                60        70        80        90       100         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB9 KFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQANVAPNCGVNAVEL----
       :: .:.:. :::::::::::.:...::..:. :.:::: ::  .:   :::. .:     
CCDS12 KFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRGRL
             110       120       130       140       150       160 

                                 310                  320          
pF1KB9 ------------------AKTLAGM---GLQ-----------PGNISPTSKLVSRSTL--
                         :..:  :   ::.           : :..  .  . ..::  
CCDS12 QLEIRAPTADEIHVTVGEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNP
             170       180       190       200       210       220 

                      330                                          
pF1KB9 ----------------RRQGKE-----------------------------------SSK
                       :: . :                                   ...
CCDS12 VWNETFVFNLKPGDVERRLSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLNQE
             230       240       250       260       270       280 

       340                                                         
pF1KB9 EGNG-------------------------------IGVNSS-------------------
       ::.                                .: .::                   
CCDS12 EGEYYNVPVADADNCSLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGA
             290       300       310       320       330       340 

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB9 --NRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKR
         .:: :..: :. :::::::::::::. . . .:::.:.::::::.:::::.::..:::
CCDS12 SPGRLHISDFSFLMVLGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVEKR
             350       360       370       380       390       400 

         410            420       430       440       450       460
pF1KB9 ILSLARNHP-----FLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYA
       .:.:.   :     :::::   :::::::.::::.:.:::::.:::.  .: : .: :::
CCDS12 VLALGGRGPGGRPHFLTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYA
             410       420       430       440       450       460 

              470       480       490       500       510       520
pF1KB9 AEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDY
       :::  .:.:::..::::::::::::.:: ::: :..:::::::..  :.:: ::::::::
CCDS12 AEIAIGLFFLHNQGIIYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDY
             470       480       490       500       510       520 

              530       540       550       560       570       580
pF1KB9 IAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHED
       :::::.  . :: .::::..:::::::: :. ::..:.:..::.::... :.::  : ..
CCDS12 IAPEIIAYQPYGKSVDWWSFGVLLYEMLAGQPPFDGEDEEELFQAIMEQTVTYPKSLSRE
             530       540       550       560       570       580 

              590       600       610       620       630       640
pF1KB9 ATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSRED
       :..: :.:.::.:  ::::    :: .:  : ::. ::: .:.. .: ::::::  .:  
CCDS12 AVAICKGFLTKHPGKRLGS-GPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSG
             590       600        610       620       630       640

              650       660       670       680                  
pF1KB9 VSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP               
         :::  : .  :.::: :.  :  :.: .:..:.::.:..                 
CCDS12 -ENFDKFFTRAAPALTPPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
               650       660       670       680       690       

>>CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1               (409 aa)
 initn: 1193 init1: 878 opt: 1193  Z-score: 668.7  bits: 133.4 E(32554): 6.3e-31
Smith-Waterman score: 1193; 50.6% identity (77.7% similar) in 346 aa overlap (343-681:57-402)

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB9 PGNISPTSKLVSRSTLRRQGKESSKEGNGIGVNSSNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLA
                                     :.. :. ::...:..:::.:.::..::.:.
CCDS41 DGIAYISSSRKHDSIKDDSEDLKPVIDGMDGIKISQGLGLQDFDLIRVIGRGSYAKVLLV
         30        40        50        60        70        80      

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB9 RVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMTEKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFV
       :.:.. ..::.::.::... .:.:.. ..:::...  : ..:::. :  :::: .:::.:
CCDS41 RLKKNDQIYAMKVVKKELVHDDEDIDWVQTEKHVFEQASSNPFLVGLHSCFQTTSRLFLV
         90       100       110       120       130       140      

            440       450       460       470       480       490  
pF1KB9 MEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAEIISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGH
       .:.:::::::::.:..:.. : .::::::::  :: :::..::::::::::::::: .::
CCDS41 IEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYAAEICIALNFLHERGIIYRDLKLDNVLLDADGH
        150       160       170       180       190       200      

            500       510       520       530       540       550  
pF1KB9 CKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIAPEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHA
        ::.:.::::::.  : ::.::::::.:::::::.   :: .:::::.:::..::. :..
CCDS41 IKLTDYGMCKEGLGPGDTTSTFCGTPNYIAPEILRGEEYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRS
        210       220       230       240       250       260      

                   560       570       580       590       600     
pF1KB9 PFE--AEN-----EDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDATGILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGE
       ::.  ..:     :: ::..::.  .  : .:   :. .::.:..:.:  :::   : : 
CCDS41 PFDIITDNPDMNTEDYLFQVILEKPIRIPRFLSVKASHVLKGFLNKDPKERLGCRPQTGF
        270       280       290       300       310       320      

         610       620       630       640       650       660     
pF1KB9 HAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVSNFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPM
         :  : ::. :::  :...:  :::.:.: .   ..::: .: .:   ::: ::  .  
CCDS41 SDIKSHAFFRSIDWDLLEKKQALPPFQPQITDDYGLDNFDTQFTSEPVQLTPDDEDAIKR
        330       340       350       360       370       380      

         670       680        
pF1KB9 INQDEFRNFSYVSPELQP     
       :.:.::..: :..: :       
CCDS41 IDQSEFEGFEYINPLLLSTEESV
        390       400         




683 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 23:19:30 2016 done: Thu Nov  3 23:19:31 2016
 Total Scan time:  3.440 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com