Result of FASTA (ccds) for pF1KB9098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9098, 1257 aa
  1>>>pF1KB9098 1257 - 1257 aa - 1257 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2320+/-0.00116; mu= 13.2950+/- 0.070
 mean_var=121.0504+/-23.744, 0's: 0 Z-trim(105.5): 133  B-trim: 23 in 1/50
 Lambda= 0.116571
 statistics sampled from 8336 (8481) to 8336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  4.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1257) 8195 1390.7       0
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       (1273) 4025 689.4 1.6e-197
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5         (1237) 3747 642.6 1.8e-183
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15       ( 489) 3175 546.2 7.6e-155
CCDS1802.1 SOS1 gene_id:6654|Hs108|chr2            (1333)  531 101.8 1.3e-20
CCDS9697.1 SOS2 gene_id:6655|Hs108|chr14           (1332)  511 98.4 1.3e-19
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1077)  506 97.5   2e-19
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1094)  506 97.5   2e-19
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9        (1095)  506 97.5   2e-19
CCDS65733.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1       ( 557)  442 86.6 1.9e-16
CCDS1325.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1        ( 583)  442 86.6   2e-16
CCDS55344.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9        ( 305)  396 78.7 2.5e-14
CCDS55346.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9        ( 529)  396 78.9   4e-14
CCDS55345.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9        ( 537)  396 78.9   4e-14
CCDS35143.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9        ( 557)  396 78.9 4.1e-14
CCDS54346.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2       ( 689)  397 79.1 4.4e-14
CCDS46256.1 RASGRP3 gene_id:25780|Hs108|chr2       ( 690)  397 79.1 4.4e-14
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7        ( 730)  381 76.4   3e-13
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 791)  346 70.5 1.9e-11
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 840)  346 70.5   2e-11
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 858)  346 70.6   2e-11
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       ( 867)  346 70.6   2e-11
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2       (1011)  346 70.6 2.3e-11
CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6        ( 904)  339 69.4 4.8e-11
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15      ( 597)  330 67.8 9.6e-11


>>CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15            (1257 aa)
 initn: 8195 init1: 8195 opt: 8195  Z-score: 7449.9  bits: 1390.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8195; 100.0% identity (100.0% similar) in 1257 aa overlap (1-1257:1-1257)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 KVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSIDFLNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSIDFLNT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 FLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSPRATRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSPRATRK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 FSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSPFSKAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSPFSKAT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 LDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTET
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB9 SPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB9 TPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB9 CKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFEN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB9 HSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB9 IIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB9 ALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250       
pF1KB9 KMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
             1210      1220      1230      1240      1250       

>>CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15            (1273 aa)
 initn: 7665 init1: 4009 opt: 4025  Z-score: 3659.7  bits: 689.4 E(32554): 1.6e-197
Smith-Waterman score: 8143; 98.7% identity (98.7% similar) in 1273 aa overlap (1-1257:1-1273)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RPSGLYLLEGCVCDRAPSPKPALSAKEPLEKQHYFTVNFSHENQKALELRTEDAKDCDEW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIERLKAEITS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLKDNERIQSTQTVAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRRKWKTIIQDYIRSPHADSMRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETIMFLH
              250       260       270       280       290       300

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIFYQGLKARISSWPTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQILAHCKQNRDFDKLL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVERNSLDYAKSKLEELS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITRGRLG
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CCDS10 SLSLKKEGERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTLLEEPESTEEEAKGSG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNAFEENS
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CCDS10 KVTVPQMIKRTREGTREAEMSRSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERL
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   ::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLLYGEPPKSPRATRKFSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GYTSMYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSAL
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CCDS10 SAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIM
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CCDS10 KTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSA
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pF1KB9 IFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESL
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pF1KB9 YESSLRIEPKLPT
       :::::::::::::
CCDS10 YESSLRIEPKLPT
             1270   

>>CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5              (1237 aa)
 initn: 4086 init1: 1877 opt: 3747  Z-score: 3407.3  bits: 642.6 E(32554): 1.8e-183
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pF1KB9 MQKGIRLNDGHVASLGLLARKDGTRKGYLSKRSSDNTKWQTKWFALLQNLLFYFESDSSS
       :::..: :.::.  :..::::.::..:.:::.... ..:. ::::: ::.:::::...: 
CCDS40 MQKSVRYNEGHALYLAFLARKEGTKRGFLSKKTAEASRWHEKWFALYQNVLFYFEGEQSC
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       ::.:.:::::: :.:.:.:  : ..    .. :.::.:::: :.::.:: :::: :. .:
CCDS40 RPAGMYLLEGCSCERTPAPPRAGAGQGGVRDALDKQYYFTVLFGHEGQKPLELRCEEEQD
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         ::. :: .:::  .  :.:.:::::.::.::::::: .:.:::.:.:: . ::::::.
CCDS40 GKEWMEAIHQASYADILIEREVLMQKYIHLVQIVETEKIAANQLRHQLEDQDTEIERLKS
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       :: .: : .::..  :.   .::: :::::::::::.::::::::::::.:::: ::::.
CCDS40 EIIALNKTKERMRPYQS-NQEDEDPDIKKIKKVQSFMRGWLCRRKWKTIVQDYICSPHAE
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pF1KB9 SMRKRNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSSIFLNSETI
       :::::::.::.:.:::.:::.::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS40 SMRKRNQIVFTMVEAESEYVHQLYILVNGFLRPLRMAASSKKPPISHDDVSSIFLNSETI
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       ::::.::.:::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS40 MFLHEIFHQGLKARIANWPTLILADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQVLANCKQNRDF
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       :::::.:::.: :: : ::::::::::::::::.::::::::::::::::.::..:::::
CCDS40 DKLLKQYEANPACEGRMLETFLTYPMFQIPRYIITLHELLAHTPHEHVERKSLEFAKSKL
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pF1KB9 EELSRIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQVPMSEKGKITR
       :::::.::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:::::::::  :.::...
CCDS40 EELSRVMHDEVSDTENIRKNLAIERMIVEGCDILLDTSQTFIRQGSLIQVPSVERGKLSK
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        ::::::::::::::::::.::..::::.::::::: :.: :.:::::::.:::......
CCDS40 VRLGSLSLKKEGERQCFLFTKHFLICTRSSGGKLHLLKTGGVLSLIDCTLIEEPDASDDD
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pF1KB9 AKGSGQDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDNIRCNGLMMNA
       .::::: . :::::: ::: :.  :::.:.: :::::::: ::::::::::::::::  .
CCDS40 SKGSGQVFGHLDFKIVVEPPDAAAFTVVLLAPSRQEKAAWMSDISQCVDNIRCNGLMTIV
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pF1KB9 FEENSKVTVPQMIKSDASLYCDDVDIRFSKTMNSCKVLQIRYASVERLLERLTDLRFLSI
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CCDS40 FEENSKVTVPHMIKSDARLHKDDTDICFSKTLNSCKVPQIRYASVERLLERLTDLRFLSI
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pF1KB9 DFLNTFLHSYRVFTTAIVVLDKLITIYKKPISAIPARSLELLFASGQNNKLLYGEPPKSP
       ::::::::.::.:::: ::: ::  :::.:...::.:::::.::..:::.  .    :::
CCDS40 DFLNTFLHTYRIFTTAAVVLGKLSDIYKRPFTSIPVRSLELFFATSQNNRGEHLVDGKSP
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pF1KB9 RATRKFSSPPPLSITKTSSPSRRRKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSP
       :  :::::::::....:::: : :::::. :. .   ::::.. :  ..   :  ..  :
CCDS40 RLCRKFSSPPPLAVSRTSSPVRARKLSLTSPLNSKIGALDLTTSSSPTTTTQSPAASPPP
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pF1KB9 FS-KATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPE-DPSALSKQSSEVSMREESDIDQ---
        . .  :: :.   . :  .. :   . . ..:. :     :.: . .. : .  :.   
CCDS40 HTGQIPLDLSR---GLSSPEQSPGTVEENVDNPRVDLCNKLKRSIQKAVLESAPADRAGV
     780       790          800       810       820       830      

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pF1KB9 NQSDDGDT-ETSPTKSPTTPKSVKNKNSSEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASA
       ..:  .:: : :: .::.::. .. ..    :     .:      .  :: . ..: :::
CCDS40 ESSPAADTTELSPCRSPSTPRHLRYRQ----P-----GG------QTADNAHCSVSPASA
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pF1KB9 FAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKH
       ::::::.:..:.:             ::   .:. ::::.:::.::::::::::::::::
CCDS40 FAIATAAAGHGSP------------PGFNNTERTCDKEFIIRRTATNRVLNVLRHWVSKH
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pF1KB9 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQM
       .:::: :.::: .:...::::..::.:: :::::::::.:.:.:.:  : .. ::.: ::
CCDS40 AQDFELNNELKMNVLNLLEEVLRDPDLLPQERKAAANILRALSQDDQDDIHLKLEDIIQM
     930       940       950       960       970       980         

    1010      1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KB9 AEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKH
       .. .::: ::. ::.:.:::.:::::..:..::::::.:::::::.:::::::::::..:
CCDS40 TDCMKAECFESLSAMELAEQITLLDHVIFRSIPYEEFLGQGWMKLDKNERTPYIMKTSQH
     990      1000      1010      1020      1030      1040         

    1070      1080      1090      1100      1110      1120         
pF1KB9 FNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLK
       :::.:::.::.:.   :...:..:::::::::::::::::::.::::::..:::::.:::
CCDS40 FNDMSNLVASQIMNYADVSSRANAIEKWVAVADICRCLHNYNGVLEITSALNRSAIYRLK
    1050      1060      1070      1080      1090      1100         

    1130      1140      1150      1160      1170      1180         
pF1KB9 KTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTP
       ::: :::::::::.::::: ::::::::::::.::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS40 KTWAKVSKQTKALMDKLQKTVSSEGRFKNLRETLKNCNPPAVPYLGMYLTDLAFIEEGTP
    1110      1120      1130      1140      1150      1160         

    1190      1200      1210      1220      1230      1240         
pF1KB9 NYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSL
       :.::.::::::::::::::::::::::::.:.:.:: ::.:::::.....::..::: ::
CCDS40 NFTEEGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTSYRIDHQPKVAQYLLDKDLIIDEDTLYELSL
    1170      1180      1190      1200      1210      1220         

    1250       
pF1KB9 RIEPKLPT
       .:::.:: 
CCDS40 KIEPRLPA
    1230       

>>CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15            (489 aa)
 initn: 3175 init1: 3175 opt: 3175  Z-score: 2893.5  bits: 546.2 E(32554): 7.6e-155
Smith-Waterman score: 3175; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (769-1257:1-489)

      740       750       760       770       780       790        
pF1KB9 RKLSLNIPIITGGKALDLAALSCNSNGYTSMYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42                               MYSAMSPFSKATLDTSKLYVSSSFTNKIPD
                                             10        20        30

      800       810       820       830       840       850        
pF1KB9 EGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDGDTETSPTKSPTTPKSVKNKNSS
               40        50        60        70        80        90

      860       870       880       890       900       910        
pF1KB9 EFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFP
              100       110       120       130       140       150

      920       930       940       950       960       970        
pF1KB9 PDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLT
              160       170       180       190       200       210

      980       990      1000      1010      1020      1030        
pF1KB9 QERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QERKAAANIIRTLTQEDPGDNQITLEEITQMAEGVKAEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVF
              220       230       240       250       260       270

     1040      1050      1060      1070      1080      1090        
pF1KB9 KKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWV
              280       290       300       310       320       330

     1100      1110      1120      1130      1140      1150        
pF1KB9 AVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKN
              340       350       360       370       380       390

     1160      1170      1180      1190      1200      1210        
pF1KB9 LREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LREALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQT
              400       410       420       430       440       450

     1220      1230      1240      1250       
pF1KB9 AYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AYKIEHQAKVTQYLLDQSFVMDEESLYESSLRIEPKLPT
              460       470       480         

>>CCDS1802.1 SOS1 gene_id:6654|Hs108|chr2                 (1333 aa)
 initn: 499 init1: 252 opt: 531  Z-score: 483.7  bits: 101.8 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 532; 28.7% identity (62.8% similar) in 376 aa overlap (902-1256:653-1021)

             880       890       900       910         920         
pF1KB9 TSCRELDNNRSALSAASAFAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFP--PDQRNGDKEFV
                                     :.  .  :... ..  :   . .   ::..
CCDS18 FVRTFLTTYRSFCKPQELLSLIIERFEIPEPEPTEADRIAIENGDQPLSAELKRFRKEYI
            630       640       650       660       670       680  

     930       940       950       960       970       980         
pF1KB9 IRRAATNRVLNVLRHWVSKHSQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANII-
         . .  ::::: :::: .:  ::: .  :  ..  :.  :    . . .  .. ..:: 
CCDS18 --QPVQLRVLNVCRHWVEHHFYDFERDAYLLQRMEEFIGTVRG--KAMKKWVESITKIIQ
              690       700       710       720         730        

      990        1000      1010        1020           1030         
pF1KB9 RTLTQED--PGDNQITLEEITQMAEGVKAEP--FENHSAL-----EIAEQLTLLDHLVFK
       :    .:  :: : ::..     .:   ..:  .:. . :     :::.:::::.  ...
CCDS18 RKKIARDNGPGHN-ITFQSSPPTVEWHISRPGHIETFDLLTLHPIEIARQLTLLESDLYR
      740       750        760       770       780       790       

    1040      1050      1060      1070      1080      1090         
pF1KB9 KIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVA
        .   :. :. : : .:.  .: ..:  .: ....  . . :...:... ::... . . 
CCDS18 AVQPSELVGSVWTKEDKEINSPNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVETENLEERVAVVSRIIE
       800       810       820       830       840       850       

    1100      1110      1120      1130      1140      1150         
pF1KB9 VADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNL
       . .. . :.:.:.:::..:.:: : ..:: .:. .. .. : .... ..:  :: ..:. 
CCDS18 ILQVFQELNNFNGVLEVVSAMNSSPVYRLDHTFEQIPSRQKKILEEAHEL--SEDHYKKY
       860       870       880       890       900         910     

    1160      1170      1180      1190         1200      1210      
pF1KB9 REALKNCDPPCVPYLGMYLTDLAFIEEGTPNYTE-DG--LVNFSKMRMISHIIREIRQFQ
          :.. .:::::..:.:::..   :::.:.  .  :  :.:::: : ...:  ::.:.:
CCDS18 LAKLRSINPPCVPFFGIYLTNILKTEEGNPEVLKRHGKELINFSKRRKVAEITGEIQQYQ
         920       930       940       950       960       970     

       1220      1230         1240         1250                    
pF1KB9 QTAYKIEHQAKVTQYLLDQSFV---MDEE---SLYESSLRIEPKLPT             
       .  : .. .. . ... . . .   :..:    :...::.:::. :              
CCDS18 NQPYCLRVESDIKRFFENLNPMGNSMEKEFTDYLFNKSLEIEPRNPKPLPRFPKKYSYPL
         980       990      1000      1010      1020      1030     

CCDS18 KSPGVRPSNPRPGTMRHPTPLQQEPRKISYSRIPESETESTASAPNSPRTPLTPPPASGA
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

>>CCDS9697.1 SOS2 gene_id:6655|Hs108|chr14                (1332 aa)
 initn: 515 init1: 237 opt: 511  Z-score: 465.6  bits: 98.4 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 523; 29.5% identity (63.2% similar) in 353 aa overlap (920-1254:671-1017)

     890       900       910       920       930       940         
pF1KB9 FAIATAGANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKH
                                     : .   ::.:  . .  :.:::.:::: .:
CCDS96 LLIERFEIPEPEPTDADKLAIEKGEQPISADLKRFRKEYV--QPVQLRILNVFRHWVEHH
              650       660       670       680         690        

     950       960       970       980       990        1000       
pF1KB9 SQDFETNDELKCKVIGFLEEVMHDPELLTQERKAAANIIRTLTQEDPG--DNQITLEEIT
         ::: . ::  .. .:.  :    . . .  .. :.:::   : . .  ...::.:   
CCDS96 FYDFERDLELLERLESFISSVRG--KAMKKWVESIAKIIRRKKQAQANGVSHNITFESPP
      700       710       720         730       740       750      

      1010        1020           1030      1040      1050      1060
pF1KB9 QMAEGVKAEP--FENHSAL-----EIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERT
          :   ..:  ::. . .     :::.:::::.  ...:.   :. :. : : .:.  .
CCDS96 PPIEWHISKPGQFETFDLMTLHPIEIARQLTLLESDLYRKVQPSELVGSVWTKEDKEINS
        760       770       780       790       800       810      

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KB9 PYIMKTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSM
       : ..:  .: ....  . . :.. :... ::... . . . .. . :.:.:.::::.:..
CCDS96 PNLLKMIRHTTNLTLWFEKCIVEAENFEERVAVLSRIIEILQVFQDLNNFNGVLEIVSAV
        820       830       840       850       860       870      

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KB9 NRSAIFRLKKTWLKVSKQTKALIDKLQKLVSSEGRFKNLREALKNCDPPCVPYLGMYLTD
       :  ...:: .:.  .... . ..:.  .:  :. .::.    ::. .:::::..:.:::.
CCDS96 NSVSVYRLDHTFEALQERKRKILDEAVEL--SQDHFKKYLVKLKSINPPCVPFFGIYLTN
        880       890       900         910       920       930    

             1190         1200      1210      1220      1230       
pF1KB9 LAFIEEGTPNYTED---GLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTAYKIEHQAKVTQYL--LDQ
       .   :::. .. .     :.:::: : ...:  ::.:.:.  : .. .  . ...  :. 
CCDS96 ILKTEEGNNDFLKKKGKDLINFSKRRKVAEITGEIQQYQNQPYCLRIEPDMRRFFENLNP
          940       950       960       970       980       990    

        1240          1250                                         
pF1KB9 SFVMDEES----LYESSLRIEPKLPT                                  
           .:.     :...::.:::.                                     
CCDS96 MGSASEKEFTDYLFNKSLEIEPRNCKQPPRFPRKSTFSLKSPGIRPNTGRHGSTSGTLRG
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

>>CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9             (1077 aa)
 initn: 386 init1: 175 opt: 506  Z-score: 462.4  bits: 97.5 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 508; 28.4% identity (59.2% similar) in 461 aa overlap (807-1254:628-1064)

        780       790       800       810       820       830      
pF1KB9 SKATLDTSKLYVSSSFTNKIPDEGDTTPEKPEDPSALSKQSSEVSMREESDIDQNQSDDG
                                     :.::::.:             .  ..: ::
CCDS48 GVDSVQELAPPPALPPKQRQLEPPAGKDGHPRDPSAVS------------GVPGKDSRDG
       600       610       620       630                   640     

        840       850        860       870       880       890     
pF1KB9 DTETSPTKSPTTPKSVKNKNS-SEFPLFSYNNGVVMTSCRELDNNRSALSAASAFAIATA
        .: .: ::: . .:.....  .:. :...:. .   . ..  ..   . ..:.  . . 
CCDS48 -SERAP-KSPDALESAQSEEEVDELSLIDHNEIMSRLTLKQEGDDGPDVRGGSGDILLVH
          650        660       670       680       690       700   

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB9 GANEGTPNKEKYRRMSLASAGFPPDQRNGDKEFVIRRAATNRVLNVLRHWVSKHS--QDF
       ...    .   : .  :..     . ..  :..  :    .   ..... :::..     
CCDS48 ATETDRKDLVLYCEAFLTTYRTFISPEELIKKLQYRYEKFSPFADTFKKRVSKNTFFVLV
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       :.: ::.:.:.             
CCDS78 LWELSLKIKPRNITRRKTDREEKT
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>>CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9             (1095 aa)
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CCDS48 GVDSVQELAPPPALPPKQRQLEPPAGKDGHPRDPSAVS------------GVPGKDSRDG
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pF1KB9 LYESSLRIEPKLPT          
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CCDS48 LWELSLKIKPRNITRRKTDREEKT
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CCDS65                             MDLMNGQASSVNIAATASEKSSSSESLS-DKG
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pF1KB9 TQMAEGVKAEPFE--NHSALEIAEQLTLLDHLVFKKIPYEEFFGQGWMKLEKNERTPYIM
       ... ..  :  :.  . .  : : :.::.:  ::: :  .:. . :: : ::   .:  .
CCDS65 SELKKSFDAVVFDVLKVTPEEYAGQITLMDVPVFKAIQPDELSSCGWNKKEKYSSAPNAV
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pF1KB9 KTTKHFNDISNLIASEIIRNEDINARVSAIEKWVAVADICRCLHNYNAVLEITSSMNRSA
         :..:: .:  .. ::.. . .. :. .. ... .:     :.: .:.. ..:... . 
CCDS65 AFTRRFNHVSFWVVREILHAQTLKIRAEVLSHYIKTAKKLYELNNLHALMAVVSGLQSAP
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       :::: :::  .:.. :. ..::. ..:.:  .: ::. ...    ::.::::.::.::..
CCDS65 IFRLTKTWALLSRKDKTTFEKLEYVMSKEDNYKRLRDYISSLKMTPCIPYLGIYLSDLTY
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pF1KB9 IEEGTPNYTEDGLVNFSKMRMISHIIREIRQFQQTA-YKIEHQAKVTQYLLD-------Q
       :. . :. : . : : ..  ....:.: : ..::.  : :    .: .:: .       :
CCDS65 IDSAYPS-TGSILENEQRSNLMNNILRIISDLQQSCEYDIPMLPHVQKYLNSVQYIEELQ
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CCDS65 KFVEDDN--YKLSLKIEPGTSTPRSAASREDLVGPEVGASPQSGRKSVAAEGALLPQTPP
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1257 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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