Result of FASTA (ccds) for pF1KB5418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5418, 484 aa
  1>>>pF1KB5418 484 - 484 aa - 484 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.3102+/-0.00138; mu= -23.0260+/- 0.080
 mean_var=412.0281+/-93.694, 0's: 0 Z-trim(106.9): 168  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.063185
 statistics sampled from 9146 (9279) to 9146 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.285), width:  16
 Scan time:  1.870

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2331.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2            ( 484) 3371 322.4 6.9e-88
CCDS54427.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2           ( 526) 3371 322.4 7.4e-88
CCDS4437.1 CLK4 gene_id:57396|Hs108|chr5           ( 481) 2639 255.6 8.4e-68
CCDS1107.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1            ( 498) 1840 182.8 7.3e-46
CCDS72939.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1           ( 499) 1828 181.7 1.6e-45
CCDS10265.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15          ( 490) 1642 164.8 1.9e-40
CCDS45304.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15          ( 638) 1642 164.8 2.4e-40


>>CCDS2331.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2                 (484 aa)
 initn: 3371 init1: 3371 opt: 3371  Z-score: 1691.3  bits: 322.4 E(32554): 6.9e-88
Smith-Waterman score: 3371; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:1-484)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 HSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECID
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 HKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 FELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 YTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 DVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 EHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 EHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLL
              430       440       450       460       470       480

           
pF1KB5 KKSI
       ::::
CCDS23 KKSI
           

>>CCDS54427.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2                (526 aa)
 initn: 3371 init1: 3371 opt: 3371  Z-score: 1690.8  bits: 322.4 E(32554): 7.4e-88
Smith-Waterman score: 3371; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:43-526)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PERRGSPLRGDLLGFQNVREPSSCGETLSGMRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR
             20        30        40        50        60        70  

               40        50        60        70        80        90
pF1KB5 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQ
             80        90       100       110       120       130  

              100       110       120       130       140       150
pF1KB5 RDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLI
            140       150       160       170       180       190  

              160       170       180       190       200       210
pF1KB5 CQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVL
            200       210       220       230       240       250  

              220       230       240       250       260       270
pF1KB5 EHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAY
            260       270       280       290       300       310  

              280       290       300       310       320       330
pF1KB5 QICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSAT
            320       330       340       350       360       370  

              340       350       360       370       380       390
pF1KB5 YDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAM
            380       390       400       410       420       430  

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 MERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERL
            440       450       460       470       480       490  

              460       470       480    
pF1KB5 FDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI
            500       510       520      

>>CCDS4437.1 CLK4 gene_id:57396|Hs108|chr5                (481 aa)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 2639  Z-score: 1330.7  bits: 255.6 E(32554): 8.4e-68
Smith-Waterman score: 2639; 79.1% identity (90.7% similar) in 484 aa overlap (1-482:1-480)

               10         20        30        40         50        
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKD-WDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHS-KMCDSHYLE
       :::::::.:::::... : . ..:.  ::::..:::::.:::..:: .:. :  : ::::
CCDS44 MRHSKRTHCPDWDSRESWGHESYRG--SHKRKRRSHSSTQENRHCKPHHQFKESDCHYLE
               10        20          30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB5 SRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHR
       .::.::.::..:::.::::::: .:  : : .:: :: :. : :::: :: ::: : : :
CCDS44 ARSLNERDYRDRRYVDEYRNDYCEGYVPRHYHRDIESGYRIHCSKSSVRSRRSSPKRK-R
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB5 IHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVEC
        .: .::. :..:::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS44 NRHCSSHQ-SRSKSHRRKRSRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVEC
       120        130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 IDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHIC
       :::   : :::::::::: :: ::::::::::::::.:::::.::::::::::.::::.:
CCDS44 IDHGMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPNSVFRCVQMLEWFDHHGHVC
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 IVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQ
       :::::::::::::::::.::::..::::.::::::.:.:::: ::::::::::::::::.
CCDS44 IVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRQMAYQICQSINFLHHNKLTHTDLKPENILFVK
        240       250       260       270       280       290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 SDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQ
       :::.  :: :.::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SDYVVKYNSKMKRDERTLKNTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQ
        300       310       320       330       340       350      

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB5 PCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLD
       ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:.::::::::::::::..::
CCDS44 PCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPQHMIQKTRKRKYFHHNQLD
        360       370       380       390       400       410      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB5 WDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFD
       ::::::::::: ::::::::::: .: :::.::::...::::::..:::: :::.:::::
CCDS44 WDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPTQRITLDEALQHPFFD
        420       430       440       450       460       470      

      480    
pF1KB5 LLKKSI
       ::::  
CCDS44 LLKKK 
        480  

>>CCDS1107.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1                 (498 aa)
 initn: 1759 init1: 1719 opt: 1840  Z-score: 936.9  bits: 182.8 E(32554): 7.3e-46
Smith-Waterman score: 1840; 55.4% identity (80.7% similar) in 487 aa overlap (1-481:1-482)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
       : : .: .  .  ..     ..:: . ..::.:: ::...  : .  .    ::....::
CCDS11 MPHPRRYHSSERGSRGSYREHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRRRRE----DSYHVRSR
               10        20        30        40            50      

                    70         80        90       100       110    
pF1KB5 SI-----NEKDYHSRRYIDEYR-NDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYK
       :      ...  ..:::   :: :::..    .. . :..  :. .  .:: :: ::: .
CCDS11 SSYDDRSSDRRVYDRRYCGSYRRNDYSRDRGDAYYDTDYRHSYEYQRENSSYRSQRSSRR
         60        70        80        90       100       110      

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 SKHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGK
        ::: ..  :.  :...::  .:..::::: ::::: . :: :. :::::.:::::.::.
CCDS11 -KHRRRRRRSRTFSRSSSHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGR
         120       130       140       150       160       170     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 VVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHH
       ::.:.::. :: .::.::.:::..: :::: ::.:::..:  ::..   ::::..::..:
CCDS11 VVQCVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYH
         180       190       200       210       220       230     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 GHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENI
       ::.:: ::::::::.::.:.:..::. . ..:.::.:.:..:.:::.:::::::::::::
CCDS11 GHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENI
         240       250       260       270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 LFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILAL
       :::.:::  .:: . :::::.. .  ..::::::::.: :::::.::::::::::::: :
CCDS11 LFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILEL
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB5 GWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHH
       ::::::::::::::..:::.:::.: :::..::::::::::::.:..::.::::.:::..
CCDS11 GWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYR
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pF1KB5 DRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKH
        ::::::..:::::: . ::::.... :.  ::..:::::..::::.::::.:: :::.:
CCDS11 GRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQH
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          480                 
pF1KB5 PFFDLLKKSI             
       :::  :.                
CCDS11 PFFARLRAEPPNKLWDSSRDISR
         480       490        

>>CCDS72939.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1                (499 aa)
 initn: 1794 init1: 1754 opt: 1828  Z-score: 931.0  bits: 181.7 E(32554): 1.6e-45
Smith-Waterman score: 1828; 55.3% identity (80.5% similar) in 488 aa overlap (1-481:1-483)

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pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
       : : .: .  .  ..     ..:: . ..::.:: ::...  : .  .    ::....::
CCDS72 MPHPRRYHSSERGSRGSYREHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRRRRE----DSYHVRSR
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pF1KB5 SI-----NEKDYHSRRYIDEYR-NDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYK
       :      ...  ..:::   :: :::..    .. . :..  :. .  .:: :: ::: .
CCDS72 SSYDDRSSDRRVYDRRYCGSYRRNDYSRDRGDAYYDTDYRHSYEYQRENSSYRSQRSSRR
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pF1KB5 SKHRIHHSTSHRRSHGKS-HRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFG
        ::: ..  :.  :...: :  .:..::::: ::::: . :: :. :::::.:::::.::
CCDS72 -KHRRRRRRSRTFSRSSSQHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFG
         120       130       140       150       160       170     

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pF1KB5 KVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEH
       .::.:.::. :: .::.::.:::..: :::: ::.:::..:  ::..   ::::..::..
CCDS72 RVVQCVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDY
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pF1KB5 HGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPEN
       :::.:: ::::::::.::.:.:..::. . ..:.::.:.:..:.:::.::::::::::::
CCDS72 HGHMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPEN
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pF1KB5 ILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILA
       ::::.:::  .:: . :::::.. .  ..::::::::.: :::::.::::::::::::: 
CCDS72 ILFVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILE
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pF1KB5 LGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFH
       :::::::::::::::..:::.:::.: :::..::::::::::::.:..::.::::.:::.
CCDS72 LGWSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFY
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pF1KB5 HDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALK
       . ::::::..:::::: . ::::.... :.  ::..:::::..::::.::::.:: :::.
CCDS72 RGRLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQ
         420       430       440       450       460       470     

           480                 
pF1KB5 HPFFDLLKKSI             
       ::::  :.                
CCDS72 HPFFARLRAEPPNKLWDSSRDISR
         480       490         

>>CCDS10265.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15               (490 aa)
 initn: 1549 init1: 1549 opt: 1642  Z-score: 839.4  bits: 164.8 E(32554): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 1642; 51.2% identity (75.0% similar) in 484 aa overlap (1-477:1-472)

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pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
       :.: ::   :.  :   .: .:       .:.::.:  .:. : .:   .    .  .::
CCDS10 MHHCKRYRSPE-PDPYLSY-RW-------KRRRSYSREHEG-RLRYPSRREPPPRRSRSR
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pF1KB5 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCE---PGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKH
       : ..  :. :::  : :.. :  ::   :.  .  .    . :  .:  :.   . :  :
CCDS10 SHDRLPYQ-RRY-RERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAH
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pF1KB5 RIHH----STSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFG
       . :.    : :   :....  .. .::::::.::::.:. :: :. ::::: .::::.::
CCDS10 HCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFG
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pF1KB5 KVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEH
       :::::.::  :  .::.::..:: .: :::: ::.::....  : .. : :: : .::. 
CCDS10 KVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNF
      170       180       190       200       210       220        

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pF1KB5 HGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPEN
       :::.::.::::: .:..:.:::.: :. : :.:.::::.:... ::: :.::::::::::
CCDS10 HGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPEN
      230       240       250       260       270       280        

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pF1KB5 ILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILA
       ::::.:..   :: . . .:... : .:.:.::::::.: :::.:.:.::::: ::::: 
CCDS10 ILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILE
      290       300       310       320       330       340        

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pF1KB5 LGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFH
       :::.::::::::::::.::: :::.: ::...:::.:::.::::.:.:::..:::.:::.
CCDS10 LGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFY
      350       360       370       380       390       400        

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 HDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALK
       .  : :::.:: ::::.. ::::: .::....:: .::::...:::.:::.:::: ::: 
CCDS10 KGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALL
      410       420       430       440       450       460        

           480               
pF1KB5 HPFFDLLKKSI           
       ::::                  
CCDS10 HPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR
      470       480       490

>>CCDS45304.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15               (638 aa)
 initn: 1549 init1: 1549 opt: 1642  Z-score: 837.7  bits: 164.8 E(32554): 2.4e-40
Smith-Waterman score: 1642; 51.2% identity (75.0% similar) in 484 aa overlap (1-477:149-620)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR
                                     :.: ::   :.  :   .: .:       .
CCDS45 GLPRAEVAAGSGRGARSGEWGLAAAGAWETMHHCKRYRSPE-PDPYLSY-RW-------K
      120       130       140       150        160                 

               40        50        60        70        80          
pF1KB5 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCE---PG
       :.::.:  .:. : .:   .    .  .::: ..  :. :::  : :.. :  ::   :.
CCDS45 RRRSYSREHEG-RLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQ-RRY-RERRDSDTYRCEERSPS
     170       180        190       200         210       220      

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pF1KB5 HRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHH----STSHRRSHGKSHRRKRTRSVED
         .  .    . :  .:  :.   . :  :. :.    : :   :....  .. .:::::
CCDS45 FGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVED
        230       240       250       260       270       280      

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pF1KB5 DEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAA
       :.::::.:. :: :. ::::: .::::.:::::::.::  :  .::.::..:: .: :::
CCDS45 DKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAA
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KB5 RSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLD
       : ::.::....  : .. : :: : .::. :::.::.::::: .:..:.:::.: :. : 
CCDS45 RLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLP
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pF1KB5 HIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKV
       :.:.::::.:... ::: :.::::::::::::::.:..   :: . . .:... : .:.:
CCDS45 HVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRV
        410       420       430       440       450       460      

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pF1KB5 VDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHD
       .::::::.: :::.:.:.::::: ::::: :::.::::::::::::.::: :::.: ::.
CCDS45 ADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHE
        470       480       490       500       510       520      

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB5 SKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQ
       ..:::.:::.::::.:.:::..:::.:::..  : :::.:: ::::.. ::::: .::..
CCDS45 NREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQD
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pF1KB5 DVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI           
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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