Result of FASTA (omim) for pF1KB4626
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4626, 770 aa
  1>>>pF1KB4626 770 - 770 aa - 770 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8908+/-0.000435; mu= -1.0602+/- 0.027
 mean_var=267.3534+/-53.634, 0's: 0 Z-trim(119.6): 132  B-trim: 637 in 2/53
 Lambda= 0.078439
 statistics sampled from 33633 (33820) to 33633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.397), width:  16
 Scan time: 14.550

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001078923 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating  ( 770) 5118 593.2 1.4e-168
XP_011522986 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase- ( 777) 5094 590.5  9e-168
NP_054749 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating pro ( 761) 3309 388.5 5.7e-107
XP_011522987 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase- ( 768) 3285 385.8 3.8e-106
XP_016875749 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 664) 2538 301.2 9.4e-81
NP_001128686 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating  ( 729) 2538 301.2   1e-80
XP_016875748 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 694) 2528 300.1 2.1e-80
NP_476510 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 759) 2528 300.1 2.3e-80
XP_005254054 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 758) 2526 299.9 2.7e-80
NP_631940 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 471) 2434 289.3 2.5e-77
XP_016875750 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 470) 2432 289.1 2.9e-77
XP_016875747 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 713) 2414 287.2 1.7e-76
XP_006719771 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 714) 2404 286.0 3.7e-76
XP_006719770 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 744) 2381 283.5 2.3e-75
XP_006719776 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 456) 2373 282.4 2.9e-75
NP_476511 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 631) 2373 282.5 3.8e-75
NP_001128685 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating  ( 681) 2238 267.2 1.6e-70
NP_055591 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating pro ( 679) 2230 266.3   3e-70
XP_006719775 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 596) 2224 265.6 4.3e-70
XP_006719772 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase- ( 709) 2225 265.8 4.6e-70
NP_001317083 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating  ( 421) 2218 264.8 5.3e-70
NP_001317082 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating  ( 708) 2217 264.9 8.5e-70
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462)  309 48.8 6.1e-05
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527)  309 48.9 6.7e-05
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565)  309 48.9 7.1e-05
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580)  309 48.9 7.2e-05
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580)  309 48.9 7.2e-05
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630)  309 48.9 7.7e-05
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683)  309 49.0 8.2e-05
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 911)  309 49.0  0.0001
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 804)  294 47.3  0.0003
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808)  294 47.3  0.0003
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857)  294 47.3 0.00032
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882)  294 47.3 0.00033
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886)  294 47.3 0.00033
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073)  294 47.4 0.00038
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098)  294 47.4 0.00039
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106)  294 47.4 0.00039
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126)  294 47.4 0.00039
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147)  294 47.4  0.0004
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151)  294 47.4  0.0004
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK  ( 836)  283 46.1 0.00074
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856)  283 46.1 0.00075
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172)  283 46.2 0.00096
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192)  283 46.2 0.00097
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192)  283 46.2 0.00097
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  259 43.3  0.0046
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  259 43.3  0.0046
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776)  259 43.3  0.0046
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778)  259 43.3  0.0046


>>NP_001078923 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating prot  (770 aa)
 initn: 5118 init1: 5118 opt: 5118  Z-score: 3147.8  bits: 593.2 E(85289): 1.4e-168
Smith-Waterman score: 5118; 100.0% identity (100.0% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770
pF1KB4 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
              730       740       750       760       770

>>XP_011522986 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase-acti  (777 aa)
 initn: 4667 init1: 4667 opt: 5094  Z-score: 3133.0  bits: 590.5 E(85289): 9e-168
Smith-Waterman score: 5094; 99.1% identity (99.1% similar) in 777 aa overlap (1-770:1-777)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKNGHYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSEA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
              370       380       390       400       410       420

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       :::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
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>>NP_054749 (OMIM: 608434) ARF GTPase-activating protein  (761 aa)
 initn: 3307 init1: 3307 opt: 3309  Z-score: 2041.5  bits: 388.5 E(85289): 5.7e-107
Smith-Waterman score: 5026; 98.8% identity (98.8% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-761)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
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       :::::::::::::         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_054 KRRQQGKSLSSPTDNLELSLRSQSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGATRSNRARSM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 DSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHKLQAENLQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
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pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKRPALEPVRSSLRLLNASAYR
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pF1KB4 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
             720       730       740       750       760 

>>XP_011522987 (OMIM: 608434) PREDICTED: ARF GTPase-acti  (768 aa)
 initn: 2856 init1: 2856 opt: 3285  Z-score: 2026.7  bits: 385.8 E(85289): 3.8e-106
Smith-Waterman score: 5002; 97.9% identity (97.9% similar) in 777 aa overlap (1-770:1-768)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 HKNGHYIIPQMAD---------SLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPPGDELTTRL
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pF1KB4 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLLSCSQEGSRHTSKLSRHG
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pF1KB4 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGADSDYENTQSGDPLLGLEGKRFLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQ
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pF1KB4 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPK-------RPALEPVRSSLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       :::::::::::::
XP_011 VTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFPKPHSCPLQRPALEPVRSSLRL
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pF1KB4 LNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQLVTITTREKKQ
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>>XP_016875749 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase-acti  (664 aa)
 initn: 2686 init1: 1468 opt: 2538  Z-score: 1570.8  bits: 301.2 E(85289): 9.4e-81
Smith-Waterman score: 2773; 63.0% identity (77.8% similar) in 721 aa overlap (1-700:1-659)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
XP_016 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
XP_016 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
XP_016 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_016 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::        .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
XP_016 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
              250               260       270       280       290  

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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_016 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
       :::::::.:::.  ::.:: :..       .:. .:: :::::::::::: :    : :.
XP_016 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:.... 
XP_016 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
       ::.:: .::.        : :    .. ..:. .    :.  :  . .:::: ::. ::.
XP_016 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
       470       480       490       500         510       520     

      530            540       550       560       570       580   
pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
         : :.     :   :::::               ::                       
XP_016 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PA-----------------------
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           590       600       610           620       630         
pF1KB4 SCSQEGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELES
               :.:.: ...:  .:::.:: .     :.    .:..   .   . . :.   
XP_016 --------HASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTAE
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pF1KB4 LDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFP
            .: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.:::
XP_016 PHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFP
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pF1KB4 KRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQ
       :                                                           
XP_016 KVKTQV                                                      
      660                                                          

>>NP_001128686 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating prot  (729 aa)
 initn: 3011 init1: 1468 opt: 2538  Z-score: 1570.2  bits: 301.2 E(85289): 1e-80
Smith-Waterman score: 3106; 64.0% identity (79.1% similar) in 788 aa overlap (1-767:1-726)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
NP_001 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
NP_001 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
NP_001 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_001 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::        .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
NP_001 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
NP_001 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
       :::::::.:::.  ::.:: :..       .:. .:: :::::::::::: :    : :.
NP_001 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:.... 
NP_001 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
       ::.:: .::.        : :    .. ..:. .    :.  :  . .:::: ::. ::.
NP_001 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
       470       480       490       500         510       520     

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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
         : :.     :   :::::               ::                       
NP_001 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PA-----------------------
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pF1KB4 SCSQEGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELES
               :.:.: ...:  .:::.:: .     :.    .:..   .   . . :.   
NP_001 --------HASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTAE
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pF1KB4 LDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLFP
            .: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.:::
NP_001 PHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALFP
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pF1KB4 KRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAKQ
       :.:  . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.:::::::::::::::::
NP_001 KKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAKQ
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     760       770
pF1KB4 LVTITTREKKQ
       ::::::.:   
NP_001 LVTITTKENNN
      720         

>>XP_016875748 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase-acti  (694 aa)
 initn: 2681 init1: 1468 opt: 2528  Z-score: 1564.4  bits: 300.1 E(85289): 2.1e-80
Smith-Waterman score: 2861; 64.3% identity (80.5% similar) in 722 aa overlap (1-700:1-689)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
XP_016 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
XP_016 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
XP_016 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_016 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::        .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
XP_016 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_016 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
       :::::::.:::.  ::.:: :..       .:. .:: :::::::::::: :    : :.
XP_016 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:.... 
XP_016 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
       ::.:: .::.        : :    .. ..:. .    :.  :  . .:::: ::. ::.
XP_016 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
       470       480       490       500         510       520     

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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
         : :.     :   :::::               :: . :    .:.:..:  ::.  :
XP_016 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
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pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
       : :. :..:..:.: ...:  .:::.:: .     :.    .:..   .   . . :.  
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pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
             .: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.::
XP_016 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
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pF1KB4 PKRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAK
       ::                                                          
XP_016 PKVKTQV                                                     
       690                                                         

>>NP_476510 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating protein  (759 aa)
 initn: 3006 init1: 1468 opt: 2528  Z-score: 1563.8  bits: 300.1 E(85289): 2.3e-80
Smith-Waterman score: 3194; 65.1% identity (81.5% similar) in 789 aa overlap (1-767:1-756)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
NP_476 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
NP_476 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
               70        80        90       100       110       120

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       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
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       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::        .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
NP_476 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
NP_476 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
       :::::::.:::.  ::.:: :..       .:. .:: :::::::::::: :    : :.
NP_476 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:.... 
NP_476 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
       ::.:: .::.        : :    .. ..:. .    :.  :  . .:::: ::. ::.
NP_476 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
       470       480       490       500         510       520     

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pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
         : :.     :   :::::               :: . :    .:.:..:  ::.  :
NP_476 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
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pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
       : :. :..:..:.: ...:  .:::.:: .     :.    .:..   .   . . :.  
NP_476 SWSRDESARRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTA
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pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
             .: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.::
NP_476 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
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pF1KB4 PKRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAK
       ::.:  . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.::::::::::::::::
NP_476 PKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAK
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pF1KB4 QLVTITTREKKQ
       :::::::.:   
NP_476 QLVTITTKENNN
       750         

>>XP_005254054 (OMIM: 608564) PREDICTED: ARF GTPase-acti  (758 aa)
 initn: 3097 init1: 1468 opt: 2526  Z-score: 1562.6  bits: 299.9 E(85289): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 3192; 65.1% identity (81.4% similar) in 789 aa overlap (1-767:1-755)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
XP_005 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
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pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
XP_005 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
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pF1KB4 PCRDDDGVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGTTPLHVAAKAGQT
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
XP_005 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
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       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::         ::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
XP_005 HKNGQHFIIPQMAD---------SLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
XP_005 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
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pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
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XP_005 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
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pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:.... 
XP_005 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLQT
       410        420       430       440       450       460      

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pF1KB4 LQAENLQLRQPPGP----VPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPF
       ::.:: .::.        : :    .. ..:. .    :.  :  . .:::: ::. ::.
XP_005 LQSENSNLRKQATTNVYQVQTGSEYTDTSNHSSLKRRPSA--RGSRPMSMYETGSGQKPY
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      530            540       550       560       570       580   
pF1KB4 GGPPGD-----ELTTRLQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYRIRKGVSASAVPFTPSSPLL
         : :.     :   :::::               :: . :    .:.:..:  ::.  :
XP_005 L-PMGEASRPEESRMRLQPF---------------PAHIGRSALVTSSSSLPSFPST--L
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pF1KB4 SCSQ-EGSRHTSKLSRHGSGADSDYENTQSGDPLLGL----EGKRFLELGKEEDFHPELE
       : :. :..:..:.: ...:  .:::.:: .     :.    .:..   .   . . :.  
XP_005 SWSRDESARRASRLEKQNSTPESDYDNTPNDMEPDGMGSSRKGRQRSMVWPGDGLVPDTA
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pF1KB4 SLDGDLDPGLPSTEDVILKTEQVTKNIQELLRAAQEFKHDSFVPCSEKIHLAVTEMASLF
             .: :::::::: ::::.::::::::::::: ::::..::::.::.::::::.::
XP_005 EPHVAPSPTLPSTEDVIRKTEQITKNIQELLRAAQENKHDSYIPCSERIHVAVTEMAALF
        630       640       650       660       670       680      

      700       710       720       730       740       750        
pF1KB4 PKRPALEPVRSSLRLLNASAYRLQSECRKTVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAKAAK
       ::.:  . ::.:::::..:::::::::.::.: .::.:.: ::.::::::::::::::::
XP_005 PKKPKSDMVRTSLRLLTSSAYRLQSECKKTLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAKAAK
        690       700       710       720       730       740      

      760       770
pF1KB4 QLVTITTREKKQ
       :::::::.:   
XP_005 QLVTITTKENNN
        750        

>>NP_631940 (OMIM: 608564) ARF GTPase-activating protein  (471 aa)
 initn: 2334 init1: 1468 opt: 2434  Z-score: 1509.2  bits: 289.3 E(85289): 2.5e-77
Smith-Waterman score: 2434; 76.8% identity (91.0% similar) in 478 aa overlap (1-470:1-465)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSRKGPRAEVCADCSAPDPGWASISRGVLVCDECCSVHRSLGRHISIVKHLRHSAWPPTL
       ::..   .:::::::.:::.:::..::...:::::::::::::::: :.::.:. :::::
NP_631 MSKRLRSSEVCADCSGPDPSWASVNRGTFLCDECCSVHRSLGRHISQVRHLKHTPWPPTL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 LQMVHTLASNGANSIWEHSLLDPAQVQSGRRKANPQDKVHPIKSEFIRAKYQMLAFVHKL
       ::::.:: .:::::::::::::::...:::::::::::::: :.::::::::::::::.:
NP_631 LQMVETLYNNGANSIWEHSLLDPASIMSGRRKANPQDKVHPNKAEFIRAKYQMLAFVHRL
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       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::: 
NP_631 PCRDDDSVTAKDLSKQLHSSVRTGNLETCLRLLSLGAQANFFHPEKGNTPLHVASKAGQI
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pF1KB4 LQAELLVVYGADPGSPDVNGRTPIDYARQAGHHELAERLVECQYELTDRLAFYLCGRKPD
       ::::::.:::::::. : .:.::.:::::.::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_631 LQAELLAVYGADPGTQDSSGKTPVDYARQGGHHELAERLVEIQYELTDRLAFYLCGRKPD
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pF1KB4 HKNG-HYIIPQMADRSRQKCMSQSLDLSELAKAAKKKLQALSNRLFEELAMDVYDEVDRR
       :::: :.:::::::        .::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
NP_631 HKNGQHFIIPQMAD--------SSLDLSELAKAAKKKLQSLSNHLFEELAMDVYDEVDRR
              250               260       270       280       290  

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pF1KB4 ENDAVWLATQNHSTLVTERSAVPFLPVNPEYSATRNQGRQKLARFNAREFATLIIDILSE
       :.:::::::::::.:::: ..:::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::::.
NP_631 ETDAVWLATQNHSALVTETTVVPFLPVNPEYSSTRNQGRQKLARFNAHEFATLVIDILSD
            300       310       320       330       340       350  

     360       370       380              390       400       410  
pF1KB4 AKRRQQGKSLSSPTDNLELSLRS-------QSDLDDQHDYDSVASDEDTDQEPLRSTGAT
       :::::::.:::.  ::.:: :..       .:. .:: :::::::::::: :    : :.
NP_631 AKRRQQGSSLSGSKDNVELILKTINNQHSVESQDNDQPDYDSVASDEDTDLE----TTAS
            360       370       380       390       400            

            420       430       440       450       460       470  
pF1KB4 RSNRARSMDSSDLSDGAVTLQEYLELKKALATSEAKVQQLMKVNSSLSDELRRLQREIHK
       ..:: .:.:: ::::: ::.::..:.:.::..::::.:::::::..:::::: .:...  
NP_631 KTNRQKSLDS-DLSDGPVTVQEFMEVKNALVASEAKIQQLMKVNNNLSDELRIMQKKLLG
      410        420       430       440       450       460       

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB4 LQAENLQLRQPPGPVPTPPLPSERAEHTPMAPGGSTHRRDRQAFSMYEPGSALKPFGGPP
                                                                   
NP_631 KDAN                                                        
       470                                                         




770 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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