Result of FASTA (ccds) for pF1KB4505
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4505, 1172 aa
  1>>>pF1KB4505 1172 - 1172 aa - 1172 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2505+/-0.00137; mu= 19.4679+/- 0.082
 mean_var=192.2287+/-35.756, 0's: 0 Z-trim(107.7): 191  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.092505
 statistics sampled from 9542 (9762) to 9542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.3), width:  16
 Scan time:  3.670

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6          (1172) 8548 1155.3       0
CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15         (1170) 5584 759.7 9.1e-219
CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19          ( 757) 2464 343.0 1.6e-93
CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1          ( 836) 2422 337.5 8.1e-92
CCDS72937.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1          ( 947) 2422 337.6 8.7e-92
CCDS1099.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1           ( 956) 2422 337.6 8.7e-92
CCDS78027.1 THBS4 gene_id:7060|Hs108|chr5          ( 870) 2403 335.0 4.8e-91
CCDS4049.1 THBS4 gene_id:7060|Hs108|chr5           ( 961) 2403 335.0 5.1e-91
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8          (1584)  610 96.1 7.3e-19
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6           (1522)  587 93.0   6e-18
CCDS14282.1 CFP gene_id:5199|Hs108|chrX            ( 469)  539 85.8 2.6e-16
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1          (1551)  539 86.6 5.1e-16
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1          (1584)  539 86.6 5.2e-16
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1         (5635)  541 87.6   9e-16
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5          (1074)  468 76.9   3e-13
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1151)  432 72.1 8.6e-12
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1205)  432 72.1 8.9e-12


>>CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6               (1172 aa)
 initn: 8548 init1: 8548 opt: 8548  Z-score: 6178.8  bits: 1155.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8548; 100.0% identity (100.0% similar) in 1172 aa overlap (1-1172:1-1172)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MVWRLVLLALWVWPSTQAGHQDKDTTFDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYRFVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVWRLVLLALWVWPSTQAGHQDKDTTFDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYRFVRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 DYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIVSNGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIVSNGP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 ADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALDEPFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALDEPFY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 EHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAEINAISEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAEINAISEN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 TETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSENLKRVSND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSENLKRVSND
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQITCPPATC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQITCPPATC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 ASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSNTCLGPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSNTCLGPSI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 QTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGGKNCKGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGGKNCKGSG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQER
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 QMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 CFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCKDKTHNCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCKDKTHNCH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 KHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATYHCIKDNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATYHCIKDNC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 PHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVGDRCDNCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVGDRCDNCP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 YVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGDHCDNCPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGDHCDNCPL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 VHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQGDACDPDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQGDACDPDD
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 DNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNAISETDFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNAISETDFR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 NFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGTFYVNTDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGTFYVNTDR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 DDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTGTGEHLRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTGTGEHLRN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 ALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQVMADSGPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQVMADSGPI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170  
pF1KB4 YDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI
             1150      1160      1170  

>>CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15              (1170 aa)
 initn: 5438 init1: 4961 opt: 5584  Z-score: 4041.0  bits: 759.7 E(32554): 9.1e-219
Smith-Waterman score: 5618; 61.7% identity (83.0% similar) in 1176 aa overlap (1-1171:3-1169)

                  10        20         30        40        50      
pF1KB4   MVWRL-VLLALWVWPSTQAGHQDKDTT-FDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYR
         ..: : ::. . :  ...  ..  :.. ::.: ...  ::  : .  .::::. ::.:
CCDS32 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB4 FVRFDYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIV
       .   . ::::  : .. ..  .: ..::.: :.:.:  :.::::::::    : . : .:
CCDS32 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB4 SNGPADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALD
       ::: : ::::.  ..: .::::.:.. :: .:::..:. :  .  .:.. :. ...  ::
CCDS32 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB4 EPF---YEHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAE
        :.   . .  :  .:. .:::.. .. :.:.::::..:: .. :::: .:::... .. 
CCDS32 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDN-FQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVL
              190       200        210       220       230         

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB4 INAISENTETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSEN
       ..   .:. .   .: . :.:.: ...    .:  ::.::..:: :: ::...:. :...
CCDS32 LTL--DNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDS
     240         250       260       270       280       290       

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB4 LKRVSNDNQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQI
       ...:...:. : . .  ::       :...:  . .:: :.::::: : :..  :::...
CCDS32 IRKVTEENKELANELRRPP------LCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKV
       300       310             320       330       340       350 

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB4 TCPPATCASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSN
       .::   :.. .  .::::: :  : ....:::::.:::.::..::.: ::::::::  .:
CCDS32 SCPIMPCSNATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNN
             360       370       380       390       400       410 

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB4 TCLGPSIQTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGG
        : : :.:::.: ...:: :..::::::::::::::::::: : :::::::::: :::.:
CCDS32 RCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNG
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pF1KB4 KNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKAC
       : :.: .::::::.   :::.: :.:::::. :.:::.::...:.:.::.: ::.::: :
CCDS32 KPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDC
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pF1KB4 VGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDE
       :::: : :.:::..::.::::::::: :..:.:.:::::.::.:: :. ::: .: :.::
CCDS32 VGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDE
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pF1KB4 CALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCK
       :  ::: ::. .   :: ::.::..:::::::. :.:: : :.: : ..::::.:.::: 
CCDS32 CKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCT
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pF1KB4 DKTHNCHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATY
       : ::.:.:.:.: ::::.:::::.:::. ::::.:.:::::.::::::: ::::..::::
CCDS32 DGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATY
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pF1KB4 HCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVG
       :: :::::.::::::::.:::::::::::::::: . :..::: . .:: : :::.:.::
CCDS32 HCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVG
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pF1KB4 DRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGD
       :::::::: ::: : :::::::::::..::::: ..:::::: ::::.:::::: :::::
CCDS32 DRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGD
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pF1KB4 HCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQG
       .:::::: ::::: : :.: .:: ::::.:::.:::::: :::::. ::::::::.::.:
CCDS32 QCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKG
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pF1KB4 DACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNA
       :::: ::::::.:::.:::::: ::::.: ::::::: ::::::.:..:::::.::::  
CCDS32 DACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVD
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pF1KB4 ISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGT
       ::::::: :::.:::::::.: :::::.::::::::::.: :::.:::.:::..::::::
CCDS32 ISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGT
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pF1KB4 FYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTG
       :..::.::::::::::::::::::::::::::::.::. .:::: ::::.:.::::::::
CCDS32 FFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTG
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pF1KB4 TGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQV
        ::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::.:.::::::.:::...:::..
CCDS32 PGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKI
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pF1KB4 MADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI
       :::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::: 
CCDS32 MADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
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>>CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19               (757 aa)
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CCDS12 REITFLKNTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGA-RCGPCP
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pF1KB4 VGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEA
       .:: :::.:: :..::   :  ::   .: ::.::.:::.:  ::: : :    ::::  
CCDS12 AGFTGNGSHCTDVNECNAHP--CFP--RV-RCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAF
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pF1KB4 AKTEKQVCEPENPCKDKTHNC---------------------------------------
       ::..::::   : :.   :::                                       
CCDS12 AKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCP
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pF1KB4 -------HKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNAT
              :.::.:.      :   .: : .:.::.:..::.:.::::.:. .: :     
CCDS12 DGSPSECHEHADCVLE---RDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPE---
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pF1KB4 YHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEV
        .: ::::  .::::::: :.:::::::: : :.::: .::::: :. :: : . :.:. 
CCDS12 RQCRKDNCVTVPNSGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKW
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pF1KB4 GDRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVG
       :: ::::   .:  : :::..:.::::. ::::: . :. :::: : :.::.:.::::.:
CCDS12 GDACDNCRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIG
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pF1KB4 DHCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQ
       : :::::   ::::.:::.:.::: ::...: : ::::...:::: . :. : : :.:::
CCDS12 DACDNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQ
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pF1KB4 GDACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENN
       ::::: :::::::::.::::::: :: ::: : :: ::.:.:::: :.. :  :::::: 
CCDS12 GDACDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENA
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pF1KB4 AISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSG
        .. :::: :: : :::.: .:::::::. .::.:.::: :::::.:::.  :..::: :
CCDS12 EVTLTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEG
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pF1KB4 TFYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTT
       ::.:::  :::::::.::::.:: ::::::::. ::::. .: :: .  :..::.:.:.:
CCDS12 TFHVNTVTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSST
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pF1KB4 GTGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQ
       : ::.:::::::::.: .::: ::.::::.::::  .::: : :::..:::::  .:: .
CCDS12 GPGEQLRNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPE
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pF1KB4 VMADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI             
       ..:::. . : :. :::::.: :::: . ...:.:.: :              
CCDS12 LVADSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
          710       720       730       740       750       

>>CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1               (836 aa)
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Smith-Waterman score: 2562; 52.2% identity (69.9% similar) in 688 aa overlap (537-1171:143-818)

        510       520       530       540          550       560   
pF1KB4 TVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKACVGDVQERQMCN---KRSCPVDGCLSNPCFPGAQ
                                     ..: :.:.   .::     :  :::: :..
CCDS58 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHEQRS----HCSPNPCFRGVD
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pF1KB4 CSS-FPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDECALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPC
       :   .   .. :: :: :. :::::: :..::: . : ::  :.   :.::.:::::  :
CCDS58 CMEVYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEAC
      170       180       190       200        210          220    

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pF1KB4 PPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCE-----------------------------------
       :  :.:.:  :::.. :.. ::::.                                   
CCDS58 PRGYKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGF
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pF1KB4 ---------PENPCKDKTHN-CHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDL
                :   :.. .:. :: ::.:..     .   .:.:..:.::.: .:: :.:.
CCDS58 LGNQSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFE---RNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDI
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pF1KB4 DGWPNLNLVCATNATYHCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQ
       ::.:.  : :  : . :: .:::   ::::::: :.::.:: :::: :.::. . .:::.
CCDS58 DGYPDQALPCMDN-NKHCKQDNCLLTPNSGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCR
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pF1KB4 LLFNPRQADYDKDEVGDRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPY
       :. :  : . : :  :: ::::: : :  : :::.:::::::. :.::: . :  :::: 
CCDS58 LFPNKDQQNSDTDSFGDACDNCPNVPNNDQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPK
              410       420       430       440       450       460

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pF1KB4 VYNTDQRDTDGDGVGDHCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCP
       : :  : : : ::::: ::.:: . :: :::.:.::::: ::.::: : ::::...::::
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>>CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6                (1522 aa)
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