Result of FASTA (ccds) for pF1KB4249
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4249, 362 aa
  1>>>pF1KB4249 362 - 362 aa - 362 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9388+/-0.00127; mu= 12.6373+/- 0.075
 mean_var=130.7402+/-40.996, 0's: 0 Z-trim(101.8): 292  B-trim: 841 in 2/47
 Lambda= 0.112168
 statistics sampled from 6210 (6685) to 6210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  2.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362) 2422 404.3 8.1e-113
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12        ( 404)  695 124.9 1.2e-28
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  624 113.4 3.1e-25
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  624 113.4 3.3e-25
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  624 113.4 3.3e-25
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  618 112.4 6.1e-25
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  612 111.4 1.2e-24
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 352)  608 110.8 1.9e-24
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2          ( 356)  608 110.8 1.9e-24
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 372)  573 105.1 9.8e-23
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17          ( 378)  573 105.2 9.9e-23
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  570 104.6 1.3e-22
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  567 104.2 1.9e-22
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  560 103.0 4.2e-22
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  560 103.1 4.5e-22
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  559 102.9 4.8e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  558 102.7 5.2e-22
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3            ( 352)  556 102.4 6.3e-22
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  556 102.4 6.4e-22
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  554 102.1 8.5e-22
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  549 101.2 1.4e-21
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  546 100.7 1.9e-21
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 360)  542 100.1 3.1e-21
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19          ( 362)  540 99.8 3.9e-21
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  539 99.6 4.4e-21
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  538 99.5 4.8e-21
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  538 99.5   5e-21
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3         ( 374)  536 99.2 6.2e-21
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  524 97.2 2.4e-20
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  520 96.6 3.6e-20
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  520 96.6 3.7e-20
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19          ( 353)  510 94.9 1.1e-19
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  506 94.3 1.8e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  506 94.3 1.8e-19
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19          ( 351)  502 93.6 2.7e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  499 93.2   4e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  494 92.4 6.8e-19
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3           ( 384)  492 92.1 8.8e-19
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361)  489 91.5 1.2e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  488 91.4 1.5e-18
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  477 89.6 4.3e-18
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  475 89.3 5.9e-18
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14          ( 365)  474 89.1 6.4e-18
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1         ( 374)  473 89.0 7.3e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  467 88.0 1.5e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  467 88.0 1.5e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  467 88.0 1.5e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  467 88.0 1.5e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  467 88.0 1.5e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  467 88.0 1.5e-17


>>CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2               (362 aa)
 initn: 2422 init1: 2422 opt: 2422  Z-score: 2138.9  bits: 404.3 E(32554): 8.1e-113
Smith-Waterman score: 2422; 100.0% identity (100.0% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 ANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
              310       320       330       340       350       360

         
pF1KB4 TK
       ::
CCDS25 TK
         

>>CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12             (404 aa)
 initn: 636 init1: 362 opt: 695  Z-score: 627.9  bits: 124.9 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 695; 34.2% identity (68.8% similar) in 292 aa overlap (40-331:52-336)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB4 EPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVN
                                     : :.:..:   :. .::.:.. : .:. ::
CCDS89 DLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFAL---YLAMFVVGLVENLLVICVN
              30        40        50           60        70        

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB4 IQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHLIFSINLF
        ...  .   . ::::.::::: .::..:::.. ..    :  : ..:. :: .. .:..
CCDS89 WRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGSFSCRFTHYFYFVNMY
       80        90       100       110       120       130        

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB4 GSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDTYYLKTVTSA
       .:::::.:.:::::...:  . . .  .. :::..:  .:.:.  . ::.. ... : . 
CCDS89 SSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVLSAIIPLPEVVHIQLVEGP
      140       150       160       170       180       190        

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB4 SNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASSDQEKHS
          : .:  . : .. . : ... : ...::: .:: .:.::  : :  .   .. ... 
CCDS89 ---EPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTACRLRQPGQPKSRR
         200       210       220       230       240       250     

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB4 SRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCLSLVHCC
          .. .::.::..:::::::..::  .   : : . :.: : :.    : .:.:..:: 
CCDS89 HCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTH-ISLHCHLVHLLYFFYDVIDCFSMLHCV
         260       270       280        290       300       310    

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB4 VNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK       
       .::.::.:.. ..: .:..: .                                      
CCDS89 INPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHSIIITKGDSQPAAAA
          320       330       340       350       360       370    

>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                 (359 aa)
 initn: 528 init1: 385 opt: 624  Z-score: 566.5  bits: 113.4 E(32554): 3.1e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:18-350)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
                                     ::.   .. ..  .  .: .:::.:...::
CCDS31              MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 ---VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
          .:..  .. ::..     ..::::.:::  .::.:.:.:  ... .::.:.  ::..
CCDS31 LVVIVIYFYMKLKTVA---SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
        50        60           70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
           :.::..:.:.:::.:.::::.:..  ..   :  .: .:.::..::::  .:::  
CCDS31 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
        . ..    ..: : : .:. : . .   ::. :.. .:::  :: :: . : :. .:..
CCDS31 IHRNVFFIENTNITVC-AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
          170       180        190       200       210       220   

              250            260       270       280       290     
pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
        . . .:.. :     :::.. :. :.  :.:... ..::..  :  :   ::.   . :
CCDS31 KAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDT
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       :. .: :..  . :.::..:.:..... ::  .:.: .  : .....:.  .  : .:  
CCDS31 AMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKM--STLSYR
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            360           
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         . . .:::         
CCDS31 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
              350         

>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                (388 aa)
 initn: 528 init1: 385 opt: 624  Z-score: 566.1  bits: 113.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:47-379)

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                                     ::.   .. ..  .  .: .:::.:...::
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          .:..  .. ::..     ..::::.:::  .::.:.:.:  ... .::.:.  ::..
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           :.::..:.:.:::.:.::::.:..  ..   :  .: .:.::..::::  .:::  
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        . ..    ..: : : .:. : . .   ::. :.. .:::  :: :: . : :. .:..
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pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
        . . .:.. :     :::.. :. :.  :.:... ..::..  :  :   ::.   . :
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       :. .: :..  . :.::..:.:..... ::  .:.: .  : .....:.  .  : .:  
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            360           
pF1KB4 EYSALEQSTK         
         . . .:::         
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
     370       380        

>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                (394 aa)
 initn: 528 init1: 385 opt: 624  Z-score: 566.0  bits: 113.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:53-385)

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pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
                                     ::.   .. ..  .  .: .:::.:...::
CCDS82 DIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
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pF1KB4 ---VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
          .:..  .. ::..     ..::::.:::  .::.:.:.:  ... .::.:.  ::..
CCDS82 LVVIVIYFYMKLKTVA---SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
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pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
           :.::..:.:.:::.:.::::.:..  ..   :  .: .:.::..::::  .:::  
CCDS82 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
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pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
        . ..    ..: : : .:. : . .   ::. :.. .:::  :: :: . : :. .:..
CCDS82 IHRNVFFIENTNITVC-AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
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pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
        . . .:.. :     :::.. :. :.  :.:... ..::..  :  :   ::.   . :
CCDS82 KAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDT
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pF1KB4 ALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNY-RY--ELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSET
       :. .: :..  . :.::..:.:..... ::  .:.: .  : .....:.  .  : .:  
CCDS82 AMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKM--STLSYR
       320       330       340       350       360         370     

            360           
pF1KB4 EYSALEQSTK         
         . . .:::         
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
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>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2                (360 aa)
 initn: 551 init1: 272 opt: 618  Z-score: 561.2  bits: 112.4 E(32554): 6.1e-25
Smith-Waterman score: 618; 30.8% identity (67.2% similar) in 338 aa overlap (7-342:13-342)

                     10        20        30        40         50   
pF1KB4       MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNK-SVLLYTLSFIYIF
                   :. .  ..:. :.  ..   ...:.. :   :..  .  : . .:: .
CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYS-STLPPFLLDAAPCE--PESLEINKYFVVIIYAL
               10        20         30        40          50       

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB4 IFVIGMIANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMG
       .:......::.:. : . ...    :  :.::::.:::  .::.:.:..: :  : : .:
CCDS24 VFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFG
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pF1KB4 ELTCKVTHLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAF
        . :::. :.  .:....:..:.:.::::::.:.. : : .... .:.  .:. .: :..
CCDS24 TFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVK-FICLSIWGLSL
         120       130       140       150       160        170    

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pF1KB4 CVSLPDTYYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYF
        ..::   . .:: : ::    :   . ... . : . ....   .:: ::. :.   : 
CCDS24 LLALPVLLFRRTVYS-SNVSPACYEDMGNNTAN-WRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYG
          180        190       200        210       220       230  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB4 LLARAISASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHAL
       .  :..  .   .:: . ..::. :..::.:::::....: : .   . :  ::. .. .
CCDS24 FTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHI
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB4 FTALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAF-IFKYSAKTGLTKLIDASRVSET
         :: .:. :...: :.::..:.::....:. :.: . :    .: .: :          
CCDS24 DRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSS
            300       310       320       330       340       350  

            360  
pF1KB4 EYSALEQSTK
                 
CCDS24 SGHTSTTL  
            360  

>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2                (350 aa)
 initn: 532 init1: 288 opt: 612  Z-score: 556.1  bits: 111.4 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 612; 31.3% identity (68.0% similar) in 300 aa overlap (30-328:24-318)

               10        20        30        40         50         
pF1KB4 MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVL-LYTLSFIYIFIFVIGM
                                    :  . : : .  .:  :.. . : ..:....
CCDS24       MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSL
                     10        20        30        40        50    

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB4 IANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKV
       ..::.:. : . ...    :  :.::::.:::  .::.:.:..: :  : : .: . :::
CCDS24 LGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFGTFLCKV
           60        70        80        90       100         110  

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pF1KB4 THLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPD
       . :.  .:....:..:.:.::::::.:.. : : ......:.  ::.  : :.. .::: 
CCDS24 VSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVK-FVCLGCWGLSMNLSLP-
            120       130       140       150        160       170 

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pF1KB4 TYYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAI
        . .. .   .:.   :     . . : : . ....  ..:: ::. ..   : .  :..
CCDS24 FFLFRQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAK-WRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTL
              180       190        200       210       220         

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pF1KB4 SASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHV
         .   .:: . ..::. :..::.:::::....: : .   . :  .:. .. .  :: .
CCDS24 FKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDA
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pF1KB4 TQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQ
       :. :...: :.::..:.::..:.:. ..:                               
CCDS24 TEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSN
     290       300       310       320       330       340         

>>CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2               (352 aa)
 initn: 516 init1: 195 opt: 608  Z-score: 552.6  bits: 110.8 E(32554): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 608; 29.0% identity (65.9% similar) in 328 aa overlap (34-361:28-347)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
                                     :    : .     :  :: .::. :...:.
CCDS46    MEGISIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVGNG
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       .:. :    :     :  : :.:..:::  :.:.: :.:. : .  : .:.. ::..:.:
CCDS46 LVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN--WYFGNFLCKAVHVI
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       ...::..:...:. .:.::::.:.. ::.   :: ....:: . ::. :. ...::  ..
CCDS46 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPD--FI
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pF1KB4 KTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASS
        . .: ....  :  :::.     :.. ...  ...:. .:  .:   : ..   .: :.
CCDS46 FANVSEADDRYICDRFYPNDL---WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSK
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pF1KB4 DQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCL
        ..:... :     ...:..:::::.... .: : .:. :   :..:...   . .:. :
CCDS46 GHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEAL
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       .. :::.::.::.:.. ...   ..: . . :  ..:  :  ..: ...  :.  .:.  
CCDS46 AFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHA-LTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSF
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CCDS46 HSS
     350  

>>CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2               (356 aa)
 initn: 516 init1: 195 opt: 608  Z-score: 552.5  bits: 110.8 E(32554): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 608; 29.0% identity (65.9% similar) in 328 aa overlap (34-361:32-351)

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                                     :    : .     :  :: .::. :...:.
CCDS33 SIPLPLLQIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVGNG
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pF1KB4 VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHLI
       .:. :    :     :  : :.:..:::  :.:.: :.:. : .  : .:.. ::..:.:
CCDS33 LVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN--WYFGNFLCKAVHVI
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pF1KB4 FSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDTYYL
       ...::..:...:. .:.::::.:.. ::.   :: ....:: . ::. :. ...::  ..
CCDS33 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPD--FI
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pF1KB4 KTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASS
        . .: ....  :  :::.     :.. ...  ...:. .:  .:   : ..   .: :.
CCDS33 FANVSEADDRYICDRFYPNDL---WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSK
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pF1KB4 DQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCL
        ..:... :     ...:..:::::.... .: : .:. :   :..:...   . .:. :
CCDS33 GHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEAL
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pF1KB4 SLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK 
       .. :::.::.::.:.. ...   ..: . . :  ..:  :  ..: ...  :.  .:.  
CCDS33 AFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHA-LTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSF
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CCDS33 HSS
          

>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17               (372 aa)
 initn: 415 init1: 249 opt: 573  Z-score: 521.7  bits: 105.1 E(32554): 9.8e-23
Smith-Waterman score: 573; 31.3% identity (65.0% similar) in 300 aa overlap (33-330:41-335)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB4 LHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIAN
                                     .: .   ..   . : ..: .:  .:...:
CCDS77 VIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYSIICFVGLLGN
               20        30        40        50        60        70

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pF1KB4 SVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHL
       ..:: . :  :     :  :.::::.::.  .::.: :. : ..  .: .:   ::.   
CCDS77 GLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK--SWVFGVHFCKLIFA
               80        90       100       110         120        

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pF1KB4 IFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKK--MVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
       :.....:.....: :.:.:::..:.  ...   : .  .. .. :. .:.::  .:.:. 
CCDS77 IYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILATVLSIPEL
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pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
        :     :.:..   : :.  ::   : .: ......:.:: ::.  ..  :... :.. 
CCDS77 LYSDLQRSSSEQAMRC-SLITEHV--EAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLVIIRTLL
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pF1KB4 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
        . . :.... :.:.. ::::.:  :::. .:: .  . ..    ::.: . :  :  ::
CCDS77 QARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLNIAYDVT
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pF1KB4 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
         :. :.::::: ::.::. ..: .:.: :                              
CCDS77 YSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRRSSMSVEAE
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362 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 21:31:42 2016 done: Thu Nov  3 21:31:43 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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