seq1 = pF1KB3783.tfa, 2274 bp
seq2 = pF1KB3783/gi568815592r_166312768.tfa (gi568815592r:166312768_166962170), 649403 bp

>pF1KB3783 2274
>gi568815592r:166312768_166962170 (Chr6)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-124  (103912-103972)   96% ==
173-291  (423385-423503)   100% ->
292-373  (430858-430939)   100% ->
374-454  (451814-451894)   100% ->
455-534  (453889-453968)   100% ->
535-641  (457559-457665)   100% ->
642-679  (461247-461284)   100% ->
680-822  (463521-463663)   100% ->
823-893  (471430-471500)   100% ->
894-982  (473250-473338)   100% ->
983-1047  (492266-492330)   100% ->
1048-1150  (502620-502722)   99% ->
1151-1281  (510938-511068)   100% ->
1282-1407  (513322-513447)   99% ->
1408-1497  (529681-529770)   100% ->
1498-1656  (531560-531718)   100% ->
1657-1818  (538754-538915)   100% ->
1819-1895  (542213-542289)   100% ->
1896-2013  (543829-543946)   100% ->
2014-2151  (548240-548377)   100% ->
2152-2274  (549284-549406)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAATCGCACAGTTGCTGGAACTATGGAAAAAGATCGAGGTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAATCGCACAGTTGCTGGAACTATGGAAAAAGATCGAGGTGGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGGAAATAGAG         ACCACAGAGGAGGATCTCAACCTGGATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGGAAATAGAGGTG...CAGACCACAGAGGAGGATCTCAACCTGGATG

    100     .    :    .    :    .    :
     92 TGGGGCCCGCCACAGAAGACACTGCAGAAGAAG
        ||| |||| ||||||||||||||||||||||||
 103940 TGGAGCCCACCACAGAAGACACTGCAGAAGAAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    173 AGGAAGAAGGCGTCGTGAAGGAGATAGACATCAGCCATCATGTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 423385 AGGAAGAAGGCGTCGTGAAGGAGATAGACATCAGCCATCATGTGAAGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    223 GGCTTTGAGAAGGCAGATCCTTCCCAGTTTGAGCTGCTGAAGGTTTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 423435 GGCTTTGAGAAGGCAGATCCTTCCCAGTTTGAGCTGCTGAAGGTTTTAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 ACAAGGATCCTATGGAAAG         GTGTTCCTGGTGAGGAAGGTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 423485 ACAAGGATCCTATGGAAAGGTA...AAGGTGTTCCTGGTGAGGAAGGTGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    314 AGGGGTCCGACGCTGGGCAGCTCTACGCCATGAAGGTCCTTAAGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 430880 AGGGGTCCGACGCTGGGCAGCTCTACGCCATGAAGGTCCTTAAGAAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    364 ACCCTAAAAG         TTCGGGACCGAGTGAGATCGAAGATGGAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 430930 ACCCTAAAAGGTA...CAGTTCGGGACCGAGTGAGATCGAAGATGGAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 AGACATCTTGGCAGAAGTGAATCACCCCTTCATTGTGAAGCTTCATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451845 AGACATCTTGGCAGAAGTGAATCACCCCTTCATTGTGAAGCTTCATTATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    455          CCTTTCAGACGGAAGGAAAGCTCTACCTGATCCTGGACTTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451895 GTA...CAGCCTTTCAGACGGAAGGAAAGCTCTACCTGATCCTGGACTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 CTGCGGGGAGGGGACCTCTTCACCCGGCTCTCCAAAGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 453930 CTGCGGGGAGGGGACCTCTTCACCCGGCTCTCCAAAGAGGTG...TAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    537 CATGTTCACGGAGGAGGATGTCAAGTTCTACCTGGCTGAGCTGGCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 457561 CATGTTCACGGAGGAGGATGTCAAGTTCTACCTGGCTGAGCTGGCCTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587 CTTTAGACCATCTCCACAGCCTGGGGATCATCTACAGAGATCTGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 457611 CTTTAGACCATCTCCACAGCCTGGGGATCATCTACAGAGATCTGAAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 GAGAA         CATCCTCCTGGATGAAGAGGGGCACATTAAGATCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 457661 GAGAAGTA...TAGCATCCTCCTGGATGAAGAGGGGCACATTAAGATCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    678 AG         ATTTCGGCCTGAGTAAGGAGGCCATTGACCACGACAAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 461283 AGGTT...TAGATTTCGGCCTGAGTAAGGAGGCCATTGACCACGACAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    719 GAGCGTACTCCTTCTGCGGGACGATCGAGTACATGGCGCCCGAGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 463560 GAGCGTACTCCTTCTGCGGGACGATCGAGTACATGGCGCCCGAGGTGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    769 AACCGGCGAGGACACACGCAGAGTGCCGACTGGTGGTCCTTCGGCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 463610 AACCGGCGAGGACACACGCAGAGTGCCGACTGGTGGTCCTTCGGCGTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    819 CATG         TTTGAGATGCTCACGGGGTCCCTGCCGTTCCAGGGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 463660 CATGGTG...CAGTTTGAGATGCTCACGGGGTCCCTGCCGTTCCAGGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    860 AGGACAGGAAGGAGACCATGGCTCTCATCCTCAA         AGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 471467 AGGACAGGAAGGAGACCATGGCTCTCATCCTCAAGTG...CAGAGCCAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGGGGATGCCGCAGTTCCTCAGTGGGGAGGCACAGAGTTTGCTGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 473257 CTGGGGATGCCGCAGTTCCTCAGTGGGGAGGCACAGAGTTTGCTGCGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCTCTTCAAACGGAACCCCTGCAACCGGCTGG         GTGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 473307 TCTCTTCAAACGGAACCCCTGCAACCGGCTGGGTA...CAGGTGCTGGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTGACGGAGTGGAGGAAATTAAGCGCCATCCCTTCTTTGTGACCATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 492275 TTGACGGAGTGGAGGAAATTAAGCGCCATCCCTTCTTTGTGACCATAGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TGGAAC         ACGCTGTACCGGAAGGAGATCAAGCCACCATTCAA
        ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 492325 TGGAACGTA...TAGACGCTGTACCGGAAGGAGATCAAGCCACCGTTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ACCAGCAGTGGGCAGGCCTGAGGACACCTTCCACTTTGACCCCGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 502655 ACCAGCAGTGGGCAGGCCTGAGGACACCTTCCACTTTGACCCCGAGTTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CAGCGCGGACGCCCACAG         ACTCTCCTGGCGTCCCCCCGAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 502705 CAGCGCGGACGCCCACAGGTG...CAGACTCTCCTGGCGTCCCCCCGAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GCAAACGCTCATCACCTGTTTAGAGGATTCAGCTTTGTGGCCTCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 510961 GCAAACGCTCATCACCTGTTTAGAGGATTCAGCTTTGTGGCCTCAAGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GATCCAGGAGCCCTCACAGCAAGATCTGCACAAAGTCCCAGTTCACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 511011 GATCCAGGAGCCCTCACAGCAAGATCTGCACAAAGTCCCAGTTCACCCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCGTGCAG         CAGTTACACGGGAACAACATCCACTTCACCGAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 511061 TCGTGCAGGTA...CAGCAGTTACACGGGAACAACATCCACTTCACCGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCTACGAGATCAAGGAGGACATCGGGGTGGGCTCCTACTCAGTGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 513355 GGCTACGAGATCAAGGAGGACATCGGGGTGGGCTCCTACTCAGTGTGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GCGATGTGTGCATAAAGCCACGGACACCGAGTATGCCGTGAAG       
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||>>>...>
 513405 GCGATGTGTGCATAAAGCCACAGACACCGAGTATGCCGTGAAGGTA...C

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1408   ATCATTGATAAGAGCAAGAGAGACCCCTCGGAAGAGATTGAGATCCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529679 AGATCATTGATAAGAGCAAGAGAGACCCCTCGGAAGAGATTGAGATCCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CTGCGGTACGGCCAGCACCCGAACATCATCACCCTCAAGGAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 529729 CTGCGGTACGGCCAGCACCCGAACATCATCACCCTCAAGGATGTG...CA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1498  GTCTATGATGATGGCAAGTTTGTGTACCTGGTAATGGAGCTGATGCGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531559 GGTCTATGATGATGGCAAGTTTGTGTACCTGGTAATGGAGCTGATGCGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GTGGGGAGCTCCTGGACCGCATCCTCCGGCAGAGATACTTCTCGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531609 GTGGGGAGCTCCTGGACCGCATCCTCCGGCAGAGATACTTCTCGGAGCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GAAGCCAGTGACGTCCTGTGCACCATCACCAAGACCATGGACTACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531659 GAAGCCAGTGACGTCCTGTGCACCATCACCAAGACCATGGACTACCTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 TTCCCAGGGG         GTTGTTCATCGAGACCTGAAGCCGAGTAACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 531709 TTCCCAGGGGGTA...CAGGTTGTTCATCGAGACCTGAAGCCGAGTAACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 TCCTGTACAGGGATGAGTCGGGGAGCCCAGAATCCATCCGAGTCTGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 538785 TCCTGTACAGGGATGAGTCGGGGAGCCCAGAATCCATCCGAGTCTGCGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TTCGGCTTTGCCAAGCAGCTGCGCGCGGGGAACGGGCTGCTCATGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 538835 TTCGGCTTTGCCAAGCAGCTGCGCGCGGGGAACGGGCTGCTCATGACACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CTGCTACACGGCCAATTTCGTGGCCCCGGAG         GTCCTGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 538885 CTGCTACACGGCCAATTTCGTGGCCCCGGAGGTG...TAGGTCCTGAAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 GTCAAGGCTATGATGCGGCGTGTGACATCTGGAGTTTGGGGATCCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 542223 GTCAAGGCTATGATGCGGCGTGTGACATCTGGAGTTTGGGGATCCTGTTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 TACACCATGCTGGCAGG         ATTTACCCCTTTTGCAAATGGGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 542273 TACACCATGCTGGCAGGGTA...CAGATTTACCCCTTTTGCAAATGGGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 AGACGATACCCCTGAGGAGATTCTGGCGCGGATCGGCAGTGGGAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 543853 AGACGATACCCCTGAGGAGATTCTGGCGCGGATCGGCAGTGGGAAGTATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 CCCTTTCTGGGGGAAACTGGGACTCGATATCTGACGCAGCTAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 543903 CCCTTTCTGGGGGAAACTGGGACTCGATATCTGACGCAGCTAAAGTG...

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2014    GACGTCGTGTCCAAGATGCTCCACGTGGACCCTCATCAGCGCCTGAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 548237 CAGGACGTCGTGTCCAAGATGCTCCACGTGGACCCTCATCAGCGCCTGAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 GGCGATGCAAGTGCTCAAACACCCGTGGGTGGTCAACAGAGAGTACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 548287 GGCGATGCAAGTGCTCAAACACCCGTGGGTGGTCAACAGAGAGTACCTGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CCCCAAACCAGCTCAGCCGACAGGACGTGCACCTGGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 548337 CCCCAAACCAGCTCAGCCGACAGGACGTGCACCTGGTGAAGGTA...CAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 GGCGCGATGGCCGCCACCTACTTTGCTCTAAACAGAACACCTCAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 549284 GGCGCGATGGCCGCCACCTACTTTGCTCTAAACAGAACACCTCAGGCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GCGGCTGGAGCCCGTGCTGTCGTCCAACCTGGCTCAGCGCAGAGGCATGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 549334 GCGGCTGGAGCCCGTGCTGTCATCCAACCTGGCTCAGCGCAGAGGCATGA

   2250     .    :    .    :
   2252 AGAGACTCACGTCCACGCGGTTG
        |||||||||||||||||||| ||
 549384 AGAGACTCACGTCCACGCGGCTG