Result of FASTA (ccds) for pF1KB3476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3476, 723 aa
  1>>>pF1KB3476 723 - 723 aa - 723 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6999+/-0.000916; mu= 17.9461+/- 0.055
 mean_var=70.3557+/-13.778, 0's: 0 Z-trim(105.3): 16  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.152906
 statistics sampled from 8339 (8352) to 8339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time:  3.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3899.1 TARS gene_id:6897|Hs108|chr5            ( 723) 4949 1101.3       0
CCDS58943.1 TARS gene_id:6897|Hs108|chr5           ( 756) 4209 938.1       0
CCDS10394.1 TARSL2 gene_id:123283|Hs108|chr15      ( 802) 3639 812.3       0
CCDS60252.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1         ( 588) 1416 321.9 1.8e-87
CCDS60251.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1         ( 636) 1416 321.9 1.9e-87
CCDS952.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1           ( 718) 1416 321.9 2.1e-87


>>CCDS3899.1 TARS gene_id:6897|Hs108|chr5                 (723 aa)
 initn: 4949 init1: 4949 opt: 4949  Z-score: 5894.7  bits: 1101.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4949; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (1-723:1-723)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
              670       680       690       700       710       720

          
pF1KB3 EEF
       :::
CCDS38 EEF
          

>>CCDS58943.1 TARS gene_id:6897|Hs108|chr5                (756 aa)
 initn: 4209 init1: 4209 opt: 4209  Z-score: 5012.2  bits: 938.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4866; 95.6% identity (95.6% similar) in 755 aa overlap (2-723:2-756)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB3 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGIS----------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS58 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISHTASCKNLSS
               70        80        90       100       110       120

                                     120       130       140       
pF1KB3 -----------------------QGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDE
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LASLLASVAIPSSGMPWPPLFFLQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDE
              130       140       150       160       170       180

       150       160       170       180       190       200       
pF1KB3 EAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCK
              190       200       210       220       230       240

       210       220       230       240       250       260       
pF1KB3 KIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVR
              250       260       270       280       290       300

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB3 HTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIG
              310       320       330       340       350       360

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB3 RDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSG
              370       380       390       400       410       420

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB3 HWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSG
              430       440       450       460       470       480

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB3 ALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLG
              490       500       510       520       530       540

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB3 DIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQL
              550       560       570       580       590       600

       570       580       590       600       610       620       
pF1KB3 PIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVG
              610       620       630       640       650       660

       630       640       650       660       670       680       
pF1KB3 PTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVN
              670       680       690       700       710       720

       690       700       710       720   
pF1KB3 IRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEEF
              730       740       750      

>>CCDS10394.1 TARSL2 gene_id:123283|Hs108|chr15           (802 aa)
 initn: 3632 init1: 3535 opt: 3639  Z-score: 4332.2  bits: 812.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3639; 71.7% identity (89.3% similar) in 722 aa overlap (4-723:86-802)

                                          10        20        30   
pF1KB3                            MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKK
                                     :.:   ... .: . :   .. ..:.  ::
CCDS10 QLRAENCDLRHRLCSLRLCLAEERSRQATLESAELEAAQEAGAQPP--PSQSQDKDMKKK
          60        70        80        90       100         110   

            40        50        60        70          80        90 
pF1KB3 KNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKD--SKPIKVTLPDGK
       : ::. .:   .:..  : .:  ::....::: .:. .::  ..:   :. : : . ::.
CCDS10 KMKESEAD---SEVKHQPIFIKERLKLFEILKKDHQLLLAIYGKKGDTSNIITVRVADGQ
           120          130       140       150       160       170

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB3 QVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQA
        :..: :::::::.:  ::: ::..:::::::. .:::::::: : .:::: :..:::::
CCDS10 TVQGEVWKTTPYQVAAEISQELAESTVIAKVNGELWDLDRPLEGDSSLELLTFDNEEAQA
              180       190       200       210       220       230

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB3 VYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIK
       :::::::::.:::::  ::: :::::::::::::::..:. .:::...:.:: .:: :::
CCDS10 VYWHSSAHILGEAMELYYGGHLCYGPPIENGFYYDMFIEDRAVSSTELSALENICKAIIK
              240       250       260       270       280       290

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB3 EKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGK
       ::: ::::::.:: :: :::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::
CCDS10 EKQPFERLEVSKEILLEMFKYNKFKCRILNEKVNTATTTVYRCGPLIDLCKGPHVRHTGK
              300       310       320       330       340       350

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB3 IKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQE
       ::..:: :::::::::. .:::::::::::::: ::...:::::::::::::::::..::
CCDS10 IKTIKIFKNSSTYWEGNPEMETLQRIYGISFPDNKMMRDWEKFQEEAKNRDHRKIGKEQE
              360       370       380       390       400       410

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB3 LYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQH
       :.:::.::::::::::.::.:::.: .::: ::.:: : ::..::..::.:: .::::::
CCDS10 LFFFHDLSPGSCFFLPRGAFIYNTLTDFIREEYHKRDFTEVLSPNMYNSKLWEASGHWQH
              420       430       440       450       460       470

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB3 YSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTG
       ::::::.::.::. ::::::::::::::: ::::::::.:.:.:::::::::::::.:.:
CCDS10 YSENMFTFEIEKDTFALKPMNCPGHCLMFAHRPRSWREMPIRFADFGVLHRNELSGTLSG
              480       490       500       510       520       530

             460       470       480       490       500       510 
pF1KB3 LTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEV
       ::::::::::::::::..::::.::::::.::..:::.:::::.::::::::.:::.::.
CCDS10 LTRVRRFQQDDAHIFCTVEQIEEEIKGCLQFLQSVYSTFGFSFQLNLSTRPENFLGEIEM
              540       550       560       570       580       590

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB3 WDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRF
       :..:::::.::: .::: :..: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WNEAEKQLQNSLMDFGEPWKMNPGDGAFYGPKIDIKIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRF
              600       610       620       630       640       650

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB3 NLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCD
       ::::::.::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.
CCDS10 NLTYVSKDGDDKKRPVIIHRAILGSVERMIAILSENYGGKWPFWLSPRQVMVIPVGPTCE
              660       670       680       690       700       710

             640       650       660       670       680       690 
pF1KB3 EYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTR
       .:: .: ..: .  ::::.::: .:::::::::::::::::::::::::::...::.:::
CCDS10 KYALQVSSEFFEEGFMADVDLDHSCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKIDNAVNVRTR
              720       730       740       750       760       770

             700       710       720   
pF1KB3 DNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEEF
       :::.:::  .. .:..:..:.. :. .::: :
CCDS10 DNKIHGEILVTSAIDKLKNLRKTRTLNAEEAF
              780       790       800  

>>CCDS60252.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1              (588 aa)
 initn: 2094 init1: 919 opt: 1416  Z-score: 1684.0  bits: 321.9 E(32554): 1.8e-87
Smith-Waterman score: 1782; 42.8% identity (63.8% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-588)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
                                     :...  :: ... : : . . ::  :.:. 
CCDS60   MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
                 10        20        30        40        50        

               90       100       110       120       130       140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
       . ::..:: :...:: .:.:::::.:  ::. :::..: :.::.  .::.:::: :  :.
CCDS60 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
       60        70        80        90       100       110        

              150       160       170       180        190         
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
       .: :.. :..::.::::.:..: : :.  :. :: ::  : :::.:..: .:  . ....
CCDS60 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
      120       130       140       150       160       170        

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
         :: .:...    . :.:::.... :  .::                            
CCDS60 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFK----------------------------
      180       190       200       210                            

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
                                                                   
CCDS60 ------------------------------------------------------------
                                                                   

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
                                                 .:: .:::.:: ::..:.
CCDS60 ------------------------------------------AEYAHRGFSEVKTPTLFS
                                                        220        

     380       390       400                        410       420  
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
       ..::  ::::.::.:.::. .                    . .::::::::.::::: :
CCDS60 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
      230       240       250       260       270       280        

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
       ::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
CCDS60 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
      290       300       310       320       330       340        

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
       ::.::.:.::::.: :::::  ::::  .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
CCDS60 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
      350       360       370       380       390       400        

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
       :::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. :   .:::..:::.::::::...
CCDS60 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
      410       420       430       440        450       460       

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
       .:.:. :::::.:::: ::.:.:::   .:::....:... : ...:.: : : ::...:
CCDS60 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
       470       480       490       500       510       520       

            670       680       690       700       710       720  
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
       : ::::.::: .:::.::. . :::::::::.  ::  . :...:: .:.. :  .::: 
CCDS60 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
       530       540       550       560       570       580       

        
pF1KB3 F
       :
CCDS60 F
        

>>CCDS60251.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1              (636 aa)
 initn: 2261 init1: 919 opt: 1416  Z-score: 1683.5  bits: 321.9 E(32554): 1.9e-87
Smith-Waterman score: 2076; 46.7% identity (69.6% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-636)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
                                     :...  :: ... : : . . ::  :.:. 
CCDS60   MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
                 10        20        30        40        50        

               90       100       110       120       130       140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
       . ::..:: :...:: .:.:::::.:  ::. :::..: :.::.  .::.:::: :  :.
CCDS60 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
       60        70        80        90       100       110        

              150       160       170       180        190         
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
       .: :.. :..::.::::.:..: : :.  :. :: ::  : :::.:..: .:  . ....
CCDS60 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
      120       130       140       150       160       170        

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
         :: .:...    . :.:::.... :  .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
CCDS60 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
      180       190       200       210       220       230        

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
       ::.:::.::::.: .::.                                          
CCDS60 LCQGPHLRHTGQIGGLKL------------------------------------------
      240       250                                                

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
                                               . .:: .:::.:: ::..:.
CCDS60 ----------------------------------------LSAEYAHRGFSEVKTPTLFS
                                                260       270      

     380       390       400                        410       420  
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
       ..::  ::::.::.:.::. .                    . .::::::::.::::: :
CCDS60 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
        280       290       300       310       320       330      

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
       ::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
CCDS60 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
        340       350       360       370       380       390      

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
       ::.::.:.::::.: :::::  ::::  .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
CCDS60 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
        400       410       420       430       440       450      

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
       :::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. :   .:::..:::.::::::...
CCDS60 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
        460       470       480       490        500       510     

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
       .:.:. :::::.:::: ::.:.:::   .:::....:... : ...:.: : : ::...:
CCDS60 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
         520       530       540       550       560       570     

            670       680       690       700       710       720  
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
       : ::::.::: .:::.::. . :::::::::.  ::  . :...:: .:.. :  .::: 
CCDS60 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
         580       590       600       610       620       630     

        
pF1KB3 F
       :
CCDS60 F
        

>>CCDS952.1 TARS2 gene_id:80222|Hs108|chr1                (718 aa)
 initn: 2658 init1: 919 opt: 1416  Z-score: 1682.7  bits: 321.9 E(32554): 2.1e-87
Smith-Waterman score: 2631; 54.1% identity (79.9% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-718)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
                                     :...  :: ... : : . . ::  :.:. 
CCDS95   MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
                 10        20        30        40        50        

               90       100       110       120       130       140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
       . ::..:: :...:: .:.:::::.:  ::. :::..: :.::.  .::.:::: :  :.
CCDS95 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
       60        70        80        90       100       110        

              150       160       170       180        190         
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
       .: :.. :..::.::::.:..: : :.  :. :: ::  : :::.:..: .:  . ....
CCDS95 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
      120       130       140       150       160       170        

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
         :: .:...    . :.:::.... :  .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
CCDS95 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
      180       190       200       210       220       230        

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
       ::.:::.::::.: .::. .:::. :....  :::::. :::::  ..:. :: ..:::.
CCDS95 LCQGPHLRHTGQIGGLKLLSNSSSLWRSSGAPETLQRVSGISFPTTELLRVWEAWREEAE
      240       250       260       270       280       290        

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
        ::::.::..:::.::::::::::::::.:. .::::. :::.:: .:::.:: ::..:.
CCDS95 LRDHRRIGKEQELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYNALVAFIRAEYAHRGFSEVKTPTLFS
      300       310       320       330       340       350        

     380       390       400                        410       420  
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
       ..::  ::::.::.:.::. .                    . .::::::::.::::: :
CCDS95 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
      360       370       380       390       400       410        

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
       ::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
CCDS95 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
      420       430       440       450       460       470        

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
       ::.::.:.::::.: :::::  ::::  .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
CCDS95 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
      480       490       500       510       520       530        

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
       :::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. :   .:::..:::.::::::...
CCDS95 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
      540       550       560       570        580       590       

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
       .:.:. :::::.:::: ::.:.:::   .:::....:... : ...:.: : : ::...:
CCDS95 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
       600       610       620       630       640       650       

            670       680       690       700       710       720  
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
       : ::::.::: .:::.::. . :::::::::.  ::  . :...:: .:.. :  .::: 
CCDS95 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
       660       670       680       690       700       710       

        
pF1KB3 F
       :
CCDS95 F
        




723 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 21:00:17 2016 done: Thu Nov  3 21:00:17 2016
 Total Scan time:  3.060 Total Display time:  0.130

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com