Result of FASTA (ccds) for pF1KB3347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3347, 737 aa
  1>>>pF1KB3347 737 - 737 aa - 737 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4274+/-0.00106; mu= 1.5188+/- 0.064
 mean_var=211.0187+/-42.402, 0's: 0 Z-trim(110.7): 19  B-trim: 58 in 1/52
 Lambda= 0.088290
 statistics sampled from 11804 (11810) to 11804 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.363), width:  16
 Scan time:  3.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31021.1 PROX1 gene_id:5629|Hs108|chr1          ( 737) 4916 639.4 5.8e-183
CCDS73663.1 PROX2 gene_id:283571|Hs108|chr14       ( 592)  835 119.5 1.5e-26
CCDS45136.2 PROX2 gene_id:283571|Hs108|chr14       ( 365)  607 90.4 5.5e-18


>>CCDS31021.1 PROX1 gene_id:5629|Hs108|chr1               (737 aa)
 initn: 4916 init1: 4916 opt: 4916  Z-score: 3398.2  bits: 639.4 E(32554): 5.8e-183
Smith-Waterman score: 4916; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (1-737:1-737)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MPDHDSTALLSRQTKRRRVDIGVKRTVGTASAFFAKARATFFSAMNPQGSEQDVEYSVVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPDHDSTALLSRQTKRRRVDIGVKRTVGTASAFFAKARATFFSAMNPQGSEQDVEYSVVQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 HADGEKSNVLRKLLKRANSYEDAMMPFPGATIISQLLKNNMNKNGGTEPSFQASGLSSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HADGEKSNVLRKLLKRANSYEDAMMPFPGATIISQLLKNNMNKNGGTEPSFQASGLSSTG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SEVHQEDICSNSSRDSPPECLSPFGRPTMSQFDMDRLCDEHLRAKRARVENIIRGMSHSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEVHQEDICSNSSRDSPPECLSPFGRPTMSQFDMDRLCDEHLRAKRARVENIIRGMSHSP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 SVALRGNENEREMAPQSVSPRESYRENKRKQKLPQQQQQSFQQLVSARKEQKREERRQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVALRGNENEREMAPQSVSPRESYRENKRKQKLPQQQQQSFQQLVSARKEQKREERRQLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QQLEDMQKQLRQLQEKFYQIYDSTDSENDEDGNLSEDSMRSEILDARAQDSVGRSDNEMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QQLEDMQKQLRQLQEKFYQIYDSTDSENDEDGNLSEDSMRSEILDARAQDSVGRSDNEMC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ELDPGQFIDRARALIREQEMAENKPKREGNNKERDHGPNSLQPEGKHLAETLKQELNTAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELDPGQFIDRARALIREQEMAENKPKREGNNKERDHGPNSLQPEGKHLAETLKQELNTAM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SQVVDTVVKVFSAKPSRQVPQVFPPLQIPQARFAVNGENHNFHTANQRLQCFGDVIIPNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQVVDTVVKVFSAKPSRQVPQVFPPLQIPQARFAVNGENHNFHTANQRLQCFGDVIIPNP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LDTFGNVQMASSTDQTEALPLVVRKNSSDQSASGPAAGGHHQPLHQSPLSATTGFTTSTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDTFGNVQMASSTDQTEALPLVVRKNSSDQSASGPAAGGHHQPLHQSPLSATTGFTTSTF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 RHPFPLPLMAYPFQSPLGAPSGSFSGKDRASPESLDLTRDTTSLRTKMSSHHLSHHPCSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RHPFPLPLMAYPFQSPLGAPSGSFSGKDRASPESLDLTRDTTSLRTKMSSHHLSHHPCSP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AHPPSTAEGLSLSLIKSECGDLQDMSEISPYSGSAMQEGLSPNHLKKAKLMFFYTRYPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AHPPSTAEGLSLSLIKSECGDLQDMSEISPYSGSAMQEGLSPNHLKKAKLMFFYTRYPSS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 NMLKTYFSDVKFNRCITSQLIKWFSNFREFYYIQMEKYARQAINDGVTSTEELSITRDCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NMLKTYFSDVKFNRCITSQLIKWFSNFREFYYIQMEKYARQAINDGVTSTEELSITRDCE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LYRALNMHYNKANDFEVPERFLEVAQITLREFFNAIIAGKDVDPSWKKAIYKVICKLDSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LYRALNMHYNKANDFEVPERFLEVAQITLREFFNAIIAGKDVDPSWKKAIYKVICKLDSE
              670       680       690       700       710       720

              730       
pF1KB3 VPEIFKSPNCLQELLHE
       :::::::::::::::::
CCDS31 VPEIFKSPNCLQELLHE
              730       

>>CCDS73663.1 PROX2 gene_id:283571|Hs108|chr14            (592 aa)
 initn: 1077 init1: 798 opt: 835  Z-score: 590.2  bits: 119.5 E(32554): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 1094; 37.7% identity (59.9% similar) in 626 aa overlap (124-727:17-587)

           100       110       120       130       140             
pF1KB3 SQLLKNNMNKNGGTEPSFQASGLSSTGSEVHQEDICSNSSRDSPPECL---SPFGR---P
                                     :  . :... :.: :  :   :::     :
CCDS73               MDPNSILLSPQPQICSHLAEACTEGERSSSPPELDRDSPFPWSQVP
                             10        20        30        40      

       150       160       170       180       190       200       
pF1KB3 TMSQFDMDRLCDEHLRAKRARVENIIRGMSHSPSVALRGNENEREMAPQSVSPR--ESYR
       . :  : . . :::..:::::::.:.:::  ::.  . ::      :  .::::  .. :
CCDS73 SSSPTDPEWFGDEHIQAKRARVETIVRGMCLSPNPLVPGN------AQAGVSPRCPKKAR
         50        60        70        80              90       100

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB3 ENKRKQKLPQQQQQSFQQLVSARKEQKREERRQLKQQLEDMQKQLRQLQEKFYQIYDSTD
       : ::::.::  :  .. . . :  . .:.   ....::. ...:::.:::.. :     :
CCDS73 ERKRKQNLPTPQ--GLLMPAPAWDQGNRKGGPRVREQLHLLKQQLRHLQEHILQAAKPRD
              110         120       130       140       150        

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB3 SENDEDGNLSEDSMRSEILDARAQDSVGRSDNEMCELDPGQFIDRARALIREQEMAENKP
       . .   :  .  .     :.:.  .. :          :       :  . . .  ..  
CCDS73 TAQGPGGCGTGKGP----LSAKQGNGCG----------P-------RPWVVDGDHQQGTS
      160       170           180                        190       

          330       340        350       360        370         380
pF1KB3 KR-EGNNKERDHGPNSLQPEGKHLA-ETLKQELNTAMSQVVDTVV-KVFSAKPSR--QVP
       :   : .:...    :. : :   . : :..::. :.::.::.:. ::.   :..  :. 
CCDS73 KDLSGAEKHQESEKPSFLPSGAPASLEILRKELTRAVSQAVDSVLQKVLLDPPGHLTQLG
       200       210       220       230       240       250       

              390           400          410       420       430   
pF1KB3 QVFPPLQIPQARFA----VNGENHN---FHTANQRLQCFGDVIIPNPLDTFGNVQMASST
       . :   :. ..:      :.:  ..   . .  .:.:  . :    :.   ::...:.  
CCDS73 RSFQG-QVAEGRSEPSPPVGGACKDPLALAALPRRVQLQAGV----PV---GNLSLAKRL
       260        270       280       290           300            

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB3 DQTE--ALPLVVRKNSSDQSASGPAAGGHHQPLHQSPLSATTGFTTSTFRHPFPLPLMAY
       :. .    : .. :  .:  :. : ..  :   .:  ::   :   .. .     :  . 
CCDS73 DSPRYPIPPRMTPKPCQDPPANFPLTAPSHIQENQI-LSQLLGHRYNNGHWSSSPPQDSS
     310       320       330       340        350       360        

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB3 PFQSPLGAPSGSFSGKDRASPESLDLTRDTTSLRTKMSSHHLSHHPCSPAHPPSTAEGLS
         . : . :  ..     ..:. : :...   :   ..: ::   :  :.          
CCDS73 SQRHPSSEP--ALRPWRTTKPQPLVLSQQQCPL--PFTSAHLESLPLLPS----------
      370         380       390         400       410              

             560       570       580       590       600       610 
pF1KB3 LSLIKSECGDLQDMSEISPYSGSAMQEGLSPNHLKKAKLMFFYTRYPSSNMLKTYFSDVK
          .: :   :. . :  :.:   .::::.:.::::::::::.:::::::.::.:: ::.
CCDS73 ---VKMEQRGLHAVMEALPFSLVHIQEGLNPGHLKKAKLMFFFTRYPSSNLLKVYFPDVQ
             420       430       440       450       460       470 

             620       630       640       650       660       670 
pF1KB3 FNRCITSQLIKWFSNFREFYYIQMEKYARQAINDGVTSTEELSITRDCELYRALNMHYNK
       ::::::::.::::::::::::::::: :::::.::::. . : . :. ::..::::::::
CCDS73 FNRCITSQMIKWFSNFREFYYIQMEKSARQAISDGVTNPKMLVVLRNSELFQALNMHYNK
             480       490       500       510       520       530 

             680       690       700       710       720       730 
pF1KB3 ANDFEVPERFLEVAQITLREFFNAIIAGKDVDPSWKKAIYKVICKLDSEVPEIFKSPNCL
       .::::::. :::.:..::.::: :. ::.: :::::: :::.: ::::..::::::    
CCDS73 GNDFEVPDCFLEIASLTLQEFFRAVSAGRDSDPSWKKPIYKIISKLDSDIPEIFKSSSYP
             540       550       560       570       580       590 

             
pF1KB3 QELLHE
             
CCDS73 Q     
             

>>CCDS45136.2 PROX2 gene_id:283571|Hs108|chr14            (365 aa)
 initn: 840 init1: 604 opt: 607  Z-score: 436.4  bits: 90.4 E(32554): 5.5e-18
Smith-Waterman score: 626; 44.0% identity (69.3% similar) in 257 aa overlap (492-727:109-360)

             470       480       490       500        510       520
pF1KB3 QPLHQSPLSATTGFTTSTFRHPFPLPLMAYPFQSPLGAPSGSFS-GKDRASPESLDLTRD
                                     :  . :  :. ... :. ...:.    .:.
CCDS45 PNPLVPGNAQAGVSPRCPKKARERKRKQNLPTPQGLLMPAPAWDQGNRKGGPR----VRE
       80        90       100       110       120       130        

              530       540       550                560       570 
pF1KB3 TTSLRTKMSSHHLSHHPCSPAHPPSTAEGLS--------LSLIKSE-CGDLQDMSEISPY
          :  :.. .::..:  . :.: .::.: .        ::  ... ::    . . .  
CCDS45 QLHL-LKQQLRHLQEHILQAAKPRDTAQGPGGCGTGKGPLSAKQGNGCGPRPWVVDGDHQ
           140       150       160       170       180       190   

             580       590       600        610                 620
pF1KB3 SGSAMQEGLSPNHLKKAKLMFFYTRYPSS-NMLKTYFSDV----------KFNRCITSQL
       .:.. . . . .: .. :  :. .  :.: ..:.  .. .          :::::::::.
CCDS45 QGTSKDLSGAEKHQESEKPSFLPSGAPASLEILRKELTRAVSQAVDSVLQKFNRCITSQM
           200       210       220       230       240       250   

              630       640       650       660       670       680
pF1KB3 IKWFSNFREFYYIQMEKYARQAINDGVTSTEELSITRDCELYRALNMHYNKANDFEVPER
       ::::::::::::::::: :::::.::::. . : . :. ::..::::::::.::::::. 
CCDS45 IKWFSNFREFYYIQMEKSARQAISDGVTNPKMLVVLRNSELFQALNMHYNKGNDFEVPDC
           260       270       280       290       300       310   

              690       700       710       720       730       
pF1KB3 FLEVAQITLREFFNAIIAGKDVDPSWKKAIYKVICKLDSEVPEIFKSPNCLQELLHE
       :::.:..::.::: :. ::.: :::::: :::.: ::::..::::::          
CCDS45 FLEIASLTLQEFFRAVSAGRDSDPSWKKPIYKIISKLDSDIPEIFKSSSYPQ     
           320       330       340       350       360          




737 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 20:56:37 2016 done: Thu Nov  3 20:56:38 2016
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