Result of FASTA (ccds) for pF1KB3114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3114, 545 aa
  1>>>pF1KB3114 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6776+/-0.00132; mu= 16.2981+/- 0.079
 mean_var=67.8165+/-13.558, 0's: 0 Z-trim(99.8): 76  B-trim: 180 in 1/49
 Lambda= 0.155742
 statistics sampled from 5809 (5885) to 5809 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.181), width:  16
 Scan time:  3.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2           ( 545) 3525 801.8       0
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2          ( 535) 3367 766.3       0
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2          ( 519) 3154 718.4 4.9e-207
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2          ( 501) 2917 665.2 5.1e-191
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7           ( 634) 2364 541.0 1.6e-153
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7          ( 709) 2364 541.0 1.8e-153
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7          ( 769) 2360 540.1 3.5e-153
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12          ( 536) 1980 454.7 1.3e-127
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12         ( 516) 1934 444.3 1.6e-124
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12         ( 495) 1925 442.3 6.3e-124
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 673)  591 142.6 1.4e-33
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 679)  591 142.6 1.4e-33
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 687)  591 142.6 1.4e-33
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 745)  591 142.6 1.5e-33
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 748)  591 142.6 1.5e-33
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 809)  591 142.6 1.7e-33
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6          ( 450)  587 141.6 1.8e-33
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 507)  586 141.4 2.4e-33
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5          ( 518)  585 141.2 2.8e-33
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8          ( 456)  575 138.9 1.2e-32
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8          ( 482)  575 139.0 1.3e-32
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19         ( 606)  554 134.3 4.1e-31
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19         ( 680)  554 134.3 4.5e-31
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19         ( 712)  554 134.3 4.7e-31
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19         ( 647)  548 132.9 1.1e-30
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19         ( 825)  548 133.0 1.4e-30
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19         ( 860)  548 133.0 1.4e-30
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19         ( 864)  548 133.0 1.4e-30
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19         ( 886)  548 133.0 1.5e-30
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1          ( 503)  528 128.4   2e-29
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1          ( 564)  528 128.4 2.2e-29
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1          ( 721)  528 128.5 2.7e-29
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1            ( 736)  528 128.5 2.8e-29
CCDS31754.1 PDE3A gene_id:5139|Hs108|chr12         (1141)  513 125.2 4.2e-28
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 433)  504 123.0 7.3e-28
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 459)  504 123.0 7.7e-28
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 465)  504 123.0 7.8e-28
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 466)  504 123.0 7.8e-28
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 491)  504 123.0 8.2e-28
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 492)  504 123.0 8.2e-28
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 507)  504 123.0 8.4e-28
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 526)  504 123.0 8.7e-28
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 533)  504 123.0 8.8e-28
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 540)  504 123.0 8.9e-28
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 552)  504 123.0   9e-28
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 567)  504 123.0 9.3e-28
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21         ( 593)  504 123.0 9.6e-28
CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11         ( 920)  457 112.6 2.1e-24
CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11         ( 932)  457 112.6 2.2e-24
CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11         ( 934)  457 112.6 2.2e-24


>>CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2                (545 aa)
 initn: 3525 init1: 3525 opt: 3525  Z-score: 4280.6  bits: 801.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3525; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
              490       500       510       520       530       540

            
pF1KB3 DETHS
       :::::
CCDS22 DETHS
            

>>CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2               (535 aa)
 initn: 3367 init1: 3367 opt: 3367  Z-score: 4088.8  bits: 766.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3367; 100.0% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                   
CCDS33 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ     
              490       500       510       520       530          

            
pF1KB3 DETHS

>>CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2               (519 aa)
 initn: 3151 init1: 3151 opt: 3154  Z-score: 3830.4  bits: 718.4 E(32554): 4.9e-207
Smith-Waterman score: 3154; 98.6% identity (98.8% similar) in 497 aa overlap (25-521:9-505)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
                               .:  ::    ::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                 MDDHVTIRKKHLQRPIFRLRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAA
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRS
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMI
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGI
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSL
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGF
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGS
          410       420       430       440       450       460    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNAEEKH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                   
CCDS58 MSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ     
          470       480       490       500       510              

            
pF1KB3 DETHS

>>CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2               (501 aa)
 initn: 2917 init1: 2917 opt: 2917  Z-score: 3542.9  bits: 665.2 E(32554): 5.1e-191
Smith-Waterman score: 2917; 99.1% identity (99.8% similar) in 453 aa overlap (69-521:35-487)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB3 VKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLA
                                     .. .::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 INKLFCFNFLVQCFRGKSKPSKCQIRKKVKNHIERLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLA
           10        20        30        40        50        60    

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB3 STFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVD
           70        80        90       100       110       120    

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB3 KWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPY
          130       140       150       160       170       180    

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB3 HNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDV
          190       200       210       220       230       240    

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB3 AILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQ
          250       260       270       280       290       300    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB3 IKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAEL
          310       320       330       340       350       360    

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB3 GLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVAS
          370       380       390       400       410       420    

      460       470       480       490       500       510        
pF1KB3 SSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKEL
          430       440       450       460       470       480    

      520       530       540     
pF1KB3 AAQGESDLHKNSEDLVNAEEKHDETHS
       :::                        
CCDS74 AAQEARTSSQKCEFIHQ          
          490       500           

>>CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7                (634 aa)
 initn: 2455 init1: 1467 opt: 2364  Z-score: 2869.7  bits: 541.0 E(32554): 1.6e-153
Smith-Waterman score: 2453; 67.7% identity (87.5% similar) in 554 aa overlap (1-542:1-549)

               10        20        30                 40        50 
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGI---------LRCLVKQLERGDVNVVD
       : : . ::::.:....:::  :: ::.: ::.:.         :: ::::::::...:::
CCDS54 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB3 LKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKK
       ::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.:::  ..
CCDS54 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB3 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS
        .:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.:::::
CCDS54 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB3 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV
       :.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS54 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB3 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH
       ::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS54 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
              250       260       270       280       290       300

             300        310       320       330       340       350
pF1KB3 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE
       :.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::
CCDS54 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KB3 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS
       .:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.::::::::::::::::
CCDS54 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KB3 TMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIAD
       :::::::.:::::::::::..::: ::::: :::.:.:..  ..   :: ..: .   .:
CCDS54 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SD
              430       440       450       460       470          

              480       490       500       510       520       530
pF1KB3 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNS
       : .::..: : :.::   . :. .:: :::: . ..... :.:::.  . . :   .:..
CCDS54 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEA
        480       490       500       510       520        530     

                540                                                
pF1KB3 EDL--VNAEEKHDETHS                                           
       :.   . :::.. :                                              
CCDS54 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE
         540       550       560       570       580       590     

>>CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7               (709 aa)
 initn: 2455 init1: 1467 opt: 2364  Z-score: 2868.9  bits: 541.0 E(32554): 1.8e-153
Smith-Waterman score: 2453; 67.7% identity (87.5% similar) in 554 aa overlap (1-542:1-549)

               10        20        30                 40        50 
pF1KB3 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGI---------LRCLVKQLERGDVNVVD
       : : . ::::.:....:::  :: ::.: ::.:.         :: ::::::::...:::
CCDS55 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB3 LKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKK
       ::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.:::  ..
CCDS55 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB3 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS
        .:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.:::::
CCDS55 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB3 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV
       :.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS55 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB3 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH
       ::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS55 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
              250       260       270       280       290       300

             300        310       320       330       340       350
pF1KB3 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE
       :.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::
CCDS55 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KB3 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS
       .:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.::::::::::::::::
CCDS55 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KB3 TMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIAD
       :::::::.:::::::::::..::: ::::: :::.:.:..  ..   :: ..: .   .:
CCDS55 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SD
              430       440       450       460       470          

              480       490       500       510       520       530
pF1KB3 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNS
       : .::..: : :.::   . :. .:: :::: . ..... :.:::.  . . :   .:..
CCDS55 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEA
        480       490       500       510       520        530     

                540                                                
pF1KB3 EDL--VNAEEKHDETHS                                           
       :.   . :::.. :                                              
CCDS55 EEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAE
         540       550       560       570       580       590     

>>CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7               (769 aa)
 initn: 2355 init1: 1467 opt: 2360  Z-score: 2863.5  bits: 540.1 E(32554): 3.5e-153
Smith-Waterman score: 2360; 69.9% identity (89.6% similar) in 511 aa overlap (35-542:104-609)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 ATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE
                                     :: ::::::::...:::::::.::::.:::
CCDS55 VHDPRPPEEILADELPQLDSPEVLVKTSFRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVLE
            80        90       100       110       120       130   

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pF1KB3 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA
       .::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.:::  .. .:::.:.:::::
CCDS55 SVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFKSIVHA
           140       150       160       170       180       190   

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pF1KB3 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF
       ::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.::::::.:.:::..:::.
CCDS55 VQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYELL
           200       210       220       230       240       250   

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB3 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL
       ::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::::.. .::. .::
CCDS55 TRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANWL
           260       270       280       290       300       310   

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pF1KB3 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQE-E
       :::::.:..:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::.:. :
CCDS55 TELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRLLQDDE
           320       330       340       350       360       370   

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pF1KB3 EMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILH
       ::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::.:.. :..::.::
CCDS55 EMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLMLH
           380       390       400       410       420       430   

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB3 AADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDF
       .::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS55 TADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDF
           440       450       460       470       480       490   

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB3 IVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSD
       ::::::..::: ::::: :::.:.:..  ..   :: ..: .   .:: .::..: : :.
CCDS55 IVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISS---SDA-KRSGVKTSGSE
           500       510       520       530           540         

           490       500       510       520       530         540 
pF1KB3 GSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDL--VNAEEKHD
       ::   . :. .:: :::: . ..... :.:::.  . . :   .:..:.   . :::.. 
CCDS55 GSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPK-EEKAKKEAEEKARLAAEEQQK
     550       560       570       580        590       600        

                                                                   
pF1KB3 ETHS                                                        
       :                                                           
CCDS55 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK
      610       620       630       640       650       660        

>>CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12               (536 aa)
 initn: 2086 init1: 1978 opt: 1980  Z-score: 2404.6  bits: 454.7 E(32554): 1.3e-127
Smith-Waterman score: 2016; 58.3% identity (82.1% similar) in 532 aa overlap (8-539:12-519)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNI
                  .:: .  .   : .  ..::: .:...:: .::::: :..:. .::::.
CCDS88 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSLLRYMVKQLENGEINIEELKKNL
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 EYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKP
       ::.::.::::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::..     .. ::::
CCDS88 EYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKP
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB3 KFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSL
       ::::::::::::::::::.:.::  :: .: .::.  ::..: : ::::.::.:. .:.:
CCDS88 KFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHAL
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 KFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIML
       . ...::.::..::.:::::.  :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:
CCDS88 RTIVFELLTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLL
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB3 HTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAA
       .::..: :.:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:..
CCDS88 RTGMVHCLSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSV
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB3 YRLMQEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAK
       .::::..::::.:::.::.. .:: :::::::.:::: ::::.:.....::: : ::. :
CCDS88 FRLMQDDEMNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPK
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB3 TMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQS
       ..::.:::::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::
CCDS88 ALSLLLHAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQS
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB3 QIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSN
       ::::::::::::::.::: .:: : :: .: ::....                 ...  .
CCDS88 QIGFIDFIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQ
              430       440       450                       460    

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB3 TKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNSEDLVNA
        . ..  :. .::       . ::... :  ::.::..::: ::.: .. . . ..:   
CCDS88 PSLDVEVGDPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPC
          470              480       490       500        510      

        540                
pF1KB3 EEKHDETHS           
       ::.                 
CCDS88 EEEAPPSPAEDEHNQNGNLD
        520       530      

>>CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12              (516 aa)
 initn: 2015 init1: 1934 opt: 1934  Z-score: 2349.0  bits: 444.3 E(32554): 1.6e-124
Smith-Waterman score: 1970; 60.0% identity (83.2% similar) in 505 aa overlap (35-539:19-499)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 ATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLE
                                     :: .::::: :..:. .::::.::.::.::
CCDS53             MANPVPVQRSHLQGPILRLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLE
                           10        20        30        40        

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB3 AVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHA
       ::::::::..:::::::.....:.::::::::::::::..     .. ::::::::::::
CCDS53 AVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVHA
       50        60        70        80        90       100        

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB3 VQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELF
       ::::::::::.:.::  :: .: .::.  ::..: : ::::.::.:. .:.:. ...::.
CCDS53 VQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFELL
      110       120       130       140       150       160        

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB3 TRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWL
       ::..::.:::::.  :..: .:::.::.:::::::: ::::::::::: ..:.::..: :
CCDS53 TRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHCL
      170       180       190       200       210       220        

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB3 TELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQEEE
       .:.:.::..:::::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:...::::..:
CCDS53 SEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDE
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CCDS53 MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHA
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       ::::::.:.: .: ::: ::::::: :::::::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS53 ADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFIDFI
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       ::::::.::: .:: : :: .: ::....                 ...  . . ..  :
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       . .::       . ::... :  ::.::..::: ::.: .. . . ..:   ::.     
CCDS53 DPNPD-------VVSFRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITN-QMSIDELSPCEEEAPPSP
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CCDS53 AEDEHNQNGNLD
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CCDS73                               MVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLLEAVY
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CCDS73 ELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDDEMNI
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CCDS73 FINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLLHAADI
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CCDS73 TFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQP----------------SFQWRQPSLDVEVGDPN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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