Result of FASTA (omim) for pF1KB1569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB1569, 983 aa
  1>>>pF1KB1569 983 - 983 aa - 983 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9406+/-0.000802; mu= -3.6453+/- 0.048
 mean_var=1034.6064+/-232.065, 0's: 0 Z-trim(113.2): 1106  B-trim: 0 in 0/57
 Lambda= 0.039874
 statistics sampled from 21271 (22425) to 21271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  8.270

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3  ( 983) 6648 400.9 1.7e-110
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 6629 399.9 3.5e-110
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 6200 375.1 9.2e-103
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 4715 289.8   5e-77
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5  (1015) 4709 289.4 6.4e-77
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4  ( 986) 4325 267.3 2.8e-70
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 4325 267.3 2.8e-70
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 4315 266.7 4.2e-70
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 4272 264.3 2.3e-69
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 4262 263.7 3.5e-69
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 4235 262.1   1e-68
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 4204 260.3 3.4e-68
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1  ( 984) 3777 235.8 8.6e-61
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3  ( 998) 3719 232.5 8.8e-60
NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3  ( 539) 3667 229.0 5.3e-59
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 3370 212.4 9.7e-54
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 3370 212.4 9.9e-54
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 3368 212.3   1e-53
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 3368 212.3   1e-53
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7  ( 998) 3356 211.6 1.7e-53
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4  ( 987) 3167 200.7 3.2e-50
NP_001073917 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1130) 3076 195.6 1.3e-48
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2697 173.5 4.1e-42
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2696 173.5 4.4e-42
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1  ( 976) 2680 172.7 8.5e-42
XP_016856023 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 973) 2655 171.2 2.3e-41
NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 2651 171.0 2.7e-41
XP_016856024 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 965) 2645 170.7 3.4e-41
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 2575 166.5 5.2e-40
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 2575 166.6 5.5e-40
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 2570 166.3 6.5e-40
XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 2295 150.1 3.2e-35
XP_006713655 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1146) 2271 149.3 1.1e-34
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 2204 145.3 1.5e-33
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 2204 145.3 1.5e-33
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 2204 145.3 1.5e-33
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 2173 143.4 4.9e-33
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 2173 143.5   5e-33
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 2173 143.5 5.1e-33
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5  (1037) 2173 143.6 5.3e-33
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 2173 143.6 5.3e-33
XP_016861701 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1012) 2168 143.3 6.4e-33
XP_016861700 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1018) 2168 143.3 6.4e-33
XP_016861702 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type ( 990) 2148 142.1 1.4e-32
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 2149 142.2 1.4e-32
XP_016861708 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type ( 537) 2093 138.4 9.6e-32
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 2057 136.9 5.3e-31
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 2049 136.4 7.3e-31
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 1968 131.7 1.8e-29
XP_016865855 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 442) 1898 127.0 2.1e-28


>>NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 isof  (983 aa)
 initn: 6648 init1: 6648 opt: 6648  Z-score: 2104.9  bits: 400.9 E(85289): 1.7e-110
Smith-Waterman score: 6648; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB1 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB1 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB1 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB1 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB1 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB1 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
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pF1KB1 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB1 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB1 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
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pF1KB1 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
              790       800       810       820       830       840

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pF1KB1 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
              850       860       870       880       890       900

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pF1KB1 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
              910       920       930       940       950       960

              970       980   
pF1KB1 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
       :::::::::::::::::::::::
NP_005 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
              970       980   

>>XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type-A r  (982 aa)
 initn: 3335 init1: 3335 opt: 6629  Z-score: 2099.0  bits: 399.9 E(85289): 3.5e-110
Smith-Waterman score: 6629; 99.9% identity (99.9% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-982)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
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XP_005 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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>>XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type-A r  (918 aa)
 initn: 6200 init1: 6200 opt: 6200  Z-score: 1965.9  bits: 375.1 E(85289): 9.2e-103
Smith-Waterman score: 6200; 100.0% identity (100.0% similar) in 916 aa overlap (1-916:1-916)

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XP_005 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
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XP_005 LLLDQSNVDITTFRTTVT                                          
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>>NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 i  (1016 aa)
 initn: 3366 init1: 2127 opt: 4715  Z-score: 1503.9  bits: 289.8 E(85289): 5e-77
Smith-Waterman score: 4715; 68.4% identity (90.3% similar) in 977 aa overlap (10-983:44-1016)

                                    10        20        30         
pF1KB1                      MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
                                     :: :..: .   :. .::::::::::.:..
NP_001 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
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pF1KB1 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
       :.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:.  ..:..:..::
NP_001 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
               80        90       100       110       120       130

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB1 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
       :::::::::.:  :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
NP_001 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
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pF1KB1 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
       :..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.   
NP_001 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
              200       210       220       230       240       250

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB1 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
       ::..:.:: :::::.:  ..::.:.::.::::::::::: :.:::::..  ::.:::::.
NP_001 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
              260       270       280       290       300       310

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB1 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
       ::    ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
NP_001 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
              320       330       340       350       360       370

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pF1KB1 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
       :::.:.:  : ::::::::.. : ::::. .   :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
NP_001 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
              380       390       400       410       420       430

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pF1KB1 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
       :::::::::::.::::::.::   ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
NP_001 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
              440       450       460       470       480       490

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pF1KB1 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
       ::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..:  .::: ..::::::::::::::
NP_001 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
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pF1KB1 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGY-KSKHGA
       . ::.:::::.: : . :...::. .::.:..:..:::.::: ::. :: ::: :.:.  
NP_001 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAKQDP
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pF1KB1 DEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVC
       .:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
NP_001 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
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pF1KB1 SGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVM
       :::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_001 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
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        700       710       720       730       740       750      
pF1KB1 IVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
       ::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
     730       740       750       760       770       780         

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pF1KB1 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
NP_001 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
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pF1KB1 VMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVS
       :.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
NP_001 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
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pF1KB1 ILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVE
       .::::::::.::: ...:. : :::: ..: .   ..:..:.::...  ..  :::    
NP_001 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
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pF1KB1 YSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
       ::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...:  :: ::.
NP_001 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
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>>NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 isof  (1015 aa)
 initn: 4410 init1: 3358 opt: 4709  Z-score: 1502.0  bits: 289.4 E(85289): 6.4e-77
Smith-Waterman score: 4709; 68.4% identity (90.3% similar) in 977 aa overlap (10-983:44-1015)

                                    10        20        30         
pF1KB1                      MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
                                     :: :..: .   :. .::::::::::.:..
NP_872 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
            20        30        40        50           60        70

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pF1KB1 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
       :.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:.  ..:..:..::
NP_872 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
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pF1KB1 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
       :::::::::.:  :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
NP_872 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
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pF1KB1 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
       :..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.   
NP_872 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
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pF1KB1 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
       ::..:.:: :::::.:  ..::.:.::.::::::::::: :.:::::..  ::.:::::.
NP_872 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
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pF1KB1 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
       ::    ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
NP_872 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
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pF1KB1 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
       :::.:.:  : ::::::::.. : ::::. .   :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
NP_872 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
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pF1KB1 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
       :::::::::::.::::::.::   ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
NP_872 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
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pF1KB1 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
       ::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..:  .::: ..::::::::::::::
NP_872 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
              500        510       520       530       540         

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pF1KB1 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGY-KSKHGA
       . ::.:::::.:  :. :...::. .::.:..:..:::.::: ::. :: ::: :.:.  
NP_872 VFSRRFEFETTP-VFAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAKQDP
     550       560        570       580       590       600        

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pF1KB1 DEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVC
       .:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
NP_872 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
      610       620       630       640       650       660        

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pF1KB1 SGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVM
       :::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_872 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
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pF1KB1 IVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
       ::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
NP_872 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
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pF1KB1 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
NP_872 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
      790       800       810       820       830       840        

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pF1KB1 VMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVS
       :.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
NP_872 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
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pF1KB1 ILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVE
       .::::::::.::: ...:. : :::: ..: .   ..:..:.::...  ..  :::    
NP_872 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
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pF1KB1 YSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
       ::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...:  :: ::.
NP_872 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
      970       980       990      1000      1010     

>>NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 isof  (986 aa)
 initn: 4238 init1: 1965 opt: 4325  Z-score: 1382.7  bits: 267.3 E(85289): 2.8e-70
Smith-Waterman score: 4325; 63.6% identity (86.9% similar) in 974 aa overlap (10-975:9-975)

               10          20        30        40        50        
pF1KB1 MDCQLSILLLLSC--SVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHG-WEEISG
                :.::  .. :.       :.:::.::::...:::::::. : .: :::.: 
NP_004  MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSI
                10        20        30        40        50         

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pF1KB1 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
       .::. ::::::::::::. ::::::::.:. :..::..:.:.:::::::::.: :.::::
NP_004 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
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NP_001 KNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLE
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