Result of FASTA (ccds) for pF1KB1569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB1569, 983 aa
  1>>>pF1KB1569 983 - 983 aa - 983 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1648+/-0.00147; mu= 7.0426+/- 0.085
 mean_var=320.3625+/-69.983, 0's: 0 Z-trim(105.7): 680  B-trim: 90 in 1/52
 Lambda= 0.071656
 statistics sampled from 7760 (8553) to 7760 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  3.550

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983) 6648 703.4 5.8e-202
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016) 4715 503.5 8.5e-142
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015) 4709 502.9 1.3e-141
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986) 4325 463.2 1.1e-129
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984) 3777 406.6 1.3e-112
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3           ( 998) 3719 400.6 8.3e-111
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3          ( 539) 3667 394.8 2.4e-109
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986) 3370 364.5  6e-100
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055) 3370 364.5 6.2e-100
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987) 3368 364.3 6.9e-100
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998) 3356 363.0 1.6e-99
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987) 3167 343.5 1.2e-93
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3        (1130) 3076 334.2 9.2e-91
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976) 2680 293.1 1.8e-78
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976) 2651 290.1 1.4e-77
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037) 2173 240.8 1.1e-62
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038) 2173 240.8 1.1e-62
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004) 2057 228.8 4.4e-59
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1          ( 495) 1860 208.0 3.9e-53
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1       (1008) 1747 196.7   2e-49
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005) 1700 191.9 5.7e-48
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7           (1022) 1545 175.8 3.8e-43
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7          ( 729) 1471 168.0 6.3e-41
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6          ( 279) 1199 139.3   1e-32
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1         ( 295) 1093 128.4 2.1e-29
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504)  765 94.8 4.7e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505)  765 94.8 4.7e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525)  765 94.8 4.8e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526)  765 94.8 4.9e-19
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1367)  769 95.8 6.4e-19
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  759 94.8 1.3e-18
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  759 94.8 1.3e-18
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1366)  756 94.4 1.6e-18
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537)  747 93.0 1.8e-18
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543)  746 92.9 1.9e-18
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509)  743 92.5 2.3e-18
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  748 93.5 2.5e-18
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  748 93.5 2.5e-18
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491)  740 92.2 2.8e-18
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512)  740 92.2 2.9e-18
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534)  738 92.0 3.4e-18
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536)  737 91.9 3.6e-18
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6             ( 505)  732 91.4   5e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 312)  720 89.8   9e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5            ( 453)  723 90.4   9e-18
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5             ( 822)  723 90.7 1.3e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 619)  720 90.3 1.3e-17
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  717 90.0 1.7e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 694)  716 89.9 1.9e-17
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 752)  716 90.0   2e-17


>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3                (983 aa)
 initn: 6648 init1: 6648 opt: 6648  Z-score: 3739.3  bits: 703.4 E(32554): 5.8e-202
Smith-Waterman score: 6648; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB1 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB1 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB1 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB1 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB1 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB1 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB1 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB1 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB1 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB1 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB1 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB1 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
              910       920       930       940       950       960

              970       980   
pF1KB1 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
       :::::::::::::::::::::::
CCDS29 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
              970       980   

>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1016 aa)
 initn: 3366 init1: 2127 opt: 4715  Z-score: 2659.2  bits: 503.5 E(32554): 8.5e-142
Smith-Waterman score: 4715; 68.4% identity (90.3% similar) in 977 aa overlap (10-983:44-1016)

                                    10        20        30         
pF1KB1                      MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
                                     :: :..: .   :. .::::::::::.:..
CCDS75 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
            20        30        40        50           60        70

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB1 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
       :.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:.  ..:..:..::
CCDS75 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
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       :::::::::.:  :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
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       :..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.   
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       .:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
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       :::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
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       ::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
CCDS75 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
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       :.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
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       ::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...:  :: ::.
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>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2                (986 aa)
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pF1KB1 MDCQLSILLLLSC--SVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHG-WEEISG
                :.::  .. :.       :.:::.::::...:::::::. : .: :::.: 
CCDS24  MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSI
                10        20        30        40        50         

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pF1KB1 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
       .::. ::::::::::::. ::::::::.:. :..::..:.:.:::::::::.: :.::::
CCDS24 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
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       :::::::.:::.:.   .::.::.:::::::::::::.:.::::.:::::::.:::..::
CCDS24 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
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pF1KB1 GFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSKE
       ::::::::::::.:::::::..::::.::.:::.::::.   :..:::::::::::::.:
CCDS24 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEE
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pF1KB1 EDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSST
       .: :.:::...::::::::.: ::::.:::.  ::::. :.::::. .  :::::::: .
CCDS24 KDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYS
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pF1KB1 QEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKD
         .:. .: :. ..::::.:  :: ::::::.: :.:::.::::: :.:: : .::::.:
CCDS24 VWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQD
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pF1KB1 VTFNIICKKCGW-NIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGV
       ...:..:::::  . ..:.::. .:.. :.: :: .: :..::::::::::::: :::::
CCDS24 ISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGV
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pF1KB1 SELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYY
       :. .  : : ..:..:::::::: .  ..  ...: :..:.: ::..:::.::.::::::
CCDS24 SKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYY
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pF1KB1 EKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETS--PDSF
       ::...: :: :.:. . :. :..:.: : :::..:::::::::  :. .:  :.  :. .
CCDS24 EKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRI
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pF1KB1 SISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGY-KSKHGADEKRLHFGNGHLKLPG
         .: .: :.....:..:..... .. .:.  :   : :.:. :::..      ::.  :
CCDS24 IGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEK------HLN-QG
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pF1KB1 LRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAI
       .:::::: :::::.:::.:::::.::. :.:.::.:.::::::::::::.:.:.:: :::
CCDS24 VRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAI
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pF1KB1 KTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLR
       ::::.:::.:::::::.::::::::::::::.::::::: :::::.::::::::::.:::
CCDS24 KTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLR
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pF1KB1 KHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLE
       :.:..:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS24 KNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLE
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pF1KB1 DDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQD
       :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS24 DDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQD
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pF1KB1 VIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIIT
       ::::..:::::::::::: ::.:::::::::.:..:::: :::..::::::::.:::   
CCDS24 VIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTG
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pF1KB1 SAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMK
       . ..::.. ::: :. ....  ..::::...   . :. ::.. :.. ....... .:. 
CCDS24 TESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLA
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            960       970       980      
pF1KB1 KVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV   
       ..:.:..  :.::.::..:..::           
CCDS24 RIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
            960       970       980      

>>CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3               (984 aa)
 initn: 3662 init1: 994 opt: 3777  Z-score: 2135.3  bits: 406.6 E(32554): 1.3e-112
Smith-Waterman score: 3777; 56.4% identity (83.0% similar) in 963 aa overlap (29-980:19-980)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
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CCDS46           MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDE
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       . . :::::::::.. .::::: :... : .:..::.:..::.:::.:.: : :.:::::
CCDS46 NLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETF
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pF1KB1 NLYYMESDDDHGVK----FREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNK
       ::::.:.:.  ..:    . :  . :.:::::::::.:.:.: :..:.:::.:  ::...
CCDS46 NLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTR
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pF1KB1 KGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSK
       .:::::::: :::..:.::::.:::::  :.:.:.::.:.   .: ::: .::.:. :..
CCDS46 NGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAE
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pF1KB1 EEDPP-RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYE-ERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPH
       : : : ..::. .:::.::::.:.:. ::: : .  :.::  : .:: .    :..:: .
CCDS46 EVDVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSN
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pF1KB1 SSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGG
       : .  ..:  : :...:.::: ::: .:::  ::.:::::: .::::.::.:  : .:::
CCDS46 SRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGG
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB1 RKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVN
       : :::.:::::::  . ..:  :. ::.:.:::.:::.  :....: ::: :::.:.:.:
CCDS46 RDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAIN
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pF1KB1 GVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVK
       :::  :  : : ..:.::::::::: :  ...  ..  ::.::: .::.:::::::::..
CCDS46 GVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIR
              420       430       440       450       460       470

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pF1KB1 YYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSF
       ::::...: . .. :.. ... :..:.:  .:: :.::::.::::  : :. :.:  :. 
CCDS46 YYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDD
              480       490       500       510       520       530

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pF1KB1 SISGESSQVVMIAISAAVAIILLT--VVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLP
         :    :. .:: :::.......  :.: .. .:  .:...   ..:  :...:. . :
CCDS46 YKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGS-P
              540       550       560       570       580          

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pF1KB1 GLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVA
       :.. :.:: :::::..::.:::::.:.. ..:..:.:::::::: .::::::.:.:: ::
CCDS46 GMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVA
     590       600       610       620       630       640         

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pF1KB1 IKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFL
       :::::.::.::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::
CCDS46 IKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFL
     650       660       670       680       690       700         

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pF1KB1 RKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVL
       :..:.:::::::::::::::.:::::..:.::::::::::::.::::::::::::::: :
CCDS46 RQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYL
     710       720       730       740       750       760         

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pF1KB1 EDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMS
       .::  . .::.  :::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::.::::::.::
CCDS46 QDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMS
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pF1KB1 NQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLK
       :::::.:... :::::::::::::.::::::::::::.::.: .::. :::.::::.:::
CCDS46 NQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLK
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pF1KB1 IITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTD
        ... .: ::. :::.:  :.:.: :. :::...  .. .. :  . ..: . .......
CCDS46 TVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSE
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pF1KB1 DMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV 
       :. ..:.:..: ::::..::.....: ...:    
CCDS46 DLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA
     950       960       970       980    

>>CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3                (998 aa)
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                                     : .:.:.: . .::.: :.:  ::::.:: 
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pF1KB1 DEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKE
       :: ..:::::::::: . ::::::::... : ..:..:::::::.::::::: . :.:::
CCDS32 DEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIPNIPGSCKE
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       ::::.:.:.:.: .      . :. ..:.:::: ::::...: :    ..::..:  ::.
CCDS32 TFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNTKVRSFGPL
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       .: :::::::: :::..:.:::...:::  :. ..:.::.:.   .  ::: . :.:. :
CCDS32 SKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVIAPGTCIPN
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pF1KB1 SKEEDPP-RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEE--RGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKC
       . : . : ..::. .:::.::.: :.: .:.:   .  .:. : :: ::: .:.  :  :
CCDS32 AVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQGEGPCLPC
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pF1KB1 PPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLD
       ::.: :   ..  : :.::..:::.:  . :::  :: ::.::::.::::.::.:: : :
CCDS32 PPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLILEWSEPRD
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pF1KB1 TGGRKDVTFNIICKKC--GWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFE
        ::: :. .:.:::::  . . . :  :. ::.:.:::.:::.  : .. ::::: ::::
CCDS32 LGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLLAHTRYTFE
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pF1KB1 IDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIIL
       ..::::::  :  : ..:::.::::::::: : :..   .: .:..:::  ::.:::.::
CCDS32 VQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPPERPNGVIL
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pF1KB1 DYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFET
       :::.::.::.:  .:   . .. ..: ...:.::. :: :.::::.::::  ::  ::::
CCDS32 DYEMKYFEKSEGIAS--TVTSQMNSVQLDGLRPDARYVVQVRARTVAGYGQYSRPAEFET
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pF1KB1 SPDSFSISGE-SSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGH
       . .  : . . . :. .:. ::.........:. . :   :  :..::.: .  .  . .
CCDS32 TSERGSGAQQLQEQLPLIVGSATAGLVFVVAVVVIAI--VCLRKQRHGSDSEYTEKLQQY
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pF1KB1 LKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKE
       .  ::...:.:: :::::..::.:::::.:.. ..:..:.::::::::: :::: :...:
CCDS32 IA-PGMKVYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSCVKIEEVIGAGEFGEVCRGRLKQPGRRE
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pF1KB1 ISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSL
       . ::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::.::::.::.::: .:
CCDS32 VFVAIKTLKVGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMILTEFMENCAL
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pF1KB1 DSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGL
       ::::: .:.:::::::::::::::.::::::.:.::::::::::::.:::::::::::::
CCDS32 DSFLRLNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLSEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
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pF1KB1 SRVLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPY
       :: ::::: . .::.  :::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS32 SRFLEDDPSDPTYTSSLGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPY
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pF1KB1 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
       :.:::::::.::.. ::::::::::.::.::::::: .::: :::: :::. ::::::: 
CCDS32 WDMSNQDVINAVEQDYRLPPPMDCPTALHQLMLDCWVRDRNLRPKFSQIVNTLDKLIRNA
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pF1KB1 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
       .:::.:.:: .  :. :::..  : ::: :.::::...  .. :: :... ..: : .:.
CCDS32 ASLKVIASAQSGMSQPLLDRTVPDYTTFTTVGDWLDAIKMGRYKESFVSAGFASFDLVAQ
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pF1KB1 ISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV  
       ....:. ..:::..: ::::.:::. .. :  :  .::  
CCDS32 MTAEDLLRIGVTLAGHQKKILSSIQDMRLQM-NQTLPVQV
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>>CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3               (539 aa)
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pF1KB1 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
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pF1KB1 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
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pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
CCDS46 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDCMYYFNAV 
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pF1KB1 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH

>>CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1                 (986 aa)
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pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
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CCDS22          MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDE
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       ... :::::::::.. ::::::::... : .:..:.::.::..:::.::: : :.:::::
CCDS22 NMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETF
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pF1KB1 NLYYMESDDDHGVK----FREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNK
       ::::.:.: : ..:    . :. ..:.:::::::::.:.::: :..:.:::.:  :::..
CCDS22 NLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSR
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pF1KB1 KGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSK
       .:::::::: :.:..:..:::...:::  ..: :.: .:.   .: ::: .::::. :..
CCDS22 SGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAE
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pF1KB1 EEDPP-RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYE--ERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPP
       : : : ..::. .::::::::.: :.::.:  : : .:..:  : .:: .:.  :..:: 
CCDS22 EVDVPIKLYCNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPI
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       .: :  .:. :: :.:.:.::: :: .: ::  ::.:. :::..::::..:.:. : :.:
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       ::.:...:::::.:: .   :  :. ::.. :::.:::.  . ..::::::.:::::.::
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       :::.. :    :::.:.::::::::: :  ...   . .::.:::..:..:::.:::::.
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pF1KB1 KYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDS
       .::::. .: . : ...  ..::...::  .:::::.::::.::::  : :. :.:  ..
CCDS22 QYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEA
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pF1KB1 -FSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGAD----EKRLHFGNGH
        .. : . .  ..:. :::  ..:..::. ...   :. .. . ::    .:  :. .::
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pF1KB1 LKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKE
       .  ::.. :.:: :::::..::.:::::.: . ..:..:.:::::::::::.::::.:.:
CCDS22 MT-PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKRE
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       :::::..:.:::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::.:::::::::::::
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pF1KB1 WEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNP
       :.:.:::::.:... ::::::::::.::.::::::::::::.:::: :::. :::.::::
CCDS22 WDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNP
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pF1KB1 GSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAK
       .::: ..  ..  .  :::..  : :.: :. .::...  .. :: :... ..: :....
CCDS22 NSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQ
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       .  .:. .::::..: ::::..::.....:         
CCDS22 MMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV
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CCDS81 NMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETF
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CCDS81 NLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSR
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pF1KB1 KGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-MDSQSLVEVRGSCVNNSK
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pF1KB1 GRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAV
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CCDS81 GREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAV
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CCDS81 WDMTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNP
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CCDS81 NSLKAMAPLSSGINLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQ
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CCDS81 MMMEDILRVGVTLAGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEGQPLARRPRATGRTKRCQPRDV
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>>CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1                 (987 aa)
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Smith-Waterman score: 3806; 57.2% identity (82.8% similar) in 960 aa overlap (29-975:20-978)

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pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
                                   : .:.:: :  .::::. .:  ::::.:: ::
CCDS23          MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDE
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
       ... :::::::::.. ::::::::... : .:..:.::.::..:::.::: : :.:::::
CCDS23 NMNTIRTYQVCNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETF
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       ::::.:.: : ..:    . :. ..:.:::::::::.:.::: :..:.:::.:  :::..
CCDS23 NLYYYEADFDSATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSR
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CCDS23 SGFYLAFQDYGGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAE
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       : : : ..::. .::::::::.: :.::.:  : : .:..:  : .:: .:.  :..:: 
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CCDS23 GREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAV
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CCDS23 NGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYEL
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pF1KB1 KYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDS
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CCDS23 QYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEA
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pF1KB1 -FSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGYKSKHGADEKRL-HFGNGHLK
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CCDS23 EYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMT
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pF1KB1 LPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEIS
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CCDS23 -PGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIF
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CCDS23 VAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDS
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CCDS23 FLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSR
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pF1KB1 VLEDDP-EAAYTTR-GGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWE
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CCDS23 FLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWD
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CCDS23 MTNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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