seq1 = pF1KA1503.tfa, 2370 bp seq2 = pF1KA1503/gi568815581f_7619735.tfa (gi568815581f:7619735_7843383), 223649 bp >pF1KA1503 2370 >gi568815581f:7619735_7843383 (Chr17) 1-166 (100001-100166) 100% -> 167-228 (103894-103955) 100% -> 229-399 (107388-107558) 100% -> 400-628 (113353-113581) 100% -> 629-739 (114449-114559) 100% -> 740-978 (114736-114974) 100% -> 979-1170 (117333-117524) 100% -> 1171-1376 (119999-120204) 100% -> 1377-1506 (120686-120815) 100% -> 1507-1689 (121076-121258) 100% -> 1690-2370 (123194-123874) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCCAGCAAAGCTGAGAAGAAGCAGCGATTGAGTGGCCGAGGAAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCCAGCAAAGCTGAGAAGAAGCAGCGATTGAGTGGCCGAGGAAGCTC 50 . : . : . : . : . : 51 CCAGGCAAGCTGGTCAGGGCGGGCCACTCGGGCTGCTGTGGCCACACAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCAGGCAAGCTGGTCAGGGCGGGCCACTCGGGCTGCTGTGGCCACACAGG 100 . : . : . : . : . : 101 AGCAGGGGAATGCCCCGGCTGTCAGTGAGCCAGAGCTGCAGGCTGAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AGCAGGGGAATGCCCCGGCTGTCAGTGAGCCAGAGCTGCAGGCTGAGCTC 150 . : . : . : . : . : 151 CCCAAGGAGGAGCCTG AGCCACGGTTGGAGGGACCTCAAGC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 100151 CCCAAGGAGGAGCCTGGTG...TAGAGCCACGGTTGGAGGGACCTCAAGC 200 . : . : . : . : . : 192 ACAGAGTGAAGAATCAGTGGAGCCCGAGGCAGATGTG AAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 103919 ACAGAGTGAAGAATCAGTGGAGCCCGAGGCAGATGTGGTA...TAGAAGC 250 . : . : . : . : . : 233 CCCTCTTCCTTTCCCGAGCTGCGCTGACAGGACTGGCGGATGCAGTGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107392 CCCTCTTCCTTTCCCGAGCTGCGCTGACAGGACTGGCGGATGCAGTGTGG 300 . : . : . : . : . : 283 ACACAGGAGCATGATGCCATTCTGGAACACTTTGCCCAGGACCCTACAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107442 ACACAGGAGCATGATGCCATTCTGGAACACTTTGCCCAGGACCCTACAGA 350 . : . : . : . : . : 333 ATCCATCCTCACCATCTTCATTGACCCTTGTTTTGGGCTGAAGCTAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107492 ATCCATCCTCACCATCTTCATTGACCCTTGTTTTGGGCTGAAGCTAGAGC 400 . : . : . : . : . : 383 TGGGCATGCCTGTACAG ACCCAGAACCAGCTTGTCTACTTC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 107542 TGGGCATGCCTGTACAGGTG...CAGACCCAGAACCAGCTTGTCTACTTC 450 . : . : . : . : . : 424 ATTCGCCAAGCACCAGTTCCCATCACCTGGGAGAACTTCGAGGCAACTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113377 ATTCGCCAAGCACCAGTTCCCATCACCTGGGAGAACTTCGAGGCAACTGT 500 . : . : . : . : . : 474 GCAGTTTGGGACGGTGCGGGGCCCCTATATCCCGGCCCTGCTTCGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113427 GCAGTTTGGGACGGTGCGGGGCCCCTATATCCCGGCCCTGCTTCGGCTGC 550 . : . : . : . : . : 524 TCGGTGGAGTCTTTGCCCCTCAGATCTTTGCAAACACAGGCTGGCCTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113477 TCGGTGGAGTCTTTGCCCCTCAGATCTTTGCAAACACAGGCTGGCCTGAG 600 . : . : . : . : . : 574 AGCATTAGAAATCATTTTGCTTCTCATCTGCACAAGTTCTTGGCCTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113527 AGCATTAGAAATCATTTTGCTTCTCATCTGCACAAGTTCTTGGCCTGCCT 650 . : . : . : . : . : 624 GACAG ACACTCGGTACAAACTGGAGGGGCACACGGTCCTCT |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113577 GACAGGTA...TAGACACTCGGTACAAACTGGAGGGGCACACGGTCCTCT 700 . : . : . : . : . : 665 ACATCCCTGCAGAGGCCATGAACATGAAGCCTGAGATGGTGATAAAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114485 ACATCCCTGCAGAGGCCATGAACATGAAGCCTGAGATGGTGATAAAGGAC 750 . : . : . : . : . : 715 AAAGAGCTGGTGCAACGGCTAGAGA CCTCCATGATCCACTG |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 114535 AAAGAGCTGGTGCAACGGCTAGAGAGTG...CAGCCTCCATGATCCACTG 800 . : . : . : . : . : 756 GACCCGGCAGATAAAGGAGATGCTCAGTGCCCAGGAGACTGTGGAGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114752 GACCCGGCAGATAAAGGAGATGCTCAGTGCCCAGGAGACTGTGGAGACAG 850 . : . : . : . : . : 806 GAGAAAATTTAGGTCCTCTGGAGGAGATTGAGTTCTGGCGCAACCGATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114802 GAGAAAATTTAGGTCCTCTGGAGGAGATTGAGTTCTGGCGCAACCGATGC 900 . : . : . : . : . : 856 ATGGACCTGTCTGGCATCAGTAAGCAGCTGGTGAAGAAGGGAGTGAAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114852 ATGGACCTGTCTGGCATCAGTAAGCAGCTGGTGAAGAAGGGAGTGAAGCA 950 . : . : . : . : . : 906 CGTTGAATCCATCCTGCACCTTGCCAAGTCGTCCTACTTGGCGCCCTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114902 CGTTGAATCCATCCTGCACCTTGCCAAGTCGTCCTACTTGGCGCCCTTTA 1000 . : . : . : . : . : 956 TGAAACTGGCACAGCAGATCCAG GATGGCTCTCGTCAAGCA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 114952 TGAAACTGGCACAGCAGATCCAGGTT...CAGGATGGCTCTCGTCAAGCA 1050 . : . : . : . : . : 997 CAGTCAAACCTGACCTTTTTGTCAATCCTGAAGGAACCTTACCAGGAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117351 CAGTCAAACCTGACCTTTTTGTCAATCCTGAAGGAACCTTACCAGGAGTT 1100 . : . : . : . : . : 1047 GGCTTTCATGAAGCCCAAGGACATCTCTAGCAAGCTCCCTAAGCTGATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117401 GGCTTTCATGAAGCCCAAGGACATCTCTAGCAAGCTCCCTAAGCTGATCA 1150 . : . : . : . : . : 1097 GTCTCATCCGCATCATCTGGGTCAACTCTCCCCACTACAACACTCGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117451 GTCTCATCCGCATCATCTGGGTCAACTCTCCCCACTACAACACTCGGGAG 1200 . : . : . : . : . : 1147 AGACTGACCTCGCTCTTCCGAAAG GTATGTGACTGTCAGTA ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 117501 AGACTGACCTCGCTCTTCCGAAAGGTG...TAGGTATGTGACTGTCAGTA 1250 . : . : . : . : . : 1188 TCACTTCGCCCGCTGGGAAGATGGCAAGCAGGGTCCCCTTCCTTGCTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120016 TCACTTCGCCCGCTGGGAAGATGGCAAGCAGGGTCCCCTTCCTTGCTTCT 1300 . : . : . : . : . : 1238 TTGGTGCCCAGGGGCCACAGATAACACGGAACTTGCTGGAGATTGAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120066 TTGGTGCCCAGGGGCCACAGATAACACGGAACTTGCTGGAGATTGAGGAC 1350 . : . : . : . : . : 1288 ATCTTTCATAAAAATCTGCACACGCTGCGAGCCGTTCGCGGGGGTATCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120116 ATCTTTCATAAAAATCTGCACACGCTGCGAGCCGTTCGCGGGGGTATCCT 1400 . : . : . : . : . : 1338 GGATGTCAAGAACACCTGTTGGCATGAAGACTACAATAA GT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 120166 GGATGTCAAGAACACCTGTTGGCATGAAGACTACAATAAGTG...CAGGT 1450 . : . : . : . : . : 1379 TCCGTGCCGGAATCAAGGACCTGGAGGTGATGACCCAGAACCTGATCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120688 TCCGTGCCGGAATCAAGGACCTGGAGGTGATGACCCAGAACCTGATCACC 1500 . : . : . : . : . : 1429 TCAGCCTTCGAGTTGGTGCGGGACGTGCCGCACGGCGTGCTTCTGCTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120738 TCAGCCTTCGAGTTGGTGCGGGACGTGCCGCACGGCGTGCTTCTGCTGGA 1550 . : . : . : . : . : 1479 CACCTTCCACAGGCTTGCCTCCCGCGAG GCTATCAAGCGGA ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 120788 CACCTTCCACAGGCTTGCCTCCCGCGAGGTG...TAGGCTATCAAGCGGA 1600 . : . : . : . : . : 1520 CTTATGACAAGAAGGCGGTGGATCTCTACATGCTGTTCAATAGCGAGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121089 CTTATGACAAGAAGGCGGTGGATCTCTACATGCTGTTCAATAGCGAGCTG 1650 . : . : . : . : . : 1570 GCCCTGGTGAACCGTGAACGGAACAAGAAATGGCCAGACCTGGAGCCCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121139 GCCCTGGTGAACCGTGAACGGAACAAGAAATGGCCAGACCTGGAGCCCTA 1700 . : . : . : . : . : 1620 CGTGGCCCAGTATTCCGGAAAGGCGCGCTGGGTGCACATCCTCCGGCGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121189 CGTGGCCCAGTATTCCGGAAAGGCGCGCTGGGTGCACATCCTCCGGCGTC 1750 . : . : . : . : . : 1670 GCATCGACAGAGTCATGACC TGCCTTGCTGGTGCTCATTTC ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 121239 GCATCGACAGAGTCATGACCGTA...CAGTGCCTTGCTGGTGCTCATTTC 1800 . : . : . : . : . : 1711 CTGCCCCGTATTGGGACTGGAAAGGAGAGTGTGCACACCTATCAGCAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123215 CTGCCCCGTATTGGGACTGGAAAGGAGAGTGTGCACACCTATCAGCAGAT 1850 . : . : . : . : . : 1761 GGTCCAGGCCATTGATGAGCTGGTTCGAAAAACCTTCCAAGAGTGGACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123265 GGTCCAGGCCATTGATGAGCTGGTTCGAAAAACCTTCCAAGAGTGGACAT 1900 . : . : . : . : . : 1811 CAAGTCTGGACAAGGATTGCATTCGGCGGTTGGATACCCCATTGCTGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123315 CAAGTCTGGACAAGGATTGCATTCGGCGGTTGGATACCCCATTGCTGCGA 1950 . : . : . : . : . : 1861 ATCAGCCAGGAGAAGGCGGGCATGCTGGATGTCAACTTTGACAAGTACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123365 ATCAGCCAGGAGAAGGCGGGCATGCTGGATGTCAACTTTGACAAGTACAG 2000 . : . : . : . : . : 1911 GAGCCACCTGGCCCCTTTTCCCTATACTCCCCTTCTGCAGCTCTCCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123415 GAGCCACCTGGCCCCTTTTCCCTATACTCCCCTTCTGCAGCTCTCCCAAG 2050 . : . : . : . : . : 1961 AATTTCACTCCCATCTTTTGACTCCTCTCTTCATTATTCTCTCTCTTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123465 AATTTCACTCCCATCTTTTGACTCCTCTCTTCATTATTCTCTCTCTTTCT 2100 . : . : . : . : . : 2011 CATACAATATGTTTGCTATCGTCATTTTACTTTTTTTTTTCTTCTTTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123515 CATACAATATGTTTGCTATCGTCATTTTACTTTTTTTTTTCTTCTTTTAT 2150 . : . : . : . : . : 2061 TTTTGTCTCTCCCCACCTCCCACCCTGCTATCAACATTTTAATTTTACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123565 TTTTGTCTCTCCCCACCTCCCACCCTGCTATCAACATTTTAATTTTACAA 2200 . : . : . : . : . : 2111 CTTATCTTAAAACACAACAAAACAAAACAATGATCGGCCAGGCACGGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123615 CTTATCTTAAAACACAACAAAACAAAACAATGATCGGCCAGGCACGGTGG 2250 . : . : . : . : . : 2161 CTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGGGGTGGGCGCATCGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| 123665 CTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGCATCGCT 2300 . : . : . : . : . : 2211 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCAGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123715 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCAGTCT 2350 . : . : . : . : . : 2261 CTGCAAAAAATACAAAGATTAGCTGGGCGTGGTGGCACAAGCCTGTGGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| 123765 CTGCAAAAAATACAAAGATTAGCTGGGCGTGGTGGCACAAGCCTGTAGTC 2400 . : . : . : . : . : 2311 TCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATCGCCTGAGCCCGGGAGGCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123815 TCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATCGCCTGAGCCCGGGAGGCA 2450 . : 2361 GAGGCTGCAG |||||||||| 123865 GAGGCTGCAG