seq1 = pF1KA1113.tfa, 3381 bp seq2 = pF1KA1113/gi568815597r_114297651.tfa (gi568815597r:114297651_114610930), 313280 bp >pF1KA1113 3381 >gi568815597r:114297651_114610930 (Chr1) (complement) 1-526 (99855-100380) 100% -> 527-645 (146543-146661) 100% -> 646-790 (147375-147519) 100% -> 791-923 (147695-147827) 100% -> 924-1040 (177198-177314) 100% -> 1041-1155 (180019-180133) 99% -> 1156-1302 (183037-183183) 100% -> 1303-1420 (183637-183754) 100% -> 1421-1695 (185208-185482) 100% -> 1696-1860 (186176-186340) 100% -> 1861-2061 (189295-189495) 100% -> 2062-2194 (200615-200747) 100% -> 2195-2258 (202191-202254) 100% -> 2259-2418 (203831-203990) 100% -> 2419-2768 (205172-205521) 99% -> 2769-2892 (208048-208171) 100% -> 2893-2967 (209468-209542) 100% -> 2968-3120 (211322-211474) 100% -> 3121-3171 (212941-212991) 100% -> 3172-3381 (213071-213280) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCGGAAAACAAAGGCGGCGGCGAGGCTGAGAGCGGCGGCGGGGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99855 ATGGCGGAAAACAAAGGCGGCGGCGAGGCTGAGAGCGGCGGCGGGGGCAG 50 . : . : . : . : . : 51 CGGCAGCGCGCCGGTAACTGCCGGGGCCGCCGGGCCCGCCGCGCAGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99905 CGGCAGCGCGCCGGTAACTGCCGGGGCCGCCGGGCCCGCCGCGCAGGAGG 100 . : . : . : . : . : 101 CGGAGCCGCCTCTCACCGCGGTGCTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99955 CGGAGCCGCCTCTCACCGCGGTGCTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGC 150 . : . : . : . : . : 151 GGCAGGGCCGGCGCTGAGGGCGGCGCGGCCGGGCCCGACGACGGGGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100005 GGCAGGGCCGGCGCTGAGGGCGGCGCGGCCGGGCCCGACGACGGGGGGGT 200 . : . : . : . : . : 201 GGCCGCGGCCTCCTCGGGCTCGGCCCAGGCTGCTTCATCTCCTGCGGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100055 GGCCGCGGCCTCCTCGGGCTCGGCCCAGGCTGCTTCATCTCCTGCGGCCT 250 . : . : . : . : . : 251 CAGTGGGCACTGGAGTTGCCGGGGGCGCAGTATCGACGCCGGCTCCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100105 CAGTGGGCACTGGAGTTGCCGGGGGCGCAGTATCGACGCCGGCTCCAGCT 300 . : . : . : . : . : 301 CCAGCCTCGGCTCCCGCTCCGGGTCCCTCGGCAGGGCCGCCTCCTGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100155 CCAGCCTCGGCTCCCGCTCCGGGTCCCTCGGCAGGGCCGCCTCCTGGACC 350 . : . : . : . : . : 351 GCCAGCCTCGCTCCTGGACACCTGCGCCGTGTGTCAGCAGAGCTTGCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100205 GCCAGCCTCGCTCCTGGACACCTGCGCCGTGTGTCAGCAGAGCTTGCAGA 400 . : . : . : . : . : 401 GCCGGCGTGAGGCGGAGCCCAAGCTGCTGCCCTGTCTTCACTCCTTCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100255 GCCGGCGTGAGGCGGAGCCCAAGCTGCTGCCCTGTCTTCACTCCTTCTGC 450 . : . : . : . : . : 451 CTGCGCTGCCTGCCCGAGCCGGAGCGCCAGCTCAGCGTGCCCATCCCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100305 CTGCGCTGCCTGCCCGAGCCGGAGCGCCAGCTCAGCGTGCCCATCCCGGG 500 . : . : . : . : . : 501 GGGCAGCAACGGCGACATCCAGCAAG TTGGTGTAATACGGT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 100355 GGGCAGCAACGGCGACATCCAGCAAGGTG...TAGTTGGTGTAATACGGT 550 . : . : . : . : . : 542 GCCCAGTATGCCGCCAAGAATGCAGACAGATAGACCTTGTGGATAATTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146558 GCCCAGTATGCCGCCAAGAATGCAGACAGATAGACCTTGTGGATAATTAT 600 . : . : . : . : . : 592 TTTGTGAAAGACACATCTGAAGCTCCTAGCAGTTCTGATGAAAAATCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146608 TTTGTGAAAGACACATCTGAAGCTCCTAGCAGTTCTGATGAAAAATCAGA 650 . : . : . : . : . : 642 ACAG GTATGTACTAGTTGTGAAGACAATGCAAGTGCAGTTG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146658 ACAGGTA...TAGGTATGTACTAGTTGTGAAGACAATGCAAGTGCAGTTG 700 . : . : . : . : . : 683 GCTTTTGTGTAGAATGTGGAGAGTGGCTATGTAAGACATGTATCGAAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147412 GCTTTTGTGTAGAATGTGGAGAGTGGCTATGTAAGACATGTATCGAAGCA 750 . : . : . : . : . : 733 CATCAAAGAGTAAAATTTACTAAAGATCACTTGATCAGGAAGAAAGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147462 CATCAAAGAGTAAAATTTACTAAAGATCACTTGATCAGGAAGAAAGAAGA 800 . : . : . : . : . : 783 TGTCTCAG AGTCTGTTGGAGCATCTGGTCAACGCCCTGTTT ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 147512 TGTCTCAGGTA...CAGAGTCTGTTGGAGCATCTGGTCAACGCCCTGTTT 850 . : . : . : . : . : 824 TCTGCCCTGTACACAAACAAGAACAGTTGAAACTTTTCTGTGAAACATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147728 TCTGCCCTGTACACAAACAAGAACAGTTGAAACTTTTCTGTGAAACATGT 900 . : . : . : . : . : 874 GATAGATTGACATGTAGAGACTGTCAGCTATTGGAACACAAAGAACATAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147778 GATAGATTGACATGTAGAGACTGTCAGCTATTGGAACACAAAGAACATAG 950 . : . : . : . : . : 924 GTATCAGTTTTTGGAAGAAGCTTTTCAAAATCAGAAGGGTG >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147828 GTA...AAGGTATCAGTTTTTGGAAGAAGCTTTTCAAAATCAGAAGGGTG 1000 . : . : . : . : . : 965 CAATTGAGAATCTACTGGCGAAACTTCTTGAGAAGAAGAATTATGTTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 177239 CAATTGAGAATCTACTGGCGAAACTTCTTGAGAAGAAGAATTATGTTCAT 1050 . : . : . : . : . : 1015 TTTGCAGCTACTCAGGTGCAGAATAG GATAAAAGAAGTAAA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 177289 TTTGCAGCTACTCAGGTGCAGAATAGGTA...CAGGATAAAAGAAGTAAA 1100 . : . : . : . : . : 1056 TGAGACTAACAAACGAGTAGAACAGGAAATTAAAGTGGCCATTTTCACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 180034 TGAGACTAACAAACGAGTAGAACAGGAAATTAAAGTGGCCATTTTCACCC 1150 . : . : . : . : . : 1106 TTATCAATGAAATTAATAAGAAAGGAAAATCTCTCTTACAGCAGCTAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 180084 TTATCAATGAAATTAATAAGAAAGGAAAATCTCTCTTACAACAGCTAGAG 1200 . : . : . : . : . : 1156 AATGTTACAAAGGAAAGACAGATGAAGTTACTACAGCAGCA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 180134 GTA...CAGAATGTTACAAAGGAAAGACAGATGAAGTTACTACAGCAGCA 1250 . : . : . : . : . : 1197 GAATGACATCACAGGCCTTTCCCGGCAGGTGAAGCATGTTATGAACTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183078 GAATGACATCACAGGCCTTTCCCGGCAGGTGAAGCATGTTATGAACTTCA 1300 . : . : . : . : . : 1247 CAAATTGGGCAATTGCAAGTGGCAGCAGCACAGCACTACTATACAGCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183128 CAAATTGGGCAATTGCAAGTGGCAGCAGCACAGCACTACTATACAGCAAG 1350 . : . : . : . : . : 1297 CGACTG ATTACTTTCCAGTTGCGTCATATTTTGAAAGCACG ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183178 CGACTGGTG...AAGATTACTTTCCAGTTGCGTCATATTTTGAAAGCACG 1400 . : . : . : . : . : 1338 GTGTGATCCTGTCCCTGCTGCTAATGGAGCAATACGTTTCCATTGTGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183672 GTGTGATCCTGTCCCTGCTGCTAATGGAGCAATACGTTTCCATTGTGATC 1450 . : . : . : . : . : 1388 CCACCTTCTGGGCAAAGAATGTAGTCAATTTAG GTAATCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 183722 CCACCTTCTGGGCAAAGAATGTAGTCAATTTAGGTG...CAGGTAATCTA 1500 . : . : . : . : . : 1429 GTAATAGAGAGTAAACCAGCTCCTGGTTATACTCCTAATGTTGTAGTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185216 GTAATAGAGAGTAAACCAGCTCCTGGTTATACTCCTAATGTTGTAGTTGG 1550 . : . : . : . : . : 1479 GCAAGTTCCTCCAGGGACAAACCACATTAGTAAAACCCCTGGACAGATTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185266 GCAAGTTCCTCCAGGGACAAACCACATTAGTAAAACCCCTGGACAGATTA 1600 . : . : . : . : . : 1529 ACTTAGCACAGCTTCGACTCCAGCACATGCAACAACAAGTATATGCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185316 ACTTAGCACAGCTTCGACTCCAGCACATGCAACAACAAGTATATGCACAG 1650 . : . : . : . : . : 1579 AAACATCAGCAGTTGCAACAGATGAGGATGCAGCAACCACCAGCACCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185366 AAACATCAGCAGTTGCAACAGATGAGGATGCAGCAACCACCAGCACCTGT 1700 . : . : . : . : . : 1629 ACCAACTACAACAACAACAACACAACAGCATCCTAGACAAGCAGCCCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185416 ACCAACTACAACAACAACAACACAACAGCATCCTAGACAAGCAGCCCCTC 1750 . : . : . : . : . : 1679 AGATGTTACAACAACAG CCTCCTCGATTGATCAGTGTGCAA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 185466 AGATGTTACAACAACAGGTA...TAGCCTCCTCGATTGATCAGTGTGCAA 1800 . : . : . : . : . : 1720 ACAATGCAAAGAGGCAACATGAACTGTGGAGCTTTTCAAGCCCATCAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 186200 ACAATGCAAAGAGGCAACATGAACTGTGGAGCTTTTCAAGCCCATCAGAT 1850 . : . : . : . : . : 1770 GAGACTGGCTCAGAATGCTGCCAGAATACCAGGGATACCCAGGCACAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 186250 GAGACTGGCTCAGAATGCTGCCAGAATACCAGGGATACCCAGGCACAGCG 1900 . : . : . : . : . : 1820 GCCCTCAATATTCCATGATGCAGCCACACCTCCAAAGACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 186300 GCCCTCAATATTCCATGATGCAGCCACACCTCCAAAGACAAGTA...TAG 1950 . : . : . : . : . : 1861 CACTCAAACCCAGGGCATGCTGGACCCTTTCCCGTAGTATCGGTACACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189295 CACTCAAACCCAGGGCATGCTGGACCCTTTCCCGTAGTATCGGTACACAA 2000 . : . : . : . : . : 1911 CACCACAATCAACCCAACGAGCCCTACTACAGCAACTATGGCAAATGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189345 CACCACAATCAACCCAACGAGCCCTACTACAGCAACTATGGCAAATGCAA 2050 . : . : . : . : . : 1961 ACCGAGGTCCCACCAGCCCATCTGTTACAGCAATAGAGCTAATCCCCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189395 ACCGAGGTCCCACCAGCCCATCTGTTACAGCAATAGAGCTAATCCCCTCA 2100 . : . : . : . : . : 2011 GTTACCAATCCAGAAAACCTTCCATCGCTGCCAGATATTCCACCCATACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189445 GTTACCAATCCAGAAAACCTTCCATCGCTGCCAGATATTCCACCCATACA 2150 . : . : . : . : . : 2061 G TTGGAAGATGCTGGCTCAAGTAGTTTAGATAATCTACTAA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189495 GGTT...CAGTTGGAAGATGCTGGCTCAAGTAGTTTAGATAATCTACTAA 2200 . : . : . : . : . : 2102 GTAGATACATCTCAGGCAGTCACCTACCCCCACAGCCTACAAGCACCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 200655 GTAGATACATCTCAGGCAGTCACCTACCCCCACAGCCTACAAGCACCATG 2250 . : . : . : . : . : 2152 AATCCTTCTCCAGGTCCCTCTGCCCTTTCTCCGGGATCATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 200705 AATCCTTCTCCAGGTCCCTCTGCCCTTTCTCCGGGATCATCAGGTA...T 2300 . : . : . : . : . : 2195 GTTTATCCAATTCTCACACACCTGTGAGACCCCCAAGTACTTCTAGTA >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 202189 AGGTTTATCCAATTCTCACACACCTGTGAGACCCCCAAGTACTTCTAGTA 2350 . : . : . : . : . : 2243 CTGGCAGTCGAGGCAG CTGTGGGTCATCAGGAAGAACTGCT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 202239 CTGGCAGTCGAGGCAGGTG...TAGCTGTGGGTCATCAGGAAGAACTGCT 2400 . : . : . : . : . : 2284 GAGAAGACAAGTCTTAGTTTCAAATCTGATCAGGTGAAGGTCAAGCAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203856 GAGAAGACAAGTCTTAGTTTCAAATCTGATCAGGTGAAGGTCAAGCAAGA 2450 . : . : . : . : . : 2334 ACCTGGGACTGAAGATGAAATATGTAGCTTTTCAGGAGGTGTAAAACAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203906 ACCTGGGACTGAAGATGAAATATGTAGCTTTTCAGGAGGTGTAAAACAAG 2500 . : . : . : . : . : 2384 AAAAAACAGAGGATGGCAGGAGGAGTGCTTGCATG TTGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 203956 AAAAAACAGAGGATGGCAGGAGGAGTGCTTGCATGGTA...TAGTTGAGC 2550 . : . : . : . : . : 2425 AGTCCTGAGAGTAGCTTGACACCACCTCTCTCAACCAACCTGCATCTAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205178 AGTCCTGAGAGTAGCTTGACACCACCTCTCTCAACCAACCTGCATCTAGA 2600 . : . : . : . : . : 2475 AAGTGAATTGGATGCATTGGCAAGCCTGGAAAACCATGTGAAAACTGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 205228 AAGTGAATTGGATGCATTGGCAAGCCTGGAAAACCATGTGAAAATTGAAC 2650 . : . : . : . : . : 2525 CTGCAGATATGAATGAAAGCTGCAAACAGTCAGGGCTCAGCAGCCTTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205278 CTGCAGATATGAATGAAAGCTGCAAACAGTCAGGGCTCAGCAGCCTTGTT 2700 . : . : . : . : . : 2575 AATGGAAAGTCCCCAATTCGAAGCCTCATGCACAGGTCGGCAAGGATTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205328 AATGGAAAGTCCCCAATTCGAAGCCTCATGCACAGGTCGGCAAGGATTGG 2750 . : . : . : . : . : 2625 AGGAGATGGCAACAATAAAGATGATGACCCAAATGAAGACTGGTGTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205378 AGGAGATGGCAACAATAAAGATGATGACCCAAATGAAGACTGGTGTGCTG 2800 . : . : . : . : . : 2675 TCTGCCAAAACGGAGGAGATCTCTTGTGCTGCGAAAAATGTCCAAAGGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 205428 TCTGCCAAAACGGAGGAGATCTCTTGTGCTGCGAAAAATGTCCAAAGGTC 2850 . : . : . : . : . : 2725 TTTCATCTAACTTGTCATGTTCCAACACTACTTAGCTTTCCAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 205478 TTTCATCTAACTTGTCATGTTCCAACACTACTTAGCTTTCCAAGGTA... 2900 . : . : . : . : . : 2769 TGGGGACTGGATATGCACATTTTGTAGAGATATTGGAAAGCCAGAAG >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 208045 TAGTGGGGACTGGATATGCACATTTTGTAGAGATATTGGAAAGCCAGAAG 2950 . : . : . : . : . : 2816 TTGAATATGATTGTGATAATTTGCAACATAGTAAGAAGGGGAAAACTGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 208095 TTGAATATGATTGTGATAATTTGCAACATAGTAAGAAGGGGAAAACTGCG 3000 . : . : . : . : . : 2866 CAGGGGTTAAGCCCCGTGGACCAAAGG AAATGTGAACGTCT |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 208145 CAGGGGTTAAGCCCCGTGGACCAAAGGGTA...CAGAAATGTGAACGTCT 3050 . : . : . : . : . : 2907 TCTGCTTTACCTCTATTGCCATGAATTAAGTATTGAATTCCAGGAGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209482 TCTGCTTTACCTCTATTGCCATGAATTAAGTATTGAATTCCAGGAGCCTG 3100 . : . : . : . : . : 2957 TTCCTGCTTCG ATACCAAACTACTATAAAATTATAAAGAAA |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 209532 TTCCTGCTTCGGTG...TAGATACCAAACTACTATAAAATTATAAAGAAA 3150 . : . : . : . : . : 2998 CCAATGGATTTATCCACCGTGAAAAAGAAGCTTCAGAAAAAACATTCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211352 CCAATGGATTTATCCACCGTGAAAAAGAAGCTTCAGAAAAAACATTCCCA 3200 . : . : . : . : . : 3048 ACACTACCAAATCCCGGATGACTTTGTGGCCGATGTCCGTTTGATCTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211402 ACACTACCAAATCCCGGATGACTTTGTGGCCGATGTCCGTTTGATCTTCA 3250 . : . : . : . : . : 3098 AGAACTGTGAAAGGTTTAATGAA ATGATGAAAGTTGTTCAA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 211452 AGAACTGTGAAAGGTTTAATGAAGTA...TAGATGATGAAAGTTGTTCAA 3300 . : . : . : . : . : 3139 GTTTATGCAGACACACAAGAGATTAATTTGAAG GCTGATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 212959 GTTTATGCAGACACACAAGAGATTAATTTGAAGGTA...CAGGCTGATTC 3350 . : . : . : . : . : 3180 AGAAGTAGCTCAGGCAGGGAAAGCAGTTGCATTGTACTTTGAAGATAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213079 AGAAGTAGCTCAGGCAGGGAAAGCAGTTGCATTGTACTTTGAAGATAAAC 3400 . : . : . : . : . : 3230 TCACAGAGATCTACTCAGACAGGACCTTCGCACCTTTGCCAGAGTTTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213129 TCACAGAGATCTACTCAGACAGGACCTTCGCACCTTTGCCAGAGTTTGAG 3450 . : . : . : . : . : 3280 CAGGAAGAGGATGATGGTGAGGTAACTGAGGACTCTGATGAAGACTTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213179 CAGGAAGAGGATGATGGTGAGGTAACTGAGGACTCTGATGAAGACTTTAT 3500 . : . : . : . : . : 3330 ACAGCCCCGCAGAAAACGCCTAAAGTCAGATGAGAGACCAGTACATATAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213229 ACAGCCCCGCAGAAAACGCCTAAAGTCAGATGAGAGACCAGTACATATAA 3550 3380 AG || 213279 AG