seq1 = pF1KA0671.tfa, 1608 bp
seq2 = pF1KA0671/gi568815596f_46658531.tfa (gi568815596f:46658531_46860138), 201608 bp

>pF1KA0671 1608
>gi568815596f:46658531_46860138 (Chr2)

1-1608  (100001-101608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAAAGTGGGAAAAATGTGGAATAACTTCAAATACAGGTGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAAAGTGGGAAAAATGTGGAATAACTTCAAATACAGGTGTCAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCTTCGGTCATGAGGGAGGAAGCCGTAGTGAAAATGTGGACATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCTTCGGTCATGAGGGAGGAAGCCGTAGTGAAAATGTGGACATGAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAACAGATGTTTGTCTGTCAAAGAGAAAAACATCAGCATAGGAGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAACAGATGTTTGTCTGTCAAAGAGAAAAACATCAGCATAGGAGACTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTCCTCAGCAACAAAGCAGTCCCTTAAGAGAAAATATTGCCTTACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTCCTCAGCAACAAAGCAGTCCCTTAAGAGAAAATATTGCCTTACAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGATTAAGCCCTTCGAAGAATTCTTCAAGGAGAAATCAAAATTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGATTAAGCCCTTCGAAGAATTCTTCAAGGAGAAATCAAAATTGTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGAAATCCCTCAAATTGTTGAAATAAGCATCGAAAAGGATAATGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGAAATCCCTCAAATTGTTGAAATAAGCATCGAAAAGGATAATGATTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTGTTACCCCAGGAACAAGACTTGCACGAAGAGATTCCTACTCTCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGTGTTACCCCAGGAACAAGACTTGCACGAAGAGATTCCTACTCTCGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCTCCATGGGGTGGGAAGAAAAAACATTCCTGTTCTACAAAGACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCTCCATGGGGTGGGAAGAAAAAACATTCCTGTTCTACAAAGACCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTTCATTGGATGCTGATAAAAAGTTTGGTAGAACTCGAAGTGGACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTTCATTGGATGCTGATAAAAAGTTTGGTAGAACTCGAAGTGGACTTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGAGAGAGAGGCGCTACGGCGTAAGTTCTGTACACGACATGGACAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGAGAGAGAGGCGCTACGGCGTAAGTTCTGTACACGACATGGACAGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCCAGCAGAACTGTAGGAAGTCGCTCTCTAAGACAGAGGTTGCAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCCAGCAGAACTGTAGGAAGTCGCTCTCTAAGACAGAGGTTGCAGGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGTGGGCTTGTGTTTTCCCATGAGAACTTACAGCAAGCAGTCAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGTGGGCTTGTGTTTTCCCATGAGAACTTACAGCAAGCAGTCAAAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTTTTCCAATAAAAGAAAAATCCATCTCTCTGAATTAATGCTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCTTTTCCAATAAAAGAAAAATCCATCTCTCTGAATTAATGCTTGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATGCCCTTTTCCTGCTGGCTCAGATTTAGCCCAAAAATGGCATTTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATGCCCTTTTCCTGCTGGCTCAGATTTAGCCCAAAAATGGCATTTGATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACAGCATACAGCTCCTGTGAGCCCACATTCAACATTTTTTGATACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACAGCATACAGCTCCTGTGAGCCCACATTCAACATTTTTTGATACATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATCCATCTTTGGTTTCTACAGAAGATGAAGAAGATAGGCTTAGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATCCATCTTTGGTTTCTACAGAAGATGAAGAAGATAGGCTTAGAGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAGGCGGCTTAGTATTGAAGAAGGGGTTGATCCCCCTCCCAATGCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAGGCGGCTTAGTATTGAAGAAGGGGTTGATCCCCCTCCCAATGCACAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TACATACATTTGAAGCTACTGCACAGGTTAATCCATTATATAAACTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TACATACATTTGAAGCTACTGCACAGGTTAATCCATTATATAAACTGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCAAAATTAGCTCCTGGAATGACTGAAATAAGTGGGGACAGTTCTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCAAAATTAGCTCCTGGAATGACTGAAATAAGTGGGGACAGTTCTGCAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCCACAAGCTAATTGTGACTCGGAAGAGGATACAACCACCCTGTGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCCACAAGCTAATTGTGACTCGGAAGAGGATACAACCACCCTGTGTTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTCACGGAGGCAGAAGCAGCGTCAGATATCTGGAGACAGCCATACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTCACGGAGGCAGAAGCAGCGTCAGATATCTGGAGACAGCCATACCCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTTAGCAGACAGGGAGCTTGGAAAGTCCACACACAGATTGATTACATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTTAGCAGACAGGGAGCTTGGAAAGTCCACACACAGATTGATTACATACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTGCCTCGTGCCTGATTTGCTTCAAATTACAGGGAATCCCTGTTACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTGCCTCGTGCCTGATTTGCTTCAAATTACAGGGAATCCCTGTTACTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GAGTGATGGACCGTTATGAAGCAGAAGCCCTTCTCGAAGGGAAACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GAGTGATGGACCGTTATGAAGCAGAAGCCCTTCTCGAAGGGAAACCTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGCACGTTTTTGCTCAGGGACTCTGCGCAAGAGGACTACCTCTTCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGCACGTTTTTGCTCAGGGACTCTGCGCAAGAGGACTACCTCTTCTCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAGCTTCCGCCGCTACAACAGATCCCTGCATGCCCGAATTGAGCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAGCTTCCGCCGCTACAACAGATCCCTGCATGCCCGAATTGAGCAGTGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATCACAACTTTAGTTTCGACGCCCATGACCCGTGTGTATTTCACTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATCACAACTTTAGTTTCGACGCCCATGACCCGTGTGTATTTCACTCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ACTGTAACGGGACTTTTAGAACATTATAAAGATCCCAGTTCGTGCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ACTGTAACGGGACTTTTAGAACATTATAAAGATCCCAGTTCGTGCATGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTTTGAACCATTGCTTACTATATCACTAAATAGGACTTTCCCTTTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TTTTGAACCATTGCTTACTATATCACTAAATAGGACTTTCCCTTTTAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGCAGTATATCTGTCGCGCGGTAATCTGCAGGTGCACTACGTATGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGCAGTATATCTGTCGCGCGGTAATCTGCAGGTGCACTACGTATGATGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATTGATGGGCTCCCTCTACCCTCAATGTTACAGGATTTTTTAAAAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATTGATGGGCTCCCTCTACCCTCAATGTTACAGGATTTTTTAAAAGAGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCATTATAAACAAAAAGTTAGAGTTCGCTGGTTGGAACGAGAACCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCATTATAAACAAAAAGTTAGAGTTCGCTGGTTGGAACGAGAACCAGTCA

   1600     .
   1601 AGGCAAAG
        ||||||||
 101601 AGGCAAAG