Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0520
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0520, 1353 aa
1>>>pF1KA0520 1353 - 1353 aa - 1353 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1933+/-0.000994; mu= 24.2994+/- 0.060
mean_var=82.8733+/-16.776, 0's: 0 Z-trim(106.4): 34 B-trim: 146 in 1/48
Lambda= 0.140886
statistics sampled from 8947 (8979) to 8947 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 4.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32382.1 ADCY9 gene_id:115|Hs108|chr16 (1353) 9030 1846.3 0
CCDS8767.1 ADCY6 gene_id:112|Hs108|chr12 (1168) 682 149.5 5.1e-35
CCDS6363.1 ADCY8 gene_id:114|Hs108|chr8 (1251) 670 147.1 2.9e-34
CCDS75593.1 ADCY1 gene_id:107|Hs108|chr7 ( 338) 661 144.8 3.9e-34
CCDS3022.1 ADCY5 gene_id:111|Hs108|chr3 (1261) 666 146.3 5.1e-34
CCDS56274.1 ADCY5 gene_id:111|Hs108|chr3 ( 911) 662 145.3 7.1e-34
CCDS34631.1 ADCY1 gene_id:107|Hs108|chr7 (1119) 662 145.4 8.2e-34
CCDS1715.1 ADCY3 gene_id:109|Hs108|chr2 (1144) 639 140.8 2.1e-32
CCDS82424.1 ADCY3 gene_id:109|Hs108|chr2 (1145) 639 140.8 2.1e-32
CCDS73882.1 ADCY7 gene_id:113|Hs108|chr16 ( 734) 624 137.5 1.3e-31
CCDS10741.1 ADCY7 gene_id:113|Hs108|chr16 (1080) 624 137.7 1.7e-31
CCDS9627.1 ADCY4 gene_id:196883|Hs108|chr14 (1077) 591 131.0 1.8e-29
CCDS3872.2 ADCY2 gene_id:108|Hs108|chr5 (1091) 580 128.7 8.4e-29
CCDS77978.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 551) 348 81.3 8e-15
CCDS75203.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 594) 348 81.4 8.4e-15
CCDS77977.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 599) 348 81.4 8.5e-15
CCDS47154.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 619) 348 81.4 8.7e-15
CCDS77975.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 641) 348 81.4 8.9e-15
CCDS34085.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 690) 341 80.0 2.5e-14
CCDS54812.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 624) 330 77.7 1.1e-13
CCDS8335.1 GUCY1A2 gene_id:2977|Hs108|chr11 ( 732) 328 77.4 1.6e-13
CCDS77976.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 586) 305 72.6 3.6e-12
CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs108|chrX (1108) 308 73.5 3.7e-12
CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs108|chr9 (1047) 299 71.6 1.3e-11
CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs108|chr17 (1103) 291 70.0 4.1e-11
>>CCDS32382.1 ADCY9 gene_id:115|Hs108|chr16 (1353 aa)
initn: 9030 init1: 9030 opt: 9030 Z-score: 9911.5 bits: 1846.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9030; 99.9% identity (100.0% similar) in 1353 aa overlap (1-1353:1-1353)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASPPHQQLLHHHSTEVSCDSSGDSNSVRVKINPKQLSSNSHPKHCKYSISSSCSSSGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MASPPHQQLLHHHSTEVSCDSSGDSNSVRVKINPKQLSSNSHPKHCKYSISSSCSSSGDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GGVPRRVGGGGRLRRQKKLPQLFERASSRWWDPKFDSVNLEEACLERCFPQTQRRFRYAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGVPRRVGGGGRLRRQKKLPQLFERASSRWWDPKFDSVNLEEACLERCFPQTQRRFRYAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FYIGFACLLWSIYFAVHMRSRLIVMVAPALCFLLVCVGFFLFTFTKLYARHYAWTSLALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FYIGFACLLWSIYFAVHMRSRLIVMVAPALCFLLVCVGFFLFTFTKLYARHYAWTSLALT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LLVFALTLAAQFQVLTPVSGRGDSSNLTATARPTDTCLSQVGSFSMCIEVLFLLYTVMHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLVFALTLAAQFQVLTPVSGRGDSSNLTATARPTDTCLSQVGSFSMCIEVLFLLYTVMHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PLYLSLCLGVAYSVLFETFGYHFRDEACFPSPGAGALHWELLSRGLLHGCIHAIGVHLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLYLSLCLGVAYSVLFETFGYHFRDEACFPSPGAGALHWELLSRGLLHGCIHAIGVHLFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 MSQVRSRSTFLKVGQSIMHGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSQVRSRSTFLKVGQSIMHGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HATSSPKNRKKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HATSSPKNRKKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DLFGRFDRLCEETKCEKISTLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLFGRFDRLCEETKCEKISTLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KEMVNMRVGVHTGTVLCGILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEMVNMRVGVHTGTVLCGILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DRYEMEDGKVIERLGQSVVADQLKGLKTYLISGQRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYEMEDGKVIERLGQSVVADQLKGLKTYLISGQRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SGPRGQGTASSGNVSDLAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGPRGQGTASSGNVSDLAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 STKASGGPNPKTQNGLLSPPQEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLRFKNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STKASGGPNPKTQNGLLSPPQEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLRFKNI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 REKTDAHFVDVIKEDSLMKDYFFKPPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEEVIKNSPVKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 REKTDAHFVDVIKEDSLMKDYFFKPPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEEVIKNSPVKTF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ASPTFSSLLDVFLSTTVFLTLSTTCFLKYEAATVPPPPAALAVFSAALLLEVLSLAVSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASPTFSSLLDVFLSTTVFLTLSTTCFLKYEAATVPPPPAALAVFSAALLLEVLSLAVSIR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 MVFFLEDVMACTKRLLEWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTSEYETNIHFPVFTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVFFLEDVMACTKRLLEWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTSEYETNIHFPVFTGS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 AALIAVVHYCNFCQLSSWMRSSLATVVGAGPLLLLYVSLCPDSSVLTSPLDAVQNFSSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AALIAVVHYCNFCQLSSWMRSSLATVVGAGPLLLLYVSLCPDSSVLTSPLDAVQNFSSER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 NPCNSSVPRDLRRPASLIGQEVVLVFFLLLLLVWFLNREFEVSYRLHYHGDVEADLHRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPCNSSVPRDLRRPASLIGQEVVLVFFLLLLLVWFLNREFEVSYRLHYHGDVEADLHRTK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 IQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQLKVSQTYSKNHDSGGVIFASIVNFSEFYEENYEGGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQLKVSQTYSKNHDSGGVIFASIVNFSEFYEENYEGGKE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 CYRVLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAASGLNTAQAQDGSHPQEHLQILFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CYRVLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAASGLNTAQAQDGSHPQEHLQILFE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 FAKEMMRVVDDFNSNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTKLLYDIWGDTVNIASRMDTT
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FAKEMMRVVDDFNNNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTKLLYDIWGDTVNIASRMDTT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 GVECRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVECRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSISP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 DIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYVDKTSLGSDSSTQAKDAHLSPKRPWKEPVKAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYVDKTSLGSDSSTQAKDAHLSPKRPWKEPVKAEE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350
pF1KA0 RGRFGKAIEKDDCDETGIEEANELTKLNVSKSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGRFGKAIEKDDCDETGIEEANELTKLNVSKSV
1330 1340 1350
>>CCDS8767.1 ADCY6 gene_id:112|Hs108|chr12 (1168 aa)
initn: 1217 init1: 667 opt: 682 Z-score: 742.2 bits: 149.5 E(32554): 5.1e-35
Smith-Waterman score: 1313; 29.2% identity (55.5% similar) in 1224 aa overlap (53-1241:97-1161)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 GDSNSVRVKINPKQLSSNSHPKHCKYSISSSCSSSGDSGGVPRRVGGGGRLRRQKKLPQL
. ...: . .: : .:: ..: :.
CCDS87 DDAFIRRGGPGKGKELGLRAVALGFEDTEVTTTAGGTAEVAPDAVPRSGR-SCWRRLVQV
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 FERASSRWWDPKFDSVNLEEACLERCFPQTQRRFRYALFYIGFACLLWSIYFAVHMRSRL
:. . .: :..::. . : ..: . . .. :: .. .: :
CCDS87 FQ-------SKQFRSAKLERLYQRYFFQMNQSSLT---LLMAVLVLLTAVLLAFHAAP--
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 IVMVAPALCFLLVCVGFFLFTFTKLYARH-YAWTSL-ALTLLVFALTLAAQFQVLTPVSG
. :: ::.:.. .. . . :: . :. ... .:... :.: :.:
CCDS87 -ARPQPAYVALLACAAALFVGLMVVCNRHSFRQDSMWVVSYVVLGILAAVQ------VGG
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KA0 RGDSSNLTATARPTDTCLSQVGSFSMC-IEVLFLLYTVMHLPLYLSLCLGVAYSVLFETF
:.: : .. : : . ... ::.. . . .. :.. :.: .
CCDS87 -----ALAADPRSPSAGL-------WCPVFFVYIAYTLLPIRMRAAVLSGLGLSTLHLIL
230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 GYHFRDEACFPSPGAGALHWELLSRG-LLHGCIHAIGVHLFVMSQVRSRSTFLKVGQSIM
.... . :. :. :. . :: : ..::. ..: .:..: .. :.
CCDS87 AWQLNR--------GDAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPAEVSQRQAFQETRGYIQ
280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 HGKDLEVEKALKERMIHSVMPRIIADDLMKQGDEESENSVKRHATSSPKNRKKKSSIQKA
:. :. .::.. ::.:. .: .. :. . .:
CCDS87 ARLHLQHENRQQERLLLSVLPQHVAMEM-----------------------KEDINTKKE
330 340 350 360
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 PIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLNDLFGRFDRLCEETKCEKI
. :. . .:. ..:::::::: :::..... .:. :: ::.::.:::.: :..: .:
CCDS87 DMMFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLRI
370 380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 STLGDCYYCVAGCPEPRADHAYCCIEMGLGMIKAIEQFCQEKKEMVNMRVGVHTGTVLCG
. ::::::::.: :: :::::.::.:::. ::.:: . ::::::.:.: : ::
CCDS87 KILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGVDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVHCG
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 ILGMRRFKFDVWSNDVNLANLMEQLGVAGKVHISEATAKYLDDRYEMEDGKVIERLGQSV
.::.:...::::::::.::: :: : ::..::..:: .::. ::.: :. :: ..
CCDS87 VLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGRAGRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGER--NAY
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 VADQLKGLKTYLISG--QRAKESRCSCAEALLSGFEVIDGSQVSSGPRGQGTASSGNVSD
. .: ..:.:: : :. :: . :. . . ..: . :: : :
CCDS87 LKEQ--HIETFLILGASQKRKEEKAMLAKLQRTRANSMEGLM----PRW--------VPD
550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 LAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQNGCQDEHKNSTKASGGPNPKTQNGL
..:. : . : : : .: :. : ::..:
CCDS87 -----RAFSRTKDSKA----FR------------QMGIDDSSKD--------NRGTQDAL
590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 LSPPQEEKLTNSQTSLCEILQEKGRWAGVSLDQSALLPLRFKNIREKTDAHFVDVIKEDS
:..: . :.:.. ..: .. :: ..:. :. ......
CCDS87 --NPEDE--------VDEFLSR-------AIDARSIDQLRKDHVRR-----FLLTFQRED
620 630 640 650
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 LMKDYFFK-PPINQFSLNFLDQELERSYRTSYQEEVIKNSPVKTFASPTFSSLLDVFLST
: : : : : .:. : . : .. : .:. ..:.. ..:
CCDS87 LEKKYSRKVDP--RFGAYVACALLVFCFICFIQLLIF---PHSTLMLGIYASIF-LLLLI
660 670 680 690 700 710
800 810 820 830 840
pF1KA0 TVFLTLSTTCFLKYEAATVPPPPAALAVFSAALLL-EVLSLAV---SIRMVFF--LEDVM
::.. .: . : :: .: ... .. : :: :. .:: . ...
CCDS87 TVLICAVYSCGSLF--------PKALQRLSRSIVRSRAHSTAVGIFSVLLVFTSAIANMF
720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 ACTKRLLEWIAGWLPRHCIGAILVSLPALAVYSHVTS-EYETNIHFPVFTGSAALIAVVH
.:.. . : : . .: :: . :. . .: .. :. :. . .
CCDS87 TCNHTPI--------RSCAARMLNLTPADITACHLQQLNYSLGLDAPLCEGTMPTCSFPE
770 780 790 800 810
910 920 930 940 950
pF1KA0 YCNFCQLSSWMRSS----------LATVVGAGPLLLLYVSLCPDSSVLTSP--LDAVQNF
: .: : . :: :: . : . :. . : : .... . : .:...
CCDS87 YFIGNMLLSLLASSVFLHISSIGKLAMIFVLGLIYLVLLLLGPPATIFDNYDLLLGVHGL
820 830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 SSERNPCNS-SVPRDLRRPASLIGQEVVLVFFLLLLLVWFLNREFEVSYRLHYHGDVEAD
.: . .. . : : . . ..::: : : : .. : . :: . ..:
CCDS87 ASSNETFDGLDCPAAGRVALKYMTPVILLVFALALYL---HAQQVESTARLDFLWKLQAT
880 890 900 910 920 930
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LHRTKIQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQL-----KVSQTYSKNHDSGGVIFASIVNFSEF
.. ... .. ::.::.: :: .. . .. : .. . .:.::::.:::::
CCDS87 GEKEEMEELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSEF
940 950 960 970 980 990
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 Y---EENYEGGKECYRVLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAASGLNTAQAQD
: : : :: :: :.:::.:.::::..:. . ..:::::::.::::::::: :.. :
CCDS87 YVELEANNEG-VECLRLLNEIIADFDEIISEERFRQLEKIKTIGSTYMAASGLN-ASTYD
1000 1010 1020 1030 1040
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 GSHPQEHLQILFEFAKEMMRVVDDFNSNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTKLLYDIW
. :. : ..: ..:. . .: . . ::....:.: ::..:::::. : ::::
CCDS87 QVG-RSHITALADYAMRLMEQMKHINEHSFN-NFQMKIGLNMGPVVAGVIGARKPQYDIW
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 GDTVNIASRMDTTGVECRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYLYPKCTD
:.:::..::::.::: ::::. . :.::. ::... ::.:.:::::.: ::.
CCDS87 GNTVNVSSRMDSTGVPDRIQVTTDLYQVLAAKGYQLECRGVVKVKGKGEMTTYFLNGGPS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 HRVIPQHQLSISPDIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYVDKTSLGSDSSTQAKDAHLS
CCDS87 S
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270 280 290 300 310 320
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.. .: .. ... .......: :... :. . .:. .:..::.. . .
CCDS63 -----QVVIPRLAVISIN-QVVAQAVLFMCMNTAGIFISYLSDRAQRQAFLETRRCVEAR
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330 340 350 360 370 380
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. ....:::: .. ..: : : ... : :: :..: : . :. :
CCDS63 -RKHNIETYLI--KQPEDSLLSLPE------DIVKESVSSSDRRNSGATFTEGSWSPELP
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. . . :.. :: .: : .:. . :.: .
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:...... : : . : :. : : .. . .. :::: :... :
CCDS63 LINFLGAILNILWCDFDKSIPLKNLTFNSSAVFTDICSYPEYFVFTGVLAMVT----CAV
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: .:.: .. :: .::..... ..:: . : .. . . : : .:.
CCDS63 FLRLNSVLK--LA-------VLLIMIAI---YALLTETVYA--GLFLRYDNLNHS-GEDF
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: .:: :... ..:: :.. ....: . :: . :.: . .... .:.. .
CCDS63 -----LGTKEVSLLLMAMFLLAVFYHGQQLEYTARLDFLWRVQAKEEINEMKELREHNEN
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pF1KA0 LLRNIIPYHVAEQL-----KVSQTYSKNHDSGGVIFASIVNFSEFYE--ENYEGGKECYR
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CCDS63 MLRNILPSHVARHFLEKDRDNEELYSQSYDAVGVMFASIPGFADFYSQTEMNNQGVECLR
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pF1KA0 VLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGATYMAASGLNTAQAQDGSHPQEHLQILFEFAK
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CCDS63 LLNEIIADFDELLGEDRFQDIEKIKTIGSTYMAVSGL-SPEKQQCEDKWGHLCALADFSL
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pF1KA0 EMMRVVDDFNSNMLWFNFKLRVGFNHGPLTAGVIGTTKLLYDIWGDTVNIASRMDTTGVE
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CCDS63 ALTESIQEINKHSFN-NFELRIGISHGSVVAGVIGAKKPQYDIWGKTVNLASRMDSTGVS
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pF1KA0 CRIQVSEESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKG----KGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSIS
:::: ::.: .:. .:. ::::: . ::: .:..:::.
CCDS63 GRIQVPEETYLILKDQGFAFDYRGEIYVKGISEQEGKIKTYFLLGRVQPNPFILPPRRLP
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CCDS63 GQYSLAAVVLGLVQSLNRQRQKQLLNENNNTGIIKGHYNRRTLLSPSGTEPGAQAEGTDK
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CCDS75 DENEKQERLLMSLLPRNVAME-MK------EDFLK------PPER-----------IFHK
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CCDS75 YYCVSGLTQPKTDHAHCCVEMGLDMIDTITSVAEATEVDLNMRVGLHTGRVLCGVLGLRK
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CCDS75 WQYDVWSNDVTLANVMEAAGLPGKVHITKTTLACLNGDYEVEPGYGHERNSFLKTHNIET
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CCDS75 FFIVPSHRRKIFPGLILSDIKPAKRMKFKTVCYLLVQLMHCRKMFKAEIPFSNVMTCEDD
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CCDS30 ALLQIFRSK----KFPSDKLERLYQRYFFRLNQSSLTMLMAVLVLVCLVMLAFHAARPPL
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CCDS30 QL-----PYLAVLAAAVGVILIMAVLCNRAAFHQDHMGLACYALI-AVVLAVQVVGLLLP
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. :. : .. : . .. .::.. . . .. :: :.: .
CCDS30 QPRSASEGIWWT-----------------VFFIYTIYTLLPVRMRAAVLSGVLLSALHLA
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.. . . : : .:.: :. .: . .:: ..: .:..: .. . :.
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. :. .::.. ::.:: .: .. . . ..:.
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. .. ...:.:: :. :: . :... .. .... .: :.
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CCDS30 LEANNEG-VECLRLLNEIIADFDEIISEDRFRQLEKIKTIGSTYMAASGLNDSTYDKVG-
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CCDS30 -KTHIKALADFAMKLMDQMKYINEHSFN-NFQMKIGLNIGPVVAGVIGARKPQYDIWGNT
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CCDS30 VNVASRMDSTGVPDRIQVTTDMYQVLAANTYQLECRGVVKVKGKGEMMTYFLNGGPPLS
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pF1KA0 IPQHQLSISPDIRVQVDGSIGRSPTDEIANLVPSVQYVDKTSLGSDSSTQAKDAHLSPKR
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pF1KA0 ATSSPKNRKKKSSIQKAPIAFRPFKMQQIEEVSILFADIVGFTKMSANKSAHALVGLLND
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CCDS56 LFARFDKLAAENHCLRIKILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGMDMIEAISLVREVTG
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210 220 230 240 250 260
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CCDS56 DYEVEPGCGGER--NAYLKEH--SIETFLILRCTQKRKEEK-----AMIAKMNRQRTNSI
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CCDS56 GHNPPHWGAE------------RPFYN------------------HLGG---NQVSKEMK
320 330 340
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: .:: .:. : :. :. . :: ..: .. :: ..
CCDS56 RM----GFEDPKDKNAQESANPED----------EVDEFLGR----AIDARSIDRLRSEH
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.:. :. ...: .: : : : ..:. : . : .. : .
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: .:. .:. ...::: . . : . . : : : ..: .. .. ..
CCDS56 F-------MLSFYLTCSLLLTLVVFVSVIYSCVKLFPSP--LQTLSRKIVRSKMNSTLVG
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.: .::. . ....:..: : .. .: :.: :. . :: . .:
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pF1KA0 -----TNIHFPVFTGSAALIAVVHYCNFCQLSSWMRSSLATVVGAGPLLLLYV---SLCP
: .:: . ..:.... : :.: . : .. .:.. : .:
CCDS56 CGSPWPNCNFPEYFTYSVLLSLLACSVFLQISCIGKLVLMLAIELIYVLIVEVPGVTLFD
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....:.. .:.. :.. . : :. . : . ... :.: : .. .. :
CCDS56 NADLLVTA-NAIDFFNNGTSQC----PEHATKVALKVVTPIIISVFVLAL--YLHAQQVE
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pF1KA0 VSYRLHYHGDVEADLHRTKIQSMRDQADWLLRNIIPYHVAEQL-----KVSQTYSKNHDS
. :: . ..: .. ... .. ::.::.: :: .. . .. : .. .
CCDS56 STARLDFLWKLQATEEKEEMEELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCEC
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pF1KA0 GGVIFASIVNFSEFY---EENYEGGKECYRVLNELIGDFDELLSKPDYSSIEKIKTIGAT
.:.::::.:::::: : : :: :: :.:::.:.::::..:. . ..:::::::.:
CCDS56 VAVMFASIANFSEFYVELEANNEG-VECLRLLNEIIADFDEIISEDRFRQLEKIKTIGST
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pF1KA0 YMAASGLNTAQAQDGSHPQEHLQILFEFAKEMMRVVDDFNSNMLWFNFKLRVGFNHGPLT
:::::::: . . . . :.. : .:: ..: . .: . . ::....:.: ::..
CCDS56 YMAASGLNDSTYDKVG--KTHIKALADFAMKLMDQMKYINEHSFN-NFQMKIGLNIGPVV
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:::::. : :::::.:::.:::::.::: ::::. . :.::. :... ::.:.:::
CCDS56 AGVIGARKPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVPDRIQVTTDMYQVLAANTYQLECRGVVKVKG
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::.: ::.
CCDS56 KGEMMTYFLNGGPPLS
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. . . : :: :: : :.. : ..: : :. .. ..:. .::
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. :. : . :. :. : . .:: .. :: . .... .:..::.. . :
CCDS34 ASHLLVTATL-VPAKRPRLWRTLGANALLFVGVNMYGVFVRILTERSQRKAFLQARSCIE
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CCDS34 KILGDCYYCVSGLTQPKTDHAHCCVEMGLDMIDTITSVAEATEVDLNMRVGLHTGRVLCG
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. . ....:..: .. .. .. :. . : .. . : . . . .:
CCDS34 L--KTHNIETFFIVPSHRRK--------IFPGLILSD---IKPAKRMKFKTVCYLLVQLM
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. : : . : :.. . :.:. : . ...
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::: : :. : . : . :. : :: : .:. ...:
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.: :.:.. : :..:. . :.: . .. : :. .. .: : .: ..
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.: : : . :. : .. . . : . : ... .. . .:.. ...:.
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: : .: . :: .:. .. :. .:.. .. :. .: :
CCDS34 LPW--AWSSKPN-----SSLVVLSSGGQRTA-------LPTLPCEST-----HHALLCCL
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::. :: ... :: : . .: : : . . : :. :
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.: . : .....:. . . :. .. :: : ..:. .: ..... . .: :
CCDS34 VSGRSYEPIVAILLFSCALALHARQVDIRLRLDYLWAAQAEEEREDMEKVKLDNRRILFN
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..: :::... .:. : ..... ::.:::: ::..:: : .: : :: :.::
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:.:.:::::. : :..::::::::.::::: :: :. .. . . ::. : .:: ::
CCDS34 EIIADFDELMEKDFYKDIEKIKTIGSTYMAAVGLAPTSGTKAKKSISSHLSTLADFAIEM
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. :.:..: . . .: ::::.: ::..:::::. . :::::.:::.:::::.:::. :
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CCDS34 GRAGLQGRRPPVCPMPGVSVRAGLPPHSPGQYLPSAAAGKEA
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CCDS17 LFVLCKKGLLPDRVTRRVLPYVLWLLITAQIF-SYLGLNFARAHAASDTVGWQVFFVFSF
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. ::: :: . ..:. :. ..: .. : :. :.:. .:. : :
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.:. . :.. . :..::.. ::. .:: .. .: .. :..:. .::...:.
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::. :: : . : . :.::::::::::::..:. ::.
CCDS17 ----------------MKKDESQKDQQQFNTMYMYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQ
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:: :::.::.:::.: . . .:. :::::::. : :. : ::: : : :::.:..::
CCDS17 ELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLRIKILGDCYYCICGLPDYREDHAVCSILMGLAMVEAI
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.. : :.::::::::::: :.::..:...::::.::..:: :: :. :.::::.
CCDS17 SYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLGGVLGQKRWQYDVWSTDVTVANKMEAGGIPGRVHISQ
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.: : ....: : : : : ::..:::: ... . .. . ..:
CCDS17 STMDCLKGEFDVEPGDGGSR------CDYLEEKGIETYLIIASKPEVKKTATQNGL----
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pF1KA0 EVIDGSQVSSGPRGQGTASSGNVSDLAQTVKTFDNLKTCPSCGITFAPKSEAGAEGGAPQ
.:: . : : ..:... : .: . :. :.: .
CCDS17 ---NGSAL---PNGAPASSKSSSPALIETKE--------PN--------------GSAHS
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CCDS17 SGSTSE-KPEEQDAQADNPSFPN----PRRRLRLQD----LAD------RVVDASEDEHE
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CCDS17 LNQLLNEALLERESAQ---VVKK----RNTFL------LSMRFMDPEMETRYSVEKEKQS
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.. .. :. . .: . . .:. ..: . : : : :: : :
CCDS17 GAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWLMTNYVTFMVGEILLLILTICSL---AAIFPRAFPK
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CCDS17 MMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWNEALVTNMLPEHVARHFLGSK
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CCDS17 RVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERERWQHLADLADFALAMKDTLT
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CCDS17 NIN-NQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTVNVASRMESTGVMGNIQVVE
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pF1KA0 ESYRVLSKMGYDFDYRGTVNVKGKGQMKTYLYPKCTDHRVIPQHQLSISPDIRVQVDGSI
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CCDS17 ETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATFPNGPSVTLPHQVVDNS
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.. .. :. . .: . . .:. ..: . : : : :: : :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]