FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0440, 1803 aa 1>>>pF1KA0440 1803 - 1803 aa - 1803 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7521+/-0.000447; mu= 2.6621+/- 0.028 mean_var=183.9981+/-38.573, 0's: 0 Z-trim(116.5): 102 B-trim: 912 in 1/53 Lambda= 0.094551 statistics sampled from 27625 (27729) to 27625 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 14.950 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016857386 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 4126 576.6 7.2e-163 XP_016857387 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 4126 576.6 7.2e-163 XP_005273268 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 4126 576.6 7.2e-163 XP_011542545 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 4126 576.6 7.2e-163 XP_005273270 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 4126 576.6 7.2e-163 XP_005273269 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 4126 576.6 7.2e-163 XP_016857385 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 4126 576.6 7.2e-163 NP_065859 (OMIM: 611609) signal-induced proliferat (1722) 4126 576.6 7.2e-163 XP_016882007 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1780) 3504 491.7 2.6e-137 XP_011524959 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 3504 491.7 2.6e-137 XP_016882006 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 3504 491.7 2.6e-137 XP_005258728 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 3504 491.7 2.6e-137 NP_055888 (OMIM: 616655,616851) signal-induced pro (1781) 3504 491.7 2.6e-137 NP_694985 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 1593 231.0 4.7e-59 XP_005274246 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 1593 231.0 4.7e-59 NP_006738 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 1593 231.0 4.7e-59 XP_011543516 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 1593 231.0 4.7e-59 XP_016857466 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 617) 683 106.8 6.7e-22 XP_016857480 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 683 106.8 6.8e-22 XP_016857465 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 683 106.8 6.8e-22 XP_016857463 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 651) 683 106.8 7.1e-22 XP_016857478 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 683 106.8 7.1e-22 XP_016857464 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 683 106.8 7.1e-22 XP_016857479 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 683 106.8 7.1e-22 XP_016857461 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 683 106.8 7.1e-22 XP_016857462 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 683 106.8 7.2e-22 XP_016857475 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 683 106.8 7.2e-22 XP_016857477 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 683 106.8 7.2e-22 XP_016857476 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 683 106.8 7.2e-22 NP_002876 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating pr ( 663) 683 106.8 7.2e-22 XP_016857473 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 683 106.8 7.4e-22 NP_001139129 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 681) 683 106.8 7.4e-22 XP_005246012 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 683 106.8 7.4e-22 XP_016857459 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 683 106.8 7.4e-22 XP_016857474 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 683 106.8 7.4e-22 XP_016857471 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 683 106.8 7.5e-22 XP_016857472 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 683 106.8 7.5e-22 XP_016857457 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 683 106.8 7.5e-22 XP_016857470 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 683 106.8 7.5e-22 XP_016857458 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 683 106.8 7.5e-22 XP_016857456 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 710) 683 106.8 7.7e-22 XP_016857469 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 719) 683 106.8 7.8e-22 NP_001139130 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 727) 683 106.8 7.8e-22 XP_006710868 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 683 106.8 8e-22 XP_016857468 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 683 106.8 8e-22 XP_016857455 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 683 106.8 8e-22 XP_006710867 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 683 106.8 8e-22 NP_001317312 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 748) 683 106.8 8e-22 XP_016857454 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 683 106.8 8e-22 XP_016857460 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 804) 683 106.8 8.6e-22 >>XP_016857386 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-induced (1704 aa) initn: 3490 init1: 2161 opt: 4126 Z-score: 3045.0 bits: 576.6 E(85289): 7.2e-163 Smith-Waterman score: 5385; 51.5% identity (73.0% similar) in 1838 aa overlap (1-1801:1-1701) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MTSLKRSQTERPLATDRASVVGTDGTPKV-HTDDFYMRRFRSQNGSLG-SSVMAPVGPPR :.. ..:: :. ::: : :.. ..::.. :.:.. ::..: .. . . . 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XP_016 LKSESVETSLFRKLRTVKSEHETFKFTSELEESRLERGIRPWNCQRCFAHYDVQSILFNI 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 NEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQG :::. .: :: ::.: :::::::. ... : ..... ::.:: :::::: .:. :.: XP_016 NEAMATRANVGKRKNITTGASAASQTQM---PTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEG 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 DDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAVL : :::.::.:::::::: ::::.:.:.::..::.:::. :: ::::.::::::::::.:: XP_016 DGKSNDLVLSCPYFRNETGGEGDRRIALSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVL 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 EVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREKP :::.:: .: ..:::::.::.:::::::::::: ::: :::: ::::::::::::::: XP_016 EVPRENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAYYYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKV 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 DEMKEN-GSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN .. ::. :: .:::. :::::: ::::..:::::::::.:.::::::::::::.:.:::. 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1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA0 ASSAHSDEKWYDGDRTESELNSYNYLQGTSADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAATSSPRSG .:: .:... .:: . :: . .:..:.:.::::::. :. . :: : XP_016 TSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDTAPCMPA----TILG-----PVHL 1240 1250 1260 1270 1280 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 PGKEKVAPLWHSSSEVISMADRTLETESHGLDRKTESSLSLDIHSKSQAGSTPLTRENST :... : :: .: . :: .. : : : . ..:. ... :. . :.: XP_016 AGSRS---LIHSRAE--QWAD---AADVSGPD--DEPAKLYSVHGYASTISAGSAAEGSM 1290 1300 1310 1320 1330 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA0 FSINDAASHTSTMSSRHSASPVVFTSARS----SPKEELHPAAPSQLAPSFSSSSSSSSG .... .::.: .:.::.:: . : : : : . . .: .:. : : XP_016 GDLSEISSHSS--GSHHSGSPSAHCSKSSGSLDSSKVYIVSHSSGQQVPG------SMSK 1340 1350 1360 1370 1380 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA0 PRSFYPRQGATSKYLIGWKKPEGTINSVGFMDTRKRHQSDGNEIAHTRLRASTRDLRASP : : ::::..::.::::: ::. :. . . .. : . .: : XP_016 P---YHRQGAVNKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPGMYSEMDVMSTATQHQTVVGDAVA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA0 KPTSKSTIEEDLKKLIDLESP-TPESQKSFKFHALSSPQSPFPSTPTSRRALHRTLSDES . :.. .::. ::. .:: . :....:.:.. :: ::.:.::::::: XP_016 E-TQHVLSKEDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSP----------RRSLYRTLSDES 1450 1460 1470 1480 1490 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA0 IYNSQR-EHFFTSRASLLDQALPNDVLFSSTYPSLPKSLPLR-RPSYTLGMKSLHGEFSA : ...: : .::.:.::::::::.:::.: : ..:: : .:. ..: ::..:: XP_016 ICSNRRGSSFGSSRSSVLDQALPNDILFSTT-PPYHSTLPPRAHPAPSMG--SLRNEFWF 1500 1510 1520 1530 1540 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KA0 SDSSLTDIQETRRQPMPDPGLMPLPDTAADLDWSNLVDAAKAYEVQR-ASFFAASDENH- ::.::.: .. :::::::::::. :::..:::::.:.: :: ::: . .: .: XP_016 SDGSLSD-----KSKCADPGLMPLPDTATGLDWTHLVDAARAFEDQRVASFCTLTDMQHG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA0 RPLSAASNSDQLEDQALPQMKPYSSKDSSPT-LASKVDQLEGMLKMLREDLKKEKEDKAH . : .:.. : . . .. . ::. :..::.::: .:..:. ::.:::.::: XP_016 QDLEGAQELPLCVDPGSGKEFMDTTGERSPSPLTGKVNQLELILRQLQTDLRKEKQDKAV 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1770 1780 1790 1800 pF1KA0 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XP_011 LKSESVETSLFRKLRTVKSEHETFKFTSELEESRLERGIRPWNCQRCFAHYDVQSILFNI 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 NEAIMNRHNVIKRRNTTTGASAAAVASLVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQG :::. .: :: ::.: :::::::. ... : ..... ::.:: :::::: .:. :.: XP_011 NEAMATRANVGKRKNITTGASAASQTQM---PTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEG 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 DDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKISLSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAVL : :::.::.:::::::: ::::.:.:.::..::.:::. :: ::::.::::::::::.:: XP_011 DGKSNDLVLSCPYFRNETGGEGDRRIALSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVL 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 EVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREKP :::.:: .: ..:::::.::.:::::::::::: ::: :::: ::::::::::::::: XP_011 EVPRENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAYYYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKV 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 DEMKEN-GSPYNYRIIFRTSELMTLRGSVLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELN .. ::. :: .:::. :::::: ::::..:::::::::.:.::::::::::::.:.:::. 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