Result of FASTA (ccds) for pF1KA0288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0288, 1084 aa
  1>>>pF1KA0288 1084 - 1084 aa - 1084 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3631+/-0.00106; mu= -0.5804+/- 0.063
 mean_var=295.9892+/-60.983, 0's: 0 Z-trim(112.4): 49  B-trim: 13 in 1/55
 Lambda= 0.074548
 statistics sampled from 13133 (13175) to 13133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.405), width:  16
 Scan time:  5.810

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2           (1084) 7222 791.3       0
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1069) 3906 434.7 5.4e-121
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1066) 3878 431.6 4.3e-120
CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1011) 3744 417.2  9e-116
CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1122) 2946 331.4 6.7e-90
CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1123) 2946 331.4 6.7e-90
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1025) 2884 324.7 6.4e-88
CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 954) 2287 260.5 1.3e-68
CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 974) 2278 259.5 2.6e-68
CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12         ( 991) 2278 259.5 2.6e-68
CCDS47557.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 590) 1594 185.8 2.4e-46
CCDS56467.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 562) 1386 163.4 1.3e-39
CCDS56465.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 588)  923 113.6 1.3e-24
CCDS56466.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 546)  873 108.2   5e-23
CCDS75565.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 549)  856 106.4 1.8e-22
CCDS56468.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 513)  778 98.0 5.7e-20
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX         (1215)  774 97.9 1.5e-19
CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22       ( 669)  744 94.4 8.8e-19
CCDS54545.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22       ( 649)  500 68.2 6.8e-11


>>CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2                (1084 aa)
 initn: 7222 init1: 7222 opt: 7222  Z-score: 4213.1  bits: 791.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7222; 100.0% identity (100.0% similar) in 1084 aa overlap (1-1084:1-1084)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 NKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDDFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDDFP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 LRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 SSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TGPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TGPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EQPPAQAPLVTGLGALPLHAQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EQPPAQAPLVTGLGALPLHAQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 VIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LDRLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LDRLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 RIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 LLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 VHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 PMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 MGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 MEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

           
pF1KA0 EPPL
       ::::
CCDS25 EPPL
           

>>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1069 aa)
 initn: 3320 init1: 1590 opt: 3906  Z-score: 2285.7  bits: 434.7 E(32554): 5.4e-121
Smith-Waterman score: 3931; 58.2% identity (79.4% similar) in 1095 aa overlap (25-1084:1-1069)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
                               .. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS47                         MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
                                       10        20         30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
       :..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :::.::
CCDS47 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLA
          40        50        60        70        80        90     

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
       .:.::::::...:::..:::::.:...:::.:  :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS47 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
         100       110       120       130       140       150     

                190       200       210       220       230        
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
       .:.  :     . :: .:  :. ::  ..:.:::::::: ::.: ::.. . :  :::::
CCDS47 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
         160       170       180       190       200       210     

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSA-PG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::..::: ..::.:. ::. ::
CCDS47 FPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVTESSVSSSSPG
         220       230       240       250       260       270     

       300        310        320       330       340       350     
pF1KA0 SGPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNIT
       ::::::::. .:::.  :... : .:     .:  .:.. .: :   : :::::::::::
CCDS47 SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNIT
         280       290       300        310       320       330    

         360       370         380       390         400           
pF1KA0 LGLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGG
       :::::. ::  .:..  .. ..    .:.: . : :: .    :  :. :   :: .  .
CCDS47 LGLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
          340        350       360        370       380       390  

       410       420       430       440        450          460   
pF1KA0 AAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLG
       ..:. ::::..: ::   :  ::.  :..::: :: :.  .:.::.:   ::: .::::.
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLN
            400       410         420       430       440       450

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA0 RTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPE
       :::::::::..  : .:::::::::::::.::   :::..:::.. :  :  .:: :: :
CCDS47 RTQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQ--YQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLE
              460         470       480         490       500      

           530       540            550               560       570
pF1KA0 ETEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEA
       :.::::.  ::. .    :: :.     .... :       :.: :.::.::..:::.  
CCDS47 EAEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQ
        510       520           530       540       550       560  

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 EPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRA
          .:.: :..        : :: .: :  . . :   :: . :.:.  ..  :: .::.
CCDS47 --IQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRT
              570             580        590       600        610  

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 QSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQ
       .::::....:  ... : .:  .::..:: :::::::.::.:..::::::::::::::::
CCDS47 HSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQ
            620       630       640       650       660       670  

              700       710       720       730       740          
pF1KA0 ETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRL
       :::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. ..  :  :
CCDS47 ETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSL
            680       690       700       710       720       730  

     750       760       770       780       790       800         
pF1KA0 PCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTP
       ::::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.::::::::::::::::::::: 
CCDS47 PCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTA
            740       750       760       770       780       790  

     810       820       830       840       850       860         
pF1KA0 MGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGN
       ::::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.::
CCDS47 MGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGN
            800       810       820       830       840       850  

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 FFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLV
       ::::::::.::::: : :.:.:.:.::::::::::.::: ::::.: :.:.:: ::.:::
CCDS47 FFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLV
            860       870       880       890       900       910  

     930       940       950       960       970       980         
pF1KA0 SSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACV
       :.::::.:::  :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS47 SAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
            920       930       940       950       960       970  

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KA0 SALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCE
       .:::::::.:: : .:.: :: ::: :..:..::.::::. .. ..   : .:  ::   
CCDS47 NALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--
            980       990      1000      1010      1020      1030  

    1050      1060          1070      1080    
pF1KA0 NEEAETVTAMASLSVGV-KP---AEKRPDEEPMEEEPPL
       .::.:::.:.:::.: : .:    ..:   ::::::: :
CCDS47 QEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
             1040      1050      1060         

>>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1066 aa)
 initn: 2732 init1: 1590 opt: 3878  Z-score: 2269.5  bits: 431.6 E(32554): 4.3e-120
Smith-Waterman score: 3903; 58.0% identity (79.2% similar) in 1095 aa overlap (25-1084:1-1066)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
                               .. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS47                         MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
                                       10        20         30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
       :..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.::::   :.::
CCDS47 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIK---ELLA
          40        50        60        70        80           90  

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
       .:.::::::...:::..:::::.:...:::.:  :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS47 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
            100       110       120       130       140       150  

                190       200       210       220       230        
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
       .:.  :     . :: .:  :. ::  ..:.:::::::: ::.: ::.. . :  :::::
CCDS47 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
            160       170       180       190       200       210  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSA-PG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::..::: ..::.:. ::. ::
CCDS47 FPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVTESSVSSSSPG
            220       230       240       250       260       270  

       300        310        320       330       340       350     
pF1KA0 SGPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNIT
       ::::::::. .:::.  :... : .:     .:  .:.. .: :   : :::::::::::
CCDS47 SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNIT
            280       290       300        310       320       330 

         360       370         380       390         400           
pF1KA0 LGLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGG
       :::::. ::  .:..  .. ..    .:.: . : :: .    :  :. :   :: .  .
CCDS47 LGLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
              340       350       360        370       380         

       410       420       430       440        450          460   
pF1KA0 AAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLG
       ..:. ::::..: ::   :  ::.  :..::: :: :.  .:.::.:   ::: .::::.
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLN
     390       400       410         420       430       440       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA0 RTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPE
       :::::::::..  : .:::::::::::::.::   :::..:::.. :  :  .:: :: :
CCDS47 RTQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQ--YQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLE
       450         460       470         480       490       500   

           530       540            550               560       570
pF1KA0 ETEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEA
       :.::::.  ::. .    :: :.     .... :       :.: :.::.::..:::.  
CCDS47 EAEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQ
           510           520       530       540       550         

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 EPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRA
          .:.: :..        : :: .: :  . . :   :: . :.:.  ..  :: .::.
CCDS47 --IQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRT
       560       570              580       590        600         

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 QSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQ
       .::::....:  ... : .:  .::..:: :::::::.::.:..::::::::::::::::
CCDS47 HSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQ
     610       620       630       640       650       660         

              700       710       720       730       740          
pF1KA0 ETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRL
       :::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. ..  :  :
CCDS47 ETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSL
     670       680       690       700       710       720         

     750       760       770       780       790       800         
pF1KA0 PCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTP
       ::::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.::::::::::::::::::::: 
CCDS47 PCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTA
     730       740       750       760       770       780         

     810       820       830       840       850       860         
pF1KA0 MGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGN
       ::::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.::
CCDS47 MGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGN
     790       800       810       820       830       840         

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 FFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLV
       ::::::::.::::: : :.:.:.:.::::::::::.::: ::::.: :.:.:: ::.:::
CCDS47 FFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLV
     850       860       870       880       890       900         

     930       940       950       960       970       980         
pF1KA0 SSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACV
       :.::::.:::  :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS47 SAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
     910       920       930       940       950       960         

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KA0 SALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCE
       .:::::::.:: : .:.: :: ::: :..:..::.::::. .. ..   : .:  ::   
CCDS47 NALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--
     970       980       990      1000      1010      1020         

    1050      1060          1070      1080    
pF1KA0 NEEAETVTAMASLSVGV-KP---AEKRPDEEPMEEEPPL
       .::.:::.:.:::.: : .:    ..:   ::::::: :
CCDS47 QEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
      1030      1040      1050      1060      

>>CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1011 aa)
 initn: 2674 init1: 1532 opt: 3744  Z-score: 2191.9  bits: 417.2 E(32554): 9e-116
Smith-Waterman score: 3769; 58.7% identity (79.8% similar) in 1032 aa overlap (25-1025:1-1005)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
                               .. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS47                         MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
                                       10        20         30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
       :..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.::::   :.::
CCDS47 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIK---ELLA
          40        50        60        70        80           90  

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
       .:.::::::...:::..:::::.:...:::.:  :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS47 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
            100       110       120       130       140       150  

                190       200       210       220       230        
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
       .:.  :     . :: .:  :. ::  ..:.:::::::: ::.: ::.. . :  :::::
CCDS47 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
            160       170       180       190       200       210  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSA-PG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::..::: ..::.:. ::. ::
CCDS47 FPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVTESSVSSSSPG
            220       230       240       250       260       270  

       300        310        320       330       340       350     
pF1KA0 SGPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNIT
       ::::::::. .:::.  :... : .:     .:  .:.. .: :   : :::::::::::
CCDS47 SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNIT
            280       290       300        310       320       330 

         360       370         380       390         400           
pF1KA0 LGLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGG
       :::::. ::  .:..  .. ..    .:.: . : :: .    :  :. :   :: .  .
CCDS47 LGLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
              340       350       360        370       380         

       410       420       430       440        450          460   
pF1KA0 AAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLG
       ..:. ::::..: ::   :  ::.  :..::: :: :.  .:.::.:   ::: .::::.
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLN
     390       400       410         420       430       440       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA0 RTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPE
       :::::::::..  : .:::::::::::::.::   :::..:::.. :  :  .:: :: :
CCDS47 RTQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQY--QQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLE
       450         460       470         480       490       500   

           530       540                   550        560       570
pF1KA0 ETEEELREHQALLDEPYLDRLPGQ------------KEAHAQAG-VQVKQEPIESDEEEA
       :.::::.  ::. .    :: :..             .. .:.: :.::.::..:::.  
CCDS47 EAEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDA-
           510           520       530       540       550         

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 EPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRA
          .:.: :..        : :: .: :  . . :   :: . :.:.  ..  :: .::.
CCDS47 -QIQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRT
       560       570              580       590        600         

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 QSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQ
       .::::....:  ... : .:  .::..:: :::::::.::.:..::::::::::::::::
CCDS47 HSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQ
     610       620       630       640       650       660         

              700       710       720       730       740          
pF1KA0 ETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRL
       :::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. ..  :  :
CCDS47 ETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSL
     670       680       690       700       710       720         

     750       760       770       780       790       800         
pF1KA0 PCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTP
       ::::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.::::::::::::::::::::: 
CCDS47 PCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTA
     730       740       750       760       770       780         

     810       820       830       840       850       860         
pF1KA0 MGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGN
       ::::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.::
CCDS47 MGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGN
     790       800       810       820       830       840         

     870       880       890       900       910       920         
pF1KA0 FFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLV
       ::::::::.::::: : :.:.:.:.::::::::::.::: ::::.: :.:.:: ::.:::
CCDS47 FFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLV
     850       860       870       880       890       900         

     930       940       950       960       970       980         
pF1KA0 SSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACV
       :.::::.:::  :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS47 SAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
     910       920       930       940       950       960         

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KA0 SALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCE
       .:::::::.:: : .:.: :: ::: :..:..::.:                        
CCDS47 NALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSMSLKFS                  
     970       980       990      1000      1010                   

    1050      1060      1070      1080    
pF1KA0 NEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEEEPPL

>>CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1122 aa)
 initn: 3348 init1: 1745 opt: 2946  Z-score: 1727.4  bits: 331.4 E(32554): 6.7e-90
Smith-Waterman score: 4105; 58.7% identity (78.9% similar) in 1145 aa overlap (1-1084:1-1122)

               10        20        30        40               50   
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAV-------PMDLRL
       :.: .. ::.:::.  .:.:  . .. .: ::.:  .:: .. ::..       :  ..:
CCDS45 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLP-RAMPSSMGGGGGGSPSPVEL
               10        20        30         40        50         

            60        70        80        90       100       110   
pF1KA0 DHQFSLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIK
          .   : .:.:::::::::::::::.::.:.:.:.::::.::..:.::::.::..:.:
CCDS45 RGALVGSV-DPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLK
      60         70        80        90       100       110        

           120               130       140       150       160     
pF1KA0 QQQEMLAMKHQQELL--------EHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESA
       ::::::: :.:::.:        :.::. :..::: :::::. ::.:  :.::::.::::
CCDS45 QQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQE-ELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESA
      120       130       140       150        160       170       

         170       180       190       200       210       220     
pF1KA0 VASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSG---VS
       .::::::..::::.:.:.:  .  .::: . . :. : : ..:.:::::::::::   . 
CCDS45 IASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCW-G-AHHASLDQSSPPQSGPPGTP
       180       190       200       210         220       230     

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA0 TSYNHPVLGMYDAKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKK
        ::. :. : ::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :....::
CCDS45 PSYKLPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKK
         240       250       260       270       280       290     

                  290       300       310       320       330      
pF1KA0 RPLDVT------DSACSSAPGSGPSSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAR
       : ...:      .:.:.:::::::::::.: ... ::::.. .::.::.:    :: .  
CCDS45 RAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTI-AENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPL
         300       310       320        330       340       350    

        340       350       360               370       380        
pF1KA0 EGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPAT--------GPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSL-
       ..:   . ::::::::::.::: ::          :   . ::.::: .: .:.:  .: 
CCDS45 DSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLT
          360       370       380       390       400       410    

         390        400        410       420       430       440   
pF1KA0 --FPGTHLTPY-LSTSPLERDGGA-AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-
         : .:   :  :    :: ::.  .:. ::::..::::   :. :.    :.:::.:: 
CCDS45 GKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLI----AVPLHGQSP
          420       430       440       450       460           470

            450          460       470       480       490         
pF1KA0 LVGADRVSPSIH---KLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQ
       :: ..::. :..   :: .::::.::::.::::. ::::.::.::::::::::.::    
CCDS45 LVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ----
              480       490       500       510       520          

     500       510       520       530        540       550        
pF1KA0 QQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQ-ALLDEPYLDRLPGQKEAHAQAGVQ-
       ::::..::. : .:  ::: .::::::::: :.: .:: :  :  .: .  .....  . 
CCDS45 QQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALT-MPREGSTESESTQED
        530       540       550       560       570        580     

       560       570            580        590       600       610 
pF1KA0 VKQEPIESDEEEAEP-----PREVEPGQRQ-PSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQAS
       ...:  :.: :: :       .: : : .. :. .:     . :. . : .. :. ::: 
CCDS45 LEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAP
         590       600       610       620       630       640     

             620       630       640       650          660        
pF1KA0 MEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR---FTTGLVYDTLMLKHQCT
       .  : .:     :. :.:.:::::.   : ... :: .:    ::::.::::.:::::: 
CCDS45 LSLATVP-----HQALGRTQSSPAA---PGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQCM
         650            660          670       680       690       

      670       680       690       700       710       720        
pF1KA0 CGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPL
       ::..  :::::::::::::::::::: .::: ::::::::.:.:::::: :::::::.::
CCDS45 CGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPL
       700       710       720       730       740       750       

      730       740        750       760       770       780       
pF1KA0 NRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVAT
       :::::::::::: ... ... :::::.::::::.:::.::..:.:.::::..::.::::.
CCDS45 NRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAA
       760       770       780       790       800       810       

       790       800       810       820       830       840       
pF1KA0 GELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGT
       ::::::::..::::::::::: ::::.:::::..::::::.:.:.:.::::::.::::::
CCDS45 GELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
       820       830       840       850       860       870       

       850       860       870       880       890       900       
pF1KA0 QQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEY
       :::::.::::::.::::::.::::::::::.::: :::::.:::.:.:::.:::.::.::
CCDS45 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEY
       880       890       900       910       920       930       

       910       920       930       940       950       960       
pF1KA0 LAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGR
       :.:::::::::: ::.:::::::.:::::::: .:::::...:::::.::.::: :::::
CCDS45 LTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGR
       940       950       960       970       980       990       

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KA0 IVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKY
       .:::::::::::::::::::::::::. ::.:: : ::::.:: ::: ..:::.::.::.
CCDS45 VVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKH
      1000      1010      1020      1030      1040      1050       

      1030      1040      1050      1060      1070                 
pF1KA0 WRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEK--------RPDEEPME
       : :.:. ..  :::: :::. :.::::::.::: ::::.. :.         :: :::::
CCDS45 WSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPME
      1060      1070      1080      1090      1100      1110       

    1080    
pF1KA0 EEPPL
       .:: :
CCDS45 QEPAL
      1120  

>>CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1123 aa)
 initn: 3348 init1: 1745 opt: 2946  Z-score: 1727.4  bits: 331.4 E(32554): 6.7e-90
Smith-Waterman score: 4094; 58.7% identity (78.7% similar) in 1144 aa overlap (2-1084:3-1123)

                10        20        30        40               50  
pF1KA0  MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAV-------PMDLR
         : .   ::.:::.  .:.:  . .. .: ::.:  .:: .. ::..       :  ..
CCDS32 MNSPNESADGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLP-RAMPSSMGGGGGGSPSPVE
               10        20        30        40         50         

             60        70        80        90       100       110  
pF1KA0 LDHQFSLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHI
       :   .   : .:.:::::::::::::::.::.:.:.:.::::.::..:.::::.::..:.
CCDS32 LRGALVGSV-DPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHL
      60         70        80        90       100       110        

            120               130       140       150       160    
pF1KA0 KQQQEMLAMKHQQELL--------EHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKES
       :::::::: :.:::.:        :.::. :..::: :::::. ::.:  :.::::.:::
CCDS32 KQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQE-ELEKQRLEQQLLILRNKEKSKES
      120       130       140       150        160       170       

          170       180       190       200       210       220    
pF1KA0 AVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSG---V
       :.::::::..::::.:.:.:  .  .::: . . :. : : ..:.:::::::::::   .
CCDS32 AIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCW-G-AHHASLDQSSPPQSGPPGT
       180       190       200       210         220       230     

             230       240       250       260       270       280 
pF1KA0 STSYNHPVLGMYDAKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALK
         ::. :. : ::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :....:
CCDS32 PPSYKLPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFK
         240       250       260       270       280       290     

                   290       300       310       320       330     
pF1KA0 KRPLDVT------DSACSSAPGSGPSSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVA
       :: ...:      .:.:.:::::::::::.: ... ::::.. .::.::.:    :: . 
CCDS32 KRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTI-AENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALP
         300       310       320       330        340       350    

         340       350       360               370       380       
pF1KA0 REGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPAT--------GPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSL
        ..:   . ::::::::::.::: ::          :   . ::.::: .: .:.:  .:
CCDS32 LDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTL
          360       370       380       390       400       410    

          390        400        410       420       430       440  
pF1KA0 ---FPGTHLTPY-LSTSPLERDGGA-AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS
          : .:   :  :    :: ::.  .:. ::::..::::   :. :.    :.:::.::
CCDS32 TGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLI----AVPLHGQS
          420       430       440       450       460           470

             450          460       470       480       490        
pF1KA0 -LVGADRVSPSIH---KLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQ
        :: ..::. :..   :: .::::.::::.::::. ::::.::.::::::::::.::   
CCDS32 PLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ---
              480       490       500       510       520          

      500       510       520       530        540       550       
pF1KA0 QQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQ-ALLDEPYLDRLPGQKEAHAQAGVQ
        ::::..::. : .:  ::: .::::::::: :.: .:: :  :  .: .  .....  .
CCDS32 -QQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALT-MPREGSTESESTQE
        530       540       550       560       570        580     

        560       570            580        590       600       610
pF1KA0 -VKQEPIESDEEEAEP-----PREVEPGQRQ-PSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQA
        ...:  :.: :: :       .: : : .. :. .:     . :. . : .. :. :::
CCDS32 DLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQA
         590       600       610       620       630       640     

              620       630       640       650          660       
pF1KA0 SMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR---FTTGLVYDTLMLKHQC
        .  : .:     :. :.:.:::::.   : ... :: .:    ::::.::::.::::::
CCDS32 PLSLATVP-----HQALGRTQSSPAA---PGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQC
         650            660          670       680       690       

       670       680       690       700       710       720       
pF1KA0 TCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNP
        ::..  :::::::::::::::::::: .::: ::::::::.:.:::::: :::::::.:
CCDS32 MCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSP
       700       710       720       730       740       750       

       730       740        750       760       770       780      
pF1KA0 LNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVA
       ::::::::::::: ... ... :::::.::::::.:::.::..:.:.::::..::.::::
CCDS32 LNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVA
       760       770       780       790       800       810       

        790       800       810       820       830       840      
pF1KA0 TGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNG
       .::::::::..::::::::::: ::::.:::::..::::::.:.:.:.::::::.:::::
CCDS32 AGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNG
       820       830       840       850       860       870       

        850       860       870       880       890       900      
pF1KA0 TQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAE
       ::::::.::::::.::::::.::::::::::.::: :::::.:::.:.:::.:::.::.:
CCDS32 TQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVE
       880       890       900       910       920       930       

        910       920       930       940       950       960      
pF1KA0 YLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGG
       ::.:::::::::: ::.:::::::.:::::::: .:::::...:::::.::.::: ::::
CCDS32 YLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGG
       940       950       960       970       980       990       

        970       980       990      1000      1010      1020      
pF1KA0 RIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSK
       :.:::::::::::::::::::::::::. ::.:: : ::::.:: ::: ..:::.::.::
CCDS32 RVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSK
      1000      1010      1020      1030      1040      1050       

       1030      1040      1050      1060      1070                
pF1KA0 YWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEK--------RPDEEPM
       .: :.:. ..  :::: :::. :.::::::.::: ::::.. :.         :: ::::
CCDS32 HWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPM
      1060      1070      1080      1090      1100      1110       

     1080    
pF1KA0 EEEPPL
       :.:: :
CCDS32 EQEPAL
      1120   

>>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1025 aa)
 initn: 3174 init1: 1590 opt: 2884  Z-score: 1692.0  bits: 324.7 E(32554): 6.4e-88
Smith-Waterman score: 3620; 54.9% identity (75.6% similar) in 1094 aa overlap (25-1084:1-1025)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
                               .. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS83                         MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
                                       10        20         30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
       :..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :::.::
CCDS83 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLA
          40        50        60        70        80        90     

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
       .:.::::::...:::..:::::.:...:::.:  :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS83 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
         100       110       120       130       140       150     

                190       200       210       220       230        
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
       .:.  :     . :: .:  :. ::  ..:.:::::::: ::.: ::.. . :  :::::
CCDS83 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
         160       170       180       190       200       210     

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGS
       :::::: :                                           :. ::.:::
CCDS83 FPLRKTES-------------------------------------------SVSSSSPGS
         220                                                  230  

      300        310        320       330       340       350      
pF1KA0 GPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITL
       :::::::. .:::.  :... : .:     .:  .:.. .: :   : ::::::::::::
CCDS83 GPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITL
            240       250       260        270       280       290 

        360       370         380       390         400            
pF1KA0 GLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGGA
       ::::. ::  .:..  .. ..    .:.: . : :: .    :  :. :   :: .  ..
CCDS83 GLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNS
              300       310       320        330       340         

      410       420       430       440        450          460    
pF1KA0 AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLGR
       .:. ::::..: ::   :  ::.  :..::: :: :.  .:.::.:   ::: .::::.:
CCDS83 SHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNR
     350       360       370         380       390       400       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KA0 TQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEE
       ::::::::..  : .:::::::::::::.::   :::..:::.. :  :  .:: :: ::
CCDS83 TQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQ--YQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEE
       410         420       430         440       450       460   

          530       540            550               560       570 
pF1KA0 TEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEAE
       .::::.  ::. .    :: :.     .... :       :.: :.::.::..:::.   
CCDS83 AEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQ-
           470           480       490       500       510         

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA0 PPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQ
         .:.: :..        : :: .: :  . . :   :: . :.:.  ..  :: .::..
CCDS83 -IQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRTH
       520             530        540       550        560         

             640       650       660       670       680       690 
pF1KA0 SSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQE
       ::::....:  ... : .:  .::..:: :::::::.::.:..:::::::::::::::::
CCDS83 SSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQE
     570       580       590       600       610       620         

             700       710       720       730       740        750
pF1KA0 TGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLP
       ::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. ..  :  ::
CCDS83 TGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLP
     630       640       650       660       670       680         

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 CGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPM
       :::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.::::::::::::::::::::: :
CCDS83 CGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAM
     690       700       710       720       730       740         

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 GFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNF
       :::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.:::
CCDS83 GFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNF
     750       760       770       780       790       800         

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 FPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVS
       :::::::.::::: : :.:.:.:.::::::::::.::: ::::.: :.:.:: ::.::::
CCDS83 FPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVS
     810       820       830       840       850       860         

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 SGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVS
       .::::.:::  :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::.
CCDS83 AGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVN
     870       880       890       900       910       920         

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 ALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCEN
       :::::::.:: : .:.: :: ::: :..:..::.::::. .. ..   : .:  ::   .
CCDS83 ALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--Q
     930       940       950       960       970       980         

             1060          1070      1080    
pF1KA0 EEAETVTAMASLSVGV-KP---AEKRPDEEPMEEEPPL
       ::.:::.:.:::.: : .:    ..:   ::::::: :
CCDS83 EETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
       990      1000      1010      1020     

>>CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (954 aa)
 initn: 2659 init1: 1650 opt: 2287  Z-score: 1345.4  bits: 260.5 E(32554): 1.3e-68
Smith-Waterman score: 2738; 49.0% identity (69.0% similar) in 1006 aa overlap (100-1084:59-952)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA0 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
                                     :. :.  .::.:.     .::  .::. .:
CCDS41 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
       30        40        50        60        70             80   

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA0 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
        .: :       ::.   .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..:  .:
CCDS41 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
             90       100       110       120       130       140  

     190       200       210       220       230        240        
pF1KA0 NLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGM-YDAKDDFPLRKTASEP
       ...    ..:   :   .   :.  .  .: .: :.  :: ..  :  . ::::::.:::
CCDS41 TVH---PNSPGIPYRTLE--PLETEGATRSMLS-SFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEP
               150         160       170        180       190      

      250       260       270       280        290         300     
pF1KA0 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVT-DSA--CSSAPGSGPSSPNN
       ::::: . :... :::..::::....:   .:..:: ..  ::.   ::.:.:: ::::.
CCDS41 NLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPND
        200        210       220         230       240       250   

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA0 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA
       :      :.:                                    ::  ::  :     
CCDS41 S------EHG------------------------------------PNPILGSEA-----
                                                     260           

         370       380       390       400       410       420     
pF1KA0 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA
             :..: : :.:  :  .. . : :: .    :: ..:..    :: ..::.   .
CCDS41 ------DSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS
              270       280        290       300       310         

         430          440       450       460       470       480  
pF1KA0 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI
       .:::.:  ::: ::.: ::::. ..:.: :      : ::.::.: ::: .: :      
CCDS41 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPP---
     320       330       340           350       360       370     

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA0 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD
           :  ::. : . :        .: . ..:...:. .   . :.:.   .   .   :
CCDS41 PGPMQPRLEQLKTHVQ--------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD
            380               390       400       410       420    

            550       560       570       580       590       600  
pF1KA0 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI
        :  .. .:.:        :      ::. :    : :..:         :.:: ::::.
CCDS41 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL
          430                     440                   450        

            610       620       630       640       650            
pF1KA0 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR-----------
              .. ... .:.. :::::::::::::: :   .:. :: .. :           
CCDS41 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART
      460       470       480       490        500       510       

               660       670       680       690       700         
pF1KA0 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE
         :::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
CCDS41 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE
       520       530       540       550       560       570       

     710       720       730       740        750       760        
pF1KA0 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA
       :::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
CCDS41 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS
       580       590       600       610       620       630       

      770       780       790       800       810       820        
pF1KA0 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR
       .::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
CCDS41 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ
       640       650       660       670       680       690       

      830       840       850       860       870       880        
pF1KA0 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF
        ..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
CCDS41 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF
       700       710       720       730       740       750       

      890       900       910       920       930       940        
pF1KA0 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL
       :::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS41 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
       760       770       780       790       800       810       

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KA0 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR
       ::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :.  .:.
CCDS41 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK
       820       830       840       850       860       870       

     1010      1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KA0 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP
       :: ::.::.: :...::::: :.:: .:     . ..   ..::.:.:::.::::::.  
CCDS41 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
       880       890       900       910       920       930       

     1070      1080      
pF1KA0 AEKRPDEEPMEEEPPL  
       :: ::.:. .::: :.  
CCDS41 AEDRPSEQLVEEEEPMNL
        940       950    

>>CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (974 aa)
 initn: 2652 init1: 1650 opt: 2278  Z-score: 1340.0  bits: 259.5 E(32554): 2.6e-68
Smith-Waterman score: 2894; 50.7% identity (71.6% similar) in 1006 aa overlap (100-1084:42-972)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA0 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
                                     :. :.  .::.:.     .::  .::. .:
CCDS81 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
              20        30        40        50             60      

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA0 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
        .: :       ::.   .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..:  .:
CCDS81 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
          70        80        90       100       110       120     

     190       200       210       220       230        240        
pF1KA0 NLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGM-YDAKDDFPLRKTASEP
       ...    ..:   :   .   :.  .  .: .: :.  :: ..  :  . ::::::.:::
CCDS81 TVH---PNSPGIPYRTLE--PLETEGATRSMLS-SFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEP
            130       140         150        160       170         

      250       260       270       280        290         300     
pF1KA0 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVT-DSA--CSSAPGSGPSSPNN
       ::::: . :... :::..::::....:   .:..:: ..  ::.   ::.:.:: ::::.
CCDS81 NLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPND
     180       190        200         210       220       230      

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA0 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA
       :      :.:  : . :   :. :..::  .: :.::. : :   :: :::::::  :. 
CCDS81 S------EHGPNPILGS---EALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA--PA-
              240          250       260       270       280       

         370       380       390       400       410       420     
pF1KA0 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA
           . :..: : :.:  :  .. . : :: .    :: ..:..    :: ..::.   .
CCDS81 ----RADSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS
              290       300        310       320       330         

         430          440       450       460       470       480  
pF1KA0 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI
       .:::.:  ::: ::.: ::::. ..:.: :      : ::.::.: ::: .: :      
CCDS81 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPP---
     340       350       360           370       380       390     

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA0 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD
           :  ::. : . :        .: . ..:...:. .   . :.:.   .   .   :
CCDS81 PGPMQPRLEQLKTHVQ--------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD
            400               410       420       430       440    

            550       560       570       580       590       600  
pF1KA0 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI
        :  .. .:.:        :      ::. :    : :..:         :.:: ::::.
CCDS81 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL
          450                     460                   470        

            610       620       630       640       650            
pF1KA0 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR-----------
              .. ... .:.. :::::::::::::: :   .:. :: .. :           
CCDS81 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART
      480       490       500       510        520       530       

               660       670       680       690       700         
pF1KA0 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE
         :::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
CCDS81 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE
       540       550       560       570       580       590       

     710       720       730       740        750       760        
pF1KA0 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA
       :::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
CCDS81 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS
       600       610       620       630       640       650       

      770       780       790       800       810       820        
pF1KA0 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR
       .::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
CCDS81 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ
       660       670       680       690       700       710       

      830       840       850       860       870       880        
pF1KA0 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF
        ..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
CCDS81 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF
       720       730       740       750       760       770       

      890       900       910       920       930       940        
pF1KA0 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL
       :::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS81 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
       780       790       800       810       820       830       

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KA0 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR
       ::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :.  .:.
CCDS81 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK
       840       850       860       870       880       890       

     1010      1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KA0 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP
       :: ::.::.: :...::::: :.:: .:     . ..   ..::.:.:::.::::::.  
CCDS81 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
       900       910       920       930       940       950       

     1070      1080      
pF1KA0 AEKRPDEEPMEEEPPL  
       :: ::.:. .::: :.  
CCDS81 AEDRPSEQLVEEEEPMNL
        960       970    

>>CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12              (991 aa)
 initn: 2652 init1: 1650 opt: 2278  Z-score: 1339.9  bits: 259.5 E(32554): 2.6e-68
Smith-Waterman score: 2894; 50.7% identity (71.6% similar) in 1006 aa overlap (100-1084:59-989)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA0 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
                                     :. :.  .::.:.     .::  .::. .:
CCDS87 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
       30        40        50        60        70             80   

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA0 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
        .: :       ::.   .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..:  .:
CCDS87 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
             90       100       110       120       130       140  

     190       200       210       220       230        240        
pF1KA0 NLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGM-YDAKDDFPLRKTASEP
       ...    ..:   :   .   :.  .  .: .: :.  :: ..  :  . ::::::.:::
CCDS87 TVH---PNSPGIPYRTLE--PLETEGATRSMLS-SFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEP
               150         160       170        180       190      

      250       260       270       280        290         300     
pF1KA0 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVT-DSA--CSSAPGSGPSSPNN
       ::::: . :... :::..::::....:   .:..:: ..  ::.   ::.:.:: ::::.
CCDS87 NLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPND
        200        210       220         230       240       250   

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA0 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA
       :      :.:  : . :   :. :..::  .: :.::. : :   :: :::::::  :. 
CCDS87 S------EHGPNPILGS---EALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA--PA-
                 260          270       280       290         300  

         370       380       390       400       410       420     
pF1KA0 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA
           . :..: : :.:  :  .. . : :: .    :: ..:..    :: ..::.   .
CCDS87 ----RADSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS
                 310       320        330       340       350      

         430          440       450       460       470       480  
pF1KA0 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI
       .:::.:  ::: ::.: ::::. ..:.: :      : ::.::.: ::: .: :      
CCDS87 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPP---
        360       370       380           390       400            

            490       500       510       520       530       540  
pF1KA0 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD
           :  ::. : . :        .: . ..:...:. .   . :.:.   .   .   :
CCDS87 PGPMQPRLEQLKTHVQ--------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD
     410       420               430       440       450       460 

            550       560       570       580       590       600  
pF1KA0 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI
        :  .. .:.:        :      ::. :    : :..:         :.:: ::::.
CCDS87 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL
             470                        480                490     

            610       620       630       640       650            
pF1KA0 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR-----------
              .. ... .:.. :::::::::::::: :   .:. :: .. :           
CCDS87 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART
         500       510       520        530       540       550    

               660       670       680       690       700         
pF1KA0 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE
         :::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
CCDS87 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE
          560       570       580       590       600       610    

     710       720       730       740        750       760        
pF1KA0 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA
       :::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
CCDS87 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS
          620       630       640       650       660       670    

      770       780       790       800       810       820        
pF1KA0 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR
       .::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
CCDS87 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ
          680       690       700       710       720       730    

      830       840       850       860       870       880        
pF1KA0 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF
        ..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
CCDS87 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF
          740       750       760       770       780       790    

      890       900       910       920       930       940        
pF1KA0 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL
       :::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS87 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
          800       810       820       830       840       850    

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KA0 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR
       ::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :.  .:.
CCDS87 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK
          860       870       880       890       900       910    

     1010      1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KA0 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP
       :: ::.::.: :...::::: :.:: .:     . ..   ..::.:.:::.::::::.  
CCDS87 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
          920       930       940       950       960       970    

     1070      1080      
pF1KA0 AEKRPDEEPMEEEPPL  
       :: ::.:. .::: :.  
CCDS87 AEDRPSEQLVEEEEPMNL
           980       990 




1084 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 19:38:06 2016 done: Thu Nov  3 19:38:08 2016
 Total Scan time:  5.810 Total Display time:  0.560

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com