Result of FASTA (omim) for pF1KSDB1439
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB1439, 2273 aa
  1>>>pF1KSDB1439 2273 - 2273 aa - 2273 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6221+/-0.000476; mu= 20.8592+/- 0.030
 mean_var=142.1664+/-28.848, 0's: 0 Z-trim(112.9): 249  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.107566
 statistics sampled from 21679 (21938) to 21679 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time: 22.660

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000341 (OMIM: 153800,248200,601691,601718,60411 (2273) 15305 2389.0       0
XP_016869871 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2242) 3708 589.3 1.7e-166
XP_005251830 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2263) 3708 589.3 1.7e-166
XP_016869869 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_016869867 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_016869870 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_016869868 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_011516641 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_011516642 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2288) 3708 589.3 1.7e-166
XP_005251833 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2203) 3706 589.0 2.1e-166
XP_011516644 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2142) 3705 588.8 2.3e-166
XP_006722681 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 2882 460.9 4.6e-128
XP_011525938 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1365) 2882 460.9 4.6e-128
XP_011525934 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1994) 2882 461.1  6e-128
XP_011525931 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2137) 2882 461.1 6.4e-128
NP_061985 (OMIM: 605414,608907) ATP-binding casset (2146) 2882 461.1 6.4e-128
XP_011525930 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2146) 2882 461.1 6.4e-128
XP_016881631 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2061) 2576 413.6 1.2e-113
XP_011516646 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (1565) 2533 406.8  1e-111
XP_006717059 (OMIM: 600047) PREDICTED: ATP-binding (2435) 2288 369.0 3.9e-100
NP_001597 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub- (2436) 2288 369.0 3.9e-100
NP_997698 (OMIM: 600047) ATP-binding cassette sub- (2466) 2288 369.0 3.9e-100
NP_005493 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) ATP- (2261) 2246 362.5 3.4e-98
XP_011516643 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) P (2286) 2246 362.5 3.4e-98
NP_056472 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2277) 1862 302.9   3e-80
NP_775099 (OMIM: 242500,601277,607800) ATP-binding (2595) 1862 302.9 3.3e-80
XP_011509253 (OMIM: 242500,601277,607800) PREDICTE (2598) 1847 300.6 1.6e-79
XP_011513444 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4298) 1836 299.1 7.6e-79
XP_011513443 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4329) 1836 299.1 7.7e-79
XP_016867257 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4396) 1836 299.1 7.8e-79
XP_016867256 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4433) 1836 299.1 7.8e-79
XP_011513441 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4456) 1836 299.1 7.8e-79
XP_011513440 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4468) 1836 299.1 7.9e-79
XP_011513439 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4602) 1836 299.1   8e-79
XP_011525932 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2103) 1774 289.2 3.6e-76
XP_011525936 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1752 285.6   3e-75
XP_011525937 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1752 285.6   3e-75
XP_016881632 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1487) 1752 285.6   3e-75
XP_011525935 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1631) 1752 285.7 3.2e-75
XP_006722680 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1636) 1752 285.7 3.2e-75
XP_006722679 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (2128) 1687 275.7 4.2e-72
XP_011513445 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4030) 1627 266.6 4.2e-69
XP_011513446 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4024) 1619 265.4   1e-68
XP_011525933 (OMIM: 605414,608907) PREDICTED: ATP- (1997) 1394 230.2   2e-58
XP_011513438 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (4861) 1297 215.5 1.3e-53
XP_011513435 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5013) 1297 215.5 1.3e-53
XP_011513434 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 1297 215.5 1.3e-53
NP_689914 (OMIM: 607807) ATP-binding cassette sub- (5058) 1297 215.5 1.3e-53
XP_011513432 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5059) 1297 215.5 1.3e-53
XP_011513433 (OMIM: 607807) PREDICTED: ATP-binding (5028) 1196 199.8 6.8e-49


>>NP_000341 (OMIM: 153800,248200,601691,601718,604116) r  (2273 aa)
 initn: 15305 init1: 15305 opt: 15305  Z-score: 12836.3  bits: 2389.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 15305; 100.0% identity (100.0% similar) in 2273 aa overlap (1-2273:1-2273)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGFVRQIQLLLWKNWTLRKRQKIRFVVELVWPLSLFLVLIWLRNANPLYSHHECHFPNKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGFVRQIQLLLWKNWTLRKRQKIRFVVELVWPLSLFLVLIWLRNANPLYSHHECHFPNKA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD MPSAGMLPWLQGIFCNVNNPCFQSPTPGESPGIVSNYNNSILARVYRDFQELLMNAPESQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MPSAGMLPWLQGIFCNVNNPCFQSPTPGESPGIVSNYNNSILARVYRDFQELLMNAPESQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD HLGRIWTELHILSQFMDTLRTHPERIAGRGIRIRDILKDEETLTLFLIKNIGLSDSVVYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HLGRIWTELHILSQFMDTLRTHPERIAGRGIRIRDILKDEETLTLFLIKNIGLSDSVVYL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LINSQVRPEQFAHGVPDLALKDIACSEALLERFIIFSQRRGAKTVRYALCSLSQGTLQWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LINSQVRPEQFAHGVPDLALKDIACSEALLERFIIFSQRRGAKTVRYALCSLSQGTLQWI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD EDTLYANVDFFKLFRVLPTLLDSRSQGINLRSWGGILSDMSPRIQEFIHRPSMQDLLWVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EDTLYANVDFFKLFRVLPTLLDSRSQGINLRSWGGILSDMSPRIQEFIHRPSMQDLLWVT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD RPLMQNGGPETFTKLMGILSDLLCGYPEGGGSRVLSFNWYEDNNYKAFLGIDSTRKDPIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RPLMQNGGPETFTKLMGILSDLLCGYPEGGGSRVLSFNWYEDNNYKAFLGIDSTRKDPIY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPLLMGKILYTPDSPAARRILKNANSTFEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPLLMGKILYTPDSPAARRILKNANSTFEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQMNMIRDTLGNPTVKDFLNRQLGEEGITAEAILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQMNMIRDTLGNPTVKDFLNRQLGEEGITAEAILN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD FLYKGPRESQADDMANFDWRDIFNITDRTLRLVNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FLYKGPRESQADDMANFDWRDIFNITDRTLRLVNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRALS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LLEENMFWAGVVFPDMYPWTSSLPPHVKYKIRMDIDVVEKTNKIKDRYWDSGPRADPVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLEENMFWAGVVFPDMYPWTSSLPPHVKYKIRMDIDVVEKTNKIKDRYWDSGPRADPVED
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD FRYIWGGFAYLQDMVEQGITRSQVQAEAPVGIYLQQMPYPCFVDDSFMIILNRCFPIFMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FRYIWGGFAYLQDMVEQGITRSQVQAEAPVGIYLQQMPYPCFVDDSFMIILNRCFPIFMV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD LAWIYSVSMTVKSIVLEKELRLKETLKNQGVSNAVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LAWIYSVSMTVKSIVLEKELRLKETLKNQGVSNAVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HGRILHYSDPFILFLFLLAFSTATIMLCFLLSTFFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGRILHYSDPFILFLFLLAFSTATIMLCFLLSTFFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD AWQDRMTAELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AWQDRMTAELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD QMMLLDAAVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLGGEGCSTREERALEKTEPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QMMLLDAAVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLGGEGCSTREERALEKTEPL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD TEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPGVCVKNLVKIFEPCGQPAVDRLNITFYENQITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_000 TEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPGVCVKNLVKIFEPCGRPAVDRLNITFYENQITA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD FLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRDIETSLDAVRQSLGMCPQHNILFHHLTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRDIETSLDAVRQSLGMCPQHNILFHHLTV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD AEHMLFYAQLKGKSQEEAQLEMEAMLEDTGLHHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAIAFVGDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AEHMLFYAQLKGKSQEEAQLEMEAMLEDTGLHHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAIAFVGDA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD KVVILDEPTSGVDPYSRRSIWDLLLKYRSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIAQGRLYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KVVILDEPTSGVDPYSRRSIWDLLLKYRSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIAQGRLYC
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pF1KSD LNFLYKGPRESQADDMANFDWRDIFNITDRTLRLVNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRA
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       :.:::::::.. .:.:: ::: :::::.. .:..:...: .::..:.  . .:  ::...
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       .  : .: :::: ..:.:: .:...::. :::.::.::.:.:::::.:.::::::::..:
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pF1KSD CFAWQDRMTAELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLL
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XP_016 CVAWQDYVGFTLKIFASLLSPVAFGFGCEYFALFEEQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTT
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pF1KSD SMQMMLLDAAVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLGGEGCSTREERALEKTE
       :..:::.:. .::...::.. ::::.:: : ::::   .:::.:        :.. ::..
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pF1KSD PLTEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPGVCVKNLVKIFEPCGQPAVDRLNITFYENQI
       : ... .       : .  .:.:      :: ..::::...   . ::: : ..:::.::
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       :.::::::::::::.::::::.::::::. . :.::.. ....::.::.:::::.::  :
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       :: ::. :::.::: :..... ::: :  :.::   : . ....::::::::::::.:::
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       : .:::::::::.::::::::.::.::::::.:::::.:::::::::.::::::::..:.
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       : : :. ::::: .::: :::::.: ...  :. ..: .: :  .:      ::  .   
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         .:     :  ::. . ... .:: ::.::: ::.:: ..:: .  :. :.. ::.:..
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       . :.:::.::.:::.: ::::::::.:.:      . :   :...:.  . .. :: :  
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pF1KSD EKAGQTPQDSNVCSPGAPAAHPEGQPPPEPECPGPQLNTGTQLVLQHVQALLVKRFQHTI
       :  .  :.::..   .  .    :.     .  :     : .:. :.  ::: ::.  . 
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       ::.: :.:::::::.:: .::..:...::::.::.: :.::.:..:::: : : : .   
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pF1KSD TVLADVLLNKPGFGNRCLKEGWLPEYPC-GNSTPWKTPSVSPNITQLFQKQKWTQVNPSP
         : ..: . ::::.::.. . .:. :: ..   : :  :  .: .:::. .::. ::::
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       .:.::. .   ::: :: :::::::::: : ...:::::: :::::.:::::  .: .::
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pF1KSD KSKFWVNEQRYGGISIG-GKLPVVPITGEALVGFLSDLGRIMNVSGGPITREASKEIPDF
       :.:.:::: ::::.:.: ..  ..: . : .   .... . ....    . .  . .  :
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pF1KSD EQLSEITVLTTSVDAVVAICVIFSMSFVPASFVLYLIQERVNKSKHLQFISGVSPTTYWV
       .::::....:::::..:.:::::.:::::::::..::::::.:.:::::::::.:. ::.
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pF1KSD TNFLWDIMNYSVSAGLVVGIFIGFQKKAYTSPENLPALVALLLLYGWAVIPMMYPASFLF
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XP_016 SNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPASFVF
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pF1KSD DVPSTAYVALSCANLFIGINSSAITFILELFENNRTLLRFNAVLRKLLIVFPHFCLGRGL
        .::::::.:. .:::::::.:. ::.:::: .:. :  .: .:......::::::::::
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        ..    :. :::.:: .:::::. ::...:::...::::::    .:::::.:::. ::
XP_016 PVNAKLSPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEIKELTKIYRRKRKPAVDRICVGIPPG
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pF1KSD ECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDTTVTSGDATVAGKSILTNISEVHQNMGYCPQFDAIDE
       :::::::::::::..:::::::::::: ::: .  .:::.:: ::::::::::::::: :
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       :::::::. ..: ::::: .:. ::..:.:..:::. :..  ::.::::::::::::.::
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       :: ::.:.::::::::::.:::.:::  .:...:::.:::::::::::::::::.::::.
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       ::.:. ::  ::::::..: . :  : ::.:::.:::::::::::::.:... :  :: :
XP_016 LQYQLPSSLSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNFAKDQSDDDHLKDLSL
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>>XP_005251830 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) PREDI  (2263 aa)
 initn: 5519 init1: 2148 opt: 3708  Z-score: 3110.1  bits: 589.3 E(85289): 1.7e-166
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pF1KSD HLGRIWTELHILSQFMDTLRTHPERIAGRGIRIRDILKDEETLTLFLIKNIGLSDSVVYL
        .  .   :. :.:.         . .. .....:.: :.::.. :: .:..:  :.:  
XP_005 SMKDMRKVLRTLQQI---------KKSSSNLKLQDFLVDNETFSGFLYHNLSLPKSTVDK
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pF1KSD LINSQVRPEQ-FAHGVPDLALKDIACSEALLERFIIFSQRRGAKTVRYALCSLSQGTLQW
       .. ..:  .. : .:  .: : .. :. .  :..: .    : . :   ::.: .  :  
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pF1KSD IYSYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPLLMGKILYTPDSPAARRILKNANSTF
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>>XP_016869869 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) PREDI  (2288 aa)
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       ::.:::::.::.:.:.: .::.    ..    :. :::.:: .:::::. ::...:::..
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       .::::::    .:::::.:::. :::::::::::::::..:::::::::::: ::: .  
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       .:::.:: ::::::::::::::: ::::::::. ..: ::::: .:. ::..:.:..:::
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       . :..  ::.::::::::::::.:::: ::.:.::::::::::.:::.:::  .:...::
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>>XP_016869867 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) PREDI  (2288 aa)
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       :.:.::.::.. : ..::. . ..  .  .   :. :.:.         . .. .....:
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         .: ...   ::..   : .:.   .  : . ..  . :...  .: ..::.::::: .
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       . :.::::::::::..: ..:..:    ::  :: .:: :...:::.::..: :.: :::
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       ...: .::..:.  . .:  ::....  : .: :::: ..:.:: .:...::. :::.::
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       .::.:.:::::.:.::::::::..:: :::: .   ::  .::::::::::: ::.. ::
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       :::.:.::.:. .::.: : :..  :..:::.:. .::...::.. ::::.:: : ::::
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          .:::.:        :.. ::..: ... .       : .  .:.:      :: ..:
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       ... . ....    . .  . .  :.  :.:..:.:::::::::::. ::::: .:::::
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pF1KSD TLGNPTVKDFLNRQLGEEGITAEAILNFLYKGPRESQADDMANFDWRDIFNITDRTLRLV
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>>XP_011516641 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) PREDI  (2288 aa)
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       :.:.::.::.. : ..::. . ..  .  .   :. :.:.         . .. .....:
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pF1KSD ILKDEETLTLFLIKNIGLSDSVVYLLINSQVRPEQ-FAHGVPDLALKDIACSEALLERFI
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XP_011 FLVDNETFSGFLYHNLSLPKSTVDKMLRADVILHKVFLQGY-QLHLTSL-CNGSKSEEMI
             180       190       200       210         220         

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pF1KSD IFSQRRGAKTVRYALCSLSQGTLQWIEDTLYANVDFFK-LFRVLPTLLDSRSQGINLRSW
        .    : . :   ::.: .  :   : .: .:.:..: ..:.: .     :. .  .. 
XP_011 QL----GDQEVS-ELCGLPREKLAAAERVLRSNMDILKPILRTLNSTSPFPSKELA-EAT
     230            240       250       260       270       280    

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pF1KSD GGILSDMSPRIQEFIHRPSMQDLLWVTRPLMQNGGPETFTKLMGILSDLLCGYPEGGGSR
         .: ...   ::..   : .:.   .  : . ..  . :...  .: ..::.::::: .
XP_011 KTLLHSLGTLAQELFSMRSWSDMRQEVMFLTNVNSSSSSTQIYQAVSRIVCGHPEGGGLK
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pF1KSD VLSFNWYEDNNYKAFLGIDSTRKDPIYSYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPL
       . :.::::::::::..: ..:..:    ::  :: .:: :...:::.::..: :.: :::
XP_011 IKSLNWYEDNNYKALFGGNGTEEDAETFYDNSTTPYCNDLMKNLESSPLSRIIWKALKPL
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pF1KSD LMGKILYTPDSPAARRILKNANSTFEELEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQMNMIRD
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XP_011 LVGKILYTPDTPATRQVMAEVNKTFQELAVFHDLEGMWEELSPKIWTFMENSQEMDLVRM
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        : .     : ..::     ::. :. :: : :.. :... . . ::. :: :....: .
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       ....::. :.:.:    :. : .... ::.:  ::::.::  . : .  :: ::::::::
XP_011 SRFMECVNLNKLEPIATEVWLINKSMELLDERKFWAGIVFTGITPGSIELPHHVKYKIRM
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       ::: ::.:::::: ::: :::::: ::.::.:::::::::.:::.: :  . .:  .:.:
XP_011 DIDNVERTNKIKDGYWDPGPRADPFEDMRYVWGGFAYLQDVVEQAIIRVLTGTEKKTGVY
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pF1KSD LQQMPYPCFVDDSFMIILNRCFPIFMVLAWIYSVSMTVKSIVLEKELRLKETLKNQGVSN
       .:::::::.::: :. ...: .:.::.:::::::.. .:.:: ::: :::::.. .:..:
XP_011 MQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIVYEKEARLKETMRIMGLDN
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pF1KSD AVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIMHGRILHYSDPFILFLFLLAFSTATIMLCFLLST
       ...: .::..:.  . .:  ::....  : .: :::: ..:.:: .:...::. :::.::
XP_011 SILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKLGNLLPYSDPSVVFVFLSVFAVVTILQCFLIST
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pF1KSD FFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCFAWQDRMTAELKKAVSLLSPVAFGFGTEYLVRFE
       .::.:.:::::.:.::::::::..:: :::: .   ::  .::::::::::: ::.. ::
XP_011 LFSRANLAAACGGIIYFTLYLPYVLCVAWQDYVGFTLKIFASLLSPVAFGFGCEYFALFE
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pF1KSD EQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLDAAVYGLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYF
       :::.:.::.:. .::.: : :..  :..:::.:. .::...::.. ::::.:: : ::::
XP_011 EQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLFDTFLYGVMTWYIEAVFPGQYGIPRPWYF
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pF1KSD LLQESYWLGGEGCSTREERALEKTEPLTEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPGVCVKN
          .:::.:        :.. ::..: ... .       : .  .:.:      :: ..:
XP_011 PCTKSYWFG--------EESDEKSHPGSNQKR-------ISEICMEEEPTHLKLGVSIQN
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pF1KSD LVKIFEPCGQPAVDRLNITFYENQITAFLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRD
       :::...   . ::: : ..:::.:::.::::::::::::.::::::.::::::. . :.:
XP_011 LVKVYRDGMKVAVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGTAYILGKD
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pF1KSD IETSLDAVRQSLGMCPQHNILFHHLTVAEHMLFYAQLKGKSQEEAQLEMEAMLEDTGL-H
       :.. ....::.::.:::::.::  ::: ::. :::.::: :..... ::: :  :.::  
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pF1KSD HKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAIAFVGDAKVVILDEPTSGVDPYSRRSIWDLLLKYRSGRT
        : . ....::::::::::::.:::: .:::::::::.::::::::.::.::::::.:::
XP_011 SKLKSKTSQLSGGMQRKLSVALAFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQGRT
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pF1KSD IIMSTHHMDEADLLGDRIAIIAQGRLYCSGTPLFLKNCFGTGLYLTLVRK-MKNIQSQRK
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       . :   :...:.  . .. :: :  :  .  :.::..   .  .    :.     .  : 
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XP_011 YQVKGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPS
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pF1KSD LTLHPWIYGQQYTFFSMDEPGSEQFTVLADVLLNKPGFGNRCLKEGWLPEYPC-GNSTPW
       : :.::.:..:::: : : : .     : ..: . ::::.::.. . .:. :: ..   :
XP_011 LELQPWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKDPGFGTRCMEGNPIPDTPCQAGEEEW
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pF1KSD KTPSVSPNITQLFQKQKWTQVNPSPSCRCSTREKLTMLPECPEGAGGLPPPQRTQRSTEI
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       ::::: :::::.:::::  .: .:::.:.:::: ::::.:.: ..  ..: . : .   .
XP_011 LQDLTGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQE-VNDAI
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       ... . ....    . .  . .  :.  :.:..:.:::::::::::. ::::: .:::::
XP_011 KQMKKHLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAILR
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       :.: : ..: .::::....::::::.::::....:::::..:.:::::.:::::::::..
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XP_011 LIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNL
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       :.:. :::::::.. :.::::::.: .::::::.:. .:::::::.:. ::.:::: .:.
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XP_011 AMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPRPVNAKLSPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEI
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pF1KSD KSILTNISEVHQNMGYCPQFDAIDELLTGREHLYLYARLRGVPAEEIEKVANWSIKSLGL
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XP_011 NSILSNIHEVHQNMGYCPQFDAITELLTGREHVEFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGL
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pF1KSD TVYADCLAGTYSGGNKRKLSTAIALIGCPPLVLLDEPTTGMDPQARRMLWNVIVSIIREG
       . :..  ::.::::::::::::.:::: ::.:.::::::::::.:::.:::  .:...::
XP_011 VKYGEKYAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPTTGMDPKARRFLWNCALSVVKEG
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       :.:::::::::::::::::.::::.: :::.:..::::..::::: ....: . .    :
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       ::.::..::   ::::: .:.: ::::.:. ::  ::::::..: . :  : ::.:::.:
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       :.: : ..: .::::....::::::.::::....:::::..:.:::::.:::::::::..
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       ::::::.:.:::::::::.:. ::..::.::. :: : : ::. ::: ::.:.:.:  ::
XP_011 LIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNL
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       :.:. :::::::.. :.::::::.: .::::::.:. .:::::::.:. ::.:::: .:.
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        :  .: .:......::::::::::::.. .::..:.  ::::.. ..:. :::.:.:::
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       ::.:::::.::.:.:.: .::.    ..    :. :::.:: .:::::. ::...:::..
XP_011 AMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPRPVNAKLSPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEI
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       .::::::    .:::::.:::. :::::::::::::::..:::::::::::: ::: .  
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pF1KSD KSILTNISEVHQNMGYCPQFDAIDELLTGREHLYLYARLRGVPAEEIEKVANWSIKSLGL
       .:::.:: ::::::::::::::: ::::::::. ..: ::::: .:. ::..:.:..:::
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       . :..  ::.::::::::::::.:::: ::.:.::::::::::.:::.:::  .:...::
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pF1KSD RAVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVKGAFRCMGTIQHLKSKFGDGYIVTMKIKSPKDDLLP
       :.:::::::::::::::::.::::.: :::.:..::::..::::: ....: . .    :
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pF1KSD DLNPVEQFFQGNFPGSVQRERHYNMLQFQVSSS--SLARIFQLLLSHKDSLLIEEYSVTQ
       ::.::..::   ::::: .:.: ::::.:. ::  ::::::..: . :  : ::.:::.:
XP_011 DLKPVQDFFGLAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSSLSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQ
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pF1KSD TTLDQVFVNFAKQQTES-H--DLPLHPRAAGASRQAQD             
       ::::::::::::.:... :  :: ::                         
XP_011 TTLDQVFVNFAKDQSDDDHLKDLSLHKNQTVVDVAVLTSFLQDEKVKESYV
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>>XP_005251833 (OMIM: 143890,205400,600046,604091) PREDI  (2203 aa)
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Smith-Waterman score: 7382; 50.8% identity (76.9% similar) in 2221 aa overlap (61-2261:1-2178)

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pF1KSD WPLSLFLVLIWLRNANPLYSHHECHFPNKAMPSAGMLPWLQGIFCNVNNPCFQSPTPGES
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       ::.:.:.:.::.::.. : ..::. . ..  .  .   :. :.:.         . .. .
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       ....:.: :.::.. :: .:..:  :.:  .. ..:  .. : .:  .: : .. :. . 
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        :..:    . : . :   ::.: .  :   : .: .:.:..: ..:.: .     :. .
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         ..   .: ...   ::..   : .:.   .  : . ..  . :...  .: ..::.::
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       ...:  : .     : ..::     ::. :. :: : :.. :... . . ::. :: :..
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       ..: .....::. :.:.:    :. : .... ::.:  ::::.::  . : .  :: :::
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pF1KSD YKIRMDIDVVEKTNKIKDRYWDSGPRADPVEDFRYIWGGFAYLQDMVEQGITRSQVQAEA
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XP_005 KTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIVYEKEARLKETMRI
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pF1KSD QGVSNAVIWCTWFLDSFSIMSMSIFLLTIFIMHGRILHYSDPFILFLFLLAFSTATIMLC
       .:..:...: .::..:.  . .:  ::....  : .: :::: ..:.:: .:...::. :
XP_005 MGLDNSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKLGNLLPYSDPSVVFVFLSVFAVVTILQC
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pF1KSD LVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLDAAVYGLLAWYLDQVFPGDYGTP
       .. :::::.:.::.:. .::.: : :..  :..:::.:. .::...::.. ::::.:: :
XP_005 FALFEEQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLFDTFLYGVMTWYIEAVFPGQYGIP
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pF1KSD LPWYFLLQESYWLGGEGCSTREERALEKTEPLTEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPG
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       . :.::.. ....::.::.:::::.::  ::: ::. :::.::: :..... ::: :  :
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pF1KSD RSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIAQGRLYCSGTPLFLKNCFGTGLYLTLVRK-MKNI
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pF1KSD QSQRKGSEGTCSCSSKGFSTTCPAHVDDLTPEQV-----LDGDVNELMDVVLHHVPEAKL
        :. ..: .: :  .:      ::  .     .:     :  ::. . ... .:: ::.:
XP_005 LSSCRNSSSTVSYLKKVVPELPPAGQSGGRGGEVQRLVALTQDVSAISNLIRKHVSEARL
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pF1KSD VECIGQELIFLLPNKNFKHRAYASLFRELEETLADLGLSSFGISDTPLEEIFLKVTEDSD
       :: ::.:: ..:: .  :. :.. ::.:... :.:::.::.:::.: ::::::::.:.: 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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